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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Ssu9g1432 ATGGCGCTAACCGTTgtctctctcttcttcctcttcttcacCTTTCACCTTCCCTTCTGTTTCTCCGGACAATCGAGCTCCATGGAATCAGTTCCTGATCTTCAGAACACTATGTACGCTGCTATCGATGGATATCCTTGCGTGCGACTGCTAAATCTTTCTGGAACCATCGGTTGTTCAAATCCTGGACGAGATAAGGTTGTGGCTCCAATTGTAAGGTTCGAAAATGTTGACAAACTAGCAGAGCCATCTGCTATATTGGTGTCACTGGATGAGTTTCCAACTCTCTTTACTAGAATATCAGATGACTCTAGCTTTGCTAGTAAAGTTGGCGGTGTACTGGTTGAACCAGGAACTGATTTGCAGAAtaagttaaaggGCTTCTCTCCGGATCAAAAGTTTCCACAAGCTCAATTCGCTCCATACCATAATACCAGCTATGAATGGAATCCAATTGGTTCTGGTATTATGTGGAAATCCTACAGTTTTCCTGTGTTTTTACTCACAGAAAGCGGCTCAAAGACTCTTCAAGAGTTTGTAACAAAGACTGAGGACAAAAAGAAAGCTTATACTTCTAATGTGGCTGAGTTTGATCTGGTGATGCAGACAGTGAAATCTGGAACTCATGATTCAGAGTCTTGTTTAAAAGAAGCAACTTGCCTCCCTTTAGGTGGATACAGTGTCTGGTCATCTCTTCCTCCGATCAACATTTCATCCTTACAACAGTCTAAGCCCATTTTATTGACAGTAGCATCTATGGATTCTGCTTCATTTTTTCGGGACAAAAGCCTTGGTGCAGACTCCCCTATTTCTGGTTTAATTGCATTACTAGCAGCTGTTGATGCACTTTCTCATTTGGATGGTCTTGGTGACCTTAGTAAACAGCTTGTTTTTGCAGTTTTCACCGGAGAGGCATGGGGCTACCTTGGAAGTAGGAGATTTTTGGTAGAACTTGACATGCACTCAGATGCTGTTCATGgccttaatcatacattaattGAAACGGTCATTGAAATTGGTTCTGTTGGAAAGGGTCTCAGTCAAGGTGTTAAAAATTTTTTTGCTCATACAGAAGGGGATTCTTCTGCCACAAATCAGACAATGGTTGCCTTGAAACGTGCACAGGAGTCGCTGCTATCTGAAAACATAAAGATAGCATCTGCAAGTGCCTCAAATCCTGGGATACCTCCATCCTCTTTAATGACCTTTTTGGAGAAGAATCCTGCAATCTCTGGCGTTGTCCTAGAAGATTTTGACTCTGTCTTTGTCAACAAGTTCTACCATAGTCATCTTGATGATTTATCAAATGTAAATTCATCAGCTGTAGTTGCTGCTGCTTCTCTTATTGCCCGAACCCTTTACATGCTCGCTAGTGAAACTCAGGATGTACAAGATTCAACTTTGGCTGCTATAAATGTTAACGTGTCACTTGTTGAACAACTTATGGGTTGCTTGTTGGACTGTGATCCTGGTCTTTCTTGCGAATTGGTGAAGAAATATATTTCACCCATGTCAACTTGTCCAAGCCATTATGTTGGTGTTATCTTGGACGAACCTTCTTCTACACCATATACAGGATATATCACTGATGTTCCTAGGTTCATCTGGAATTTTCTGGCCGACAGGACTTCTATCCTGAGGGAGAATAATAGCTCAGGTTGTCAACAAGGTTGCAATGGTAGAGATGAAGTTTGCATCAAAGCAGAGACTGATGGCAAGGGAGTTTGTGTTCTCTCTACAACGAGGTATGTCCCAGCATATTCAACACGGCTAAAATTTGAATCAGGAGTGTGGAATGTTTTGCCCCCTAATTCCTCTGACAAAATGGGGGTTGTGGACCCTGTCTGGACAGAGAGCAACTGGAATTCAATAGGTATGCGGGTCTACACAGTCCAAAATGCTGCTTATGATCGTTTTGTTCTGTTTGGGGGCATCACTCTGACAATCTTCGCATACCTTGCAATAGCAACCGCAAGAATCTTCTTCTCCAAAGCAACGAAGAGGGATTGA 2010 0.4129 MALTVVSLFFLFFTFHLPFCFSGQSSSMESVPDLQNTMYAAIDGYPCVRLLNLSGTIGCSNPGRDKVVAPIVRFENVDKLAEPSAILVSLDEFPTLFTRISDDSSFASKVGGVLVEPGTDLQNKLKGFSPDQKFPQAQFAPYHNTSYEWNPIGSGIMWKSYSFPVFLLTESGSKTLQEFVTKTEDKKKAYTSNVAEFDLVMQTVKSGTHDSESCLKEATCLPLGGYSVWSSLPPINISSLQQSKPILLTVASMDSASFFRDKSLGADSPISGLIALLAAVDALSHLDGLGDLSKQLVFAVFTGEAWGYLGSRRFLVELDMHSDAVHGLNHTLIETVIEIGSVGKGLSQGVKNFFAHTEGDSSATNQTMVALKRAQESLLSENIKIASASASNPGIPPSSLMTFLEKNPAISGVVLEDFDSVFVNKFYHSHLDDLSNVNSSAVVAAASLIARTLYMLASETQDVQDSTLAAINVNVSLVEQLMGCLLDCDPGLSCELVKKYISPMSTCPSHYVGVILDEPSSTPYTGYITDVPRFIWNFLADRTSILRENNSSGCQQGCNGRDEVCIKAETDGKGVCVLSTTRYVPAYSTRLKFESGVWNVLPPNSSDKMGVVDPVWTESNWNSIGMRVYTVQNAAYDRFVLFGGITLTIFAYLAIATARIFFSKATKRD 669
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Ssu9g1432 669 PANTHER NICASTRIN 17 668 IPR008710 GO:0016021|GO:0016485
Ssu9g1432 669 SUPERFAMILY Zn-dependent exopeptidases 219 454 - -
Ssu9g1432 669 Pfam Nicastrin 245 454 - -
Ssu9g1432 669 Gene3D Zn peptidases 172 473 - -
Ssu9g1432 669 Pfam Nicastrin small lobe 46 203 IPR041084 -
Ssu9g1432 669 CDD M28_Nicastrin 40 622 - -
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Ssu9g1432 K06171 - gmx:100801506 1238.02