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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Spst1g02285 ATGGAATCAGTTCCCGATCTTCAGAACACTATGTACGCTTCCATCGACGGATATCCTTGCGTGCGCCTGCTGAATCTCTCTGGAAACATCGGTTGTTCTAATCCTGGGCGTGATAAGGTTGTGGCTCCTATTGTACGGTTCGAAAATGTTGACAAAATAGCTGAGCCGTCTGCTATACTGGTGTCACTGGATGAGTTTCTAACTCTCTTTACTAGAATATCAGATGACTCCATATTTGCTAGTAAAGTCAGCGGTGTACTTGTGGAACCAAGAACTGATTTGCAGAACAAGTTAAATGGATTTTCTCCTGATCAAAAGTTTCCACAAGCTCAATTTGCGCCTTACCATAATACTAGCCATGAATGGAATACAATTTGGGTCAAAGACTCTTCAAGAGGTATTGCTCGGTATATTCATGTTCTTATAGTGGCAAAAATACTGTTTGTAACAAAGAATGAGGACAAAAAGAAAGCTTATACTTCTAATGTGGCTGAGTTTGATCTGGTCATGCAGACAGTGAAATCTGGCACACTCGATTCAGAGTCTTGTTTAAAAGAAGAAACTTGCCTTCCTTTAGGTGGATACAGTGTCTGGTCATCTCTTCCTCCAATCAACATTTCTTCCTTACAACAGTCTAAGCCCATTTTATTGACAGTGGCATCCATGGACTCTGCTTCATTTTTTCGGGACAAAAGCCTTGGGGCAGACTCCCCTATTTCTGGTTTAATTGCATTACTAGCAGCTGTTGATGCACTTTCTCATTTGGATGGTCTTGGTGTCCTTAGTAAGCAGCTTGTTTTTGCAGTTTTCACTGGAGAGGCATGGGGTTACCTTGGAAGTAGAAGATTTTTGGTAGAACTTGACTTGCACTCAGATGCTGTTCATGGCCTTAATCATACATTAATTGAAACGATCATTGAAATTGGTTCTGTTGGAAAGGGTCTCAGTGAAGGTGTAAACAACTTTTTTGCTCATACAGATGGGGATTCTTCTGCCACAAATCAAACACTGGTTGCCTTGAAACGTGCAAAGGAGTCACTGTTAACTGAAAACATAAAGATAGCATCTGCAAGTGCTTCAAATCCTGGGATACCTCCATCATCTTTAATGTCCTTTTTCGAAAAGAATCCTGCAATCTCTGGTGTTGTCCTTGAAGATTTTGACTCTGTCTTTGTCAACAAGTTCTACCATAGTCATCTTGATGATTTATCAAATGTAAATTCGTCAGCTGTAGTTGCTGCTGCTTCTCTTATTGCCCGAACCCTTTACATACTCGCTAGTGGAATTGAAGATGTTCAAGATTCAACTTTGGCTGCTATAAATGTTAATGTCTCACTTGTTGAACAACTTTTGGGTTGCTTGTTGGATTGTGATCCTGGTCTTTCTTGTGAATTGGTGAAGAAATATATTTCTCCCTTGTCAACCTGTCCAAGCCATTATGTTGGCGTTATCTTGGAGGAACCTTCATCTACACCTAATACAGGATACATCAATGATGTTCCCAGGTTCGTTTGGAATTTTCTGGCTGACAGAACTTCTATCCCGAGGGAGAACAGCTCAGATTGTCAACATGGTTGCAATGGTAGAGATGAAGTTTGCATCAAAGCAGAGACTGATGGCAAGGGAGTTTGTGTTCTCTCGACAACAAGGTATGTTCCAGCATACTCAACACGACTAAAATTTGAATCAGGAGTGTGGAATGTTTTGCCCCCTAATTCCTCTGACAAAATGGGGGTTGTGGACCCTGTCTGGACAGAGAGCAACTGGAATTCAATAGGTATGCGGGTCTACACAGTCCAAAATGCTGCTTATGATCGTCTTGTTCTGTTTGGGGGCATCACTTTGTCAATCGTCTCATACCTTGCAATAGCAACCACAAGAGCCTTTGTATCCAAAGCAATGAAGAGGGATTGA 1914 0.4138 MESVPDLQNTMYASIDGYPCVRLLNLSGNIGCSNPGRDKVVAPIVRFENVDKIAEPSAILVSLDEFLTLFTRISDDSIFASKVSGVLVEPRTDLQNKLNGFSPDQKFPQAQFAPYHNTSHEWNTIWVKDSSRGIARYIHVLIVAKILFVTKNEDKKKAYTSNVAEFDLVMQTVKSGTLDSESCLKEETCLPLGGYSVWSSLPPINISSLQQSKPILLTVASMDSASFFRDKSLGADSPISGLIALLAAVDALSHLDGLGVLSKQLVFAVFTGEAWGYLGSRRFLVELDLHSDAVHGLNHTLIETIIEIGSVGKGLSEGVNNFFAHTDGDSSATNQTLVALKRAKESLLTENIKIASASASNPGIPPSSLMSFFEKNPAISGVVLEDFDSVFVNKFYHSHLDDLSNVNSSAVVAAASLIARTLYILASGIEDVQDSTLAAINVNVSLVEQLLGCLLDCDPGLSCELVKKYISPLSTCPSHYVGVILEEPSSTPNTGYINDVPRFVWNFLADRTSIPRENSSDCQHGCNGRDEVCIKAETDGKGVCVLSTTRYVPAYSTRLKFESGVWNVLPPNSSDKMGVVDPVWTESNWNSIGMRVYTVQNAAYDRLVLFGGITLSIVSYLAIATTRAFVSKAMKRD 637
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Spst1g02285 637 Gene3D Zn peptidases 153 438 - -
Spst1g02285 637 FunFam Nicastrin 142 438 - -
Spst1g02285 637 SUPERFAMILY Zn-dependent exopeptidases 186 425 - -
Spst1g02285 637 PANTHER NICASTRIN 1 636 IPR008710 GO:0016020|GO:0016485
Spst1g02285 637 Pfam Nicastrin small lobe 19 172 IPR041084 -
Spst1g02285 637 CDD M28_Nicastrin 13 590 - -
Spst1g02285 637 Pfam Nicastrin 214 423 - -
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Spst1g02285 K06171 - gmx:100801506 1102.81