Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Rops10g00763 ATGGGAAGAGATGTGTGTGGAAGTGGAGGAATGGGAAAAGGGATTGTTTCAAGGTTGTCAAACTCATGGACTAAAATGGAGAAAGCCATCAATGATGCAGTTTCCAAGAGCTTTGTTGGAAGGTACTTCAAGTTAGAAGCAAGGAAAAGCTGTTTCACAAGAGAACTTAGAGCTGCCACAGCCACTTTTCTCACCATGGCTTACATCATCACTGTCAATGCCACCATCATTTCTGCCTCCGGTGGAACCTGCTCTGCCGCAGACTGCTCTGCTCCGGCGGGTCCTGATTGCATGCTGAAGCCTAATGCTGGCTATGAAAGTTGTCTTGCAAAGACCAAGAATGATTTGGTGGTGGCAACTGCTGTATCAGCCATGGTTGCATCCATGGCTATGGGACTATTAGCTAATCTTCCTTTGGGCTTGGCTCCAGGTATGGGACCAAATGCTTATTTGGCTTTTAACATGGTTGGTTATCATGGAACTGGGTCACTGTCATACCAAACTGCAATGGCTGTTGTTTGTGTTGAGGGATGTGCTTTTCTTTTAGCTTCTGCTGTTGGTTTAAGGGGTAAGCTTGCTAAGCTCATACCTCATTCTGTTAGGCTTGCTTGTGCTGCTGGGATTGGGCTTTTCATTGCCTTTGTGGGCTTGCAAGCCAACCAGGGTGTTGGGCTTATTGGGCCTGATCCTTCCAATCTGGTAACCATTATGGCCTGCAAAAGTATAGACCCAGAAACTGGGGCATGCTTGGGTGGAAAATTGCAAAACCCAAAGTTCTGGCTTGGTCTTGTTGGTTTTCTCATCACAAGTTATGGGTTAATGAAGAATGTCAAAGGTAGCATGATTTATGGCATTCTTTTTGTGACATTGGTGTCTTGGTTTAGGCACACAGAAGTGACTTATTTTCCTGATACCCCACTTGGAGATGCAAATTATAACTATTTTAAAAAAGTGGTTGATTTTCACAAGATTAAATCAACTGCTGGGGTTATTAGTTTCAGTGATTTTAACAGGAGGGAAGTTTGGGAGGCCTTGGCTACCTTGTTCTATGTTGATGTGCTTGCCATCACTGGCACCATGTATACCATGGCAGAGATTGGTGGTTTTTTGGATGAAAAAGGAAATTTTGAAGGTGAATACATGGCTTACATGGTTGATGCAGCTGGCACCATTGTGGGTTCTACATTGGGTGTGACAACCACAGCAACATTTGTAGAATCATCAGCTGGATTGAGAGAAGGGGGTCGTACAGGATTAACGGCTGTGATCATTGGGTTGTTTTTCTTTTTCTCATTGTTTTTCACTCCTCTATTGTCTAGTGTTCCACCATGGGCCATAGGACCTTCACTAGTGATGGTTGGTGTAATGATGATGAAGGTGGTTAAGGACATAGATTGGACCAACATAAAGGAAGCTGTCCCTGCTTTTGCTATAATGATCCTTATGCCTCTCACTTATTCCATAGCAAATGGGATTATTGGTGGCATTGGACTATACATTGCTCTTAGCCTCTTTGACTATGCCACAAGCACCATAAATTGGTTGAGGAAAATGAGAAAAATGGTGATCAAGGAACAAAACCAAGTGTCTGCCACTGCGGGTGTTGACTCAACAGTGGAAATTATATGA 1629 0.4359 MGRDVCGSGGMGKGIVSRLSNSWTKMEKAINDAVSKSFVGRYFKLEARKSCFTRELRAATATFLTMAYIITVNATIISASGGTCSAADCSAPAGPDCMLKPNAGYESCLAKTKNDLVVATAVSAMVASMAMGLLANLPLGLAPGMGPNAYLAFNMVGYHGTGSLSYQTAMAVVCVEGCAFLLASAVGLRGKLAKLIPHSVRLACAAGIGLFIAFVGLQANQGVGLIGPDPSNLVTIMACKSIDPETGACLGGKLQNPKFWLGLVGFLITSYGLMKNVKGSMIYGILFVTLVSWFRHTEVTYFPDTPLGDANYNYFKKVVDFHKIKSTAGVISFSDFNRREVWEALATLFYVDVLAITGTMYTMAEIGGFLDEKGNFEGEYMAYMVDAAGTIVGSTLGVTTTATFVESSAGLREGGRTGLTAVIIGLFFFFSLFFTPLLSSVPPWAIGPSLVMVGVMMMKVVKDIDWTNIKEAVPAFAIMILMPLTYSIANGIIGGIGLYIALSLFDYATSTINWLRKMRKMVIKEQNQVSATAGVDSTVEII* 543
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Rops10g00763 542 PANTHER XANTHINE/URACIL PERMEASE C887.17-RELATED 25 530 IPR045018 GO:0015205
Rops10g00763 542 Pfam Permease family 112 491 IPR006043 GO:0016020|GO:0022857|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Rops10g00763 Rops-Chr10 18105052 18106680 Transposed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Rops10g00763 K06901 - gmx:100778491 837.41
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Rops10g00763 10 18105052 18106680 Rops10g00763 10 18105052 18106680 ECH