Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Seca4g02901 ATGGGAAGAGGGTTTCTTTCCATGGAGAAAACCATAAACGACGCCGTTTCCAAAAGCTTTGTTGGAAGGTACTTCAAGTTAGAAGCAAGGAAAAGCTGTTTCACCAGAGAACTTCGTGCTGCTACAGCCACTTTTCTCACCATGGCTTACATCATCACTGTCAACGCCACCATCCTTGCCGCCTCCGGCGGAACCTGCTCCGCCGCCGATTGCTCGGCTCCGGCGGGTCCAGATTGCGTGGTGAAGCCAAATGCTGGGTATGAAAGTTGTCTTGCTAAGACCAAGAGTGACTTGGTGGTGGCTACTTCTGTATCAGCCATGGTTGCATCAGTGGCTATGGGAGTCTTAGCCAACCTTCCTTTAGGCTTGGCTCCAGGTATGGGACCTAATGCTTATTTAGCTTTTAATTTGGTTGGATATCATGGAACTGGGTCTCTCTCTTACCAAACTGCAATGGCTGTGGTGTGTGTTGAGGGGTGTGCTTTTCTTTTAGCCTCTGCTCTTGGCTTAAGAGGCAAGCTTGCTAAGCTCATACCTCATTCAGTTAGGCTTGCTTGTGCTGCTGGGATTGGGCTTTTTATTGCCTTTGTGGGCTTGCAAGTTAACCAAGGTGTTGGGCTTATTGGGCCTGATCCTTCCAATTTGGTGACCATCACTGCCTGCAAAAGTACTGACCCAGAAACTGGGGCATGCTTGGGTGGAAAATTGCAAAACCCAAAGTTCTGGCTTGGTCTTGTTGGTTTCCTCATCACAAGTTATGGGTTAATGAAGAATATCAAGGGTAGCATGATTTATGGCATTCTTTTTGTAACTTTTGTGTCATGGTTTAGACACACAGAAGTGACGTATTTTCCTGATACCCCACTTGGTGATGCAAATTACAGCTATTTCAAAAAAGTGGTTGATTTTCACAAGATTGAATCCACTGCTGGGGTTCTTAGGTTTGGTGATTTTAATAGGAGGGAAGTTTGGGAGGCCTTGGCTACCTTGTTCTATGTTGATGTGATTGCCACTACTGGCATCATGTATACCATGGCAGAGATTGGTGAGTTTGTGGATGAAAAAGGAAATTTTGAAGGGGAATACATGGCTTACATGGTTGATGCAGCTGGCACAATTATAGGTTCTACATTGGGTGTTACAACCACAGCAACATTTGTTGAATCATCAGCTGGGATGAGAGAAGGGGGTCGCACTGGATTAACGGCTGTGATCATTGGGTTATTCTTCTTTGTCTCATTGTTTTTCACTCCTCTTTTTTCCAGTGTTCCTCCATGGGCCATAGGCCCTTCACTAGTGATGGTTGGGGTGATGATGATGAAGGTGGTGAAGGACATTGATTGGACCAACATAAAGGAAGCAGTGCCTGCTTTTGCTATAATGCTCCTCATGCCTCTTACTTATTCAATAGCAAATGGGATTGTTAGTGGGATTGGACTCTACATTGCTCTTAGCCTCTTTGACTATGCCACAAGCACCATCAATTGGTTGAGGAAAATGAGAAGAATGGTGATTAAGGAACAAAACCAAGTGTCTGCTACCGCAGGTCTTGACTCAACAGTGGAAATTATATGA 1575 0.4508 MGRGFLSMEKTINDAVSKSFVGRYFKLEARKSCFTRELRAATATFLTMAYIITVNATILAASGGTCSAADCSAPAGPDCVVKPNAGYESCLAKTKSDLVVATSVSAMVASVAMGVLANLPLGLAPGMGPNAYLAFNLVGYHGTGSLSYQTAMAVVCVEGCAFLLASALGLRGKLAKLIPHSVRLACAAGIGLFIAFVGLQVNQGVGLIGPDPSNLVTITACKSTDPETGACLGGKLQNPKFWLGLVGFLITSYGLMKNIKGSMIYGILFVTFVSWFRHTEVTYFPDTPLGDANYSYFKKVVDFHKIESTAGVLRFGDFNRREVWEALATLFYVDVIATTGIMYTMAEIGEFVDEKGNFEGEYMAYMVDAAGTIIGSTLGVTTTATFVESSAGMREGGRTGLTAVIIGLFFFVSLFFTPLFSSVPPWAIGPSLVMVGVMMMKVVKDIDWTNIKEAVPAFAIMLLMPLTYSIANGIVSGIGLYIALSLFDYATSTINWLRKMRRMVIKEQNQVSATAGLDSTVEII. 525
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Seca4g02901 524 Pfam Permease family 92 473 IPR006043 GO:0016020|GO:0022857|GO:0055085
Seca4g02901 524 PANTHER XANTHINE/URACIL PERMEASE C887.17-RELATED 8 511 IPR045018 GO:0015205
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Seca4g02901 Seca-Chr4 49976543 49978117 Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Seca4g02901 K06901 - gmx:100808299 832.787
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Seca4g02901 4 49976543 49978117 Seca4g02901 4 49976543 49978117 ECH