Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tpr2g3579 ATGACTACTGGTAGAATCCTAACTAAAACCCCATTGATTTCTGGGTTTTCTCCAATTAATAAGTTTAGTGATTCAAGAATGATGAGTGTATTGTCCAGATCAAGCTATAGATATTATAGATGTAATACTAAGATTGTAGGTTATATACATGTGACTAGTTTGAATCGGCGAGATTTTAGTGTTCCCGATTCGAATGGGGTTCAATCTAGGAATTTTAGCAATATTTTTTGTGTTAATATTGGTAGGGTTAGGCCGAGGGTTGTATCATTGATACCGAATGTAGCTTCGGATTTTAGAAACCAGTCTACATCGGTTGATTCTAATGTTAATGACAAAAGCTTTGAGAATATTTTTATTCAAAGCAGTTTGAATCCAAAGCCTTTGGTGTTTGATAGAATTGATACTGATGATCAAAGTAAATTGGAGGAAGTTGATGGATCGAAAGTAAATTTAGATATTAAATTGAATGATTTGAGTGAGAATAAAGATGAGAGGGAGCTTTCTGAGATTGAAAAGGAAGCTTGGAAGTTGCTTCGAACGGCTGTTGTTACTTACTGTGGGAATCCAGTTGGGACTGTTGCTGCTAATGATCCTGCTGATAAACAACCTCTGAATTATGATCAAGTCTTTATCCGTGATTTTGTTCCATCTGCGCTTGCCTTTCTGCTCAATGGTGAAGGGGAAATTGTCAAGAATTTTCTACTTCACACATTGCAATTGCAGAGTTGGGAGAAGACTGTTGACTGTTACAGCCCAGGGCAAGGGTTGATGCCAGCGAGCTTCAAAGTTAGAACTATCCCTCTTGATGGAAGCAATGAAGCATTTGAGGATGTTTCAGATCCTGATTTTGGTGAATCAGCTATAGGCCGTGTTGCCCCTGTTGATTCAGGATTGTGGTGGATTATATTGTTGAGAGCATATGGGAAGTTAACGGGTGACTATTCATTGCAAGAGAGAGTGGATGTCCAGACAGGCATAAGACTGATCCTTAAGTTGTGTCTAACTGATGGATTTGACATGTTTCCTTCTCTACTAGTCACTGATGGTTCCTGCATGATTGATAGAAGGATGGGAATTCACGGTCACCCTCTTGAGATCCAGGCATTATTTTACTCAGCTTTACGCTGTTCTCGTGAGATGCTGATAGTGAATGATACAACTAGTAGTCTGGTGGCTGCCGTCAGTAATCGTTTGAGTGCACTCTCCTTTCACATGAGAGAGTACTATTGGGTTAACATGAAAAAGATTAATGAAATATATCGCTACAAAACGGAAGAGTATTCTACTGATGCTGTCAACAAATTTAACATCTATCCAGAGCAAATTCCTTCATGGCTCGTGGACTGGATATCTGAGGAAGGTGGATATTTCATCGGAAATCTGCAACCTGCTCACATGGACTTTAGGTTTTTCACACTTGGAAACCTTTGGGCCATTGTCTCTTCTTTAGGGTCAAAAAGACAGAATGAGGGCATTTTGAATTTAATAGAGGCCAAATGGGATGATATCATTGGTCAAATGCCTCTCAAGATATGCTATCCAGCATTGGAGGGCGAGGAGTGGCGTATAATCACTGGTTGTGACCCCAAGAACACCCCTTGGTCATATCACAATGGCGGATCTTGGCCGACACTTATCTGGCAGTTCACTCTAGCATGCATCAAGATGGGTAGGTCAGATTTAGCACAGAAAGCAGTTAATTTAGCAGAAAAAAGGCTTTGTGAGGATAGATGGCCAGAATATTATGATACTAGAAATGGGAAGTTTATTGGGAAGCAATCGAGGTTGATGCAGACATGGACTATAGCTGGTTTCCTTACTTCAAAGATGCTTCTAAAGAATCCAGAGAAAGCATCTTTGTTGTTTTGGGAAGAGGATTTTGAAATTCTTCACAATTGTGTCTGCATGCTTAACAAAACTGGTAGAAGGAAGTGTTCACGTTTTGCAGCAAGATCAAAGATTCTTGTTTAA 1971 0.3973 MTTGRILTKTPLISGFSPINKFSDSRMMSVLSRSSYRYYRCNTKIVGYIHVTSLNRRDFSVPDSNGVQSRNFSNIFCVNIGRVRPRVVSLIPNVASDFRNQSTSVDSNVNDKSFENIFIQSSLNPKPLVFDRIDTDDQSKLEEVDGSKVNLDIKLNDLSENKDERELSEIEKEAWKLLRTAVVTYCGNPVGTVAANDPADKQPLNYDQVFIRDFVPSALAFLLNGEGEIVKNFLLHTLQLQSWEKTVDCYSPGQGLMPASFKVRTIPLDGSNEAFEDVSDPDFGESAIGRVAPVDSGLWWIILLRAYGKLTGDYSLQERVDVQTGIRLILKLCLTDGFDMFPSLLVTDGSCMIDRRMGIHGHPLEIQALFYSALRCSREMLIVNDTTSSLVAAVSNRLSALSFHMREYYWVNMKKINEIYRYKTEEYSTDAVNKFNIYPEQIPSWLVDWISEEGGYFIGNLQPAHMDFRFFTLGNLWAIVSSLGSKRQNEGILNLIEAKWDDIIGQMPLKICYPALEGEEWRIITGCDPKNTPWSYHNGGSWPTLIWQFTLACIKMGRSDLAQKAVNLAEKRLCEDRWPEYYDTRNGKFIGKQSRLMQTWTIAGFLTSKMLLKNPEKASLLFWEEDFEILHNCVCMLNKTGRRKCSRFAARSKILV* 657
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tpr2g3579 656 PANTHER - 18 655 IPR024746 GO:0033926
Tpr2g3579 656 PANTHER ALKALINE/NEUTRAL INVERTASE C, MITOCHONDRIAL 18 655 - -
Tpr2g3579 656 Gene3D - 204 603 IPR012341 GO:0005975
Tpr2g3579 656 Pfam Alkaline and neutral invertase 174 615 IPR024746 GO:0033926
Tpr2g3579 656 SUPERFAMILY Six-hairpin glycosidases 174 607 IPR008928 GO:0005975
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tpr2g3579 Tpr-Chr2 38967974 38973966 Transposed
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tpr2g3579 - - gmx:100791877 1117.06
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Tpr2g3579 2 38967974 38973966 Tpr2g3579 2 38967974 38973966 ECH