Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Spst1g02844 ATGGCTTCCTCAAGCTCGATTCCAGCATCCGAGGCCGTGCAGGTTCTCCTCTCCTTGCTATCCGACGACTCTTCCTCTGTCAGAGAGGCCTCCATGTCCTCTCTCAAGGACATTGCCGCGCTAAATCCTCTTCTAGTTCTCGATTGCTGCGCCGTCGTTTCGCGCGGTGGACGTCGGCGGTTCGGGAACATGGCTGGAGTTTTCCAAGTGATGGCGTTCGGAGTTCGGGCACTTGACGAGAGAGACGTTGATTCTGCTTTCATGGCGAAGCTCGCTAAGATTGCTACCGCTGAGCTGATATCGTCTAAGTTGGAGGGTGAGCAATTAGATGATTACTGTAATATTCAGAAGTTAATGAGGAAGGAGCTAAAGAGAAGTTATGAGTACACTAGGCTTATTGTTCCATCACATATTTTTGTCATTACTTTATTTGAAATGACTGTGAGGATGCGTTTGGATAAACTTCTTGATAGACTCACAGAAGAAGAAAATAATGAACTAAATTCTGATTGGCAACGTGCAGCAACAAGCCTACTTGTTGCAATAGGCTCTCATTTACCTGATCTTATGATGGAAGAAATTTTTCTTCATTTATCTGGGACAAATTCAGCACTACAGGCTATGGTTCAAATCCTTGCAGAATTTGCTTCTACTGATCCCATGCAGTTCATTCCACGTTGGAAAGGTGTACTTTCACGAATTTTGCCAATTCTTGGAAATGTACGTGACATGCATCGCCCAATTTTCGCAAATGCATTTAAGTGTTGGTGTCAAGCTTCTTGGCAATATAGTATAGACTTTCCTTCACATTTTCCTCAAGATGGTGATGTCATGTCATTTCTAAATTCTGCTTTTGAGCTTTTGTTGAGAGTTTGGGCAGCTTCGAGAGACCTAAAGGTTCGCGTGGCATCTGTAGAAGCATTGGGGCAGATGGTAGGTCTCATAACACGAGCACAGTTAAAGGCTGCCCTACCAAGGCTTATCCCTACAATATTGGACTTGTATAAAAAGGATCAAGATATAGCTTTTTTGGCTACATGCAGTCTCCACAATCTGTTAAATGCCTCTTTATTGTCTGAAAGTGGCCCTCCTATGCTTGATTTTGAGATTTCTGAGGCGTCAGTTGCTATTGAACCCCAGTTGGATGCACCATGGAACTTGTTGCAATTTCTTAAATATTGTTTTGCTGCAAGATTTCCTACAAGTAGCAGATATGAAGATTTGACTCTTGTTTTATCAACACTTCTACCTGTGGTTTCTATCAATAATGACAGCAAAGACCAATCAGATTTCTCTGTGGGGCTAAAGATGTATAATGAGGTTCAGCATTGCTTTCTGACAGTTGGCTTTGTGTACCCGGATGATTTGTTTTTGTTCCTTGTAACTAAATGCAGGTTGAGGGAAGAACCATTGACTTTTGGTGCACTTTGCATTTTGAAGCATCTTTTGCCAAGGCTGTCTGAAGCTTGGCACAGTAAAATATCTCTGCTAGTCGAAGCTGTAAAGTCCTTGCTTGAGGAGCAGAATTTAGCTGTTCGAAAGGCACTATCTGAGTTAATTGTGGTTATGGCCTCTCACTGTTACTTGGTTGGTTCGCCTGGAGAGTTGTTCATTGAATATCTTGTACGCCATTGTGCTATAACTGATCAAAATCGGAGTGATCTTGAGAACACACCAAATAAGAGAATAGAGATGAAAATCGGAGCAGTTACTTCTGGTGAATTAAGAGCAGTTTGTGAAAAAGGTCTCCTTTTGGTAACTATAACGATTCCTGAAATGGAGCATATTCTTTGGCCTTTTCTGTTGAGGATGATTATTCCACGGACCTACACGGGTGCTGTGGCCACGGTAAAAGTTCTGTGTATCTCAGAGTTGTGGCGGCATAGGTCATTTAGCAATGATATGTTGAGTGAGTGTAAAACCCGTCCTGATATACCAACTGCTGAGGAACTTCTTGCGCGCTTGGTGGTGCTTTTGCATAATCCTCTGGCAAGGGAGCAATTGGCCACCCAAATTTTGACATATCCGGGCTTCATAGGAGAAGAGATAAGTTCTGCTTCAAGGATGATAGTTTTGGCATTTATGTATTTTGTACAAGTCACAATTCCGAAGATGAAGGCATATGTTAGTGACACAGAGGACTTGAAACAGGATCCGTCTTATCAAGACACTTGGGATGACATGATAATCAATGTGAGTGTGATTGACTTGATTAACATCCTCCCCTCCCCTCCCCTTGTTCAACTGTATAAATCTTTGGATGTGATCCAAGATGCAGATTGGGTTATGTCTCTTGGAAATGTTTTTGCCAAACACTATGAACTTTATGCTTCTGATGATCAGCACACTGCACTTCTACACCGTACACTTTTGATGTTATCCATCATATTGGTATGGGGATTGGTTCGGAGTTCAGTCTGTTCATTGTTCCTGTTAATTTGGCTTTTACGCACTGGTGAAATTTGGATATGGGCCTCTGCTGTGCTTTTGTGCCTGGGCATTCTGCTTCAAAAGGTTAACGACAGAGCTTATGTACATGACAAAATAGATTGGATGTACAAGCAAGCAAATATTGCAATTCCAACTAATAGACTTGGGTTGGCAAAAGCAATGGGATTGGTTGCGGCATCACACTTGGATACAGTGTTGGACAAGCTGAAGGATATTTTAGACAATGTTGGACAAAGCATATTGCAAAGGATATTGTCAATATTCTCGGATAATTTCAGAACAGAAGAGTCTGATGACATACATGCTGCTTTAGCACTAATGTATGGATATGCTGCAAAGTATGCCCCATCAACAGTTATTGAAGCCAGAATAAATGCCCTTGTTGTTGAACTCTTGAGTTTAATGGGTACCAACATGCTCTCTCGACTTCTTAATGTGCGTCATCCCAAAGCAAAGCAAGCTGTCATCACAGCAATTGATTTACTAGGCAATGCTGTCATTAATGCTTCTGAAAGTGGCTCACCATTTCCATTGAAAAGAAGGGACCAACTGCTTGATTATATTTTAACTTTAATGGGTCGGGATGACGAAGATGGCTTTGCTGATTACAATGACCTATTGCGTACTCAGGCCCTTGCTATAAGTGCCTGCACTACGTTGGTCTCGGTGGAACCAAAATTAACAGTTGAAACTAGGAACCATGTAATGAAGGCCACTTTGGGGTTCTTTGCTATACCAAATGATCCAGTTGATGTTGTCAATCCCCTTATAGACAACTTGATTACCCTTTTATGTGCAATTCTTCTCACTGGTGGAGAAGATGGAAGAAGTCGAGCAGAGCTGCTAATGCTTATCTTGAGGCAAATTGATCAATTTGTCTGTTCGCCCATTGAGTATCAGAGGAAAAGAGGCTGCCTTGCTGTACATGAGATGCTTCTAAAGTTTCGGATGATTTGTGTTAGTGGGTATTGTGCACTGGGCTGCCATGGGAGTTGTGCACATAACAAGCAAATGGACCGAACTCTGTTTGGAAATTTTTCAAAGCTACCATCTGTATTTGTACTGCCAACTCGAGAAGCTTTGTGCTTGGGAGATAGGGTAATAATGTATCTTCCACGTTGTGCAGACCCAAATTCTGAAGTCAGAAAAATATCAGCTCAAATTCTTGATCTACTATTTAGCATCTCTCTTTCGCTTCCAAGACCTGCTGGTTCATCTATATCTGCTGAAGATATAGAATTATCATACAGGGCATTATCTTCTCTCGAGGATGTTATAGCCATATTGAGGAATGATACTTCTATTGATCCATCAGAAGTTTTCAACAGGATTGTTTCCTCCCTCAGCATTCTGTTGACAAAGGAGGAGATGGTTGCTACACTGATTGGTTGCTCAGTTGCTATATGTGATAAAATCAAGCAGACAGCTGAAGGGGCTATTCAAGCTGTTGTTGAATTTGTTACAAAGAGAGGGGGAGAATTGACTGAAATCGATATCTCAAGGACAACCCAATCGCTGATATCTGCCGTTGTGCATGCAACTGACAAGCATTTGCGTGTGGAAACTCTTGGAGCTATTTCTTCTTTGGCTGAAAATACTAGCCCAAAAACTGTTTTTGACGAAGTCCTGGCTACTGCTGGAAGGGATACGATCACAAAGGATATATCCAGGTTACGTGGGGGATGGCCTATGCAGGATGCATTCTATGCATTTTCTCAACACATGGTACTGTCGGTTTTGTTTCTAGAACATGTGATATCTGTCCTTAGCCAGATTCCGATCCTAAAAGGTGATGTGGACAGAGTTGAGGATAGCCCCGTTGATGGTCAAACAGAAGATGGCAAACTGCAAGCTGCAATTTTTGCTCTTACTGCGTTCTTCAGAGGAGGGGGAAAAGTTGGAAAAAGGGCTGTTGAACAAAACTATGCTTCTGTTCTTTCTGAGCTTACACTGCAACTTGGAAGCTGTCATGGATTAACCTATTCCGGTCAGCATGAACCATTGAGGAATCTTCTTACTGCATTTCAGGCATTCTGTGAATGTGTTGGTGATCTTGAGATGGGCAAGATTTTAGCTAGAGATGGAGAACTATCAGAAAATGAGAGGTGGATTAGTCTCATTGGAGACATTGCAGGCTGCATATCTATAAAGCGACCAAAAGAGGTACAAAATATTTGTCTATTTTTAAAAAACTCATTGGATCGACCGCAAAAATATCATAGGGAAGCTGCAGCTGCTGCACTATCAGAATTTGTTCGATATAGTGGTGGACTTGGTTCACTCTTGGAGCAGATGGTTGAGGTTTTATGTCGGCATGTATCAGATGACTCTTCAACTGTTCGCCGATTATGCTTACGAGGATTAGTGCAGATCCCATTGATTCATATACTGAAGTATACAACCCAAGTCTTGGGTGTAATATTAGCTCTTCTAGATGATTCAGATGAATCTGTTCAATTAACTGCTGTATCATGCTTACTAATGATTCTCGATTCTTCACTTGATGATGCAGTTGAGCCCATCTTGCTTAATCTTTCAATAAGGCTTCGAAATCTTCAAGCAAGCATGAATGCAAAGATGCGGGCCACTTCTTTTGCAGTATTTGGGGCCCTAAGCAAATATGGAATTGGGGCACTAAGTGAGGCGTTTGTTGAGCAGGTACATGCTGCCATTCCTCGCCTGGTCTTGCATCTTCATGATGAAGATTTTAGTGTCCGATCAGCCTGTCGGAATACCCTGAAACAAGTTTTCCCATTGATGGAAATTGAAAGATTGCTCGCCGTACTAAACACACACAGTTTCCTTTCTGATCATCGAAGTGATTATGAGGACTTTCTCCGGGACATCGCAAAGCAATTTACTCAGCATCTCCCCTCCAGAGTTGATAGTTATATGGCATCATCAGTGCAGGCTTTTGACGCACCATGGCCCATAATTCAGGCAAATGCTATATACTTCTGCAGCAGTATGCTCTCTCTATCGGACAATCAGCATATTTTAGCTGTCTATCATTCACAGGTCTTTGGTATGCTGGTGGGGAAAATGAGTCGATCACCTGATGCTGTCGTTAGAGCAACATGTTCTGCTGCACTAGGCTTGTTGCTGAAATCCTCCAATTTATGTTCATTGGTAGACTCAACATCACGGAACCATGATGCAGAGTCCACGAAAAACTAG 5628 0.4208 MASSSSIPASEAVQVLLSLLSDDSSSVREASMSSLKDIAALNPLLVLDCCAVVSRGGRRRFGNMAGVFQVMAFGVRALDERDVDSAFMAKLAKIATAELISSKLEGEQLDDYCNIQKLMRKELKRSYEYTRLIVPSHIFVITLFEMTVRMRLDKLLDRLTEEENNELNSDWQRAATSLLVAIGSHLPDLMMEEIFLHLSGTNSALQAMVQILAEFASTDPMQFIPRWKGVLSRILPILGNVRDMHRPIFANAFKCWCQASWQYSIDFPSHFPQDGDVMSFLNSAFELLLRVWAASRDLKVRVASVEALGQMVGLITRAQLKAALPRLIPTILDLYKKDQDIAFLATCSLHNLLNASLLSESGPPMLDFEISEASVAIEPQLDAPWNLLQFLKYCFAARFPTSSRYEDLTLVLSTLLPVVSINNDSKDQSDFSVGLKMYNEVQHCFLTVGFVYPDDLFLFLVTKCRLREEPLTFGALCILKHLLPRLSEAWHSKISLLVEAVKSLLEEQNLAVRKALSELIVVMASHCYLVGSPGELFIEYLVRHCAITDQNRSDLENTPNKRIEMKIGAVTSGELRAVCEKGLLLVTITIPEMEHILWPFLLRMIIPRTYTGAVATVKVLCISELWRHRSFSNDMLSECKTRPDIPTAEELLARLVVLLHNPLAREQLATQILTYPGFIGEEISSASRMIVLAFMYFVQVTIPKMKAYVSDTEDLKQDPSYQDTWDDMIINVSVIDLINILPSPPLVQLYKSLDVIQDADWVMSLGNVFAKHYELYASDDQHTALLHRTLLMLSIILVWGLVRSSVCSLFLLIWLLRTGEIWIWASAVLLCLGILLQKVNDRAYVHDKIDWMYKQANIAIPTNRLGLAKAMGLVAASHLDTVLDKLKDILDNVGQSILQRILSIFSDNFRTEESDDIHAALALMYGYAAKYAPSTVIEARINALVVELLSLMGTNMLSRLLNVRHPKAKQAVITAIDLLGNAVINASESGSPFPLKRRDQLLDYILTLMGRDDEDGFADYNDLLRTQALAISACTTLVSVEPKLTVETRNHVMKATLGFFAIPNDPVDVVNPLIDNLITLLCAILLTGGEDGRSRAELLMLILRQIDQFVCSPIEYQRKRGCLAVHEMLLKFRMICVSGYCALGCHGSCAHNKQMDRTLFGNFSKLPSVFVLPTREALCLGDRVIMYLPRCADPNSEVRKISAQILDLLFSISLSLPRPAGSSISAEDIELSYRALSSLEDVIAILRNDTSIDPSEVFNRIVSSLSILLTKEEMVATLIGCSVAICDKIKQTAEGAIQAVVEFVTKRGGELTEIDISRTTQSLISAVVHATDKHLRVETLGAISSLAENTSPKTVFDEVLATAGRDTITKDISRLRGGWPMQDAFYAFSQHMVLSVLFLEHVISVLSQIPILKGDVDRVEDSPVDGQTEDGKLQAAIFALTAFFRGGGKVGKRAVEQNYASVLSELTLQLGSCHGLTYSGQHEPLRNLLTAFQAFCECVGDLEMGKILARDGELSENERWISLIGDIAGCISIKRPKEVQNICLFLKNSLDRPQKYHREAAAAALSEFVRYSGGLGSLLEQMVEVLCRHVSDDSSTVRRLCLRGLVQIPLIHILKYTTQVLGVILALLDDSDESVQLTAVSCLLMILDSSLDDAVEPILLNLSIRLRNLQASMNAKMRATSFAVFGALSKYGIGALSEAFVEQVHAAIPRLVLHLHDEDFSVRSACRNTLKQVFPLMEIERLLAVLNTHSFLSDHRSDYEDFLRDIAKQFTQHLPSRVDSYMASSVQAFDAPWPIIQANAIYFCSSMLSLSDNQHILAVYHSQVFGMLVGKMSRSPDAVVRATCSAALGLLLKSSNLCSLVDSTSRNHDAESTKN 1875
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Spst1g02844 1875 Gene3D - 1176 1611 IPR011989 -
Spst1g02844 1875 Gene3D - 1612 1857 IPR011989 -
Spst1g02844 1875 PANTHER MAESTRO-RELATED HEAT DOMAIN-CONTAINING 163 792 IPR045206 -
Spst1g02844 1875 SUPERFAMILY ARM repeat 1193 1855 IPR016024 -
Spst1g02844 1875 SUPERFAMILY ARM repeat 11 1100 IPR016024 -
Spst1g02844 1875 Gene3D - 9 340 IPR011989 -
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Spst1g02844 K24816 - gmx:100800961 2817.72