Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Seca10g00548 ATGCATTCGGTGGTAATGCATAGATACCTGTGGTGCTGCATTCTATTGGGGTATCTTTATATATCATGCCTTTCTCTTAGTTCAGGACAGCATTTGAATAGGAGTACTGGCTTAGAAGACTGGTTGGCTTATTCTGGATCACTTGTAAGAGATAATTCTCAACTCTATGATTCTGTATTTGCTGAAACTTCAACTTCATCATTCTTATTAAATGAGCCAGTTTCTTGTGAGGACTTGGAAGGTGTAGGATCTTTTAATACCACATGCTTGTTAAGCTCAACTCATTATGTGAAATCTGATATTTACATATATGGTGTTGGAAACCTGGAGATACTCTCTCATGTTTCACTTTTATGCCCTGTGGAAGGGTGCATGATAACAGTCAATGTGTCTGGCAACATTAAACTTGGTCAAAATGCATCTATTGTTGCTGGTACTGTGGTTTTATCAGCAGCCAATCTGACTATGGACTACAGTTCTTCTATAAACTCATCATCTTTGGGTGGGCCACCACCTTCCCAAACTAGTGGCACGCCCGTCGGCAATGATGGAGCTGGTGGAGGGCATGGTGGGCGTGGTGCATCCTGTTTAAAAAACAATAAAACAAACTGGGGTGGTGATGTTTATGCTTGGTCTACTTTGTCTCAACCATGGAGTTACGGAAGCAAAGGTGGTGGAAAATCTACTCAAAAACAATATGGAGGGAATGGCGGGGGGCGTATTAAGCTTCTAGTGAAGGATACTATATATGTAAATGGGTCTGTTACTGCAGAAGGAGGAGATGGAGGGTCTGATGGGGGTGGTGGCTCTGGCGGAAGTATATTGGTGCATGCCAAAAAGCTGAAGGGATATGGTACTATCAGTGCTGCTGGTGGGATGGGATGGGGTGGAGGCGGTGGAGGAAGAATATCACTTGATTGTTACAGCATACAAGAAGATTTAAAAATTACTGTCCATGGAGGTTTGAGTATGGGCTGCCCTGGGAATTCTGGAGCAGCTGGCACATATTTCAATTCAAATTTACTAAGTTTGAAAGTCAGCAATGACAATGTCACAACAGAAACAGAGACTCCTTTGCTTGACTTCTCAACCAGCCCTTTATGGTCAAATGTTTATGTGGAAAATAATGCAAAAGTTTTGGTTCCACTTGTTTGGTCCAGAGTTCAGGTAAGAGGCCAAATTAGTGTATATAGTGGAGGAAGCTTAATCTTTGGGTTGTCTGATTATCCAATTTCCGAATTTGAGCTTGTTGCAGAAGAGCTTTTATTGAGTGATTCTATCATAAAGGTTTTTGGTGCATTTAGAGTTGCTGTTAAAATGTTACTCATGTGGAATGCCACAATGCAAATTGATGGTGGTGAAAGTACTGTTGTGACTGCTTCAGTACTTGAAGTGAGAAATCTCGCTGTTCTAAGGCAAAGCTCTGTCATTAGTTCAAATACAAACTTGGGTTTATATGGTCAAGGACTGCTACAGTTGACTGGTGATGGCGATGCCATCAAAGGCCAACGACTATCCTTGTCTCTCTTCTATAATGTAACTGTTGGTCCAGGTTCTTTACTTCAAGCTCCTTTGGATGATGATGCTAGTAGAGGCACGGTGACAAAACATCTATGTGACACACAGAGATGCCCAATAGATTTAATAACTCCACCTGATGATTGTCATGTCAATTATACACTCTCCTTCTCACTTCAAATTTGTCGTGTTGAGGATCTTCTTGTAAATGGTGTTATGAAGGGAAGCATAATTCACATTCACAGGGCAAGAACTGTGATCGTTGATACTGGTGGTATGATTACTGCATCTGAATTAGGTTGCACTGAAGGTATTGGTAAGGGAAACTTTTTGAATGGAGCTGGTGGTGGTGCTGGACATGGTGGAAAAGGAGGGTCTGGATATTTCAAAGGGAGAGTGAGTATTGGTGGTAATGAATATGGAAATGCTATTCTTCCATGTGAATTGGGTAGTGGAACTGAGGGCCCTAATGAGTCATATGGGCATGTTGTTGGAGGTGGGATGATTGTGATGGGATCCATTCAGTGGCCACTTTTGACGCTTGACCTTTATGGATCCTTGAGGGCTGATGGTGAAAGCTTTAGCAAAACGATAACTATGAGTGATGGTTCTTTGGCTGGTGGTCTTGGCGGAGGTTCTGGTGGCACAGTCCTTCTTTTCCTTCAAGAACTCAGGCTTTTGGACAATTCCTCCTTATCTGTTGTCGGGGGCAATGGTGGCTCCCTTGGTGGTGGTGGTGGAGGTGGAGGTCGAATTCATTTCCATTGGTCGAAGATTGGTATGGGGGAAGAATACGTTCCTGTTGCAAGTATTAGTGGCACCATGAACTATAGTGGAGGTGCTGGGGACAATGATGGCCGTCATGGGCAGGAGGGTACCATAACTGGGAAAGCATGCCCCAAAGGCCTTTATGGAATTTTCTGTGAGGAATGTCCTATTGGTACTTACAAAGATGTTGATGGTTCTGATGCAAATCTTTGCATTCCTTGTCCTCTTGATCTTCTTCCGAATCGTGCAAATTTCATATATAAACGAGGGGGAGTTACGAAGCGCTCTTGTCCATATAAATGCATATCAGACAAGTATCGAATGCCCAATTGTTATACACCTCTGGAGGAGCTTATTTATACTTTTGGGGGTCCCTGGCCATTTTCCGTAATGTTGTCATTCATTTTATTGCTTCTGGCTCTGCTACTAAGTACTTTGAGAATCAAGTTGATTGGTTCTGGTTCATATCATAGTTCGAGTTCAATTGAACACCATAATCATCACCGTTTTCCATATCTTCTTTCTCTTTCTGAGGTGCGTGGAGCCAGAGCTGAAGAGACTCAAAGTCATGTACACAGAATGTACTTTATGGGTCCTAATACTTTTAGAGAACCCTGGCATCTTCCTTACTCACCTCCCCATGCTATTATTGAAATTGTGTATGAGGATGCTTTTAATAGATTTATTGATGAGATCAATTCGGTTGCTGCATATGATTGGTGGGAGGGATCCGTGCACAGTATACTTTCTGTTGTGGCATATCCTTGTGCTTGGTCCTGGAAGCATTGGCGACGAAGAGTCAAAATCAGTCGCCTTCAGGAATATGTCAAATCTGAATATGACCATTCTTGTCTACGCTCTTGTCGATCACGAGCTTTGTACAAAGGGATGAAGGTTGGGGCGACTCCAGATTTAATGGTAGCATACATTGATTTTTTCCTTGGTGGTGATGAGAAGCGATTAGACATTGTATCAATTATACAGAAGAGATTTCCCATGTGCATAATTTTTGGTGGGGATGGGAGCTACATGGCACCTTACAATCTTTACAGTGATACACTGTTGACCAACCTCCTTGGCCAGCATGTCCCAGCAACTGTTTGGAATCGCTTGGTAGCTGGACTGAATGCTCAGTTACGGACAGTGAGGCATGGATCAATTCGTACTGCGCTAGGTCCTGTTGTTGATTGGATAAATAGCCATGCAAATCCCCAACTTGAGTTCCATGGAGTTAAAATTGAGCTTGGATGGTTCCAAGCAACAGCTTCTGGTTACTATCAACTGGGTATTGTGGTAGCAGTTGGGGATTATTCCCTTCATGATTTGCACCAGCCTGATACTTGGGTTAGTTCTGATGAAGCTACAAGGAAAAATGTGGCACATGGAAGAAAGAATCTTAAGCAGCTGCAACATAGTTGGCCTTACATGAGCAATTCATTATCTCTTAAAAGGATAACTGGAGGAATCAATGGTGGTCTGATAAATGATGCTACCTTAAAATCATTGGACTTTAAAAGAGACCTTCTATTCCCACTTTCTCTTCTGTTGTGCAACACTAGACCTGTTGGGCGTCAGGATACTGTGCAGCTGCTGATTACTTTGATGCTCTTAGCAGATCTTTCTGTCACTCTCCTCATGTTGCTTCAGTTCTACTGGATTTCTCTTGCAGCTTTTCTTTCTGTTTTACTAATCCTTCCTCTTTCTCTACTTTCTCCATTTCCTGCTGGTTTGAATGCTTTATTCAGTAAAGAACCTAGAAGAGCTTCACTTTCTCGAGTATATGCACTGTGGAATGCTACTTCTCTATCTAATATTACATTAGAGACAACTGCCTCACAGTTAAAAGAAAATTGCATAAAGCCTTTTAAGCATAGAAAGAAGAAAGTGCAGAAGCATATGATCATATATCCTCCCTCTACTACATGA 