Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tpr3g0187 ATGGCGCTAATCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTTCTTCGCTTCTCACCTCCTCTCTTCCATTTCTGGTCAATCCAGCTCCATGGAATCGGTTCCTGATCTTCAGAATACTATGTATACCGACGTTGATGGATATCCTTGTGTTCGTTTGTTGAATCTTTCTGGAACAATCGGTTGTTCAAATCCTGGGCGTGATAAGGTTGTGGCTCCAATTGTAAGGTTTGAAAATGTTGATGACGTTTCGGAGCTATCTACTATATTGGTGTCATTGGATGATTTTCCAACTCTCTTTACCAGATTATCAGCTGATCCAAGCTTTGCAAGAAAAGTTGGTGGTGTACTAATTGAATCAGTTACTGATTCACAGAAGAAGTTAAATGGATTTTCTCCAGATCAAAAGTTTCCGCAAGCTGAATTTGCTCCTTATCATAATATCAGCTATGAATGGAATCCAATTGGTTCTGGTATTATGTGGAAATCTTACAGTTTTCCCGTGTTTCTACTCACAGAAAGTGGCACAAATACTCTTAAAAAGTTTGTATTAAAGAGTGAGAACAAAAAGAAAGCGTATACTTCTAATGTGGCCGAGTTTGATCTGGTGATGCAGACAATGAAATCTGGAACACATGATTCAGAGTCTTGTTTAAAAGAAGGAACTTGCCTCCCTTTAGGTGGATACAGTGTTTGGTCGTCTCTTCCCCCAATCAACATTTCATCCTCGAAACCGCCTAAGCCCATTATATTGACAGTAGCCTCTATGGATTCTTCTTCCTTTTTCCGGGACATAAGCCTCGGTGCAGATTCCCCTATTTCTGGTTTAATTGCATTACTGGCAGCAGCTGATGCGCTTTCTCGTTTGGATGGCCTTGGTGAACTTAGTAAGCAGCTTGTTTTTGTAGTTTTCACTGGAGAGGCATGGGGTTATCTTGGAAGTAGGAGATTTTTGGTAGAACTTGACGAGCACTCAGATGCTGTCCATGGCCTTAATCACTCATTAATTGAAAAGGTCCTTGAAATTGGTTCTGTTGGGAAGGGTCTCAGTCAAGGTCAAGGTCAAGGTGCTAAAAACTTTTTTGCTCATGCTGAAGGGGATTCTTCTGCCACAGATCAGATTATGGTTGCCCTGAAACATGCACAAGAATCACTGCTATCTGAAGACATACGGATCACATCTGCAAGTGCCTCAAATCCTGGGATACCTCCATCATCTTTAATGACCTTTTTAAATAAGAATCCTGGAATCTCTGGTGTCGTGTTAGAAGATTTTGACTCTTCCTTTGTCAACAAGTTCTACCATAGTTATCTTGATGATTTATCAAATGTGAACTCATCGGCTGTAGTTGCTGCTGCTTCTCTTGTTGCTCGAACCCTTTACATACTTGCTAGTGAAACTAATGATGTACAAAATTCAACTTTGGCTGCTATAAATGTAAATGTCACACTTGTTGAACAACTTATGGATTGCTTGTTGGACTGTGATCCCGGTCTTTCATGTGAGTTGGTGAAGAAATATATTTCACCCGCTTCAACCTGTGCGAGCAATTATGTCGGTGTTATCTTGGATGAACCTTCATCCACACCTTATCTAGGATACATTAATGATGTTCCTAGGTTCATCTGGAATTTTCTTGCCGACATAACTTCTATCCCAAAGGAGAATAATAGCTCAAGTTGTCAAAAGGGTTGCAACGGTAGAGATGAAGTTTGCATTAAAGCGGAGACTGATGGAAAGGGTGTTTGCGCTCTCTCTACAACTAGGTATGTTCCAGCATATTCAACACGGTTAAAATTTGACTCCGGAGTATGGAGTGTTTTGCCCCCTAATTCCTCTGACAAAATGGGGGTTGTAGACCCAGTCTGGACAGAAAGCAACTGGAATACAATAGGCATTCGGGTCTACACAGTCCAAATTGCTGCATATGATCGGGTTGTTCTGTTTGGGGGAATTGCTCTTACAATCTTGGCATACCTTGCAATAACAGTTACAAGAACTTTCGTTGCTAAAGCGACAAAGAGGGATTGA 2019 0.4111 MALIFFFLFLFFASHLLSSISGQSSSMESVPDLQNTMYTDVDGYPCVRLLNLSGTIGCSNPGRDKVVAPIVRFENVDDVSELSTILVSLDDFPTLFTRLSADPSFARKVGGVLIESVTDSQKKLNGFSPDQKFPQAEFAPYHNISYEWNPIGSGIMWKSYSFPVFLLTESGTNTLKKFVLKSENKKKAYTSNVAEFDLVMQTMKSGTHDSESCLKEGTCLPLGGYSVWSSLPPINISSSKPPKPIILTVASMDSSSFFRDISLGADSPISGLIALLAAADALSRLDGLGELSKQLVFVVFTGEAWGYLGSRRFLVELDEHSDAVHGLNHSLIEKVLEIGSVGKGLSQGQGQGAKNFFAHAEGDSSATDQIMVALKHAQESLLSEDIRITSASASNPGIPPSSLMTFLNKNPGISGVVLEDFDSSFVNKFYHSYLDDLSNVNSSAVVAAASLVARTLYILASETNDVQNSTLAAINVNVTLVEQLMDCLLDCDPGLSCELVKKYISPASTCASNYVGVILDEPSSTPYLGYINDVPRFIWNFLADITSIPKENNSSSCQKGCNGRDEVCIKAETDGKGVCALSTTRYVPAYSTRLKFDSGVWSVLPPNSSDKMGVVDPVWTESNWNTIGIRVYTVQIAAYDRVVLFGGIALTILAYLAITVTRTFVAKATKRD* 673
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tpr3g0187 672 SUPERFAMILY Zn-dependent exopeptidases 215 458 - -
Tpr3g0187 672 CDD M28_Nicastrin 41 625 - -
Tpr3g0187 672 Pfam Nicastrin small lobe 45 202 IPR041084 -
Tpr3g0187 672 Pfam Nicastrin 244 457 - -
Tpr3g0187 672 Gene3D Zn peptidases 172 476 - -
Tpr3g0187 672 PANTHER NICASTRIN 16 671 IPR008710 GO:0016021|GO:0016485
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tpr3g0187 K06171 - gmx:100818367 1051.58