Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pumo8g02121 ATGATAACAGTCAATGTGTCTGGCAACATTAAACTTGGTCAAAATGCATCTATTGTTGCTGGTTCTGTGGTTTTATCTGCAGCGAATCTGACAATGGAATACAATTCTTATATAGACTCATCATCTTTAGGTGGGTCACCACCTTCCCAAACTAGTGGCACACCTGTTGGCAACGATGGAGCTGGTGGAGGGCACGGTGGGCGTGGTGCATCTTGTTTAAAAAATAACAAGACAAACTGGGGTGGTGATGTTTATGCTTGGTCTACATTGTCTGAACCATGGAGTTACGGGAGCAAGGGTGGTGGAAAATCTACTAAAAAACAATATGGAGGGAATGGTGGGGGGCGTGTTAAGCTTTTAGTGAAGGACACTTTATACGTAAACGGATCTATTACTGCAGAAGGGGGAGATGGAGGGTCTGATGGGGGAGGTGGCTCTGGTGGAAGTATATTGGTTCATGCTGTAAAGCTGAAGGGATATGGTACCATCAGTGCCGCTGGTGGAACAGGATGGGGTGGAGGAGGTGGAGGAAGAATATCACTTGATTGTTACAGCATACAAGAAGATTTAAACATTACTGTTCATGGAGGTTTGAGTATTGGCTGTCCTGGGAATTCTGGAGCAGCTGGCACATATTTCAACGCACATTTACTAAGTTTAAAAGTTAGCAATGACAATGTCACAACAGAAACTGAGACTCCTTTGCTTGATTTCTCAACCAGCCCATTATGGTCAAATGTTTATGTGGAAAATAATGCGAAAGTTTTGGTTCCGCTTGTGTGGTCCAGAGTTCAGGTAAGAGGCCAAATTAGTGTGTACAGTGGAGGAAGCTTAATCTTTGGGTTGTCTGATTATCCAATTTCTGAGTTTGAGCTTGTTGCAGAAGAGCTTTTATTGAGTGATTCTATCATAAAGGTTTTTGGTGCATTTAGAGTTTCTGTTAAAATGTTACTCATGTGGGACTCCACAATGCAAATTGATGGTGGTGAAAGTACTGTTGTGACTGCTTCAGTACTTGAAGTGAGAAATCTGGCTGTTTTAAGGCAAAATTCTGTCATTACTTCAAATACAAACTTAGCTTTATATGGTCAAGGACTACTACAATTGACTGGTGACGGTGATGCAATCAAAGGCCAGCGACTGTCCTTGTCTCTCTTCTATAATGTAACTGTTGGTCCAGGTTCTTTAATTCAAGCTCCTATGGATGATGATGCTAGTAGAGGCACGGTGACAAAACATCTTTGCGACACACAGAGATGCCCAATAGATTTGATAACTCCACCTGACGATTGTCATGTCAATTACACACTCTCCTTCTCACTTCAAATTTGTCGTGTTGAGGATCTTCTTGTAAATGGCATTATGAAGGGAAGCATAATTCACATTCACAGGGCAAGAACTGTGATTGTTGATACCGATGGTATGATTAGTGCATCTGAATTAGGTTGCACTGAAGGTATTGGTAAGGGAAACTTTTTGAATGGAGCTGGTGGTGGTGCTGGACATGGTGGAAAAGGAGGGTCTGGATATTTCAACGGGAGAGAGAGTATTGGTGGTAATGAATATGGAAATGCTATTCTTCCATGTGAATTGGGTAGTGGAACTGAGGGCCCTAATGAGTCATATGGGCATGTTGTTGGAGGCGGGATGATTGTGATGGGATCCATTCAGTGGCCACTTTTGAGACTTGACCTTTATGGATCCTTGAGGGCTGATGGTGAAAGCTTTAGCAAATCAATAACAAGCGGTGATGGTTCTTTGGTTGGGGGTCTTGGTGGAGGTTCTGGTGGAACAGTCCTTCTTTTCCTTCAAGAACTTAGGCTCTTGGAGAATTCATCCTTATCTGTTGTTGGGGGCAATGGTGGCCCTGTTGGTGGTGGTGGTGGAGGTGGAGGTCGAATTCATTTCCATTGGTCAAAGATTGGTATGGAGGAAGAATATGTTCCTGTTGCAAGTATTAGTGGCACTATGAATAACAGTGGAGGTGCTGGGGACAATGATGGCCATCATGGACACGAGGGCACTATAACTGGGAAAGCATGCCCTAAAGGTCTTTATGGAATTTTCTGCGAGGAATGTCCTATTGGAACTTACAAAGATGTTGATGGTTCTGATGAACATCTTTGCATTCCTTGTCCTCTTGATCTTCTTCCAAACCGTGCAAATTTCATATATAAGCGAGGTGGTGTTACAAGACGGACTTGTCCATATAAATGTATATCAGACAAATATCGAATGCCCAATTGCTATACACCTCTAGAGGAGCTCATTTATACATTTGGGGGTCCCTGGCCATTTTCAGTAATGTCCGTGGAGCTAGAGCTGAAGAGACTCAAAGTCACTGTGCACAGAATGTACTTTATGGGTCCTAATACTTTTAGAGAACCCTGGCATCTTCCTTACTCACCTCCCCATGCTATAATTGAGATTGTGTATGAGGATGCTTTTAATAGATTTATTGATGAAATCAACTCGGTTGCTGCATATGATTGGTGGGAGGGATCAGTGCACAGTATACTTTCAGTTGTTGCATATCCTTGTGCTTGGTCCTGGAAGCATTGGCGGCGGAGAGTCAAAATCAGTCGCCTTCAGGAATATGTCAAGTCTGAATATGACCATTCTTGTCTACGCTCCTGTCGATCACGTGCTTTGTACAAAGGGATGAAGGTTGGGGCAACTCCAGATTTAATGGTAGCATACATTGATTTTTTTCTTGGTGGTGATGAGAAGCGATTAGACATTGTATCAATTATACAGAAGAGATTTCCCATGTGCATAATTTTTGGTGGGGATGGGAGCTACATGGCGCCTTATAATCTTCACAATGATACACTGTTGACCAACCTCCTTGGTCAGCATGTCCCAGCAACTGTTTGGAATCGCTTGGTAGCTGGACTGAATGCTCAGTTACGGACAGTAAGGCATGGATCAATTCGTACTGCACTAGGTCCTGTTGTTGATTGGATAAATAGCCATGCAAACCCCCAACTTGAGTTCCATGGAGTGAAAATTGAGCTTGGATGGTTCCAAGCAACAGCTTCTGGTTATTATCAGCTTGGTATCGTGGTAGCAGTTGGGGATTATTCCCTTCTTGATTTGCACCAGTCTGATACTTGGGTTGGCACAGATGAATTTATGAGGAAAAATGTGGCACATGGAAGAAAGAATGTTAAGCAGCTGCAGCATAGTTGGCCATACATGAGCAATTCATTATCTCTTAAAAGGATAACTGGAGGAATTAATGGTGGCCTAATAAATGATGCTACCTTAAAATCATTGGACTTTAAAAGGGACTTTCTATTCCCACTTTCTCTACTTTTGTGCAATACTAGACCTGTTGGTCGTCAGGACACTGTACAGTTGCTGATTACTTTGATGCTTTTAGCAGATCTTTCTATCACTCTCCTCATGTTGCTTCAGTTCTACTGGATTGCTCTTGCAGCTTTTCTTTCTGTTCTACTAATTCTTCCTCTTTCTCTACTTTCTCCATTTCCTGCTGGTCTGAATGCATTATTCAGTAAAGAACCTAGAAGAGCTTCACTTTCTCGAGTATATGCACTGTGGAATGCTACTTCTTTATCTAATATTGGAGTGGCTTTTATTTGTTGTCTCCTTCATTATGCATTATCCCACTTTCACCACCCTGATGAGGCAAGTACACGTAATGTTAAGAGGGAAGATGATAAATGCTGGCTTTTGCCTATCATCCTTTTTCTATTCAAGTCGGTACAGGCCCGTTTTGTGAATTGGCACATAGCGAATCTAGAAATTGAAGATTTTTCTCTATTTTGTCCGGATCCAGATGCTTTTTGGGCTCATGAACCTGGTTTATGA 