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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Rops11g03475 ATGGCTCCAACCTTTCTCTCTCTCTTCATCTTCCTCATCTTCACCTGCATCTCTGGACAATCTAGCTCCTTCGAATCGGTTCCTGATCTTCAGAACACTATGTACACTGTCGTCGATGGATATCCTTGTGTGCGGCTTCTCAATCTTTCTGGAACCATCGGTTGTTCAAATCCTGGGAGAGATAAGGTTGCGGCTCCAATAGTAAGGTTCGAAAATGTTGATGAGATATCAGAGCCATCTGCTATATTGGTCTCATTGGACTCGTTTCCAACTCTCTTTACCAGAATATCAGATGACTTAAGCTTTGCTAGGAAAGTTGGTGGTGTACTTGTTGAATCAAGAGCTGATTTGCAGGATAAGTTAAAGGGATTCTCTCCAGATCAAAAGTTTCCGCAAGCTGAATTTGCTCCTTACCATAATATCAGCTATGAATGGAATCCAATTGGTTCTGGTATCATGTGGAATTCCTACAATTTTCCTGTGTTTTTACTCACAGATAGTGGCACAAAGACTCTTCAAGAGTTTGTATTAAAGAATGAAAACAAAAAGAAAGCTTATGCTTCTAACGTGGCTGAGTTTGATCTGGTGATGCAGACAATGAAATCTGGAACACATGATTCAGAGTCTTGTTTAAGAGAAGCAACTTGCCTCCCTTTAGGTGGATACAGTGTCTGGTCGTCTCTTCCTCCAATCAACAGTTCGTCCTTAAAACCATCTAAGCCCATTATATTGACAGTAGCATCTATGGATTCTGCTTCATTTTTTCGGGACAAAAGCCTTGGTGCTGACTCCCCTATTTCTGGTTTAATTGCATTATTGGCGGCAGTTGATGCACTTTCTCATGTGGATGGTCTTGGTGACCTTAGTAAACAGCTTGTTTTTGTAGTTTTCACTGGAGAGACATGGGGTTATCTTGGGAGTAGGAGATTTTTGGTAGAACTTGACATGCACTCAGATGCTGTTCGTGGCCTTGATCACTCATTAATTGAAACGGTCATTGAAATTGGTTCTGTTGGAAAGGGTCTCAGTCAAGGTGTTAAAAACTTTTTTGCTCATGCAGAAGGGGATTCTTCTGCCACAAATGAGACAATGGTTGCCTTGAAACACGCACAAGAGTCACTTCTATCTGAAAAGATAAAGATTGCATCTGCAAGTGCCTCAAATCCTGGGATACCTCCATCCTCTTTAATGACCTTTTTGAAAAAGAATCCTGGAATCTCTGGTGTGGTCTTAGAAGATTTTGACTCTGTCTTTGTCAACAAGTTCTACCATAGTCATCTTGACGATTTATCGAATGTGAACTCATCGGCTGTAGTTGCTGCTGCTTCCCTTATTGCCCGAACCCTTTACATACTTGCCAGTGAAACTAAAGATGTACAAGATTCAACTTTGGCTGCTATAAATGTAAATGTCTCACTTGTTGAACAACTTATGGATTGCTTGTTGGACTGTAATCCTGGTCTTTCTTGTGATTTGGTGAAGAAATATATTTCACCTGCTTCAACCTGTCCAAGCCATTATGTTGGTGTTATCATAGATGAACCTTCATCGACCCCTTATCCAGGATACATTAATGATGTTCCCAGGTTCATCTGGAATTTTCTAGCTGACTTAACTTCCATCCCAAGGGAGAATAATAGCTTAGGTTGTCAACAAGGTTGCAATGGTAAAGATGAAGTTTGCATCAAAGCAGAGACTGATGGGAAGGGAGTTTGTGTTCTCTCTACAACCAGATATGTTCCTGCATATTCAACACGGTTGAAATTTGAATCAGGTGTGTGGAATGTTTTGCCCCCTAATTCCTCTGACAATATGGGGGTTGTGGACCCTGTCTGGACAGAAAGCAACTGGAATTCAATAGGTATGCGGGTCTACACAGTCCAAATTGCTGCTTTCGATCGTCTTGTTCTGTTTGGGGGCATTGCTCTGACAATCATGGCATATCTTGTAATAGCAATGACAAGAGCTATAGCTGCCAAAGCGTTGAAGAGGGATTGA 1998 0.4139 MAPTFLSLFIFLIFTCISGQSSSFESVPDLQNTMYTVVDGYPCVRLLNLSGTIGCSNPGRDKVAAPIVRFENVDEISEPSAILVSLDSFPTLFTRISDDLSFARKVGGVLVESRADLQDKLKGFSPDQKFPQAEFAPYHNISYEWNPIGSGIMWNSYNFPVFLLTDSGTKTLQEFVLKNENKKKAYASNVAEFDLVMQTMKSGTHDSESCLREATCLPLGGYSVWSSLPPINSSSLKPSKPIILTVASMDSASFFRDKSLGADSPISGLIALLAAVDALSHVDGLGDLSKQLVFVVFTGETWGYLGSRRFLVELDMHSDAVRGLDHSLIETVIEIGSVGKGLSQGVKNFFAHAEGDSSATNETMVALKHAQESLLSEKIKIASASASNPGIPPSSLMTFLKKNPGISGVVLEDFDSVFVNKFYHSHLDDLSNVNSSAVVAAASLIARTLYILASETKDVQDSTLAAINVNVSLVEQLMDCLLDCNPGLSCDLVKKYISPASTCPSHYVGVIIDEPSSTPYPGYINDVPRFIWNFLADLTSIPRENNSLGCQQGCNGKDEVCIKAETDGKGVCVLSTTRYVPAYSTRLKFESGVWNVLPPNSSDNMGVVDPVWTESNWNSIGMRVYTVQIAAFDRLVLFGGIALTIMAYLVIAMTRAIAAKALKRD* 666
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Rops11g03475 665 CDD M28_Nicastrin 38 618 - -
Rops11g03475 665 Gene3D Zn peptidases 171 469 - -
Rops11g03475 665 Pfam Nicastrin small lobe 42 199 IPR041084 -
Rops11g03475 665 PANTHER NICASTRIN 5 664 IPR008710 GO:0016020|GO:0016485
Rops11g03475 665 SUPERFAMILY Zn-dependent exopeptidases 214 452 - -
Rops11g03475 665 FunFam Nicastrin 169 465 - -
Rops11g03475 665 Pfam Nicastrin 241 450 - -
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Rops11g03475 K06171 - gmx:100818367 1126.31