Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pvu11g1170 ATGAGTCTCCGCCACCGTCACCCTCCGCCGGCGGCAGCCGGCGCTACAGGCCGCGACGAAGAGCCTTTCAACATCATCCCCGTGCACAACCTCCTCGCGGACCACCCGTCGCTTCGCTTCCCCGAGGTCCGCGCGGCGGTGGCAGCGCTGCGGTCAGTCGGGGACCTCCGACGTCCTCCGTTCGGGCAATGGCGGTCGAACATGGATCTCCTCGACTGGCTTGCGCTCTTTTTCGGCTTCCAGCGTGACAACGTTCGGAACCAGCGCGAGCATTTGGTTCTCCACCTCGCGAACGCTCAGATGCGCCTCACACCGCCGCCGGACAACATCGACACGCTCGACGCCGGCGTTCTCCGGCGGTTTCGCAAGAAGCTGTTGAAAAACTACGGGGCGTGGTGCTCCTACCTTGGGAAGAAGTCTAACATCTGGATCTCCGACAACCGGCGTGGTGGCGCCGGTGACGACCTTCGACGTGAGCTGCTTTACGTGTCGCTGTACCTCCTGATCTGGGGAGAGGCCGCAAATCTTCGCTTCATGCCGGAGTGCATCTGCTATATCTTCCACAACATGGCGAACGAGCTGAACAGAATTTTAGAAGATTTCATCGACGAGAACACCGGGCAGCCGGTTATGCCCTCGATTTCCGGTGAGAACGCGTTTTTGAACTCGGTTGTGAAGCCTATTTATGATACTATTAGGCGTGAGGTTGATAGTAGTAGAAATGGTACTGCTCCTCATAGTGCTTGGAGAAACTATGATGATATTAATGAATATTTTTGGAGTAGGAGGTGTTTTGAGAAGCTTAAGTGGCCTCTTGATGTTGGGAGTAACTTCTTTGTTACTGCTGGTGGTGGTGGGAAGCAAGTGGGGAAGACTGGGTTTGTGGAGCAGAGGTCGTTTTGGAATTTGTTTAGGAGTTTTGATAGGCTTTGGGTGATGTTGATATTATTTCTTCAGGCTGCTATTATTGTGGCTTGGGAAGAGAGGACTTACCCTTGGCAGGCTTTGGAGGATAGGACTGTGCAGGTCAGGGTTTTGACTATCTTTTTCACTTGGACTGGTTTGAGGTTTGTGCAGAGTTTGCTTGATATGGGGATGCAGTACAGGTTGGTGTCGCGGGAGACAATTGGGCTTGGAGTGAGGATGGTGCTGAAGTGTGTCGTGGCTGCTGCCTGGATTGTTGTGTTTGTTGTGTTTTATGCCAGGATTTGGACGCAGAGGGACCATGATAGGCGGTGGTCACCAGCGGCAAATAAACGGGTGGTGAACTTTCTGCAGGCTGTGCTTGTTTTCATTATTCCGGAGCTTTTGGCTTTGGCTCTTTTTGTGCTTCCTTGGATTAGGAATTTTGTGGAGAACACAAATTGGAGGATTTTCTACATGTTGTCATGGTGGTTTCAGAGCAGGAGCTTTGTGGGACGTGGTTTGAGGGAAGGTCTTGTCGACAATGTGAAGTATTCAGTCTTCTGGATTGTGGTGCTGGCCACAAAATTTTGCTTCAGTTACTTTTTGCAGGTGAAACCCATGATTGCTCCGTCAAAGGCAGTGTTGGACCTGAAAAATGTTAACTATGAATGGCATCAGTTTTTTCATAACAGCAACCGGTTTGCTGTTGGGTTGTTGTGGCTTCCAGTTGTGTTGATTTATCTTATGGATATACAGATTTGGTATTCAATATACTCGTCTTTTGCTGGGGCAGGTGTGGGGTTGTTTGCACACTTGGGTGAGATAAGAAATATGCAACAGCTGAAATTGAGGTTCCAGTTTTTTGCTAGCGCAATTCAGTTTAATCTCATGCCGGAGGAGCAGTTATTGAATACAAGAAGAACATTGAAGAGTAAGTTTAAGGATGCGATTCACAGGCTGAAGCTCAGGTACGGGCTTGGTCGGCCCTATAGGAAGCTTGAGTCTAACCAGATTGAGGCCAACAAGTTTGCTTTGATATGGAATGAGATAATTCTGTCTTTTAGGGAGGAGGATATTATATCTGACAAAGAGTTTGAGTTGCTGGAGCTGCCTGAGAACTCTTGGAATGTCAGGGTAATCCGCTGGCCATGTTTTCTGCTCTGCAATGAGCTACTGTTGGCACTCAGTCAGGCCAAAGAGCTGGTTGATGATAGTGATAAGAGGCTCTGTACAAAGATATGCAAGAGTGAATACAGACGCTGTGCTGTCATTGAAGCTTATGACAGTGTCAAACACTTGCTTCTTGAGATTATCAAGCACAACACGGAAGAGCATTCTATTGTGACTGTTCTGTTTCAGGAAATTGGTCACTCTCTTGAGATTGAAAAATTCACTAAATTGTTCAATACAACTGCACTGCCTAAGCTTCACAACAAGTTGATCAAACTTGTTCAGTTATTAAACAGGCCTGTCAAAGATCCTAACCAAGTGGTGAATACCCTTCAAGCCCTTTATGAGATTGCTATCCGAGACTTTTTCAAGGAGCAAAGAAATCCTGAACAGCTTAAGGAGGATGGTTTGGCTCAACAGAATCCTGCTTCTGGTCTACTTTTTGAGAATGCCATTCAGTTACCTGACACCAGCAATGAGAACTTCTATAGGCAGGTTCGGCGCTTGCACACAATTCTTACATCCAATGATTCAATGCAAAACATTCCAGTAAATTTAGAAGCTAGACGGAGAATTGCTTTCTTCAGTAACTCTCTTTTTATGAACATGCCCCATGCACCCCAAGTTGAGAAAATGATGGCTTTCAGTGTGCTAACACCTTACTATAGTGAAGAAGTGTTATACAACAAAGAACAGCTCAGAAATGAGAATGAAGATGGGGTTTCAATCCTGTACTATTTGCAGACTATATATGATGATGAGTGGAAAAATTTTATGGAGAGGATGCGTCGGGAGGGAATGACAAAAGACAGTGATCTTTGGACTGATAAACTTAGGGATTTGAGGCTCTGGGCTTCCTATAGGGGCCAGACCCTGTCACGAACAGTTAGAGGAATGATGTACTACTATCGGGCTCTCAAGATGTTGACTTTTCTGGATTCTGCATCAGAAATGGATATTCGAGAAGGTGCCCGGGAACTTGTTTCAATGAGACCAGATAGCTTAGGGAGTTCCAACTCTGAAAGGTCACCTTCCTCTAGGAGTTTAAGTAGAGGAAGCAGTTCAGTTAGTTTGTTATTTAAAGGCCATGAGTATGGGACTGCTTTAATGAAATTCACGTATGTGATTGCTTGTCAGATATATGGAACTCAGAAAGAAAAGAAGGATCCTCATGCTGATGAAATTTTGTATCTAATGAAAAAAAATGAGGCTCTTCGAGTTGCTTATGTTGATGAGAAAACCTCTGGAAGGGATGAGAAGGATTATTACTCTGTTCTTGTTAAGTATGACCAACAGTTGCAGAGGGAGGTGGAAATTTACCGAGTAAAGTTGCCTGGGCCTTTGAAGCTTGGGGAAGGAAAACCAGAAAATCAAAATCATGCCATCATCTTCACTCGTGGTGATGCAGTCCAGACTATTGATATGAATCAGGACAACTACTTTGAGGAAGCTCTTAAAATGCGAAATCTCTTGGAAGAATACAGGCATTACTATGGTATCCGGAGACCCACTATTTTGGGAGTTAGGGAACACATTTTTACTGGTTCTGTTTCTTCTCTTGCCTGGTTCATGTCAGCTCAGGAAACAAGTTTTGTCACCTTAGGGCAGAGGGTTTTGGCAAATCCTTTGAAGGTTAGAATGCATTATGGTCACCCAGATGTATTTGACAGATTTTGGTTCTTGACTCGAGGTGGTATTAGTAAAGCGTCCAGAGTGATCAACATAAGTGAGGACATCTTTGCTGGATTTAATTGTACTCTTCGTGGAGGGAATGTCACTCACCATGAATACATTCAGGTTGGAAAGGGAAGGGATGTTGGGTTGAATCAAGTATCAATGTTTGAAGCTAAGGTTGCTAGTGGAAACGGGGAGCAAGTCTTAAGTAGGGATGTGTACAGATTGGGACATAGGCTGGATTTTTTCCGTATGCTGTCATTCTTCTACACTACTGTGGGGTTCTTCTTCAACACAATGATGGTGATTCTGACTGTTTATGCATTTTTATGGTGTCGACTATATCTTGCGCTCAGTGGTGTTGAGAATGCAATGGAAAGTAACAGTAATAACAATAAAGCACTTGGTACCATCTTGAATCAACAGTTCATCATCCAACTCGGACTTTTCACTGCCCTTCCTATGATTGTAGAAAATTCCCTTGAGCATGGGTTCCTTCAAGCTATCTGGGATTTCTTGACAATGCAGCTCCAGCTTTCATCAGTTTTTTACACATTCTCAATGGGCACTCGTAGTCATTTCTTTGGTCGGACTGTTCTGCATGGTGGGGCGAAATACCGAGCTACTGGTCGTGGTTTTGTTGTTGAGCACAAGAGATTTGCTGAAATCTATAGGCTCTTTGCTCGTAGCCATTTTGTGAAAGCAATTGAGTTGGGGCTAATACTTGTAATTTATGCTACACATAGCCCTGTAGCAACTGACACTTTTGTTTATATAGCCTTGACCATCACTAGTTGGTTCTTAGTAGCGTCATGGATTATGGCGCCATTTGTGTTCAATCCTTCCGGCTTTGATTGGTTAAAAACTGTTTATGACTTTGATGATTTTATGAACTGGATTTGGTACAGTGGAAGTGTGTTTGCTAAAGCTGAACAGAGCTGGGAAAGGTGGTGGTATGAAGAACAGGATCATCTGAAGGTAACTGGCCTTTGGGGAAAGCTTTTGGAGATAATCTTAGACCTTCGATTCTTCTTTTTCCAATATGGAATTGTGTATCAGCTTGGCATTTCTGGTAGAAGTACCAGTGTTGGTGTTTACTTGCTATCTTGGATTTATGTGCTTGTTATATCTGGGATTTATGTTGTGGTAGTGTATGCCCGGAACAGATACGCAGCCAAAGAGCACATCTATTATCGTCTGGTCCAGTTCCTTGTCATAATTATTGCAATACTTGTGATAGTTGTTTTGCTGGAATTCACTAAATTCAAATTTATTGATATTTTTACTAGCCTGCTGGCATTCGTTCCCACAGGTTGGGGCCTGATATCAATTGCACAAGTATTCCGACCATTTTTGCAGTCCACTATCATTTGGGATGGTGTGGTTTCAGTGGCTCGTCTATATGACATAATGTTCGGAGTCATTGTTATGGCCCCTGTGGCACTCCTATCATGGTTGCCCGGATTTCAGAACATGCAAACCAGAATACTTTTCAATGAAGCATTCAGCAGGGGCCTCCGGATATTTCAGATTGTTACAGGGAAAAAATCACAGAGTTGA 5310 0.4444 MSLRHRHPPPAAAGATGRDEEPFNIIPVHNLLADHPSLRFPEVRAAVAALRSVGDLRRPPFGQWRSNMDLLDWLALFFGFQRDNVRNQREHLVLHLANAQMRLTPPPDNIDTLDAGVLRRFRKKLLKNYGAWCSYLGKKSNIWISDNRRGGAGDDLRRELLYVSLYLLIWGEAANLRFMPECICYIFHNMANELNRILEDFIDENTGQPVMPSISGENAFLNSVVKPIYDTIRREVDSSRNGTAPHSAWRNYDDINEYFWSRRCFEKLKWPLDVGSNFFVTAGGGGKQVGKTGFVEQRSFWNLFRSFDRLWVMLILFLQAAIIVAWEERTYPWQALEDRTVQVRVLTIFFTWTGLRFVQSLLDMGMQYRLVSRETIGLGVRMVLKCVVAAAWIVVFVVFYARIWTQRDHDRRWSPAANKRVVNFLQAVLVFIIPELLALALFVLPWIRNFVENTNWRIFYMLSWWFQSRSFVGRGLREGLVDNVKYSVFWIVVLATKFCFSYFLQVKPMIAPSKAVLDLKNVNYEWHQFFHNSNRFAVGLLWLPVVLIYLMDIQIWYSIYSSFAGAGVGLFAHLGEIRNMQQLKLRFQFFASAIQFNLMPEEQLLNTRRTLKSKFKDAIHRLKLRYGLGRPYRKLESNQIEANKFALIWNEIILSFREEDIISDKEFELLELPENSWNVRVIRWPCFLLCNELLLALSQAKELVDDSDKRLCTKICKSEYRRCAVIEAYDSVKHLLLEIIKHNTEEHSIVTVLFQEIGHSLEIEKFTKLFNTTALPKLHNKLIKLVQLLNRPVKDPNQVVNTLQALYEIAIRDFFKEQRNPEQLKEDGLAQQNPASGLLFENAIQLPDTSNENFYRQVRRLHTILTSNDSMQNIPVNLEARRRIAFFSNSLFMNMPHAPQVEKMMAFSVLTPYYSEEVLYNKEQLRNENEDGVSILYYLQTIYDDEWKNFMERMRREGMTKDSDLWTDKLRDLRLWASYRGQTLSRTVRGMMYYYRALKMLTFLDSASEMDIREGARELVSMRPDSLGSSNSERSPSSRSLSRGSSSVSLLFKGHEYGTALMKFTYVIACQIYGTQKEKKDPHADEILYLMKKNEALRVAYVDEKTSGRDEKDYYSVLVKYDQQLQREVEIYRVKLPGPLKLGEGKPENQNHAIIFTRGDAVQTIDMNQDNYFEEALKMRNLLEEYRHYYGIRRPTILGVREHIFTGSVSSLAWFMSAQETSFVTLGQRVLANPLKVRMHYGHPDVFDRFWFLTRGGISKASRVINISEDIFAGFNCTLRGGNVTHHEYIQVGKGRDVGLNQVSMFEAKVASGNGEQVLSRDVYRLGHRLDFFRMLSFFYTTVGFFFNTMMVILTVYAFLWCRLYLALSGVENAMESNSNNNKALGTILNQQFIIQLGLFTALPMIVENSLEHGFLQAIWDFLTMQLQLSSVFYTFSMGTRSHFFGRTVLHGGAKYRATGRGFVVEHKRFAEIYRLFARSHFVKAIELGLILVIYATHSPVATDTFVYIALTITSWFLVASWIMAPFVFNPSGFDWLKTVYDFDDFMNWIWYSGSVFAKAEQSWERWWYEEQDHLKVTGLWGKLLEIILDLRFFFFQYGIVYQLGISGRSTSVGVYLLSWIYVLVISGIYVVVVYARNRYAAKEHIYYRLVQFLVIIIAILVIVVLLEFTKFKFIDIFTSLLAFVPTGWGLISIAQVFRPFLQSTIIWDGVVSVARLYDIMFGVIVMAPVALLSWLPGFQNMQTRILFNEAFSRGLRIFQIVTGKKSQS* 1770
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pvu11g1170 1769 MobiDBLite consensus disorder prediction 1024 1044 - -
Pvu11g1170 1769 PANTHER GLYCOSYL TRANSFERASE, FAMILY 48, 1,3-BETA-GLUCAN SYNTHASE SUBUNIT FKS1-LIKE, DOMAIN-1-RELATED 4 1769 - -
Pvu11g1170 1769 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 874 1667 IPR003440 GO:0000148|GO:0003843|GO:0006075|GO:0016020
Pvu11g1170 1769 MobiDBLite consensus disorder prediction 1022 1044 - -
Pvu11g1170 1769 SMART FKS1_dom1_2 157 273 IPR026899 -
Pvu11g1170 1769 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 159 271 IPR026899 -
Pvu11g1170 1769 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 4 1769 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pvu11g1170 Pvu-Chr11 15358882 15365703 Transposed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pvu11g1170 1 1769 Glycosyltransferase AT4G03550 75.658 0.0 2786
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Pvu11g1170 K11000 - gmx:100811121 3298.45