Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Rops1g01968 ATGGAGGTGGTGATGCACTCTGTGGTAATGCATAAGTACCTCTGGTCCTGCATTCTACTGGCTTATCTTCATATATGGTGCCTTTCTCTTAGTTCAGGACAGCATTTGAATAGGAGTACGGGCTTAGAAGACTGGTTGGGTTATTCTGGGTCACTTGTAAGAGATAATTCTCAACTCCATGGTTCTGCATTTGCTAAAACATCAACTTCATCATCCTTATTGAATGAGTCAGTTTCTTGTGAGGACTTGGAAGGTGTAGGATCTTTCAATACCACATGCTTGCTAAGCTCAACTCATTATTTGAAATCTGATATTTACATATATGGTGTTGGAAACCTGGAGATACTCTCTCATGTTTCACTTCTATGTCCCTTGGAAGGGTGCATGATAACAGTCAATGTGTCTGGCAACATTAAACTTGGTCAAAATGCATCTATTGTTGCTGGTTCTGTGGTTTTATCAGCAGCCAATGTGACTATGGAATACAGTTCTTCTATAAATTCATCATCTTTGGGTGGGCCACCACCTTCCCAAACTAGTGGCACACCTGTTGGCAATGATGGAGCTGGTGGAGGGCATGGTGGGCGTGGTGCATCTTGTTTAAAAAACAATAAAACAAACTGGGGTGGTGACGTTTATGCTTGGTCTACGTTGTCTGAACCATGGAGTTATGGGAGCAAGGGTGGTGGAAAATCCACTCAAAAACAATATGGAGGGAATGGTGGGGGGCGTATTAAGCTTCTAGTGAAGGACACTATATATGTGAATGGGTCTGTTACCACAGAAGGAGGAGATGGAGGGTCTGATGGGGGAGGTGGTTCTGGTGGAAGTATGTTGGTACATGCCATAAAGCTGAAGGGATATGGTACTATCAGTGCTGCTGGTGGGATGGGATGGGGTGGAGGCGGTGGAGGAAGAATATCACTTGATTGTTACAGCATACAAGAAGATTTAAAAATTACTGCCCATGGAGGTTTGAGTATTGGCTGTCCTGGGAATTCTGGAGCAGCTGGCACATATTTCAATGCAAATTTACTAAGTTTGAAAGTCAGCAATGACAATGTCACAACAGAAACAGAGACTCCTTTGCTTGACTTCTCAACCAGCCCTTTATGGTCAAATGTTTATGTGGAAAATAATGCGAAAGTTTTGGTTCCACTTGTTTGGTCCAGAGTTCAGGTGAGAGGCCAAATTAGTGTATATAGTGGAGGGAGCTTAATTTTTGGGTTGTCTGATTATCCAATTTCCGAATTTGAGCTTGTTGCAGAAGAGCTTTTATTGAGTGATTCTATCATAAAGGTTTTTGGTGCATTTAGAGTTGCTGTTAAAATGTTACTCATGTGGAACTCCACAATGCAAATTGATGGTGGTGAAAGTACTGTTGTGACTGCTTCAGTACTTGAAGTGAGAAATTTGGCTGTTCTAAGGCAAAGTTCTGTCATTAGTTCAAATACAAACTTGGGTTTATATGGTCAAGGACTGCTACAATTGACTGGCGATGGTGATGCGATCAAAGGCCGGCGACTATCCTTGTCTCTCTTCTATAATGTAACTGTTGGTCCAGGTTCTTTACTTCAAGCTCCTTTGGATGATGATGATAGTAGAGGCACGGTGACAAAACATCTATGTGACACCCAGAGATGCCCGATAGATTTGATAACTCCACCTGACGATTGTCATGTCAATTATACGCTCTCCTTCTCACTTCAAATATGCCGTGTTGAGGATCTTCTTGTAAATGGCATTATGAAGGGAAGCATAATTCACATTCACAGGGCAAGGACTGTGATTGTTGATACTGATGGTATGATTACTGCATCTGAATTAGGTTGCACTGAAGGTATCGGTAAAGGTAACTTTTTGAATGGAGCTGGTGGTGGTGCTGGACATGGTGGAAGAGGAGGATCTGGATATTTCAAAGGGAGAGTGAGTATCGGTGGTAATGAATATGGAAATGCCGTTCTTCCATGTGAATTGGGTAGTGGAACTGAGGGCCCTAATGAGTCATACGGGCATGTTGTTGGAGGCGGGATGATTGTGATGGGATCCATTCAGTGGCCACTTTTGAGGCTTGACCTTTATGGATCTTTGAGGGCTGATGGTGAAAGCTTTAGCAAAGCAATAACAAGCAGTGATGGTTCTTTGGTTGGTGGTCTTGGCGGAGGTTCTGGTGGAACAGTCCTTCTTTTCCTTCAAGAACTCAGGCTTTTGGAGAATTCCTTCTTATCTGTTGTTGGGGGCAATGGTGGCTCCCTTGGGGGTGGTGGTGGAGGTGGAGGTCGAATTCATTTCCATTGGTCAAAGATCGGTATGGGGGAAGAATATGTTCCTGTTGCAAGTATTAGTGGCACCATGAACTATAGTGGAGGTGCTGGGGACAATGATGGTTATCCTGGACAGGAGGGAACCATAACTGGGAAAGCATGCCCTACAGGCCTTTATGGAATTTTCTGTGAGGAATGTCCTGTTGGTACTTACAAAGATGTTGATGGTTCTGATGCACATCTTTGCATTCCTTGTCCTCTTGCTCTTCTTCCGAATCGTGCGAATTTCATATATAAACGAGGGGGGGTTACGGAGCACTCGTGTCCGTATAAATGTATATCAGACAAGTATCGAATGCCCAATTGCTATACTCCTCTAGAGGAACTTATTTATACATTTGGGGGCCCCTGGCCATTTTCAGTAATGCTGTCATTCATTTTATTGATTCTGGCTCTGCTACTAAGTACTTTGAGAATCAAGTTGATTGGTTCTGGTTCATATCATAGTTCGAGTTCAATTGAACACCATAATCATCACCGTTTTCCATATCTTCTTTCTCTTTCTGAGGTACGTGGAGCCAGAGCAGAAGAAACTCAAAGTCATGTACATAGAATGTACTTTATGGGTCCTAATACTTTTCGAGAACCCTGGCATCTTCCTTACTCACCTCCCCATGCTATAATTGAAATTGTGTATGAGGATGCTTTTAATAGATTTATTGACGAGATTAATTCGGTTGCTGCATATGATTGGTGGGAGGGATCAGTGCACAGTATACTTTCAGTGGTGGCATATCCTTGTGCTTGGTCTTGGAAGCATTGGCGGCGAAGAGTCAAAATTAGTCGTCTTCAGGAATATGTCAAGTCTGAATATGATCATTCTTGTCTACGCTCCTGTCGATCACGAGCTTTGTACAAAGGGATGAAGGTTGGGGCAACTCCAGATTTAATGGTAGCATACATTGATTTTTTCCTTGGTGGTGATGAAAAGCGATTAGACATTGTATCGATTATACAGAAGAGATTTCCCATGTGCATAATTTTTGGTGGGGATGGGAGCTACATGACGCCTTACAATCTTCACAGTGATACACTATTGACCAACCTCCTTGGCCAGCATGTCCCAGCAACTGTCTGGAATCGCCTGGTAGCTGGACTGAATGCTCAGTTACGGACAGTGAGGCATGGATCAATTCGTACCGCACTAGGTCCTGTTGTTGATTGGATAAATAGTCATGCAAACCCCCAACTTGAGTTCCATGGTGTTAAAATTGAGCTTGGATGGTTCCAAGCAACAGCTTCTGGTTACTATCAGCTAGGTATCATGGTAGCTGTTGGGGATTATTCCCTTCATGATTTGCACCAATCTGATACTTGGGTTGGTACTGATGAAGTTATAAGGAAAGCTGTGGCGCATGGAAGAAAGAATCTTAAGCAGCCGCAGCATAATTGGCCAAGCATGAGTAATTCATTATCTCTTAAAAGGATAACTGGAGGAATTAATGGTGGCCTGATAAATGATGCTACCTTAAGATCATTGGAGTTTAAAAGAGACCTTCTATTCCCACTTTCTCTGCTGTTGTGCAACACTAGACCTGTTGGTCGTCAGGATACTGTGCAGTTGCTGATTACTTTGATGCTTTTAGCAGATCTTTCTGTCACACTCCTCATGCTGCTTCAGTTTTACTGGATATCTCTTGCAGCCTTCCTTTCTGTTTTACTAATCCTTCCCCTTTCTCTACTTTCTCCATTTCCTGCTGGTTTGAATGCTTTATTCAGTAAAGAACCTAGAAGAGCTTCACTTTCTCGAGTATATGCGTTGTGGAATGCTACTTCTCTATCTAATATTGGAGTGGCTTTTATTTGTTGCCTCGTTCATTATGCATTATCCCACTTTCACTACCCTAACGAGGCAAGTGCACGGAATGTTAAGAGGGAAGATGATAAGTGCTGGCTTTTACCTATCATCCTTTTTCTATTCAAGTCGGTACAAGCCCGTTTTGTCAATTGGCACATAGCGAATTTAGAAATCCAAGATTTTTCTCTATTTTGTCCGGATCCAGATGCTTTTTGGGCCCATGAATCTGGTTTATGA 