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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pumo5g00244 ATGGGTTTCAATTTGATTATGTGGTATCACCCCAATCTGGTTCTCAGTGTTTTGGTGCTCTTTTCCTGTTCCTTTGGCCTTTTCTCTGCAAATGATGAAGTGGGCACTGGTGAAGGTGAAACCTTTACTGTTTCAAGCTTCAGATACCCTGAGACTAGGCTCAGGCCCTTTGATTTGCGCTATATCAGAGTTGACTTGCCACCGTGGTTTTCTGCACTGTCTGTAGCCTTGAACTCAGATGTAGACCTTGATGTCTCAAGAATTGAAAGGGTTCCAATGAGCACATTGCCAATAATATGCTTTAGAGATGGAAGTCCTCCACTGCCGGATGCCTTAAACACATCTCTGAAAGATTCGGCCACCTCTGGGATAAATGGTCTAGATGTGGAGCAGTGCTTTCCTATGCAGAAAAATATCACTATGAAACTGACAAACAATCAGATATCTCCAGGTGTTTGGTACATTGGTCTTTTCAATGGCATTGGACCTACAAGGACACAGTCAAAGATGATTATCCGTGGTCCATCATACTCCTTCATTGCCAATATAAGTGTGGAAGCATGCACAAATTCAATGATGAGGGGGGATTTCTGTAACAGTTCAGTTTATCCACTTTCATGCTCAGCATCTGATGTCTCTAATGCTTTGGAGGCTAAAGTGAACAAATCAATGTTGGAAAATTTGGTGACCTGCAAAAGTAATTTTGAAGCTTTTTGTGTTCATGAAGGTGTGCCTAACTTCTTCTCCCTGGATATCATGAATATGGCAGAACAAATTATCATTACGGCAACAAATATCAGATTCAATGTTACTCCATCAAATGATATTAGTTTAATGTGTTTTGTCCGCCATGGTGCAATGCCTTCTGTGACTTCAAATGATTATTCCATTGATATTGCTAAAAGCTCACTGGTTATTCATTCACCATTAATTGGCCGTTGGCACATTAGTATAGTACCAGTCAATCTTACAAAGACTCGGGATAACAATGTAAGAGTTTGCTATTCAGTGGAATCTCAAGTGCTTCAATGCCCACTTGGGAAAGCTGGACCAAATTGTACAATGGATAGCTACTTGCTTCAGACATTTGTAAGGAGAGGTCCAACCCCCTTTGAGTCATATTATTTACCAGTTGTTGGAGGAGCATCTTATGATTCTGCCAATTTCCCTCTTGAGCCACTTTTAAAAAACTTATACATTGGAGAACCTGATAACGTTTGGACTTACTTTCTTTTGGACATTCCTCGTGGTGCGGCTGGAGGAAATATTCACATACAGCTATCCTCAGATGTGAAGATCAGTTATGAAGTGTATGCTAGATTTGGTGGATTACCATCTCTTGATAGCTGGGACTATTATTATGTTAACAAGACAAGGAGAAGTGATCCATCTATGTTTTTCACGCTATATGACTCAAGTGATAACAAAGTTAATTTTTATATTATGTATGCTAGAGAAGGAACTTGGGGTTTTGGTCTAAGACATCTTAATACCAGCAGTGATTCCACGAAAGGGCTAACTATCATGTCTATTTCACTTGAGCGATGCCCAAAACGATGTTCCTCTCATGGAGAATGTAAATTTTCTTTTGATGCTAGTGGACTGACATCGTACAGCTTCTGCTCTTGTGATCGAAACCATGGAGGCTTTGACTGTAGCATTGAGATTGTAACACATAAAGGGCATGTATGGCAATCAATTTTTCTCATTGTATCAAATGCTGCAGCCATACTTCCTGCCTATTGGGCCCTTCGGAAGAAGGCATTAGCAGAATGGGTTTTATACACATCCAGTGGAATTTCAAGTGGACTATATCATGCATGTGATGTAGGCACCTGGTGTGCATTGAGCTATAATGTCTTACAGTTCATGGACTTCTGGCTCTCTTTCATGGCTGTGATTAGCACTTTTCTTTATCTAGCTACCATTGATGAAGTATTTAAGAGGGCAATCCACACAGCTGTTGCTATCCTTACTGCCCTAATGGCTGCAACAAAAGCAACCAGGTCTTCCAATGTTGTTCTTGTAATTATGATTGGTGCTCTTGGTCTGTTTATTGGATGGTTGATAGAAATCTCAACGAAGTATCGGTCCCTTTCCTTTTCAATTGGAATCTCATTTAATTTCTCTCACTGTTTCCAAACCATAAAGCGATGGCTCTATAATCTTGTCAAGACACTTTTGAGACGGTACCATTGGGCTTTTGCCTTGGCTGGTTTTATTGCATTGGCCATGGCAGCAATAAGCTGGACACTTGAAACCAGTGAAACCTACTGGTTTTGGCATAGCATTTGGCATATTACAATATACACATCTTCTTTCTTCTTCCTTTGTTCAAAAGCAAATATTGAGGATACTGAGAATCAGCTTCCTACAAATGGAAACTATGAACTGACACATCAGGATTCACTTCCAAGAAGTGGTTAG 2427 0.4017 MGFNLIMWYHPNLVLSVLVLFSCSFGLFSANDEVGTGEGETFTVSSFRYPETRLRPFDLRYIRVDLPPWFSALSVALNSDVDLDVSRIERVPMSTLPIICFRDGSPPLPDALNTSLKDSATSGINGLDVEQCFPMQKNITMKLTNNQISPGVWYIGLFNGIGPTRTQSKMIIRGPSYSFIANISVEACTNSMMRGDFCNSSVYPLSCSASDVSNALEAKVNKSMLENLVTCKSNFEAFCVHEGVPNFFSLDIMNMAEQIIITATNIRFNVTPSNDISLMCFVRHGAMPSVTSNDYSIDIAKSSLVIHSPLIGRWHISIVPVNLTKTRDNNVRVCYSVESQVLQCPLGKAGPNCTMDSYLLQTFVRRGPTPFESYYLPVVGGASYDSANFPLEPLLKNLYIGEPDNVWTYFLLDIPRGAAGGNIHIQLSSDVKISYEVYARFGGLPSLDSWDYYYVNKTRRSDPSMFFTLYDSSDNKVNFYIMYAREGTWGFGLRHLNTSSDSTKGLTIMSISLERCPKRCSSHGECKFSFDASGLTSYSFCSCDRNHGGFDCSIEIVTHKGHVWQSIFLIVSNAAAILPAYWALRKKALAEWVLYTSSGISSGLYHACDVGTWCALSYNVLQFMDFWLSFMAVISTFLYLATIDEVFKRAIHTAVAILTALMAATKATRSSNVVLVIMIGALGLFIGWLIEISTKYRSLSFSIGISFNFSHCFQTIKRWLYNLVKTLLRRYHWAFALAGFIALAMAAISWTLETSETYWFWHSIWHITIYTSSFFFLCSKANIEDTENQLPTNGNYELTHQDSLPRSG 808
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pumo5g00244 808 Gene3D - 384 556 - -
Pumo5g00244 808 Pfam Protein of unknown function (DUF3522) 562 767 IPR021910 GO:0016020
Pumo5g00244 808 ProSitePatterns EGF-like domain signature 1. 541 552 IPR000742 -
Pumo5g00244 808 PANTHER FIVE-SPAN TRANSMEMBRANE PROTEIN M83 7 806 IPR021910 GO:0016020
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pumo5g00244 Pumo-Chr5 5844086 5853132 Dispersed/Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Pumo5g00244 - - gmx:100778959 1551.95
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pumo5g00244 5 5844086 5853132 Pumo5g00244 5 5844086 5853132 ECH
Pumo5g00244 5 5844086 5853132 Pumo7g00803 7 14184991 14193971 PCT