LGRPv2

Gene search

Sequence information

Select	Gene	Cds	Cds_length	GC_content	Pep	Pep_length
	Pste6g02088	TATCAGAGGAAGCAACCAACAGAAGCATCGTCGTCGTCATCACCACCCAATAACTCAGTCAAAGCTTCACACCTTTGTTCTTCTTCATCGTTACAATATCTCTCTTCGACCCTTTTCCTCAAAGTTCCAAAATTTGTGTTCTCCGGCACGCCCCAGTTCCCTTTTAACAATCTTCAACGCCGTTAGCCGGTATTTCAAAAAACCCCTCTTTTCTTAATTTCGAACCGGAAACCCTAGCTCCTGTGGCCCCAATTTTCGCCTTCTCAATTGGCTTCTGAAGTCGGGGGAAAAGCAAAAGGAATCAATTTATTTGGGGATTTCACCTCACAAACCCTAGTTTTGGATCTTGCTTCGGAGTTCAAATTTTGGCGCTTTTTCTTGCATTAGTTTAACTAATAGAACTACTTGTGTTACGATGCCGAGGGCAGTATGCTGGTTATAGTTGGGGGAAATGCAAAGGTATCATGCTGGCAGCTGCACTAGTGCAGTTAATAACAGTTCAATAGGTGGACCATCTGCTAGGGACACAGGAAGATCTGATTCACCTTCTTTGCCCGCTAACTTCTCTGTAAGTTCAAGGCGGCAACCACTGTTAAACCCATACAAGTTGAAGTGTGATAAAGAACCCTTGAACTCTAGGGGGATAGGGATAGAAGATGGGGATTCAGATTTGTTGGTTCTGGAAATAGAGCATCGGTTTAGTTGTGGAAGAGGAAACTCTTGGAAGGAGAATGCTCTCCTTTTTCCTCATGAAATTCCATCCTCTTTCTCTATCTCTAGCTTCATTAGTTATTTATCACGGTCACAGGAAGCTAGAGAAATTTCACTGACCCAAGTTCCGCAGTTTAACAAGACAGTTGTTCTTAATTGCAAAGAGGCTATTAGAAAACGTCTGAGGGCCATCAATGAATCTCGTGCTCAGAAGAGGAAGGCTGGTCAAGTATATGGTGTGGCTCTTTCAGGATCACAACTTGCCAGGTCTGGCATTTACCCTGAACTAAGATCTTATAGTGAGGAGTTCCAGAAGAAATGGATTGAGGCAAATGAGTTTCGATTAGAGCAAAAGTCCATGGGTAGGTGTGGACAGGCTGAGCAACCTTATTGTGAGAGGTGTAACCTAAGAGGGTGGCCCATGTGCCCAAAAATGGTATGGTTTGGCTGGTGCAGGCGTGTCATGAAAATCACGCGAGGGCACTTGAGGAGCATTTTGGCTGCGTGGTGGCCAGATCTTAGTACATCAGCCTGCGATGATCGTTGCAGTGGTGGTCATGGTCGGAAAGGCGGTGGCCGACATGATGGTGGCAGCAGTCTTGGGAAAAAGGGTTTATCTCAGCAGCACAAGCGATTACGCTCTTTGGCTGATCATATTCCTCATGGTTATAAAAGGGCATCACTTTTAGAGGTTCTTATCAGGAATAATGTTCCATTGCTTAGGGCCACTTGGTTTATCAAGGTTACTTACCTCAATCAGGTTCGACCTGGTTCTGTTGGAATTTCTTCTGGGGCTGCTGACAAGATTCAATTGTCTCGCTCTGATGTTTGGACTAAAGATGTTATCAATTACTTGCAAACTCTGCTGGATGAATTTTTGTCAAAGAATGCTTCCCATTCTGCTTCTCATGGTCGAGAACGATCACCACAAATGCCTTATACTGGATCACTGCAGAATAAAAATGACCCATTGTTTTCTGTTTCTGATGGTGAAGGGCCATCCTTACATTTTAGATGGTGGTATATTGTGCGGCTTCTGCAATGGCATCATGCTGAAGGACTGCTTCATTCTTCTCTTGTCATTGATTGGGTTTTTAATCAGTTACAGGAAAAAGAACTGCTTGAGGTTTGGCAGTTGTTATTGCCTATTATATATGGTTTTTTAGAAACTATTGTCCTATCTCAAACTTTTTTACGCACTCTTGCTGGATTAGCTCTTCGTGTCATTTGTGATCCTGCTCCAGGTGGTTCAGATCTAGTAGACAATTCCAGGAGGGCATATACAACATATGCTGTAATTGAGATGCTCCGGTATTTAATACTTGTGGTGCCAGATACTTTTGTTGCTTTGGATTGCTTTCCGTTACCATCCTCTGTAATTTCACATACAATGAATGATGGGAGTTTTGCACTAAAATCAACTGAAGCTGCAGGGAAGGTAAAAAATACTTCTGTTGATTTTGGTCACATTGTTTCATGCATCCAGAAATATACAGAAGATCTTGCAAAGGCTGCAAGCCCTGGCTATCCAGGTCATTGTCTGGCTAAAGTTGCAAAGGCTCTGGATAAAGCACTTGTTCTGGGTGATTTGCGTGTAGCATATAAATTACTGTTTGAAGATCTTTATGGTGGAACTGTATCTGAAGGTTGGGTTGCAAAAGTCAGCCCTTGCTTAAGATTATCTCTGAAATGGTTTGGATCTGTAAATACACCCCTTATATATTCCGTGTTTTTCCTTTGTGAGTGGGCAACTTGTGATTTTAGGGATTTTCGTGGTACACCTCCTCGTGACATTAAGTTAACAGGTAGGAAAGATCTTTCCCAAGTGCATATAGCAGTTAGACTTTTAAAGATGAAGATTAGGGATGTGAAGATTTCACTAAAACAAACAAATGAAAATCACAAGGCCAGTCATTTTGCAAAGAATTCTAATCAGCGGCATAATTGGAATTATGTCGGTTATGTATCCAGATTGAAATCTAGTTCAAAGATTACAGGTTCTTCACTTTTATTTGAAAGCCCAGGTCCTCTACATGATCTTATAGTTTGTTGGATTGATCAGCATGTGGTGCATAAAGGGGAAGGTCCCAAGCGTCTACATCTATTTATGATGGAACTCATACGTGCAGGCATCTTTTACCCCTTGGCATATGTACGCCAGCTGATAGTGAGTGGCATCATGGATGTGAAGGTTAATGTGGTTGACCTGGAGCGACGAAGGAGACACTATCGCATCTTAAAGCAGCTACCTGGATGCTTTATCCATGATGTTTTGGAAGAATCAGGGATTGTTGAAGGGCCACAGCTCAAAGAAGCCTTGCAAATTTACTTGAATGAACGTCGCCTCATACTTCGGGGTCCTCTGAGTGGGTCCAATGGTGATACCAGTGCTACCAATTTCTCTGCTCAGAAGAAGAAAAAATATCCTGTTTTTACAAAGGATGAAGCTTTTGGAGTGCCAATTGATCAGAGAAATGTTATCTCTACCACAATATCTTCTAAGAGTGCAAAGTATAATGCTAACGTTGAAGAATTAAGAACAGCAATCTCAGTACTGTTACAGCTACCTAACTGTTCATCTAATTTGAGCACTACAAGTTGTGATGATTCTGAAGGCAGTGTTACAAGACCTATTGGGTCTCTGTTCAGCAAAATTGATCTTGTGGAAGGTACACCTGGGTGTGAAGAATGTAGCAGAGCAAAGAGACAAAAGTTAAGTGAGGAAAGAAGCTCATTTGTTCAAGGGCATTCTCCAGTTCAATCTGATGATGACGATACATGGTGGGTGAAAAAGGGAATAAAATCGCCAGAGCCTTTCAAAGTTGATCAACCACAAAAGTCAACCAAGCAGGTCACCAAGAGTCGGCAGAAGAATGTGCGTAAAACTCAGAGTCTTGCTCAACTGGCAGCTTCTAGAATTGAGGGTAGCCAAGGGGCATCAACTAGTCATGTGTGTGGTAACAAGGTAAGCTGCCCTCACCACAGAAATGCTATGGATGGAGACGGGCAGTGGTCTGTGGATAGCACCCGCACAAGTCATTTTGGGGATATAGTTTCCATTGGAAAAGCACTAAAGCAACTACGTTTTGTTGAGAAAAGAGCAATAGCAGTTTGGCTGTTGACTGTTGTTAGGCAGGTAATCGAAGAGGTGGAGAAAAATGTTGGTAAGGTTGGTCAGTTTGGCAGGCCTTTTTCTGTTGCTGCAGAGGATAGAAGTTCATTACGGTGGAAACTGGGTGAGGACGAACTTTCTACAATACTTTATTTGATGGATATTTCTGAAGATTTAGTATCAGCTGTCAAGTTCCTCCTTTGGTTGCTGCCAAAGGTTCTTAATAGCCCCAATTCAACAATTCATTCTGGGAGGAATGTGCTGATGCTACCTAGGAATGTGGAAAACCAAGTTTGTGATGTGGGAGAGTCTTTTCTGCTATCATCTCTCAGAAGGTATGAGAATATTCTTGTTGCAGCAGACCATATTCCTGAAGCTCTGTCATCTGCAATGCAACGTGCAGCCACTGTTATTGCATCTAATGGAAGGGTTTCTGGGTCAGGGGCCCTAGCTTTTGCTCGGTATTTGTTGAGAAAATACAGCAATGTAGCTAGTGTCATTGAGTGGGAGAAAACTTTTAAGACTACATGTGATGCAAGACTTTTATCTGAACTTGAGTCTGGTAGGTCAGTGGATGGAGAGTTAGGGTTGCCCCTAGGAGTTCCTGCTGGAATAGAGGACCATGATGATTTTTTCCGTCAGAAGATCAGTGGTGGTCGGTTACCATCCAGAGTAGGTGCAGGTATGAGGGACATAGTGCAGCGACATGTTGAAGAAGCGCTACATTATCTTTTTGGAAAGGATAGAAAGCTCTTTGCTACTGGTACACCAAAAGGTCCTGCTTTAGAAAAATGGGATAATGGATATCAAATTGCTCAACAAATAGTTATGGGTCTGATTGATTGCATAAAACAGACAGGTGGTGCTGCTCAAGAAGGAGATCCCTCTTTGGTCTCTTCTGCTGTTTCGGCAATTGTTGGCAGTGTTGGTCCAACTTTAGCAAAACTGCTTGATATTTCATCTGGCAAAAATTATTCAAGTTTAACAGCAGCTACAAATTCATTGAACTCTGCCAGGAGCTTGTTGCGAATGCATATAACCTGTCTATGCCTGCTTAAGGAAGCTCTGGGAGAACGGCAGAGCCGTGTATTTGATATTGCTCTTGCTACTGAAGCTTCTACTGCTCTTACTGGTGTCTTTACTCCTAGTAAAGCATCTCGTTCTCAGTTTCAAATGTCCCCTGAAGCCCATGATTCTAGTAACACTATTTCAAATGATATGGGAAACAATTCTAATAAAATTGTGATTGCAAAAACAACCAAAATTGCTGCTGCTGTTTCTGCACTTCTCCTTGGTGCAATTATATATGGTGTTACCAGCCTGGAAAGAATGGTCACAGTTCTAAGATTGAAGGAGGGGCTGGATGTAGTACAATTTGTAAGAAGCACAAGATCCAATTCAAATGGAAATGCTCGTTCAGTTATGGCTTCAAAGGTGGAAAGTTCAGTTGAAGTTCATGTCCATTGGTTTAGATTGCTTGTTGGAAACTGCAGAACGATCTGTGAAGGTTTAGTTGTGGAACTCTTGGGTGAACCATCTATTATGGCTCTTTCAAGGATGCAACATATGCTTCCTCTGAATTTGGTTTTTCCACCTGCCTATTCAATATTTGCCTTTGTTAGGTGGCGGCCTTTCATTGTGAATGCTACAGTTCGTGAAGACATGAATCAAATTTATCAGTCTCTTACAGCAGCCATAACTGATGCATTAAAACATTTGCCATTTCGAGATGTATGTTTTAGAGATTGTCAGGGTCTTTATGATCTTATGGCTGCAGATGCAAGTGATTCTGAATTTGCAACCTTGCTAGAGTTTAATGGGTCTGACATGCATTTAAAATGTACAGCATTTGTTCCTCTACGCTCTAGGCTTTTCCTGAATGCCATGATTGATTGTAAGATGCCACAATCTATGTATACAAAGGATGATGGAAGCCGAAGTTCTGGATCTGGTGAGTCTAAAATTAAATTCATAGATAGTGATTCTAAGCATCAGGATATGCTTGTGCATGTTTTGGATACCTTGCAACCTGGGAAATTTCACTGGCAGTGGGTTATACTTAGGTTGCTTTTAAATGAACAAGCGCTCATTGAAAAACTGGAGAATCATGATGTGTCTTTAGCTGATGCTATAAAATTGTCCTTACCAAGTCCAGAGAAGGCTGCTGCTGCTTCGGAGAATGAGAACAATTTCATTCAAATACTTCTCACAAGGTTACTGGTTAGACCTGATGCTGCGCCCCTTTTTTCGGAGTTGATTCATCTCTTTGGTAGGTCACTAGAGGATTCAATGTTGTTGCAAGCTAAATGGTTCCTTGGAGGCCAGGATGTCCTCTTTGGTCGGAAGACCATTAGACAAAGGCTGCATAACATTGCTGTGAAAAAAAATCTTTCTGTTAAGATCCAATTTTGGGAGCCATGGGGTTGGTGTAATCCATCTACTGATCCATTATTGACTATCAAAGGGAATAACAAGAAGTTTGAGAGCATGCCTCTTGAAGAAGGAGAAGTTGTTGAAGAGGGAATGGATTTGAAAAGGTGCCAGCAACAAGTTACTGAGAGGGCTCTTATTGAGTTGCTTCTTCCTTGCATAGATCAAAGCTCTGATGAATCCCGCAATTCCTTTACAAATGATTTGGTGAAACAGTTAAGTTATATTGAGCAACAAATAACTGCTGTTACAGGTGGAAGTAAACCAGTGGGAAGTGCTCCTGGAGTTGAAGGTCAGCCAAATAAAGTAAACAACCGGAAAAATATGAGAGGTGGAAGCCCTGCATTAGCTAGACGACCAACAGTGGCAGCAGATTCTTCTCCCCCATCTCCTGCTGCTCTACGAGCTTCTATGTCATTACGTGTGCAGTTACTCCTGAGATGTCTTCCTATTCTTTGGGCTGACAGGGAGCCAACTATGCGTGGCACGAGACAAATTCTTGCAACTGTAATTTTTCGTCTCCTTGGTAGCCGGGTTGTGCATGAGGATGCAGACATTTTGGTGAATGCTGTGCCATCTCTGCCAATGAGGGAGACAGAGTCATCTTTTGAAGTTGCTTCTGCTGCTTTTGTAGATTCTTCTTCTGGGAGTCTGTTCGATCGTTTGCTGTTGGTTTTGCATGGGTTGTTAAGTAGTTGTCCTCCAGGTTGGCTTAGGCCAAAGCCTGTTTCGAAGATGATACATGAACCTGTGAGGGATTTTTCTGTAACTGACCGAGAATTATTGGAGACTTTGCAGAATGACTTGGATCGTATGCAACTTCCGGACTCTATTCGGTGGCATATCCAAGCAGCAATGCCCATACTCATCCCCTCGATGCGATGCTCTTTATCCTGCCAGCCACCATCCGTTTCAAATTCTGCTCTTGTTTGCCTTCAACCCAGCATTACAAATCCTGGGTTAAACTCCAGTGGTTCAACTATCCCTCATAGGAACCCGGTTCTATCAAGGGTTGCATCTAATACATCAGGGAAGTCAAAACAACAGGACAATGATTTAGAAATTGATCCTTGGACGCTTTTAGAAGATGGTGCTGGATCTTACCCTTCAGCAGGTAATACTGCTAGCATAGGAAGTGGTGACCCATTTAATATTCGAGCTGCCAGCTGGCTTAAAGGGGCTGTAAGGGTCAGACGGACTGACCTCACATATATTGGCTCTGTGGATGACGATAGTTGATTAACGATATTTTTTGTTGGTTTGGACATTGGAGTATACGAACCCCTTGGCAGGTGCTTTTATATTGGATGCATGATGGCATGAAGATGTCATTTTGTGCTTGTCCTTCTTATGTTGAAGTTGAAGGGAAGCTGAAGGGGCATTGTTTTGACTTTTGAAAAAAGAATGGGTGAAGGGATGGGTTCAAGACAGCTCATCCAATGGTTCTACTAGCCTGGTTTACTACTAATCTGTTGATCACCCCATCTGGATTGTGCACTTGCTGGCACAGTTCTTAGGTTTGTTGTATATATAGGGATGATTGTTTTACTTTGCCAATTGATCCAACATAGTGTCAAGTGATCTGTAGCTGTTTCATGTTCATTTTTATGTCAAATGAACGCTTGTGTGAGCACTGTCTATAGCTTTTAGGGGCACAAGCTCGCACAAGCGTAACCAACCATTGTTTTTCTCATACTCAAATTATCAAAAGTTATGTGGTGATCTGGAGCTTAACCATGAGCTGCAGCATTCAATTATTTGTTTGCAATTCTAGAGATAGTTTCGTTTCAGCCTAAATATTGTTAGTACTAAAAAATTACTGTGTATGCACAAATAAGCAAGGGAAAGAATTGTTAGCTTTGGGCAAATGCACACTTGTATATTATATTTATGCTGTAATGTATTAGCAGG	8164	0.4206	MQRYHAGSCTSAVNNSSIGGPSARDTGRSDSPSLPANFSVSSRRQPLLNPYKLKCDKEPLNSRGIGIEDGDSDLLVLEIEHRFSCGRGNSWKENALLFPHEIPSSFSISSFISYLSRSQEAREISLTQVPQFNKTVVLNCKEAIRKRLRAINESRAQKRKAGQVYGVALSGSQLARSGIYPELRSYSEEFQKKWIEANEFRLEQKSMGRCGQAEQPYCERCNLRGWPMCPKMVWFGWCRRVMKITRGHLRSILAAWWPDLSTSACDDRCSGGHGRKGGGRHDGGSSLGKKGLSQQHKRLRSLADHIPHGYKRASLLEVLIRNNVPLLRATWFIKVTYLNQVRPGSVGISSGAADKIQLSRSDVWTKDVINYLQTLLDEFLSKNASHSASHGRERSPQMPYTGSLQNKNDPLFSVSDGEGPSLHFRWWYIVRLLQWHHAEGLLHSSLVIDWVFNQLQEKELLEVWQLLLPIIYGFLETIVLSQTFLRTLAGLALRVICDPAPGGSDLVDNSRRAYTTYAVIEMLRYLILVVPDTFVALDCFPLPSSVISHTMNDGSFALKSTEAAGKVKNTSVDFGHIVSCIQKYTEDLAKAASPGYPGHCLAKVAKALDKALVLGDLRVAYKLLFEDLYGGTVSEGWVAKVSPCLRLSLKWFGSVNTPLIYSVFFLCEWATCDFRDFRGTPPRDIKLTGRKDLSQVHIAVRLLKMKIRDVKISLKQTNENHKASHFAKNSNQRHNWNYVGYVSRLKSSSKITGSSLLFESPGPLHDLIVCWIDQHVVHKGEGPKRLHLFMMELIRAGIFYPLAYVRQLIVSGIMDVKVNVVDLERRRRHYRILKQLPGCFIHDVLEESGIVEGPQLKEALQIYLNERRLILRGPLSGSNGDTSATNFSAQKKKKYPVFTKDEAFGVPIDQRNVISTTISSKSAKYNANVEELRTAISVLLQLPNCSSNLSTTSCDDSEGSVTRPIGSLFSKIDLVEGTPGCEECSRAKRQKLSEERSSFVQGHSPVQSDDDDTWWVKKGIKSPEPFKVDQPQKSTKQVTKSRQKNVRKTQSLAQLAASRIEGSQGASTSHVCGNKVSCPHHRNAMDGDGQWSVDSTRTSHFGDIVSIGKALKQLRFVEKRAIAVWLLTVVRQVIEEVEKNVGKVGQFGRPFSVAAEDRSSLRWKLGEDELSTILYLMDISEDLVSAVKFLLWLLPKVLNSPNSTIHSGRNVLMLPRNVENQVCDVGESFLLSSLRRYENILVAADHIPEALSSAMQRAATVIASNGRVSGSGALAFARYLLRKYSNVASVIEWEKTFKTTCDARLLSELESGRSVDGELGLPLGVPAGIEDHDDFFRQKISGGRLPSRVGAGMRDIVQRHVEEALHYLFGKDRKLFATGTPKGPALEKWDNGYQIAQQIVMGLIDCIKQTGGAAQEGDPSLVSSAVSAIVGSVGPTLAKLLDISSGKNYSSLTAATNSLNSARSLLRMHITCLCLLKEALGERQSRVFDIALATEASTALTGVFTPSKASRSQFQMSPEAHDSSNTISNDMGNNSNKIVIAKTTKIAAAVSALLLGAIIYGVTSLERMVTVLRLKEGLDVVQFVRSTRSNSNGNARSVMASKVESSVEVHVHWFRLLVGNCRTICEGLVVELLGEPSIMALSRMQHMLPLNLVFPPAYSIFAFVRWRPFIVNATVREDMNQIYQSLTAAITDALKHLPFRDVCFRDCQGLYDLMAADASDSEFATLLEFNGSDMHLKCTAFVPLRSRLFLNAMIDCKMPQSMYTKDDGSRSSGSGESKIKFIDSDSKHQDMLVHVLDTLQPGKFHWQWVILRLLLNEQALIEKLENHDVSLADAIKLSLPSPEKAAAASENENNFIQILLTRLLVRPDAAPLFSELIHLFGRSLEDSMLLQAKWFLGGQDVLFGRKTIRQRLHNIAVKKNLSVKIQFWEPWGWCNPSTDPLLTIKGNNKKFESMPLEEGEVVEEGMDLKRCQQQVTERALIELLLPCIDQSSDESRNSFTNDLVKQLSYIEQQITAVTGGSKPVGSAPGVEGQPNKVNNRKNMRGGSPALARRPTVAADSSPPSPAALRASMSLRVQLLLRCLPILWADREPTMRGTRQILATVIFRLLGSRVVHEDADILVNAVPSLPMRETESSFEVASAAFVDSSSGSLFDRLLLVLHGLLSSCPPGWLRPKPVSKMIHEPVRDFSVTDRELLETLQNDLDRMQLPDSIRWHIQAAMPILIPSMRCSLSCQPPSVSNSALVCLQPSITNPGLNSSGSTIPHRNPVLSRVASNTSGKSKQQDNDLEIDPWTLLEDGAGSYPSAGNTASIGSGDPFNIRAASWLKGAVRVRRTDLTYIGSVDDDS	2346

Annotation information

Select	Seq ID	Length	Analysis	Description	Start	End	IPR	GO
	Pste6g02088	2346	SMART	Med12_2	255	334	IPR019035	GO:0003712\|GO:0006357\|GO:0016592
	Pste6g02088	2346	MobiDBLite	consensus disorder prediction	2019	2064	-	-
	Pste6g02088	2346	Pfam	Transcription mediator complex subunit Med12	290	334	IPR019035	GO:0003712\|GO:0006357\|GO:0016592
	Pste6g02088	2346	PANTHER	MEDIATOR OF RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION SUBUNIT 12	1	63	-	-
	Pste6g02088	2346	MobiDBLite	consensus disorder prediction	1022	1050	-	-
	Pste6g02088	2346	MobiDBLite	consensus disorder prediction	271	291	-	-
	Pste6g02088	2346	MobiDBLite	consensus disorder prediction	993	1012	-	-
	Pste6g02088	2346	MobiDBLite	consensus disorder prediction	1028	1050	-	-
	Pste6g02088	2346	MobiDBLite	consensus disorder prediction	1	40	-	-

Duplication type information

Select	Gene	Chromosome	Start	End	Duplicated_type
	Pste6g02088	Pste-Chr6	9849074	9871094	Wgd

Event-related genes

Select	Gene_1	Chr_1	Start_1	End_1	Gene_2	Chr_2	Start_2	End_2	Event_name
	Pste6g02088	6	9849074	9871094	Pste6g02088	6	9849074	9871094	ECH