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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Ssu3g2695 ATGCCTGCAGCGTTGCCGGCTGATGATGATAAGCCTTACTATGGAGGCCCACCATACTACAACTATCCATATCCAACACCACCACCTTATAATGCAGAGTACCCACCCTACTCTTACAAACCACCTCCATATTACTATCAATCGCCACCTCCTTATGAACACAAGTTCCCTCCATACTACTATAAATCCCCATATCTGCCACCATCACCTCCTTATCCCTACAAATTCCCTCCATATGACTATCAATCGCCACCTCCTTATCCCTACAAATTCCCTCCATATTACTACAAATCTCCACCACCTCCCTATGTCTACaaatcacctccaccaccaccttatGTCTACAAGTCCCCTCCTCCCCCACCATATGTTTACAAGtcaccacctccacctccctATGTCTACaaatcacctccaccaccaccttatGTCTACAAGTCCCCTCCTCCCCCACCATATGTTTACAAGtcaccacctccacctccctATGTCTACacatcacctccaccaccaccgtATGTTTACAAATCCCCTCCTCCACCACCATATGTTTACAAGTCACCGCCTCCTCCGCCATATGTTTATGCAtccccaccaccacctccatACGTTTACAAGTCACCTCCCCCACCATCACCTCCTCCATATTACTACAAATCTCCACCTCCACCCTATGTTTACAAGTCACCACCACCTCCTCCCTATGACTACAAGTCCCCACCCCCACCTCCTCCATATTACTAG 744 0.3911 MPAALPADDDKPYYGGPPYYNYPYPTPPPYNAEYPPYSYKPPPYYYQSPPPYEHKFPPYYYKSPYLPPSPPYPYKFPPYDYQSPPPYPYKFPPYYYKSPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYTSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYASPPPPPYVYKSPPPPSPPPYYYKSPPPPYVYKSPPPPPYDYKSPPPPPPYY 247
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Ssu3g2695 247 Pfam Extensin-like region 149 191 IPR006706 GO:0005199|GO:0009664
Ssu3g2695 247 Pfam Extensin-like region 109 161 IPR006706 GO:0005199|GO:0009664
Ssu3g2695 247 Pfam Extensin-like region 129 171 IPR006706 GO:0005199|GO:0009664
Ssu3g2695 247 PANTHER PROLINE-RICH EXTENSIN-LIKE 17 245 - -
Ssu3g2695 247 PRINTS Proline rich extensin signature 55 67 - -
Ssu3g2695 247 PRINTS Proline rich extensin signature 35 51 - -
Ssu3g2695 247 PRINTS Proline rich extensin signature 15 27 - -
Ssu3g2695 247 PRINTS Proline rich extensin signature 105 121 - -
Ssu3g2695 247 PRINTS Proline rich extensin signature 81 102 - -
Ssu3g2695 247 PANTHER EXTENSIN-2-LIKE 17 245 - -
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Ssu3g2695 - K10178 ccaj:109813380 30.0314