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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Seca2g03602 ATGGGGACTCTGACGAGTTGCCGTTTCATGCCTCTGAACTCTGAGTTCCGGTTCAACCCGGTTCGGCGCGCATTCAGGGAGAGGATTCAGTGCCACAAGCTCAATAGACTAAGGAGCCCCTCTCGTTTCTTCGCCCACACAGACATATCCAAATGGGGAAAGCGGAAGAAGCACAGTCTCAATTTTGATAGGTTTAGGAGTTTCGCTAGCAATAACAATGACAAGGAAGCTATCGATGATGAAAGGGAAAGTGATGATAATAACAATGATCCTAAATCAAACGTAACGACCGAGCTGTTTGAAGAAGAGATAATACCCAGCTTTGATAATCAGGCATTTTTGTCCGAACTTCGATATAATTTCGCCGTTTTAGCAACAGATTCTTTTGGGCTAATGCCAGACGATCGTTTCCTATTGTTATTCCTTGGATATGTTGTTGATCCTTCTGATGTAAACCTAATTCTGGATAAGCTGTTTGGTTATTCAACCTTCTGGGTGACCAGAGTGGAGAGTTATGGGCGGCAGCAAGAAGGTGTTATTTTCTTTGGAAATTTAAGGGGAGAAAGAGAGGATGTTTTTAACAAACTCCAAAAACAGCTAGTTGAGGTCACAGGTGATAAGTACAACCTTTTTATGATGGAGGATCCCAGTTCAGATATTCCTGATCCGCAAGGTGGGCCACGTGTTAGCTTTGTTTTGCTGAAGAAGGCGGTTTCTGACCCAAGGGATATAAATCCTTGGCCAAATTCAAGTGCATTGTTCTTCTTCCTTCTAACTATTGCCTGCTTATTCCTCACGGGATTTGTTTTTCAGAACTACCTACTTCACCCAGCTGCTTCTGGTGCTATGGAAGACCCACTTTTGGTGCAGATATTTCCATTTCTTGTGTCCCGGTCCCCTTCACCTTCAACATCTGTTATAGTATTAGGAATCTTGGGGGTTATTCTGTTTCATGAGGTTGGACACATCCTTGTAGCATTTCCTAAACAAATAAAATTAACTGTTCCTTACTTCATTCCAGACGCCTATGTTGGCAGCATTATTACTATTAATCAGTTTATACCCATCCTTCCTGATAGAAGCACAAAAGTAGACATATCACTTGCGGGTCCCTTTGCTGGTGCTGTGTTATCATTTTTTATGTTTGCTATTGGTCTTCTTCTTTCATCGGATCCAGATGCAACAAGAGATTTGGTTGAAGTTCCTAGCTCATTGTTTCAAGCTTCGTTGCTACTTGGATTAATCAGTAGAGCAACTCTTGGTTATAAAGAAATGCATTCTGCGACAGTTTCAATTCACCCTCTTGTGATTGCAGGATGGTGTGGCTTAACCTCACAAGCTTTTAACATGCTTCCAGTGGGGCGCCTTGATGGTGGCAAAGCAATGCAGTCAATGAATTAA 1401 0.4226 MGTLTSCRFMPLNSEFRFNPVRRAFRERIQCHKLNRLRSPSRFFAHTDISKWGKRKKHSLNFDRFRSFASNNNDKEAIDDERESDDNNNDPKSNVTTELFEEEIIPSFDNQAFLSELRYNFAVLATDSFGLMPDDRFLLLFLGYVVDPSDVNLILDKLFGYSTFWVTRVESYGRQQEGVIFFGNLRGEREDVFNKLQKQLVEVTGDKYNLFMMEDPSSDIPDPQGGPRVSFVLLKKAVSDPRDINPWPNSSALFFFLLTIACLFLTGFVFQNYLLHPAASGAMEDPLLVQIFPFLVSRSPSPSTSVIVLGILGVILFHEVGHILVAFPKQIKLTVPYFIPDAYVGSIITINQFIPILPDRSTKVDISLAGPFAGAVLSFFMFAIGLLLSSDPDATRDLVEVPSSLFQASLLLGLISRATLGYKEMHSATVSIHPLVIAGWCGLTSQAFNMLPVGRLDGGKAMQSMN. 467
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Seca2g03602 466 CDD S2P-M50_like_2 256 465 - -
Seca2g03602 466 PANTHER ZINC METALLOPROTEASE EGY1 62 465 IPR044838 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Seca2g03602 Seca-Chr2 111504062 111514721 Wgd
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Seca2g03602 K25380 - gmx:100808073 498.049
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Seca2g03602 2 111504062 111514721 Seca2g03602 2 111504062 111514721 ECH