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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tpr3g1310 ATGGCTGTCGGATTCGGGTCATCCGAAGATGTATCCGGTTTCAAATTCCTTTTCCTTATGACGATTGTGTACGGTCTTATGTCTATGCTTACATACTCAGTCATTCACATGAACTTCATCAATCCACTTCATATCGATGCTCCTCGAGATCAATTTTCTGAAGGTAGAGCTATCCAACATGTTCGAATGTTGTCTCAAGAGATCGACGGTCGTCAAGAAGGGCGTCCTGGTTTGAAAAAAGCTGCTGATTACATTAAGACTGAGTTGGAATTAATTAAGGACAGAGCTACTTCTAATGTCAGAATTGAGATTGAAGAGAGTACTGTTAGTGGATCCTTTAATATGAACTTTTTGGGTCATTACATTGCTTTGGGATACAGAAATCATACTAATATTATTATGAGGATATCATCTATAGATTCTAAAGATACGGATCCATCGGTTTTAGTAAACGGACATTTTGATAGTCCCCTTGGTTCTCCTGGTGCTGGTGATTGTGGTTCATGTGTTGCTTCAATGCTGGAAATTGCAAGACTAATTGTGGACACTAGTTGGGTTCCGCACCACCCTGTTATTTTCCTTTTTAATGGTGCTGAGGAACTTTTCATGTTGGGTTCACATGGATTCATGAAGACAAATAAATGGAACAACACGATAGGAGCTTTTGTAAATGTGGAGGCATCTGGGACTGGAGGCCCTGATTTAGTATGCCAATCTGGACCAAGTTCTTGGCCTTCTAATATCTACGCAGAAGCAGCAATATATCCTATGGCTACTAGTGCAGCTCAGGATGTTTTTCCTATTATTCCCGGTGATACAGATTACCGAATATTTTCCGAAGACTACGGCAGTATTCCCGGGCTTGACATTATCTTCCTCCTTGGTGGTTATTTTTACCATACCTCATTTGATACAGTGGAGCAACTATTACCTGGAAGCATCCAAGCACGTGGAGAAAATTTGTTCAGCATAATCAAGGCTTTTAGTAATTCTTCTAAGTTACAAAACACATATCAAACAAATTATAGTGAAGCTAGAGCTAGTTTATTCAACGAAGAGCGAGCTATATTCTTTGATTATCTCTCATGGTTTATGATATTTTATTCCAAAAGGGTAGCTAAAATTCTTCACAGCTTTCCCATCTTCTTGTTCTTTGTCATGCCTTTTACGCGTGGTCGGTTCAGTTCCTGTTTGTCAACTTTGTGTGATTTTGTGAAAGGATTTCTGTTACATGCAGTTGGGATTATATTGGCAATTATTGTGCCTGTTGTGTTTTCTTTGCTAAGATTACTGTTCACTTCTCAGACGATGAATTGGTTTGCTCATCCATTTTTGGCTTTCTTGATGTTTATACCCTGCGCACTCGTCGGTCTTATAATCCCAAGAATTATCTGGAGACATTTTCCTCTTTCTCAAGATCCCGCAATTGTCAAGAGATCAAAAGAGGCACTATCCGATGAAGCAAGGTTTTGGGGAGCATTTGGTTTCTATGCCTTATTAACTTTGGCATATCTTGTAGCTGGTTTAAGTGGAGGATTCGTGACTTTTGTTGCGTCTGCTTCCATGCTTCCTTCATGGATATCCTTCTGCTTATCAGTCAAATCCTTCGGACGACATTCATTCAGGTCAACAATGTTTTACATATTACCCCTTTTTCCATGCCTTTCATACGCTGTTTATTTTGGTGGCTTTCTTGCTCAATTTCTGATAGAGAAGATGGGCATGATGGGTTCTCTTCCTCTACCATATGGGTACTATGTTCCGGATATTATTGTGGCAGCAGTAATTGGACTTATAACTGGTTGGTCTGTGGGCCCTCTAATGCCCATTTGTGGTCGTTGGTTAGCAAGGTCATCTATTTTGCGATTTCTGCTGCATCTTAGTCTGCTTGGTTTAGCGATATCTTCTCAGTTCTTTCCTTACTCCACGTCTGCACCTAAGAGAATTGTTTTTCAGCACACTTTCCGAACTACAGGCGTGAGTCAGATAACGGAATCCACTTATGATTTATCTGTACTAGATTCCAATTCTTTACTATTCATTTTCAAACACTCACCTGAAGTAGCAAAATTATTGAATGTTACTTCGGATTTTTCACTTGAATCTGCATCACTGTCTAAACGCCACGATTGGATGGTAATTTTTCCCGTTTCTTCTCTCTTTTCAAATAGTCTGAAGTTCCCTGCAAAAGAGGATGATATTGTGAAGCAATATGAATTCTTTCCCACATTGTCTGTTCAAAATACATCTTCAGATTCCGAAAAGGGACATAGAAGAGTTCACTTGGAGTTTTATTTAGGTTCCTTAGAAGAGATCTGGGTTGCAGTTCTTAACATCACCGGTCCATTATCTAGTTGGTCATTTGCAGATAATGCGCTTCCAGGAACCGAAGCCTATGGTGGTGGTCCACCATCATATATATTACGACTTAGCGGACCGAGCGACAGGAATTGGTCTTTCTGGTTAGAGGCTAACAGCTCTGAAGCATTGAGAGTGGAGCTTTCAGTTTTGGACCAAAAGTTGGTTGATCCCGCGAAGAGATTGAAGAATCTTTTCCCTAAATGGGTTGATGTAGTTGCTTATTCTAGTTTCATTTCTTGCTATACCTTTTAA 2613 0.3988 MAVGFGSSEDVSGFKFLFLMTIVYGLMSMLTYSVIHMNFINPLHIDAPRDQFSEGRAIQHVRMLSQEIDGRQEGRPGLKKAADYIKTELELIKDRATSNVRIEIEESTVSGSFNMNFLGHYIALGYRNHTNIIMRISSIDSKDTDPSVLVNGHFDSPLGSPGAGDCGSCVASMLEIARLIVDTSWVPHHPVIFLFNGAEELFMLGSHGFMKTNKWNNTIGAFVNVEASGTGGPDLVCQSGPSSWPSNIYAEAAIYPMATSAAQDVFPIIPGDTDYRIFSEDYGSIPGLDIIFLLGGYFYHTSFDTVEQLLPGSIQARGENLFSIIKAFSNSSKLQNTYQTNYSEARASLFNEERAIFFDYLSWFMIFYSKRVAKILHSFPIFLFFVMPFTRGRFSSCLSTLCDFVKGFLLHAVGIILAIIVPVVFSLLRLLFTSQTMNWFAHPFLAFLMFIPCALVGLIIPRIIWRHFPLSQDPAIVKRSKEALSDEARFWGAFGFYALLTLAYLVAGLSGGFVTFVASASMLPSWISFCLSVKSFGRHSFRSTMFYILPLFPCLSYAVYFGGFLAQFLIEKMGMMGSLPLPYGYYVPDIIVAAVIGLITGWSVGPLMPICGRWLARSSILRFLLHLSLLGLAISSQFFPYSTSAPKRIVFQHTFRTTGVSQITESTYDLSVLDSNSLLFIFKHSPEVAKLLNVTSDFSLESASLSKRHDWMVIFPVSSLFSNSLKFPAKEDDIVKQYEFFPTLSVQNTSSDSEKGHRRVHLEFYLGSLEEIWVAVLNITGPLSSWSFADNALPGTEAYGGGPPSYILRLSGPSDRNWSFWLEANSSEALRVELSVLDQKLVDPAKRLKNLFPKWVDVVAYSSFISCYTF* 871
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tpr3g1310 870 SUPERFAMILY Zn-dependent exopeptidases 42 331 - -
Tpr3g1310 870 CDD M28_Fxna_like 49 368 - -
Tpr3g1310 870 PANTHER METALLOPEPTIDASE M28 FAMILY MEMBER 7 868 IPR045175 GO:0006508|GO:0008235
Tpr3g1310 870 Pfam Peptidase family M28 131 321 IPR007484 -
Tpr3g1310 870 Gene3D Zn peptidases 46 347 - -
Tpr3g1310 870 PANTHER BNAA07G25020D PROTEIN 7 868 - -
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tpr3g1310 - - gmx:100796569 1451.03
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Tpr3g1310 3 11598673 11605700 Tpr3g1310 3 11598673 11605700 ECH