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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste9g00280 GGGTCACTTCCTGATTTTTCATGGTTTTCATCGTTGACCATACTATACCTTCGAAATGCAAATATTGTTGGGCCGTTATCATTTGATCACTTTCCCAATCTTCTGGATTTGGATCTTAGTTTCAACAATTTGAATGGACGATTAACTAAGTTGGAGCTCACCAAATTGACCTCGTTAGAAAGGTTAAATCTTGCTCATAATGAATTTATGGGTGAGACCCTTTTATATGATATTGGACATCTTTCTAATTTGACGTGGTTAATTCTGTCTTCCAATAAGTTGAATCGTAATCTCAGTGAAACACATCTAGAAAACCTATCGAGATTGGTGACATTGGATGTGAGTGGAAATTCACTTTCATTTAATTTCAAACCAAATTGGATTCCACCTTTTCAATTGGAAAGGTTATTTGCTTGGTCGTGCCTTTTAGGACCTCAATTTCCAACGTGGCTAAAATATCAGACGAAACTTCAAGTCCTGGAAGTTTCTAATACTGGATCAATTCCTAAATGGTTTTGGAGTATATCTTCAAGTTTGTTACACTTAAATGTTTCTCATAACAAACTCAGTGGAGTCTTACCAAAATCATTATCAAGTATAAAAGTAGAATACAGTAGTCTATGGGATTTTAGTTTCAACAACTTGTCTGGTCCAGTGCCACCTTTTCCAAAACTATTTGCTCTATATCTCTCAAACAATATGTTCTCAAGGTCTATATCTTCCTTCATTGCAACATTGTGGCCAACAGATTTAACTTACCTTGACATGTCTAGTAACTTACTTGTGGGGCCACTTCCAAATTGTTGGGACAAATTTCACAATTTAGAAGTATTGAATTTGGCAAACAACAGTTTATCAGGGAAAATACCATCGTCATTTGGCACTTTACTGCATATTAGGTCGATACATTTAAACAACAACAACTTTTTTGGTGAAGTTCCATCGTTGAGTCTTTGCAAAGGTTTAATAGTCATTGATTTTGGTGATAATATTCTTGAAGGAACATTACCAACATCAATAGGCGACAACCTGCCTCAGTTGATTGTTTTAGGTCTACGTGCTAATAAGATTCAAGGAAGTGTTCCCACAAGTTTATGTCATTTATCATTTCTTCAAGTATTGGATCTCTCTAGCAATGAAATTACAGGAAAAATACCACAGTGCCTTAATCATATGAGTGCTTTATCAAAAAAGAAGTTGCAAACTAGAACCACTTTGTACGGTATAATTCCTGCCTTTTCACCGTCTTATTGGATTATAACTTTTGTTGATGATGTAATATTGGCATGCAAAGGAAAAACCAGAGAATATGGGAATATTCTTAAACTTATGATAATGATTGATCTTTCTGATAACCACTTAACAGGAGAGATACCACAGAGTATAACAACACTTACGGCCTTAATTTCCTTAAACCTTTCAAATAATAATTTGACAGGGTTTATTCCCTGTAACATTGGTCACATGGAAAGGTTGGAATCACTTGATTTGTCAAGAAGTCATCTTCATGGTAAAATGCAAGAAAGTTTTTCAAACTTGAGTTTTCTGAGTTACATGAACTTGTCTTTCAACAACTTATCAGGAAAAATTCCAACAAGCACTAAAATACAATCCTTAAATGTCTCTACATATGTAGGAAACGGTGGGCTTTGTGGCCCACCACTCACAATTCAATGTCCCTGGGATGTGATCTCACCAAGTGGAGGAGTTGATAAAAAAGACACTTTTGAAGATGAGGATAAAATCCTTTGGGTTTTACATCAGCCTTGGATTGGGATTTTGTGTTGGATTTTGGGGTGTGTGTGGAACACTAATTATAAAAAGTTCATGGAGACACAATTGAATCTCAGGCTATCATTTTTCATAGGTAAGATAGATTCTTCCATATGTGAATTCCATCATCTCACTTTAATAGATCTCAGTTTTAATCACTTTGAAGGAGAGATTCCAAAGTGCATTGGTTCACTGACTCACTTGATAGAGTTGAATATTGCACAGAATAGACTTGTTGGTTCAGTTCCTCGAACTCTTTCCAATTTGCAACATCTTGATATTTGGAATAATAATAATTTAGCTATTGATTGGCCATCCTCAATAAGTAAAATCCCTTCTCTATCGGAGCTTTATTTAGATGATTGCAAACTCCCTCAAAGCAATCTTAAATCTATCTCCCACATCAATTCTTCCACTTCTCTCCAAATCCTAAGTTTTCGAGGAAATGAATTAAACTCTTCAATATTGTCATTGATGTTTAATGTTAGCAAACGCCTCACATATCCTGATGTCTCATCATATTCTTTGCAAAGTGTTCTAGATGCCTTTGCAAACATGAATTCTTTTCAATATCTATATCTCTCATATAATGAACTTAATGGATTTATTCCCTGTAACATTGGTCACATGAAAGGTTGGAATCACTTGATTTATCAAGAAACCATCTTCATGGTAGAATGCCAGAAAGCTTCAAATTTGAGTTTTCTGAGTTACATAAATTTGTCTTTCAACAACTTATCAGGAAAAATTCCAACAAGCACTCAACTACAATCCTTTGATGCCTCTACAAACAGTGGGCTTTGTGGCCCACCACTCATAAACCAATGCCCCTGGGATGTGATTCCACCAAGTGGAGGAGTTGATGAAGGCACTTTTAAATATGAAGATAAAATCATAAACTTTGGGTTTTACATCAGCCTTGGACTGGGATTTTGTGTTGGATTTTGG 