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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Rops4g00606 ATGGACTTTTGGAAGCTATTTGTGGTTGCATTAATGCCAGTTTTGAAGGTACTATTGGTTACTGCTGTTGGGACATTCCTTGCACTTGATCGATTTGACATACTCAAGGAAACTGCTAGGAAAAACATGAACACTATGGTATTTTTTGTCTTCTCTCCTACCCTTGTTTGTAGCAGCCTAGCTCAAACAATAACTTTTAGGAGCATGGTTATGTTGTGGTTCATGCCTTTGAATGTTCTTCTCACATTTATAATTGGAACAGCTCTTGGACTGTTACTTGTCAAAATAATTAGAGTTCCTCATCATCTTGTAGGCCTTGTGTTGGGATGTTGTTCTGCAGGAAATCTTGGAAATTTACCTCTTATTATTGTCCCGGCTGTATGTAAACAAAGAGGCAGTCCTTTTGGAGATATGGATGTTTGCTATAGAAATGGACTAGCATATGCTTCTCTATCAATGGCACTAGGATCCATTTACATTTGGTCTTATGTGTACAACGTTGTTCGCATATATTCACGCCAAATTTCTAGTCAAGTCAAAGTTGATGATTCCACGGGAAATCTGGTTTCTACATTAGAAACTGAACCAGAAAATGTTTTATCATGTTCTATAGGAGCATTGGTAGCCAAGGATATATCAAAGGCAGATCATGTGAAGCAATTTGAAATTGAATGTACAATGCCTAGTGGACAAGCAGAGGTACCAAGAAAGGAAAAGATTATGAAACAGCTAAAAATATTAGCCAAAAAGTTCAACTTAAGGTTACTATTTGCACCTTCCACAACTGGAGCGACTGTTGGTTTAATAATTGGTGTAGTCCCTCAATTTCGAAAACTGTTAATTGGTGACAATGCTCCTCTTGGAGTGGTTCAAGACTCTATAGTCATGCTGGGGGGTGCAGGCATTCCAACAATGACCTTGTTAGTTGGGGCAAATCTTATTAAGGGTTTAAAAGGTTTTGGAAAGCAGCTTCCACTTATTGTTGGCATTATTGTAGTTAGATATATTGCCTTGCCAGCAATAGGTATAGGCATTATTAAAGGTGCCATTCATTTTGGTTTAATCCACCCTGATCCATTGTATCAGTTTCTTTTGCTGCTTCAATTTGCCCTTCCACCTGCAGTATCCATCATTCTGAAAGTTTTGTTCATTGCTGCTGTTGGGGCATTTCTTGCACTTGATCGCTTTGAAATTCTAACAGAGAATGTCAAGAAGCACCTTAATACTACAGTATATTTTGTCTTCACTCCAGCTCTTGTTTGTAGCAGCCTGGCCAAAACTATAACTCTTAGGAACTTGGTTATGCTGTGGTTCATGCCCTTAAATGTTCTTCTAGTATATATTACTGGGATAGCTCTTGGATGGTTACTGATAAGAATAACAAGAATTCCTCATCATCTACATGGTCTTGTAATGGGGTGTTGTGCTGCAGGAAATTTGGCCACTTTGCCTCTTATTATAGTTCCAGCTATTTGTAAAGAAAGAAGCAAACCTTTTGGAAATGTGGATGCTTGCTACTATAATGGATTAGCATATACTTCTCTATCAATGGCACTAGGACACATTTATGCTTGGTCTATTGTGTTCAACATTATCCGCATATATTCACCTAAGACCAATGTTGTCAAAGTTGATGAATCTATAGTAAACAAAGAAACTGATCCAGAAAACCTTTCAAAATGTTCCACAAGAGTATTGGTCATGGCTGAGGACAAATCACAGCCTAATGATTGCAAGGATCAACTTGAAATTGAATGTAAAGTGCCTGATGGACAAGCAAAGGTACCAGAAAAGCCAAACATTATGAAACAGCTGAAATTATTAGCTGACAAGATCAACCTGAAGGTACTATTTGCACCTTCGTCATTGGGAGCGATGATTGGTTTGATAATCGGTGTAGTCCCTCAATTTCGGAAACTACTAGTTGGTGACAGTGCTCCAATACGTGTGGTTCAAGATTCTGCAATTATGCTGGGGGATGCAAGTGTTCCATCAATGATCTTACTGGTTGGAGCAAATCTTCTTAAGGGTTTAAAAGGATTACGAACACAAGTTCCACTTGCTGTTGGCATTATTGTGGTTAAATATATTGCCATGCCATCAATAGGTATAGGCATTGTCAAAGGTGCAGTTCATTTCAGATTGATCCCTCCTGATCCATTGTATCAGTTTGTTTTGCTGCTTCAATTTGCCCTTCCACCTGCAGTATCAGTGAGTACAATGACTCAATTGGTTGGGGTTGGTGAAACTGAATGCTCAATTATCATGTTAACCAATTATGCCTGTGCTGCAGTTTTGCTTACTCTCTGGTGCACAATCTTCATGTGGCTTGTACTATAA 2340 0.3872 MDFWKLFVVALMPVLKVLLVTAVGTFLALDRFDILKETARKNMNTMVFFVFSPTLVCSSLAQTITFRSMVMLWFMPLNVLLTFIIGTALGLLLVKIIRVPHHLVGLVLGCCSAGNLGNLPLIIVPAVCKQRGSPFGDMDVCYRNGLAYASLSMALGSIYIWSYVYNVVRIYSRQISSQVKVDDSTGNLVSTLETEPENVLSCSIGALVAKDISKADHVKQFEIECTMPSGQAEVPRKEKIMKQLKILAKKFNLRLLFAPSTTGATVGLIIGVVPQFRKLLIGDNAPLGVVQDSIVMLGGAGIPTMTLLVGANLIKGLKGFGKQLPLIVGIIVVRYIALPAIGIGIIKGAIHFGLIHPDPLYQFLLLLQFALPPAVSIILKVLFIAAVGAFLALDRFEILTENVKKHLNTTVYFVFTPALVCSSLAKTITLRNLVMLWFMPLNVLLVYITGIALGWLLIRITRIPHHLHGLVMGCCAAGNLATLPLIIVPAICKERSKPFGNVDACYYNGLAYTSLSMALGHIYAWSIVFNIIRIYSPKTNVVKVDESIVNKETDPENLSKCSTRVLVMAEDKSQPNDCKDQLEIECKVPDGQAKVPEKPNIMKQLKLLADKINLKVLFAPSSLGAMIGLIIGVVPQFRKLLVGDSAPIRVVQDSAIMLGDASVPSMILLVGANLLKGLKGLRTQVPLAVGIIVVKYIAMPSIGIGIVKGAVHFRLIPPDPLYQFVLLLQFALPPAVSVSTMTQLVGVGETECSIIMLTNYACAAVLLTLWCTIFMWLVL* 780
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Rops4g00606 779 Pfam Membrane transport protein 10 377 IPR004776 GO:0016020|GO:0055085
Rops4g00606 779 Pfam Membrane transport protein 378 770 IPR004776 GO:0016020|GO:0055085
Rops4g00606 779 PANTHER - 378 778 IPR045033 GO:0080162
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Rops4g00606 Rops-Chr4 16276410 16295321 Dispersed/Proximal
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Rops4g00606 K24139 - gmx:100807965 522.316