Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Sto5g1314 ATGCTGATTGACGTCCTTGATGGCTCAAAAGTCCAGGAAGACGATCCTGCATGCTTTATGCCTGTTTTGGAGAAAGCACCAAAATCTAAAGGTTACCAATTTCTTTTGGCAAGTTTGTCTTCCCAAGAACAATATAATCCATCCGATATTGGGACCAAAGCAGAGTTACATCACATAGATTTGGTCATTGAAGATACATTCAATCAGTTTCACTTTTCTAGGTTACACTGGTGCCTCATTTCATTTTCTGAGAAATCTATTTCTGAAATGTATAGTTTGTTAATTAGCAAGAAAAGGTTTCAGGATGCTCTAAATTTTGCTCGTAATCATGGACTGGATAAGGATGAAGTTCTAAAGTCACAGTGGTTGAATTCTAGCCAAGGGtccaatgaaataaaaatgtttttatcaAATATTGAGGACCGGGATTTCATACTTTCTGAATGCGTTGACAGAATTGGACCAACAGAGGACTCTGTGAAGGCTTTGCTTGAATACGGTCTCTGCATCACTGACCAGAATCGATTTTCAGAAGTAGACTATCCTAATGGTAGTCAAGTTTGGGATATTCGCTTGGCTAGACTTCGATTATTGCAATTTAGGGACAGGCTTGAGACATATCTCGGGATAAACATGGGCAGGTTTTCTGTGCAGGAATACAGTAAATTCCGTGTTATGCCTATTAGTGAAGCTGCTGTTGCACTCGCAGAAAGTGGAAAGATTGGTGCCCTAAACTTGCTCTTTAAGCGTCATCCATATTCATTGACTCCTTCTATGTTGGAAATATTAGCTGCCATCCCAGAAACAGTTCCTGTGCAAACATATGGGCAGCTTCTTCCTGGGATGTCTCCTCCTTCTGGTGTTGCTGTGAGGGAAGATGATTGGGTTGAATGTGAGAAGATGATTCACTTCATTAATGAGTCAGTTAATAGCCCTGACATTAGCATCCAAGTCAAAACTGAACCTATTGTCAAACACAGTCTTGGATTTTCTTGGCCTTCAACTGATGAACTCTCTAAATGGTATAAAGATAGAGCTAGAGCTATGGATAGTTTTAGTGGGCAGTTGGATAATTGCCTTAGCTTGCTTGACTTTGCTAATCGCAAAGGTATATCTGAGTTGCAGCAGTTCCATCAGGATGTCTTGTACTTGTATCAAATTATTTACTCTGATGATACGGGTGGTGAAATATGCTTCAACATGAGTCTTGTGTCATGGGAACAATTGACAGACTATGATAAGTTTAAAATTATGCTTAAGGGAGTCAATGAGGAAAATGTGGCTGAAAAATTACACAATAAAGCAATTCCATTTATGCATGAAAGGTTTAATAAGGTACCCCTTAAGGAAGATGTCCATCTCTGCAATTCTGCAAATCAAAACAAAGAGGAGTCATTTCTTGTCAGATGGTTGAAGGAAATTGCTTTGGAGAATAAATTGGACATATGCTTAGTGGTAATTGAGGAAGGCTGCAGAGACTTTCAAATTAATGTCTACTTCCAAAATGAGGCTGAAGCTGTTGATTGTGCTTTGCAATGCATATATCTGTCCACGGTCACTGATAAGTGGAGTATCATGGCAGCAATATTATCTAAGCTTCCTCAACTGCAAGATGGTGCAATGCAAGTTGAAAACTTTGAAAGAAAACTCAAAGTTGCAGAAGGCCATATTGAAGCAGGGAGGCTTTTGGCATATTACCAGGTCCCGAAGCCAATAAACTTTTTCCTAGAGGCCCATTCAGATGGAAAGAGTGTAAAACAGATTATTCGCCttatattttctaaatttataCGACGTCAGCCTGGCCGATCAGATAGTGAATGGGCCAACATGTGGCGTGATATGCAATACTTGAGGGAAAAAGCATTTCCTTTTCTGGACCTTGAGTATATATTGGTTGAATTCTGCAGAGGACTTCTTAAAGCTGGAAAGTTTTCTCTTGCAAGAAATTACTTGAAGGGTACTAGTTCAGTTGCTTTGGCACCAGAGAAGGCAGAAAACCTTGTCATTCAAGCAGCAAGAGAGTATTTTTTCTCAGCTTCAAGTCTTGCGTGTTCTGAAATCTGGAAGGCTAAAGAATGTCTTAATCTATATCCGAGTAGTGGATATGTGAAGGCGGAGGCAGATATGATTGATGCACTCACAGTTAAGCTCCCAAGCCTTGGAGTGACACTCCTGCCTATGCAGTTCAGGCAAATAAAAGATCCTATGGAAATTGTGAAAATGGCAATTACAAGTCAATCTGGGGCATATTTACATGTTGATGAACTAATTGAAAGTGCCAAACTTCTTGGCTTAAGGTCTCCAGATGACATATCAGCTGTTGAAGAAGCTATTGCTAGAGAAGCTGCTGTTGCTGGTGATTTACAGTTGGCATTTGATCTTTGTCTTGTTTTAGTAAAAAAAGGACATGGTAGTATATGGGATTTATGTGCTGCAATTGCACGGGGTCCTGCCCTTGAAAATATGGATGTGAACTCGCGAAAGCAACTACTAGGTTTTGCTTTGAGTCACTGTGATGAGGAGTCTATTGGTGAGCTTCTCCATGCATGGAAAGACCTGGACATGCAAGGACAGTGTGAGACATTAATGATGTCCACAGGAACAAATGCTTCAAACTTCTCAGTGCCAGGTTCATCTGTAGTCTCGCTTTCTGAGAAAAGCCTTCCAAATATGCTAGACCTGAATGATTTTGTTCAACAGTCTGATAGTGGTATCACTTACAACCAGAATGTTCATCTTGATAAAATTAGAGACATTGTCTCCGTTGTAGCTAAAACCTCAGCTGTTGAAGATGGAACAGATTGGGCATCAGTTTTGACAGAAAATGGTAAAGTTCTGTCTTTTGCTGCTTCAGAACTCCCATGGTTGCTTAAATTGAGTAGGAGAGAACTTGATAAGAAAGGTGATAATGGAAAGCTGTATGTAAATGCTAGAACCCATGCTGTGGTTACCATTTTGTCCTGGTTGGCTAAAAATGGATTTGCCCCAAGAGACAATCTGATTGCTTCTCTAGCAAAATCATTTATGGAACCACCCGTTACCGAAGAGGAAGACATAATTGGCTGCGCCTATCTTTTGAATCTTGTGGATGCCTTTAGTGGGGTAGAGATTATAGAAGAGCAgctcaaaataagaaaagattacCAAGAAGTTTCTAGAATCATGAATGTGGGGATGACATACAGCTTACTACACAACTCTAGAATTGGAACTAACCCTGGTCAGAGGAGGGAGCTGCTGCTGAGGAGATTTAAAGAAAAGCACGCCCCACCCAGTTCTGATGACATTGACAAAATTGGCAAAGTACAGTCTTCATTTTGGAGAGAGTGGAAACTAAAATTAGATGAGCAAAAGCGTCTGGCTGAGCATTCTAGAGCACTGGAGAAAATTATTCCTGGAGTTGAAACAGAGCGCTTTCTTTCTGGGGACTCCCTCTACATTGAGAGTGTTATTCTCTCTCTCATTGAGTCAGTAAAGTTCGAGGAAAAGAATATTTTGAAGGACATATTAAAATTAGCTGATACCTATGGCTTGAATTGTACTGAGGTGTTATTGCGGTACCTAAGTGCTGTCCTTGTTTCTGATGTTTGGTCGAATGATGATATTACAGCCGAAATTGCAAATTATAAAGGTGAAATAATTGTTAACAGTGCTGAAACCATTAAAACTATAACAATGATTGTATACCCTGCGGTTGATGGGTGCAACAAGCTTCGCCTTGCTTATCTATACAGCCTGCTGTCGGAGTGCTATTTGCAGCTGGAAAAAACTGAAGAAACATCACTGTCAATGCACCCGGATCAAGAAAATGGAAATCTAAGGTTATCACATTATTACAAGGTCATTGAGCAAGAATGCAGAAATGTTTCCTTTATTAATAAGCTGAACTTCAAAAATATAGCTGGGTTAGGTGGTTTCAACTTTGAGTGCTTCAGCAATGAAGTTTATGCACATATTGATGAAAATAACTTGTCAGCTTTGGCAAAAATGGTAGAAGCACTTGTCAACTTTTATAATGGTTCATTACCTGAGAATTTCATGTCGTGGCAGGATGTTTATAAGTATTATATACTGAATTTACTGAGAGCTTTGGAGACTAGGGCTACTACTGATTTTAGTATTAGAACTCCAGAATACCTTCAAGGATTTTTAAGTAAGCTTGAACAGAGCTATGATTCGTGCCAGGTGTATATTAGACATCTGAGACAGTCTGATGCTTTGGGGATCATGAAGCAGTACTTCACTGCAATTTTGTCTCTTTACAGTTCATATGGAAACCTACCTGATGACTCAGCATGGCAAGACAGCCTCATTATTCTTATAAACTTTTGGATGAGATTGACTGATGAAATGAAGGAAATTATATTGGAAGAAAATACAGGAGAGACTATGGGCTTTAATTCAGAATGCTTATTGAGTTGTCTGAAGGTTTTTATGAGATTGGTGATGGAGGATATCATCTCACCCAGTCAGGGCTGGGGTACCATATTTGGTTATGCCAATTGTGGATTAAGTGGTGATTCTACTAcagaaatttataatttctgcAGAGCTATGGTTTTTTCTGGTTGTGGATTTGGAGCTGTTGCAGAAGTTTTCTCACTTGTATCATCAGAGTATTCAACTGGTTCAACTTATGATTGTGGCACAGGTTCCCAGGGTCTTCCTCGTTTCTATTTAGATATTCTGGAACCTGTTCTACTGGAATTGGTTAATGGATCCCATGAGAACCAGAATTTATGTCATATATTGTCATCACTAAGCAAGCTAGAAggtgatttaaaaattatgaaatgtgTCAGACACGTAATTTGGGAAAGAATGGTCCAATTCTCTGATGATCTACAGTTACCAAGTTCCATCAGAGTTTATGTGTTAGAGCTCTTGCAATTCATCTCAAGTAAATCTATTAAGGGTTTCTCTGCTGAAATACAGGCCAATGTCATGCCATGGGAAGAATGGGATGAGTTGCTTTATACTAGTAGAAAGAGCGAGATTGATGTTGACCAGGGTTTGTCAGATCAGAAAGACTCTTCTAGTAGGTTTACAAATACTTTGGTAGCTCTGAAGTCATCCCAGCTTGTGGCATCAATCTCATCCAGCATAGAAATTACCCCTGATGACCTCTTGAATGTGGATTCTGCTGTTTCATGCTTTTCTAGGTTGTGTAGAGAAGCGAGTACAGATCTCCATTGTGATGCTTTGGTAGCTATTTTGGAGGAGTGGGATGGCCTTTTCACTACAAGAAACGTTGGGGAAACTACTGCTGAAGTATCTGATGGAGGAAATGACTGGAACAATGATGATTGGGAtgagggatgggaaagccttgAGGAAGCAGAAAATgttgtgaaagaaaagaaagaggactCAGTTTCCGTTCACCCTTTACATATATGTTGGGCAGAGATGTTTAGAAAGCTTATAAGCCTATCAAGGTTTAGTGATGTGATAAGACTGATTGATCGATCATCAGTAAAATCTAGTAGAACATTGCTCGATGAAAATGGTGCCCAGAGCTTAAGCCAGATAGCACTTGACCTGGATTGCTTCAATGCTTTGAAGATGGCACTATTGCTACCCTACAAAACATTACAGTTGCAGTGCCTGGGTGCAGTTGAGGAAAAATTGAAACAAGGCATTCCAGGAAAACACAGCAGAGACCACGAGTTCTTAATTCTTGTTTTATCATCTGGGATCATTTCTTCCATAATCACTGACTCTACCTTTGGTGCTACTTTCTCTTATGTCTGCTATTTGATTGGGAACTTATCTCATCAATGTCAAGCAGCCCTGTTATCTGGTCATTCTCAGAAAGGGAATAACAATAGTGAAGAACATGAGAATGAGTTGCTTCTTTTCAGAAGGATCATTTTCCCTAATATTATATCTGAGCTTGTGAAATCTGATCAGCATGTTCTAGCTGGATTTCTTGTCACTAGATTTATGCATACTAATGCATCACTCACTCTCATTAACATTGCTGATGCCAGTCTTAATAGGTATTTGGAGAGGCAGCTCCACATTCTACAGGCCAACGACTTACCTGTTGAGAAGACATGTAATACACTAAAGAATACTGTTAGCAGCTTGAGAGGCAAGCTGAAAAATGTGATTCAATCCACATTGCCTTTGCTTTCTGCTAGTTAG 6153 0.3883 