4212 0.4217 MHSVVMHRYLWCCILLGYLYISCLSLSSGQHLNRSTGLEDWLAYSGSLVRDNSQLYDSVFAETSTSSFLLNEPVSCEDLEGVGSFNTTCLLSSTHYVKSDIYIYGVGNLEILSHVSLLCPVEGCMITVNVSGNIKLGQNASIVAGTVVLSAANLTMDYSSSINSSSLGGPPPSQTSGTPVGNDGAGGGHGGRGASCLKNNKTNWGGDVYAWSTLSQPWSYGSKGGGKSTQKQYGGNGGGRIKLLVKDTIYVNGSVTAEGGDGGSDGGGGSGGSILVHAKKLKGYGTISAAGGMGWGGGGGGRISLDCYSIQEDLKITVHGGLSMGCPGNSGAAGTYFNSNLLSLKVSNDNVTTETETPLLDFSTSPLWSNVYVENNAKVLVPLVWSRVQVRGQISVYSGGSLIFGLSDYPISEFELVAEELLLSDSIIKVFGAFRVAVKMLLMWNATMQIDGGESTVVTASVLEVRNLAVLRQSSVISSNTNLGLYGQGLLQLTGDGDAIKGQRLSLSLFYNVTVGPGSLLQAPLDDDASRGTVTKHLCDTQRCPIDLITPPDDCHVNYTLSFSLQICRVEDLLVNGVMKGSIIHIHRARTVIVDTGGMITASELGCTEGIGKGNFLNGAGGGAGHGGKGGSGYFKGRVSIGGNEYGNAILPCELGSGTEGPNESYGHVVGGGMIVMGSIQWPLLTLDLYGSLRADGESFSKTITMSDGSLAGGLGGGSGGTVLLFLQELRLLDNSSLSVVGGNGGSLGGGGGGGGRIHFHWSKIGMGEEYVPVASISGTMNYSGGAGDNDGRHGQEGTITGKACPKGLYGIFCEECPIGTYKDVDGSDANLCIPCPLDLLPNRANFIYKRGGVTKRSCPYKCISDKYRMPNCYTPLEELIYTFGGPWPFSVMLSFILLLLALLLSTLRIKLIGSGSYHSSSSIEHHNHHRFPYLLSLSEVRGARAEETQSHVHRMYFMGPNTFREPWHLPYSPPHAIIEIVYEDAFNRFIDEINSVAAYDWWEGSVHSILSVVAYPCAWSWKHWRRRVKISRLQEYVKSEYDHSCLRSCRSRALYKGMKVGATPDLMVAYIDFFLGGDEKRLDIVSIIQKRFPMCIIFGGDGSYMAPYNLYSDTLLTNLLGQHVPATVWNRLVAGLNAQLRTVRHGSIRTALGPVVDWINSHANPQLEFHGVKIELGWFQATASGYYQLGIVVAVGDYSLHDLHQPDTWVSSDEATRKNVAHGRKNLKQLQHSWPYMSNSLSLKRITGGINGGLINDATLKSLDFKRDLLFPLSLLLCNTRPVGRQDTVQLLITLMLLADLSVTLLMLLQFYWISLAAFLSVLLILPLSLLSPFPAGLNALFSKEPRRASLSRVYALWNATSLSNITLETTASQLKENCIKPFKHRKKKVQKHMIIYPPSTT. 1404
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Seca10g00548 1403 MobiDBLite consensus disorder prediction 163 192 - -
Seca10g00548 1403 PANTHER EPHRIN TYPE-B RECEPTOR 61 1376 - -
Seca10g00548 1403 SMART GCC2_GCC3_2 811 859 - -
Seca10g00548 1403 MobiDBLite consensus disorder prediction 163 181 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Seca10g00548 Seca-Chr10 4961018 4977859 Dispersed/Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Seca10g00548 - - gmx:100784489 2352.01
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Seca10g00548 10 4961018 4977859 Seca10g00548 10 4961018 4977859 ECH