2721 0.3539 GSLPDFSWFSSLTILYLRNANIVGPLSFDHFPNLLDLDLSFNNLNGRLTKLELTKLTSLERLNLAHNEFMGETLLYDIGHLSNLTWLILSSNKLNRNLSETHLENLSRLVTLDVSGNSLSFNFKPNWIPPFQLERLFAWSCLLGPQFPTWLKYQTKLQVLEVSNTGSIPKWFWSISSSLLHLNVSHNKLSGVLPKSLSSIKVEYSSLWDFSFNNLSGPVPPFPKLFALYLSNNMFSRSISSFIATLWPTDLTYLDMSSNLLVGPLPNCWDKFHNLEVLNLANNSLSGKIPSSFGTLLHIRSIHLNNNNFFGEVPSLSLCKGLIVIDFGDNILEGTLPTSIGDNLPQLIVLGLRANKIQGSVPTSLCHLSFLQVLDLSSNEITGKIPQCLNHMSALSKKKLQTRTTLYGIIPAFSPSYWIITFVDDVILACKGKTREYGNILKLMIMIDLSDNHLTGEIPQSITTLTALISLNLSNNNLTGFIPCNIGHMERLESLDLSRSHLHGKMQESFSNLSFLSYMNLSFNNLSGKIPTSTKIQSLNVSTYVGNGGLCGPPLTIQCPWDVISPSGGVDKKDTFEDEDKILWVLHQPWIGILCWILGCVWNTNYKKFMETQLNLRLSFFIGKIDSSICEFHHLTLIDLSFNHFEGEIPKCIGSLTHLIELNIAQNRLVGSVPRTLSNLQHLDIWNNNNLAIDWPSSISKIPSLSELYLDDCKLPQSNLKSISHINSSTSLQILSFRGNELNSSILSLMFNVSKRLTYPDVSSYSLQSVLDAFANMNSFQYLYLSYNELNGFIPCNIGHMKGWNHLIYQETIFMVECQKASNLSFLSYINLSFNNLSGKIPTSTQLQSFDASTNSGLCGPPLINQCPWDVIPPSGGVDEGTFKYEDKIINFGFYISLGLGFCVGFW 907
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste9g00280 907 Pfam Leucine rich repeat 447 502 IPR001611 GO:0005515
Pste9g00280 907 SMART LRR_typ_2 656 679 IPR003591 -
Pste9g00280 907 SMART LRR_typ_2 177 199 IPR003591 -
Pste9g00280 907 SMART LRR_typ_2 272 296 IPR003591 -
Pste9g00280 907 SMART LRR_typ_2 368 392 IPR003591 -
Pste9g00280 907 SMART LRR_typ_2 81 105 IPR003591 -
Pste9g00280 907 SMART LRR_typ_2 489 512 IPR003591 -
Pste9g00280 907 SMART LRR_typ_2 56 80 IPR003591 -
Pste9g00280 907 SMART LRR_typ_2 344 367 IPR003591 -
Pste9g00280 907 SMART LRR_typ_2 465 488 IPR003591 -
Pste9g00280 907 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 1 130 IPR032675 -
Pste9g00280 907 PANTHER LRR RECEPTOR-LIKE KINASE 10 610 - -
Pste9g00280 907 SUPERFAMILY L domain-like 440 850 - -
Pste9g00280 907 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 601 871 IPR032675 -
Pste9g00280 907 FunFam LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase ERECTA 435 559 - -
Pste9g00280 907 SMART LRR_sd22_2 81 108 - -
Pste9g00280 907 SMART LRR_sd22_2 656 682 - -
Pste9g00280 907 SMART LRR_sd22_2 248 277 - -
Pste9g00280 907 SMART LRR_sd22_2 368 391 - -
Pste9g00280 907 SMART LRR_sd22_2 729 755 - -
Pste9g00280 907 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 131 562 IPR032675 -
Pste9g00280 907 SUPERFAMILY L domain-like 249 556 - -
Pste9g00280 907 Pfam Leucine Rich Repeat 274 295 IPR001611 GO:0005515
Pste9g00280 907 Pfam Leucine Rich Repeat 371 391 IPR001611 GO:0005515
Pste9g00280 907 SUPERFAMILY RNI-like 6 243 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste9g00280 Pste-Chr9 1287474 1294855 Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste9g00280 251 905 Receptor kinase-like Gene Family AT2G33060 25.267 5.70e-26 112
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste9g00280 9 1287474 1294855 Pste9g00280 9 1287474 1294855 ECH