Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pvu8g0808 ATGGCTCCAAATCTGAGGCTAAGATTATGTTTTCCCTTGTTGTTTTTGTTGCTGAGTTTTCTCTTGAATTCAAATGGTGAATTGGATCATCAAGTTTCACATAAGGTCATAGCTGCTCCTCATAAAGATGTAGGAACTAATGTAATTGATGGCACTGGTGTGGAGAATGCTTTTAATTTTGAGAATGACAATGGTGCGGTGGGTAGTAGGAAAGGTGCAAGTAATAAGGTTTCAGTTTCAACTGTTGCGTTGTTTACCCTGGCGATGGCAGCTGCCACTGGTTTAGGTGCTGTGCCCTTCTTCTTTGTGGAGCTTGATCCGCAGTGGGCTGGATTATGCAATGGAATGGCTGCAGGTGTCATGTTGGCTGCGAGCTTTGATCTAATACAGGAAGGCCAGGAGTATGGTGCTGGAAATTGGGTTGTCACTGGGATTCTAGCTGGTGGAATCTTTATTTGGCTATGTAAGAAGTTTCTTGAGCAATATGGGGAAGTAAGCATGTTGGATTTAAAAGGTGCTGACGCGGCCAAAGTTGTTCTTGTTATTGGAATAATGACTCTCCATTCTTTTGGGGAGGGATCTGGGGTTGGAGTCTCATTTGCTGGCTCAAAGGGTTTTACTCAAGGCCTGTTGGTAACTTTGGCTATTGCAGTACACAACATTCCAGAAGGATTAGCCGTTAGCATGGTGCTTGCATCAAGGGGTGTCTCTCCGCAGAATGCTATGTTATGGAGCATAATTACATCTTTACCCCAGCCCATTGTAGCAGTTCCTTCTTTTATTTGTGCTGATGCATTCAGTAAGTTTCTTCCTTTCTGTACGGGATTTGCTGCTGGATGCATGATTTGGATGGTTGTTGCGGAAGTGCTTCCTGATGCTTTCAAGGAAGCCTCAGCTTCACAGGTTGCATCAGCTGCAACCCTTTCTGTAGCATTTATGGAAGCTCTCAGCACCGTCTTTCAAAATTTCAGTCATGACTACAACGCTGAGGATGCTTCTGGCTTTTTTGTTTCATTACTTTTTGGTCTTGGCCCTTTACTTGGAGGAATTATTCTGGTTGTATTTGCTCTTGCATTGCATCTTCAGCATGCTCTCCTCATGGGCACTGCATGTGGTATTGCTTTTGTTCTTGGTGCCTGGCGACCAATACAACTTATTTTGTCTTCAAAATTGGGATTTATTCCCATTTTGTTACTCCTCGCAATGGGGGCTGCTTTCATCCAGGTTTCTACATCTGGTGTATTGAAGATGGCAGCATCCAAGAAGGCCTCAGTCAATGACTTGCCTACACTCACTGGTTTCCCACTCAGTGTTCACACCCTTCAATCATTCATATCATGTGGTGCAGTAGCCTTCCATGCCTTAGCTGAAGGACTTGCATTGGGAGTGGCGGCACCAAAAGCATATGGACTCGGTCGTCACATGGTCCTTCCAGTCTCTCTACATGGCCTTCCTCGAGGTGCAGCTGTGGCCAGCTGCATATTTGGAGCCACTGATAGCTGGCATGGTTCCCTTGCAACAGCTGCCATAATTGGATTTATGGGTCCAATATCAGCAATAGGAGCTATTCTTACTGGTATTGACTACAGTGGCCTTGATCACATAATGGTTATTGCCTGTGGTGGATTAATCCCTAGCTTTGGAAATGTAGTAAAGAGAGCTCTAAGTTTGGATAAGAGGAAGAGCACCAGTGGCCTCATTATGGGTATTGGGTTTGCTACTTTATGTCTAACATTCACTAGGTTGGTTTGCTTACATACACCTTACTGCAATTCTGCCCCAGAGGCTGTCAGATAA 1797 0.4469 MAPNLRLRLCFPLLFLLLSFLLNSNGELDHQVSHKVIAAPHKDVGTNVIDGTGVENAFNFENDNGAVGSRKGASNKVSVSTVALFTLAMAAATGLGAVPFFFVELDPQWAGLCNGMAAGVMLAASFDLIQEGQEYGAGNWVVTGILAGGIFIWLCKKFLEQYGEVSMLDLKGADAAKVVLVIGIMTLHSFGEGSGVGVSFAGSKGFTQGLLVTLAIAVHNIPEGLAVSMVLASRGVSPQNAMLWSIITSLPQPIVAVPSFICADAFSKFLPFCTGFAAGCMIWMVVAEVLPDAFKEASASQVASAATLSVAFMEALSTVFQNFSHDYNAEDASGFFVSLLFGLGPLLGGIILVVFALALHLQHALLMGTACGIAFVLGAWRPIQLILSSKLGFIPILLLLAMGAAFIQVSTSGVLKMAASKKASVNDLPTLTGFPLSVHTLQSFISCGAVAFHALAEGLALGVAAPKAYGLGRHMVLPVSLHGLPRGAAVASCIFGATDSWHGSLATAAIIGFMGPISAIGAILTGIDYSGLDHIMVIACGGLIPSFGNVVKRALSLDKRKSTSGLIMGIGFATLCLTFTRLVCLHTPYCNSAPEAVR* 599
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pvu8g0808 598 Pfam ZIP Zinc transporter 173 298 IPR003689 GO:0016020|GO:0030001|GO:0046873|GO:0055085
Pvu8g0808 598 PANTHER ZINC/IRON TRANSPORTER 28 351 - -
Pvu8g0808 598 PANTHER BNAA05G29570D PROTEIN 28 351 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pvu8g0808 Pvu-Chr8 7633779 7638577 Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Pvu8g0808 - - gmx:100800396 1032.71
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pvu8g0808 8 7633779 7638577 Pvu8g0808 8 7633779 7638577 ECH
Pvu8g0808 8 7633779 7638577 Pvu10g0614 10 9814852 9818809 PCT