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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Seca4g10155 ATGGACATGTGGGAGCTATTCCTTGTTGCATTAATGCCAGTTCTCAATTTACTTTTGATTACTGCTATTGGTGCATGCCTTGCACTTGATCGTTTTGACATACTCAGAGGGAATGTCAGGAAGCACCTCAATATTATGGTATATTTTGTCTTCGCTCCTGCTCTTATTTGTAGCAACTTAGCTAGAACTATAACTTTGAGGAGCTTGTTTATGTTGTGGTTCTTGCCATTAAATGTTCTTATAAGAAATACTGCTGGGATAGCTCTTGGATGGTTACTTGTTAAAATAATTAGAGTTCCTCATCATCTCCATGGCCTTGTGTTAGGGTGCTGTGCTGCAGCAAATCTGGGTAGTTTGCCTCTCATTATAGTTCCAGCTATCTGTAGAGAAAGAGCCAAACCTTTTGGAGATGTGGATGTTTGCTCAAGACGTGGGTTGGCATATGCTTCTCTGTCAATGGCACTGGGACACATTTATGCTTGGTCTATTGTGTACAACATTGTTCGCATATATTCACCAAAGACCAATGTTATCAAAGTTGATGAATCCATAGTAAATAAAGAAATTGATCCAGAGAATTTCTCAAAATGCTCCACAAAATCATTGGTCATGGCAGAGGACATGTCACAACCTAATAATGATGGCAAGGATGCACTTGAAATTGAATGCAAAGTGTCTGATGGAAAAGAAATGGTTGTTGTACCAGAAAAGCCAAACATTAGGAAAAAGCTGAAAATATTAGCTGATAAGATCAACCTGAAGGCACTATTTGCACCTTCAACATTGGGAGCGATTATTGGTTTGATAATTGGTGTAGTCCCTCTATTTCGAAAACTACTAATTGGTGATAATGCCCCTTTCCGTGTGGTTAAAGACTCTGTAGCCACACTGGGGGAAGCATGCATTCCAGCAATGATCTTATTGATTGGGTCACATCTTGTAAAGGGTTTAAAAGGATTTAAAAAGCAACTTCCACTTGTTGTTGGCATTCTTGTGATTGAATTTATTGTCTTGCCAGCAATTGGTATAGGCATTATCAAAGGTGCAGTTCATTACAACTTGATCCAACCTGATCCATTATATCAGTTTGTTTTACTACTTCACTATGCCCTTCCACCTGCAGTATTGTTGAGTACAATGATTCAATTGCTCGGAGTTGGTGAGAGTGAATGCTCAGTTATCATGGTAGCAACTTATTCCTGTTCTGCAGTTTTGCTTACTGTTTGGTGCACAATCTTTCTGTGGCTTGTATTATAA 1257 0.389 MDMWELFLVALMPVLNLLLITAIGACLALDRFDILRGNVRKHLNIMVYFVFAPALICSNLARTITLRSLFMLWFLPLNVLIRNTAGIALGWLLVKIIRVPHHLHGLVLGCCAAANLGSLPLIIVPAICRERAKPFGDVDVCSRRGLAYASLSMALGHIYAWSIVYNIVRIYSPKTNVIKVDESIVNKEIDPENFSKCSTKSLVMAEDMSQPNNDGKDALEIECKVSDGKEMVVVPEKPNIRKKLKILADKINLKALFAPSTLGAIIGLIIGVVPLFRKLLIGDNAPFRVVKDSVATLGEACIPAMILLIGSHLVKGLKGFKKQLPLVVGILVIEFIVLPAIGIGIIKGAVHYNLIQPDPLYQFVLLLHYALPPAVLLSTMIQLLGVGESECSVIMVATYSCSAVLLTVWCTIFLWLVL. 419
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Seca4g10155 418 Pfam Membrane transport protein 10 409 IPR004776 GO:0016020|GO:0055085
Seca4g10155 418 PANTHER - 1 417 IPR045033 GO:0080162
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Seca4g10155 Seca-Chr4 235538154 235541800 Wgd
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Seca4g10155 K24139 - gmx:100807965 488.034