MLIDVLDGSKVQEDDPACFMPVLEKAPKSKGYQFLLASLSSQEQYNPSDIGTKAELHHIDLVIEDTFNQFHFSRLHWCLISFSEKSISEMYSLLISKKRFQDALNFARNHGLDKDEVLKSQWLNSSQGSNEIKMFLSNIEDRDFILSECVDRIGPTEDSVKALLEYGLCITDQNRFSEVDYPNGSQVWDIRLARLRLLQFRDRLETYLGINMGRFSVQEYSKFRVMPISEAAVALAESGKIGALNLLFKRHPYSLTPSMLEILAAIPETVPVQTYGQLLPGMSPPSGVAVREDDWVECEKMIHFINESVNSPDISIQVKTEPIVKHSLGFSWPSTDELSKWYKDRARAMDSFSGQLDNCLSLLDFANRKGISELQQFHQDVLYLYQIIYSDDTGGEICFNMSLVSWEQLTDYDKFKIMLKGVNEENVAEKLHNKAIPFMHERFNKVPLKEDVHLCNSANQNKEESFLVRWLKEIALENKLDICLVVIEEGCRDFQINVYFQNEAEAVDCALQCIYLSTVTDKWSIMAAILSKLPQLQDGAMQVENFERKLKVAEGHIEAGRLLAYYQVPKPINFFLEAHSDGKSVKQIIRLIFSKFIRRQPGRSDSEWANMWRDMQYLREKAFPFLDLEYILVEFCRGLLKAGKFSLARNYLKGTSSVALAPEKAENLVIQAAREYFFSASSLACSEIWKAKECLNLYPSSGYVKAEADMIDALTVKLPSLGVTLLPMQFRQIKDPMEIVKMAITSQSGAYLHVDELIESAKLLGLRSPDDISAVEEAIAREAAVAGDLQLAFDLCLVLVKKGHGSIWDLCAAIARGPALENMDVNSRKQLLGFALSHCDEESIGELLHAWKDLDMQGQCETLMMSTGTNASNFSVPGSSVVSLSEKSLPNMLDLNDFVQQSDSGITYNQNVHLDKIRDIVSVVAKTSAVEDGTDWASVLTENGKVLSFAASELPWLLKLSRRELDKKGDNGKLYVNARTHAVVTILSWLAKNGFAPRDNLIASLAKSFMEPPVTEEEDIIGCAYLLNLVDAFSGVEIIEEQLKIRKDYQEVSRIMNVGMTYSLLHNSRIGTNPGQRRELLLRRFKEKHAPPSSDDIDKIGKVQSSFWREWKLKLDEQKRLAEHSRALEKIIPGVETERFLSGDSLYIESVILSLIESVKFEEKNILKDILKLADTYGLNCTEVLLRYLSAVLVSDVWSNDDITAEIANYKGEIIVNSAETIKTITMIVYPAVDGCNKLRLAYLYSLLSECYLQLEKTEETSLSMHPDQENGNLRLSHYYKVIEQECRNVSFINKLNFKNIAGLGGFNFECFSNEVYAHIDENNLSALAKMVEALVNFYNGSLPENFMSWQDVYKYYILNLLRALETRATTDFSIRTPEYLQGFLSKLEQSYDSCQVYIRHLRQSDALGIMKQYFTAILSLYSSYGNLPDDSAWQDSLIILINFWMRLTDEMKEIILEENTGETMGFNSECLLSCLKVFMRLVMEDIISPSQGWGTIFGYANCGLSGDSTTEIYNFCRAMVFSGCGFGAVAEVFSLVSSEYSTGSTYDCGTGSQGLPRFYLDILEPVLLELVNGSHENQNLCHILSSLSKLEGDLKIMKCVRHVIWERMVQFSDDLQLPSSIRVYVLELLQFISSKSIKGFSAEIQANVMPWEEWDELLYTSRKSEIDVDQGLSDQKDSSSRFTNTLVALKSSQLVASISSSIEITPDDLLNVDSAVSCFSRLCREASTDLHCDALVAILEEWDGLFTTRNVGETTAEVSDGGNDWNNDDWDEGWESLEEAENVVKEKKEDSVSVHPLHICWAEMFRKLISLSRFSDVIRLIDRSSVKSSRTLLDENGAQSLSQIALDLDCFNALKMALLLPYKTLQLQCLGAVEEKLKQGIPGKHSRDHEFLILVLSSGIISSIITDSTFGATFSYVCYLIGNLSHQCQAALLSGHSQKGNNNSEEHENELLLFRRIIFPNIISELVKSDQHVLAGFLVTRFMHTNASLTLINIADASLNRYLERQLHILQANDLPVEKTCNTLKNTVSSLRGKLKNVIQSTLPLLSAS 2050
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Sto5g1314 2050 Pfam Secretory pathway protein Sec39 232 855 IPR013244 GO:0006890
Sto5g1314 2050 PANTHER NEUROBLASTOMA-AMPLIFIED SEQUENCE 3 2004 - -
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Sto5g1314 K20473 - gmx:100805223 3111.63
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Sto5g1314 5 8981526 8991080 Sto5g1314 5 8981526 8991080 ECH