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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tpr1g3182 ATGGGTTTCATATGGTGGATTTTAGGCATAATTCATATACTTCCACTATTCATCATAGATTCAATCCCTTTAATCCATAGCCTAACTCCACAATCACCAATACAATGCAACCAAACAATCTGCACCTTAAAAAACTCGTATGGAACATGGAACGACCGCAAAACATGTTATGCACTCAATGTGACATACCCAACAACAGAACAACAACTTCGTTTAGCAGTTTCCTATGTTGTTCAAAACAACCTTAAAGCAAAAATTGTCACAAAATTCTCACACACAATCCCAACACTTTCATGTCCACAACAAAATAAAAACCAAGCCTTTTTTATCAGCACAGAAAAATATGATTCTGAGATTCAAATTGATGCTACCAATTTAACTGTAACCGTTGATTCAGGTGTGAAACTTCGTCAATTGATTGATGAAGTTGAGAAAAATGGGTTTAGTTTAGTTTCTGCACCTTATTGGGAAGGTGTTACAATTGGAGGTGTAATTAGCACTGGTGCACATGGTAGTTCTTGGTGGGGTAAAGGTGGTGCTTTTCATGATTATGTTTTAGGGATTAATATTGTTGTTCCTGGTTCTAAATCTGAAGGGTATGCTAAGATTTTGAAGTTGGATAAACATGATCCTTTGTTTAATGCTGCTATAGTTTCTCTTGGAGTTTTGGGTGCTATCTCTAAGGTAAAGTTATCTATTGAGCATAGGTTCAAAAGAAGCATAACCTTCAATTTCACTGATGATAATAATATTGAAAATGAATACATAGAACATGCAAAGAAGTATGAGTTTGCAGACATAACTTGGTATCCATCAAGACACACAGCCGTTTATAGATATGACTTCAGGGTTCCCTTAGATACCAGTGGTGATGGAGTCTATGATTTCATTGGATTTCAAGCTAATAACATCTTAATCTCTGAGTCAGTTAGAGGAGCAGAAAAATTGTTGGAAAACTTAGGAAACACAAATGGAAAATGTTTAACAGCATCAACAACATTGGCATTCAAGAAATTAACAGCCAATGGTTTGAAGAACAATGGCCTAATCTTCACTGGCTACCCTGTAATTGGTTACCAAGGAAAATTACAAACTTCAGGTTCATGCTTATATTCATCAAAAATAGACACATCATGTGCTTGGGATCCAAGAATCAAAGGATTGTTCTTCTATGAATCAACAGCAATTTTCCCTGCATCAAAATTTGGAAACTTCATTCAAGATGTGAAAAAACTAAGAGATATAAATCCACAAAATTTTTGTGGTATAGACAACTATAATGGAATTATGATACGTTACATTAAAGCCTCAGAAGCATACCTAGGACAATCAGAAGATTCTATAGTGATTGATTTCAATTATTATAGAGCAAATGACCAATTTACCCCTAGATTAAACCAAGATGTGTGGGAGGAATTGGAACAAATTGCATTTTTTAAGTATGGTGCTAAGCCACATTGGGCTAAGAATAGGAACTTAGCATTTATAAATGTGAAAAATAAATATCCTAAGTTTAATTTATTTATTGATGCTAAAAATAAAATGGATCCACAAAATGTGTTTTCTGGTGATTGGTCAGATGAGATTTTATATGGGAAGGAATTGGTAAAATTTGATGGTTGTGCTTTGGAAGGACAATGTATTTGTTCTGAAGATAGACATTGTAGTCCACAAAAAGGGTATTATTGTAATTATGGTCTTGTCTACAAGGATGCTAGGGTTTGTAGGAAATTGTCAACCTTTGTGAACACTGATTCACTCCAATGA 1767 0.3441 MGFIWWILGIIHILPLFIIDSIPLIHSLTPQSPIQCNQTICTLKNSYGTWNDRKTCYALNVTYPTTEQQLRLAVSYVVQNNLKAKIVTKFSHTIPTLSCPQQNKNQAFFISTEKYDSEIQIDATNLTVTVDSGVKLRQLIDEVEKNGFSLVSAPYWEGVTIGGVISTGAHGSSWWGKGGAFHDYVLGINIVVPGSKSEGYAKILKLDKHDPLFNAAIVSLGVLGAISKVKLSIEHRFKRSITFNFTDDNNIENEYIEHAKKYEFADITWYPSRHTAVYRYDFRVPLDTSGDGVYDFIGFQANNILISESVRGAEKLLENLGNTNGKCLTASTTLAFKKLTANGLKNNGLIFTGYPVIGYQGKLQTSGSCLYSSKIDTSCAWDPRIKGLFFYESTAIFPASKFGNFIQDVKKLRDINPQNFCGIDNYNGIMIRYIKASEAYLGQSEDSIVIDFNYYRANDQFTPRLNQDVWEELEQIAFFKYGAKPHWAKNRNLAFINVKNKYPKFNLFIDAKNKMDPQNVFSGDWSDEILYGKELVKFDGCALEGQCICSEDRHCSPQKGYYCNYGLVYKDARVCRKLSTFVNTDSLQ* 589
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tpr1g3182 588 Gene3D - 392 492 - -
Tpr1g3182 588 TIGRFAM pln_FAD_oxido: plant-specific FAD-dependent oxidoreductase 30 576 IPR010030 -
Tpr1g3182 588 PANTHER GULONOLACTONE OXIDASE 26 577 - -
Tpr1g3182 588 PANTHER L-GULONOLACTONE OXIDASE 3 26 577 - -
Tpr1g3182 588 ProSiteProfiles PCMH-type FAD-binding domain profile. 54 236 IPR016166 GO:0071949
Tpr1g3182 588 SUPERFAMILY FAD-binding/transporter-associated domain-like 44 233 IPR036318 GO:0050660
Tpr1g3182 588 Gene3D - 117 234 IPR016169 -
Tpr1g3182 588 Pfam FAD binding domain 61 193 IPR006094 GO:0050660
Tpr1g3182 588 Pfam D-arabinono-1,4-lactone oxidase 429 527 IPR007173 GO:0003885|GO:0016020
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tpr1g3182 Tpr-Chr1 36280036 36284786 Dispersed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tpr1g3182 K00103 - gmx:100778616 907.131
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Tpr1g3182 1 36280036 36284786 Tpr1g3182 1 36280036 36284786 ECH