3834 0.4231 MITVNVSGNIKLGQNASIVAGSVVLSAANLTMEYNSYIDSSSLGGSPPSQTSGTPVGNDGAGGGHGGRGASCLKNNKTNWGGDVYAWSTLSEPWSYGSKGGGKSTKKQYGGNGGGRVKLLVKDTLYVNGSITAEGGDGGSDGGGGSGGSILVHAVKLKGYGTISAAGGTGWGGGGGGRISLDCYSIQEDLNITVHGGLSIGCPGNSGAAGTYFNAHLLSLKVSNDNVTTETETPLLDFSTSPLWSNVYVENNAKVLVPLVWSRVQVRGQISVYSGGSLIFGLSDYPISEFELVAEELLLSDSIIKVFGAFRVSVKMLLMWDSTMQIDGGESTVVTASVLEVRNLAVLRQNSVITSNTNLALYGQGLLQLTGDGDAIKGQRLSLSLFYNVTVGPGSLIQAPMDDDASRGTVTKHLCDTQRCPIDLITPPDDCHVNYTLSFSLQICRVEDLLVNGIMKGSIIHIHRARTVIVDTDGMISASELGCTEGIGKGNFLNGAGGGAGHGGKGGSGYFNGRESIGGNEYGNAILPCELGSGTEGPNESYGHVVGGGMIVMGSIQWPLLRLDLYGSLRADGESFSKSITSGDGSLVGGLGGGSGGTVLLFLQELRLLENSSLSVVGGNGGPVGGGGGGGGRIHFHWSKIGMEEEYVPVASISGTMNNSGGAGDNDGHHGHEGTITGKACPKGLYGIFCEECPIGTYKDVDGSDEHLCIPCPLDLLPNRANFIYKRGGVTRRTCPYKCISDKYRMPNCYTPLEELIYTFGGPWPFSVMSVELELKRLKVTVHRMYFMGPNTFREPWHLPYSPPHAIIEIVYEDAFNRFIDEINSVAAYDWWEGSVHSILSVVAYPCAWSWKHWRRRVKISRLQEYVKSEYDHSCLRSCRSRALYKGMKVGATPDLMVAYIDFFLGGDEKRLDIVSIIQKRFPMCIIFGGDGSYMAPYNLHNDTLLTNLLGQHVPATVWNRLVAGLNAQLRTVRHGSIRTALGPVVDWINSHANPQLEFHGVKIELGWFQATASGYYQLGIVVAVGDYSLLDLHQSDTWVGTDEFMRKNVAHGRKNVKQLQHSWPYMSNSLSLKRITGGINGGLINDATLKSLDFKRDFLFPLSLLLCNTRPVGRQDTVQLLITLMLLADLSITLLMLLQFYWIALAAFLSVLLILPLSLLSPFPAGLNALFSKEPRRASLSRVYALWNATSLSNIGVAFICCLLHYALSHFHHPDEASTRNVKREDDKCWLLPIILFLFKSVQARFVNWHIANLEIEDFSLFCPDPDAFWAHEPGL 1277
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pumo8g02121 1277 PANTHER EPHRIN TYPE-B RECEPTOR 778 1272 - -
Pumo8g02121 1277 MobiDBLite consensus disorder prediction 41 70 - -
Pumo8g02121 1277 MobiDBLite consensus disorder prediction 41 57 - -
Pumo8g02121 1277 SMART GCC2_GCC3_2 687 739 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pumo8g02121 Pumo-Chr8 58143964 58158983 Dispersed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Pumo8g02121 - - gmx:100781159 2286.15
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pumo8g02121 8 58143964 58158983 Pumo8g02121 8 58143964 58158983 ECH