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Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Rops3g01653 ATGGAATCGATCCTCGCTAAAGCTCTGGAGTACACTCTCAAATATTGGCTCAAATCTTTCTCAAGAGACCAGTTCAAATTGCAGGGTCACACCGTTCAGCTTTCCAATTTAGATTTAAACGGTGATGCGTTGCATTCCAGCGTTGGATTGCCACCCGCGCTCAATGTCACCACCGCAAGAGTTGGCAAATTGGAGATCATGCTACCGTCAGTGAGCAATGTACAGATAGAGCCAATCATTGTGCAAATTGATAGGCTCGATTTGGTTCTTGAGGAGAATTCTGATTTTAAACCTTCGGAAAGTCCAACCAGTTCCACAACATCAAGTGTCCCTGCCAAGGGTAGCGGGTATGGTTTTGCTGATAAGATTGCAGATGGAATGACTATACAGATTCATACAGTTAATCTATTGCTTGAAACTCATGGAAGTTCTCGTCGCCAAGGTGGAGCAACATGGGCACCACCCATGGCATCTATAACCATACACAACCTTTTGCTGTACACCACGAATGAAAGCTGGCAGGTTGTAAATCTTAAGGAGGCACGAGAATTCTCATGTAATAAGAAGTATATATATGTGTTCAAAAAATTGGAATGGGAATCATTGTCTATTGATCTTTTGCCTCATCCTGACATGTTCACGGATGCTACTTTAGGTCGCTCTCAAGCAGGTGCAAACCTGAGAGATGATGATGGGGCAAAGCGAGTATTCTTTGGAGGCGAGCGTTTTATAGAAGGAATATCAGGAGAAGCATATATCACAGTTCAAAGAACTGAATTGAACAGTCCACTCGGGCTTGAGGTTCAGTTACATGTCACAGAAGTTGTTTGCCCTGCATTAAGTGAACCAGGACTGCGTGCACTTCTCCGCTTTATGACAGGATTATATGTATGTCTTAACAGGGGAGATGTAGATTTCAAGGCCCAACAGCGATTGACTGAAGCTGCTGGGCGTTCTCTTGTCGCAGTTGTTGTGGACCATATATTTCTCTGCATTAAAGATTCTGAGTTCAAGCTTGAGCTTTTAATGCAGTCCCTCTTTTTTTCTCGGGCCAGTCTTTCTGAAGGAGATAATGACAGTAACTTGACCAGGATTACAATTTCGGGACTATTTTTGCGGGACACCTATTCATGCCCTCCATGTACCTTAGTGCAACCATCAATGCAATCTGTCACAAGAGATGCTTTCCAAGTGCCAGAGTTTGCTAGAAGCTTTTGCCCTCCAATATATCCTCTAGGAGAGCAGCAGTGGCAATTGATTGTGGGAACTCCTCTAATATGCTTCTATTCCCTTCAGATCATGCCTTCTCCACTTCCACCATCCCTTGCTTCTCAGACAGTTATTGACTGCCAGCCTCTTCTGATCCATCTCCAGGAAGAATCCTGCTTGAGGATATCATCTTTCTTAGCTGATGGTGTGGTTGTCAATCCTCGTGATATTTTACCAGATTTCTCAGTAAAATCTTTTATTTTCACCCTCAAGGTACTGGATATTATGGTTCCTTTGGATAAGGCACAATTGGATATTTCTGAAAGCAATATGGGCAATACAGTCAAGTCCTCATTTGCTGGAGCAAGACTTCATGTTGAGAACCTTTTCTGTTTAGATTCACCCTCAATGAAACTAAAGATACTGAACCTGGAGAAGGATCCTGCTTGCTTCTGTCTTTGGGAGGATCAACCAATTGATGCTAGCCAGAAGAAGTGGGCTGCCAGAGCATCCCAGCTTACTTTATCTCTGGAAGCTAGTACTGGCACACTTGGGCATCAGAATTCTCTTGGATGGACTGCTGGATTGTTGAGATGTGTTGATTTGAAAGATGCTTGCATTGAAGTAGCTATGGCAACTGCTGATGGCAGTCCATTGTTAAAGGTTCCTCCTCCTGGGGGTATTGTAAGGGTTGGTGTTGCTTGTGGACAGTATCTATCCAACACTTCTGTTGAACAGTTATTTTTTGTCATGGATCTCTATGCTTATTTTGGGAGAGTTAGTGATAAAATAGCAATAGCTGGAAAAAAGAAAGAATTGAAGGATATTAGGAACAAATCTTTTAGTGAAAAGCTGATGGACAAGGTTCCTGGTGACACTGCTGTAAGTTTAGCATTAAAAGACCTCCAACTTCGATTTCTTGAGTCTTCTTCATTGAATGTTGAGGGAATGCCTCTAGTACAGTTTGTCGGAGATGATCTGTTCATTAGTGCCACTCATAGAACCCTTGGTGGTGCTATTGCAGTTTCATCCACGTTACGTTGGGAGAGTGTTGAGATAAGTTGTGTGGATTCTGAACACTTGGCATTTGAAAATGGCTCATCTTTTAGTTCTGGAGAAAATGTTCCCTCAACGAATGATGATGGATACCCTCAACTGAGATCTGTTTTCTGGGTGCATAACAAGAATCATCTACTGAATGGAAATGCTCATTTAGTACCATTTCTGGATTTAAGTATGGTGCATGTAATACCATTTTGTGAAGTAGACATGGAGTCACATAGTTTGGATGTCACAGCTTCTGTATCCGGTGTTTGTCTTGCTGGGGGAATGAACTATGCTGAAGCCCTTCTACATCGATTTGGAATACTTGGGCCTGATGGTGGTCCGGGGAAGGGTCTCTCTACAGGATTGGAAAACTTACAAACAGGACCCCTGGCAAAACTTTTTAAGACCACTCCTCTCATTGTTGATAGTTCAGAAGATGTTGAAAGTGTGAGAGAAGGGAAAGAAACTTGTTTTCCACACTTGAAAAAGCCAGAAAATGTGGATGTAACTATAGAATTGAGAGACTGGCTATTTGCTCTTGAAGGAGCACAAGAGATGGCTAAAAGATGGTGGTTCTCCAGCCAAGAAGATGTAGGCAGAGAACAGCGGTGTTGGCATGCATCTTTCCATAGTGTACGATTAAATGCAAAAAATAGCTCAAAGAGTATTTCTGGTGGAAAAGCACAATCACATAGAATAAACCAATATCCTCTACAGCTGGTTACGGTTGGAGTTGAAGGGCTGCAGATCTTGAAACCCCATAGCCAAAAAGACATGGCTGCAAATGGAGTTAAAGAATTTACTGATGCAGTTAGTGGAATTGGCCTTGAAGTGGGCTTGATATTATGTGAGGATAATGTTGACGATGAAATGGCTAATTGGGAAGTGGAAAATCTAAAGTCCTCTGTAAAGCAACCGATTGAGGTTGTTGTAACCAAGGATGAGGTCCAACACCTCTCTTTTCTGTATAAATCTGAAATTGATTCCATGGGCCGGATAACAGCTGGAATACTACGACTGCTTAAGCTAGAAGGTTCTGTTGGCCAGTCTGTAATGGATCAGCTAGGCAACCTAGGAAGTGAAGGCTTCGAGAAGATTTTCTCTCCTGAGAAGCTCAGCATAGATGGTATTGATCGGAGTAGAGGACACTCTCCATTACCAAACCTGATAAATGACAGCCCTCGCAAATCTTTGGAACCAACATTAACTTTGCTTGAGGAAGCAGTGGTAGATTCACAGGATAAGATTAATGCTTTGATCACTGATATTGTTGGTGCTTCTGAGTCTACCTTTCAGCACCTTACTGTTGTCAAACAACTGAGTCAAAAGATTGAGTTGATGCAGGGTTTATTGTTGCAATTGCGGAATCAACTTTAA 3633 0.4233 MESILAKALEYTLKYWLKSFSRDQFKLQGHTVQLSNLDLNGDALHSSVGLPPALNVTTARVGKLEIMLPSVSNVQIEPIIVQIDRLDLVLEENSDFKPSESPTSSTTSSVPAKGSGYGFADKIADGMTIQIHTVNLLLETHGSSRRQGGATWAPPMASITIHNLLLYTTNESWQVVNLKEAREFSCNKKYIYVFKKLEWESLSIDLLPHPDMFTDATLGRSQAGANLRDDDGAKRVFFGGERFIEGISGEAYITVQRTELNSPLGLEVQLHVTEVVCPALSEPGLRALLRFMTGLYVCLNRGDVDFKAQQRLTEAAGRSLVAVVVDHIFLCIKDSEFKLELLMQSLFFSRASLSEGDNDSNLTRITISGLFLRDTYSCPPCTLVQPSMQSVTRDAFQVPEFARSFCPPIYPLGEQQWQLIVGTPLICFYSLQIMPSPLPPSLASQTVIDCQPLLIHLQEESCLRISSFLADGVVVNPRDILPDFSVKSFIFTLKVLDIMVPLDKAQLDISESNMGNTVKSSFAGARLHVENLFCLDSPSMKLKILNLEKDPACFCLWEDQPIDASQKKWAARASQLTLSLEASTGTLGHQNSLGWTAGLLRCVDLKDACIEVAMATADGSPLLKVPPPGGIVRVGVACGQYLSNTSVEQLFFVMDLYAYFGRVSDKIAIAGKKKELKDIRNKSFSEKLMDKVPGDTAVSLALKDLQLRFLESSSLNVEGMPLVQFVGDDLFISATHRTLGGAIAVSSTLRWESVEISCVDSEHLAFENGSSFSSGENVPSTNDDGYPQLRSVFWVHNKNHLLNGNAHLVPFLDLSMVHVIPFCEVDMESHSLDVTASVSGVCLAGGMNYAEALLHRFGILGPDGGPGKGLSTGLENLQTGPLAKLFKTTPLIVDSSEDVESVREGKETCFPHLKKPENVDVTIELRDWLFALEGAQEMAKRWWFSSQEDVGREQRCWHASFHSVRLNAKNSSKSISGGKAQSHRINQYPLQLVTVGVEGLQILKPHSQKDMAANGVKEFTDAVSGIGLEVGLILCEDNVDDEMANWEVENLKSSVKQPIEVVVTKDEVQHLSFLYKSEIDSMGRITAGILRLLKLEGSVGQSVMDQLGNLGSEGFEKIFSPEKLSIDGIDRSRGHSPLPNLINDSPRKSLEPTLTLLEEAVVDSQDKINALITDIVGASESTFQHLTVVKQLSQKIELMQGLLLQLRNQL* 1211
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Rops3g01653 1210 Pfam N-terminal region of Chorein or VPS13 1 101 IPR026854 -
Rops3g01653 1210 Coils Coil 1189 1209 - -
Rops3g01653 1210 PANTHER UNCHARACTERIZED 1 1208 IPR026728 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Rops3g01653 Rops-Chr3 25776170 25791753 Dispersed/Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Rops3g01653 - - psat:127101966 1831.61
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Rops3g01653 3 25776170 25791753 Rops3g01653 3 25776170 25791753 ECH