Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pvu10g0535 ATGGATTTCTGGATGCTTTTCTTTGTTGCATTTACATCAATTATGAAACTTTTGTTGATCACTGTTCTTGGGGCATTGCTTGCACATCATCGATTTAATATACTCAGAGAAAATGCCACAAAGCACATTAATGCTATGGTGTATTTTGTCTTCACCCCTGCTCTTATCTATAGCGGCATCTCTAATACCTTAACCATAAAGAGCATGGTTATGTTGTGGTTCATGCCCTTAAGTATTCTTGTAACATACATTACTGGAACATTTGCTGGATGGTTAATGATCAAAACAATTAGAGTTCCTCCTCATCTGCATGGTTTAGTGTTGGGATGCTGTGCTGCAGGAAATCTGGCTAGTTTTCCTCTAATTATAGTTCCAACTATCTGTGAAGACAAAAACAACCCTTTTGGAGATGAAGCTATTTGTCATAGAAATGGACTTGCATATGCTTCTCTGTCAATGGCTGTAGGATACACTTATTCTTGGTGTTTTACATTTAACGTTGTTCGTATATATTCTCCTAAGATCGATGCAGTCAAAGTTGATGAATCCTCCATAAATCCAAAGTCTACAACAGAAACTGGCCCAAAAAATCTATTGAAATGCCCTTGTGGAGCATTAGTCATGAATGAGGATACAGAAAAGCTTAATGGTGGTACAGATCCACCTAAATTTGAATGTAAAGTGGCTAATGGACAAGAAAAGGTACCAGAAAAGCTAAAGTTTATGAAATGGTTGAAACTATTAGCTGAGAAGATAAAAAAGATGAAGACACTAATTGCTCCTTCCACTATAGCAGCAATTCTGGGTTTGACAATTGGTATTGTGCCTCAATTTCGAAAACTCCTAGTTGGTGACAAGGCTATCTTCAATGTGGTTCAAGACACTTTAATCATGTTGGGGGATGCAAGTGTTCCAACGATGGTCTTACTGCTTGGGGCAAACCTTGTTAAGGGTTTAAAAGCAATAGGTCAACAAGTTCCACTTATTGTTGGCATCATTGTGGTTAAATTTGTTGTCTTGCCGGTAATAGGCATATGCATTGTCAAAAGTGCAGTTCATTTCAACTTGATCCGCCATGATCCATTGTATCAATTTGTTTTACTGCTTCAATATGTCGTTCCACCTGCGATGGTAGTGAGTACAATTACTCAAATGTTTGGAGTTGGTGAGTGTGAGTGCTCAGCTATCATGTTAGCAACTTATTCCTGTGCTGCAGTTCTGCTTCCTCTTTGGTGCACATTGTTTATGTGGCTTGTACTATAA 1263 0.3816 MDFWMLFFVAFTSIMKLLLITVLGALLAHHRFNILRENATKHINAMVYFVFTPALIYSGISNTLTIKSMVMLWFMPLSILVTYITGTFAGWLMIKTIRVPPHLHGLVLGCCAAGNLASFPLIIVPTICEDKNNPFGDEAICHRNGLAYASLSMAVGYTYSWCFTFNVVRIYSPKIDAVKVDESSINPKSTTETGPKNLLKCPCGALVMNEDTEKLNGGTDPPKFECKVANGQEKVPEKLKFMKWLKLLAEKIKKMKTLIAPSTIAAILGLTIGIVPQFRKLLVGDKAIFNVVQDTLIMLGDASVPTMVLLLGANLVKGLKAIGQQVPLIVGIIVVKFVVLPVIGICIVKSAVHFNLIRHDPLYQFVLLLQYVVPPAMVVSTITQMFGVGECECSAIMLATYSCAAVLLPLWCTLFMWLVL* 421
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pvu10g0535 420 PANTHER - 1 419 IPR045033 GO:0080162
Pvu10g0535 420 Pfam Membrane transport protein 10 411 IPR004776 GO:0016021|GO:0055085
Pvu10g0535 420 PANTHER EFFLUX CARRIER FAMILY PROTEIN, PUTATIVE-RELATED 1 419 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pvu10g0535 Pvu-Chr10 8184680 8190029 Proximal
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Pvu10g0535 K24139 - gmx:100807081 578.17