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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Seca2g04197 ATGTGTATGTTACTGAGCATTACAACTCTTGTGGTCACTCATATTATTGAAGAGGAGGAAGGTGAACTGATTGAAGAAGCTGAACGTAGCCCTAAAAATCAAGAGAAAGATAAAGAGGCTTTGGGGAAGCGTCGTGAGGAATTGATTACCAGTTTACAATTGTTGGGTGATTATGAGTGCTTACTTAGTCCTCCTCAATCTGTTCTTATGGAAGCCAATCAAGCTGCTGCAAAGGCTGCTATGTTCATATCAGGAAACCCTGTTGGTAGTGGGTACTTGGAATGTATGAGCGTGAATGACTTGCCCATGAAATGTTCTGGAAACTTACGACATCTAATTGTTGAGGCTTGCATTGCAAGAAATCTACTCGACACATCAGCTTATCTTTGGCATGGCTATGTGAATGCATGCAGCAATCAAATTCCTTGTAGCATTTCTAACCATGAGGCCGGCTGGGCTTCACTGATGAAGGGATCACCGCTAACTCCTGCATTGGTTGATGTCTTGGTTGCAACACCTGCTTCCAGCTTAGCAGAGATTGAAAAAATATATGAAATTGCAATCAATGGTTCAGATGAAGAAAAGATATCTGCCGCTACCATTCTGTGTGGAGCATCTCTACTACGTGGGTGGAATGTACAGGAGCACACCATTCTATTTATCACAAGATTGCTCTCTCCTATGGTTTCTCCTAATTACACTGGGACTGAAAGCCATTTAATCAGCCAAGCTCCATTTTTAAACGTCCTTCTTGTTGGAATTTCTTCTGTAGACTGTGTTCATATTTTCTCCCTACATGGTTTGGTTCCATTACTTGCAGCGGGGCTAATGCTAATATGTGAGGTTTTTGGATCATGTGTTCCTGATGCCTCATGGACTCTTGCAACTGGAGAAAAACTCTCTCATCATGAGGTGTTCTCTAATGCATTTACTCTTTTGCTGAGATTCTGGCGGTTTGATCTTCTACCCGCTGAACAAGTGAGGAGGGAAGCAGCAACTCCACCATTTGGATCACTATTTAGTCCTGAATGCCTTTTATTGGTTCGAAACTGTAAATTAGCATCATTTGGAAGATCAGCAAAGGACCGACAAAAGCTCAAAAGACTGTCAAAAATTTTACATTTTCCTACGGAATCTGTATTTATGGATTCGTTTCCAAATTTTAACTTTTGGTATCGGCAACATCAAGAATGCATTGCTTCAATCTGCTCTGGTCTTGCGCCTGGAGGGCCTGTTCAGATTGTTGTTGCTCTACTAAGCATGATGTTTAGGAAGGTAAATAATGATACTGAACCTTTGACACCTACGGCTTTAGGAAGCAGTAGTTCATCCGGGTCTACATTTGATGATGCTTCAATGAAACTAAAAGTGCCTGCCTGGGATATCCTCGAAGCTATTCCCTTTGTGATGAATGCTGCTCTGACAGCTTGTGCTCATGGAAAACTCTCTACGCGTGAACTTGCCACAGGCCTCAAAGATCTAGCCGATTTTCTTCCAGCATCTTTGGTTACCATTGCAAGCTACTTTTCAGCTGAAGTTACACGGGGCATATGGAAGCCAGCTTTTATGAATGGAACTGATTGGCCTAGCCCCTCTGCAAATTTATCCCTTGTTGAACAACAGATAAAGAAAATTCTAGCAGCCACAGGTGTAGATGTCCCAAGCCTTGCTGTGGATGGGGACTCTCCAGCTACACTTCCTTTGCCTTTGGCAGCTTTTGTAAGCCTCACAATAACGTATAAACTTGAGAAAGCTACTGCTAGATTACTTGCCCTGATTGGCCCTGCTCTGAATGCCCTTGCTTCTGGATGCCCCTGGCCCTCCATGCCCATTTTGGCTTCTTTGTGGAGTCAGAAGGTGAAGCGTTGGAGTGACTATTTTGTGTTCTCAGCTTCCGGAACTGTCTTCCACCACAACAAGGATGCTGTAGTTCAACTACTAAAAAGTTGCTTCAAATCCACACTTGGGCTTGGCTCTGCCTGTATTTATAATAATGGTGGTGTTAGTGCCCTCCTTGGTCATGGCTTTGCTTCCCAAATAGCCGGTGGGATCTCTCCAGTTGCACCAGGGATTCTTTACTTAAGAGTGTATCGGTCTATTGGAGATATCACGTTCTTGACTGAAGAAATTTTGTCAATTCTAATGCTTTCAGTTAGAGACATAGCAAGTAGCGAGTTACCCAAGGGAGATGAAAAGAAACTTCAGAAAACCAAGTATGGAATAAAATTCGGACAAGTTTCTATTGCTAGATCCATGGCACGTGTCAAGCATGCCGCTTTACTCGGGGCTTCATTGGTTTGGATATCAGGTGGACAAAAGTTGGTCCAATCTTTGATAAGAGAGACTCTCCCTTCCTGGTTTTTGTCAGCTGATATGTTGAAGCAGGATGGTGGAGAATCTGGAGTTATGGTTGCTATGCTTAGAGGTTATGCACTGGCATTTTTTGTTATGCTTAGCGGGGCATTTGCCTGGGGTATTGACCAGTATTCACTTCCACCAAAACGACGAGCAAAGGTTATTGGGTTGCATTTGGAATTCCTTGCAAGCACCCTGGACAAGAATGAATCACTGCCTTGTCATTGTGCTACTTGGCGAGCCTATTTATCAGGTTTTATGAGGTTGATGGTGGGTTGCACTCCAATGTGGGTTCGGGAAATAGATGTGGATTTGTTGAAGAGATTGAGCAAGGGATTAAAGCGGTTGAATGAACATGAGTTGGCTCTTCGCCTTTTGGAAATTGGGGGGATAGACGTCATGGGTGCAGCAGCTGAAATGATAATTGAATTTGAACATAGATTTTAA 2802 0.4315 MCMLLSITTLVVTHIIEEEEGELIEEAERSPKNQEKDKEALGKRREELITSLQLLGDYECLLSPPQSVLMEANQAAAKAAMFISGNPVGSGYLECMSVNDLPMKCSGNLRHLIVEACIARNLLDTSAYLWHGYVNACSNQIPCSISNHEAGWASLMKGSPLTPALVDVLVATPASSLAEIEKIYEIAINGSDEEKISAATILCGASLLRGWNVQEHTILFITRLLSPMVSPNYTGTESHLISQAPFLNVLLVGISSVDCVHIFSLHGLVPLLAAGLMLICEVFGSCVPDASWTLATGEKLSHHEVFSNAFTLLLRFWRFDLLPAEQVRREAATPPFGSLFSPECLLLVRNCKLASFGRSAKDRQKLKRLSKILHFPTESVFMDSFPNFNFWYRQHQECIASICSGLAPGGPVQIVVALLSMMFRKVNNDTEPLTPTALGSSSSSGSTFDDASMKLKVPAWDILEAIPFVMNAALTACAHGKLSTRELATGLKDLADFLPASLVTIASYFSAEVTRGIWKPAFMNGTDWPSPSANLSLVEQQIKKILAATGVDVPSLAVDGDSPATLPLPLAAFVSLTITYKLEKATARLLALIGPALNALASGCPWPSMPILASLWSQKVKRWSDYFVFSASGTVFHHNKDAVVQLLKSCFKSTLGLGSACIYNNGGVSALLGHGFASQIAGGISPVAPGILYLRVYRSIGDITFLTEEILSILMLSVRDIASSELPKGDEKKLQKTKYGIKFGQVSIARSMARVKHAALLGASLVWISGGQKLVQSLIRETLPSWFLSADMLKQDGGESGVMVAMLRGYALAFFVMLSGAFAWGIDQYSLPPKRRAKVIGLHLEFLASTLDKNESLPCHCATWRAYLSGFMRLMVGCTPMWVREIDVDLLKRLSKGLKRLNEHELALRLLEIGGIDVMGAAAEMIIEFEHRF. 934
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Seca2g04197 933 PANTHER OS07G0681500 PROTEIN 1 928 IPR039638 GO:0016592|GO:2000762
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Seca2g04197 Seca-Chr2 126237258 126250998 Wgd
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Seca2g04197 - - gsj:114405248 1404.04
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Seca2g04197 2 126237258 126250998 Seca2g04197 2 126237258 126250998 ECH