Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Rops5g01192 ATGGAAGATAACAAAGACCAGGATTACTTATCCAACAGATTCCCAACTACCTCTCAGGTGGTGGAAGAGTTGAAGGAACTGTGGAGCATGGCTTTGCCCATCACAACTATGAACTTGTTGGTCTTTGTGAGAGCAGTTGTTTCTGTTCTCTTCCTTGGTAGGCTTGGTAGCCTAGAGCTAGCTGGTGGTGCACTTTCCATAGGCTTCACCAACATAACAGGGTACTCTGTTCTTGTGGGTCTTGCATCAGGTCTTGAACCGGTGTGCAGCCAAGCTTATGGAAGCAAAAGCTGGGACATTCTTACCCTCTCCCTACAAAGAATGGTCCTCATACTCCTCATGGCAATTGTGCCCATAAGCCTCCTCTGGCTTAACCTTGAAAAAATCATGCTTTTCATGGGCCAGGACAGTGCCATCACAGAAATGGCAGCCACCTATTGTTTTTACTCTCTCCCAGACCTTTTGACAAACACCTTGCTACAACCCTTAAGGGTGTTTCTAAGGTCACAACAGGTTACCAAACCCATGATGTACTGCTCCCTGGTGGCAGTGGTTTTCCATGTGCCCTTGAACTATCTTTTGGTGGTGGTTATGGAACTTGGGGTACCAGGGGTGGCCATGGCTTCTGTGCTCACAAACCTGAACATGGTTGTGCTCATGGCAGGGTATGTGTGTTTGTGGGGGAGGAAGGAGATGACACTGAAGTGGGGTTATGGTGGGGGTCTAATGGTTGGGATATATAGTGGGTTGGGGCAGTTGATGAAGTTAGCTGTGCCTAGTTGCCTTATGATATGCTTGGAGTGGTGGTGGTATGAGATTGTGACTGTGTTGGCTGGGTACTTGCCAAATCCAACCTTGGCTGTGGCAGCTACTGGGATTTTGATTCAGACAACTAGCATGATGTACACTGTCCCCATGGCACTTGCAGGTTGTGTTTCTGCCAGGGTAGGGAATGAGCTTGGAGCTGGTAAACCATACAAGGCAAAGCTAGCAGCCATGGTTGCCTTAGGATGTGCTTTTGTGATTGGCTTCATCAATGTGACATGGACTGTGATCCTTAGGCACAGGTGGGCAAGGCTATTCACCAATGATGAGGCAGTCAAAGCCTTGGTTGCATCAGTCATGCCAATCATGGGTCTTTGTGAGCTTGGAAACTGCCCTCAAACCACAGGCTGTGGCATCCTACGTGGCACTGCTAGGCCCGTCATAGGGGCCCACATAAACCTGGGCTCATTCTACTTTGTGGGCACCCCAGTGGCCGTGGGCTTGGCCTTTTGGTTCAAGGTTGGGTTCAGTGGGCTCTGGTTTGGGCTTCTCTCAGCACAGGTGGCATGTGTTGTCTCAATTCTCTATGTTGTGATAGTACGTACAGACTGGGAAGCTGAGGCTTTGAAGGCTGAGAAGCTCACAAGGGTGGAGATGGGTACTTGCAATGGGAATAAGAATGAGAAAGATGAAGAAAGCCAAAGGTTGTTGATGAATAATGGAAATGGGAACAAAAATGGTATTTGCTAA 1515 0.4851 MEDNKDQDYLSNRFPTTSQVVEELKELWSMALPITTMNLLVFVRAVVSVLFLGRLGSLELAGGALSIGFTNITGYSVLVGLASGLEPVCSQAYGSKSWDILTLSLQRMVLILLMAIVPISLLWLNLEKIMLFMGQDSAITEMAATYCFYSLPDLLTNTLLQPLRVFLRSQQVTKPMMYCSLVAVVFHVPLNYLLVVVMELGVPGVAMASVLTNLNMVVLMAGYVCLWGRKEMTLKWGYGGGLMVGIYSGLGQLMKLAVPSCLMICLEWWWYEIVTVLAGYLPNPTLAVAATGILIQTTSMMYTVPMALAGCVSARVGNELGAGKPYKAKLAAMVALGCAFVIGFINVTWTVILRHRWARLFTNDEAVKALVASVMPIMGLCELGNCPQTTGCGILRGTARPVIGAHINLGSFYFVGTPVAVGLAFWFKVGFSGLWFGLLSAQVACVVSILYVVIVRTDWEAEALKAEKLTRVEMGTCNGNKNEKDEESQRLLMNNGNGNKNGIC* 505
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Rops5g01192 504 Pfam MatE 33 193 IPR002528 GO:0015297|GO:0016020|GO:0042910|GO:0055085
Rops5g01192 504 Pfam MatE 259 420 IPR002528 GO:0015297|GO:0016020|GO:0042910|GO:0055085
Rops5g01192 504 NCBIfam MATE family efflux transporter 33 435 IPR002528 GO:0015297|GO:0016020|GO:0042910|GO:0055085
Rops5g01192 504 CDD MATE_eukaryotic 23 465 IPR045069 GO:0042910|GO:1990961
Rops5g01192 504 PANTHER MULTIDRUG RESISTANCE PROTEIN 18 459 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Rops5g01192 Rops-Chr5 25432793 25436604 Dispersed/Transposed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Rops5g01192 K03327 - gmx:100800364 853.973
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Rops5g01192 5 25432793 25436604 Rops5g01192 5 25432793 25436604 ECH