4359 0.4265 MEVVMHSVVMHKYLWSCILLAYLHIWCLSLSSGQHLNRSTGLEDWLGYSGSLVRDNSQLHGSAFAKTSTSSSLLNESVSCEDLEGVGSFNTTCLLSSTHYLKSDIYIYGVGNLEILSHVSLLCPLEGCMITVNVSGNIKLGQNASIVAGSVVLSAANVTMEYSSSINSSSLGGPPPSQTSGTPVGNDGAGGGHGGRGASCLKNNKTNWGGDVYAWSTLSEPWSYGSKGGGKSTQKQYGGNGGGRIKLLVKDTIYVNGSVTTEGGDGGSDGGGGSGGSMLVHAIKLKGYGTISAAGGMGWGGGGGGRISLDCYSIQEDLKITAHGGLSIGCPGNSGAAGTYFNANLLSLKVSNDNVTTETETPLLDFSTSPLWSNVYVENNAKVLVPLVWSRVQVRGQISVYSGGSLIFGLSDYPISEFELVAEELLLSDSIIKVFGAFRVAVKMLLMWNSTMQIDGGESTVVTASVLEVRNLAVLRQSSVISSNTNLGLYGQGLLQLTGDGDAIKGRRLSLSLFYNVTVGPGSLLQAPLDDDDSRGTVTKHLCDTQRCPIDLITPPDDCHVNYTLSFSLQICRVEDLLVNGIMKGSIIHIHRARTVIVDTDGMITASELGCTEGIGKGNFLNGAGGGAGHGGRGGSGYFKGRVSIGGNEYGNAVLPCELGSGTEGPNESYGHVVGGGMIVMGSIQWPLLRLDLYGSLRADGESFSKAITSSDGSLVGGLGGGSGGTVLLFLQELRLLENSFLSVVGGNGGSLGGGGGGGGRIHFHWSKIGMGEEYVPVASISGTMNYSGGAGDNDGYPGQEGTITGKACPTGLYGIFCEECPVGTYKDVDGSDAHLCIPCPLALLPNRANFIYKRGGVTEHSCPYKCISDKYRMPNCYTPLEELIYTFGGPWPFSVMLSFILLILALLLSTLRIKLIGSGSYHSSSSIEHHNHHRFPYLLSLSEVRGARAEETQSHVHRMYFMGPNTFREPWHLPYSPPHAIIEIVYEDAFNRFIDEINSVAAYDWWEGSVHSILSVVAYPCAWSWKHWRRRVKISRLQEYVKSEYDHSCLRSCRSRALYKGMKVGATPDLMVAYIDFFLGGDEKRLDIVSIIQKRFPMCIIFGGDGSYMTPYNLHSDTLLTNLLGQHVPATVWNRLVAGLNAQLRTVRHGSIRTALGPVVDWINSHANPQLEFHGVKIELGWFQATASGYYQLGIMVAVGDYSLHDLHQSDTWVGTDEVIRKAVAHGRKNLKQPQHNWPSMSNSLSLKRITGGINGGLINDATLRSLEFKRDLLFPLSLLLCNTRPVGRQDTVQLLITLMLLADLSVTLLMLLQFYWISLAAFLSVLLILPLSLLSPFPAGLNALFSKEPRRASLSRVYALWNATSLSNIGVAFICCLVHYALSHFHYPNEASARNVKREDDKCWLLPIILFLFKSVQARFVNWHIANLEIQDFSLFCPDPDAFWAHESGL* 1453
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Rops1g01968 1452 MobiDBLite consensus disorder prediction 166 185 - -
Rops1g01968 1452 PANTHER EPHRIN TYPE-B RECEPTOR 59 1447 - -
Rops1g01968 1452 MobiDBLite consensus disorder prediction 166 196 - -
Rops1g01968 1452 SMART GCC2_GCC3_2 815 863 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Rops1g01968 Rops-Chr1 39788197 39813291 Transposed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Rops1g01968 - - gmx:100784489 2473.74
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Rops1g01968 1 39788197 39813291 Rops1g01968 1 39788197 39813291 ECH