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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste5g01349 ATGATCCGAGAGTTGCCTCAAAATCGCAGGAACCGTGATAAAAGGATGGGTTTCAATTTGATCCTCTGGTGTCGTCCCAACCTGGTTCTCAGTGTTTTGGTGCTCTTTTCCTGTTCCTTTGGTCTTTTCTCTGCAAATGATGAAGTGGGCACAGGTGAAGGTGAAACCTTTACCGTTTCAAGCTTCAGATACCCTGAGACTAGGCTCAGGCCCTTTGATTTGCGCTATATCAGAGTTGACTTGCCACCGTGGTTTTCTGCAGTGTCTATAGCATTGAACTCAGATGTAGACCTTACACGTTTTCAGGATGTCTCAAGAATCGAAAGGGTTCCAATGAGCACATTGCCAATTATATGCTTTAGAGATGGAAGTCCTCCACTGCCAGACGCCTTAAACACATCTCTGAAAGAGTCAGCTACCTCTGGGATAAATGGTCTAGATGTGGAGCAGTGCTTTCCTATGCAGAAAAATATCACCATGAAACTGACAAACAATCAGATATCTCCAGGTGTTTGGTACATTGGTCTTTTCAATGGAATTGGACCTACAAGGACACAGTCAAAGATGATTATCCGTGGCCCTTCATACTCCTTCATGGCAAATATTAGTGTGGAAGCATGCACAAATTCAATGATGAGAGGGGATTTCTGTAACAGTTCAGTTTATCCATTTTCATGTGCTGCTTCTGATGTTTCTAATGCTTTAGAGGCTAAAGTGAACAAGTCAATGTTGGAGAATTTGGTGACCTGCAAAAGTAATTACGAAGCTTTTTGTGTTCACAAAGGTGTGTCAAACTTCTTCTCCCTGGATATAATGAATGTGGCAGAAGAAATTATCATTACAGCAACAAATATCAGATTCAATGTTACTGCATCAAATGATATTAGTTTATTGTGTTTGGTCCGCCATGGTGCAATGCCTTCTGTGACTTCAAATGACTATTCCATTGATATTGCTAAAAGCCCACTGGTTATTCATTCACCATTAATTGGCCGTTGGTACATCAGTATATTACCAGTCCATCTTACAAAGACTCAGGATAACAATGTAAGAGTTTGCTATTCGGTGGAATCTCAAGTGCTTCAGTGCCCACTTGGGAAAGCTGGACCGAATTGTACAATGGATAGCTACTTGCTTCAGACAATTGTAAGGAGAGGTTCGACCCCCTTTGAGTCATATTATTTACCAGTTGTTGGAGGAGCATCTTATGATTCTGCCAATTTTCCTCTCGAGCCACTTTTAGAAAAGTCATCATACGTTGGAGAACCTGAAAACATTTGGACTTACTTTCTTTTGGACATTCCTCGAGGTGCAGCTGGAGGAAATATTCACGTTCAGCTATCCTCAGATATGAAGATCAATTATGAAGTGTATGCTAGATTTGGTGCATTACCATCTATTGATAGCTGGGACTATTATTATGCTAACAAGACAAGGAGAAGCGATCCATCTATGTTTTTCACACTATATGACTCAAGTGATGACAGAGTTAATTTTTACATCATGTATGCTAGAGAAGGAACTTGGGGTTTTGGTCTAAGACATATTAATACAAGCAGTGATTCCATGAAAGGGCTAACTATCATGTCTATTTCACTTGAGCGATGCCCAAAACGATGTTCCTCTCACGGAGAATGCAAATTTTCATTTGATGCTAGTGGATTGACATCTTACAGCTTCTGCTCTTGTGATCGAAACCATGGAGGCTTTGACTGTAGCATTGAAATTGTGACACATCAAGGGCATGTACGACAATCAATTTTCCTCATTGTATCAAATGTTGCAGCCATACTTCCTGCTTATTGGGCCCTTCGGAAGAAGGCATTAGCAGAATGGGTTTTATACACATCCAGTGGAATTTCAAGTGGACTATATCATGCATGTGATGTAGGCACCTGGTGTGCATTGAACTATAATGTCTTACAGTTCATGGACTTCTGGCTCTCTTTCATGGCTGTGATTATCACTTTCCTTTATCTTGCTACCATTGATGAAGTATTTAAGAGGGCAATCCACGCAGCTGTTGCTATCCTTACTGCCCTAATGGCTGCAACAAAAGCAACCAGGTCTTCCAATGTTATTCTTGTGATTTTGATTGGTGCTCTTGGTCTGTTTATTGGATGGTTGATAGAAATCTCAACAAAGTATAGGTCCCTTTCCTTTTCAATTGGAATGTCGCTTAATTTCTCTCATTGTTTCCAAACTATAAAGCGATGGCTCTATAATCTTATCAAGACAATTATGAGACGGTATCACTGGGTTTTTGCCTTGGCTGGTTTTACTGCATTAGCCATGGCAGCAATAAGCTGGACACTTGAAACCAGCGAAAGCTACTGGTTTTGGCACAGCATTTGGCACATTACAATATACACATCATCTTTCTTCTTCATTTGTTCAAAAGCAAATATTGAGGATGGTGAGAATCAGCTTCCTACAAATGGAAACTATGAACTGACTCATCAGGATTCACGTTCAAGGAGTGGTTAGAATAAAGTAAATGGAATAGTGAGTAATGGTTTATGGACACTTGCATAGTGTAACACTCAATTGACACCATTTATTTCTATCTCTTTTCTTCTTATCATATCACTTACTATATCTACATTTTTCTCTTTTCTATTTCTTTC 2627 0.3982 MIRELPQNRRNRDKRMGFNLILWCRPNLVLSVLVLFSCSFGLFSANDEVGTGEGETFTVSSFRYPETRLRPFDLRYIRVDLPPWFSAVSIALNSDVDLTRFQDVSRIERVPMSTLPIICFRDGSPPLPDALNTSLKESATSGINGLDVEQCFPMQKNITMKLTNNQISPGVWYIGLFNGIGPTRTQSKMIIRGPSYSFMANISVEACTNSMMRGDFCNSSVYPFSCAASDVSNALEAKVNKSMLENLVTCKSNYEAFCVHKGVSNFFSLDIMNVAEEIIITATNIRFNVTASNDISLLCLVRHGAMPSVTSNDYSIDIAKSPLVIHSPLIGRWYISILPVHLTKTQDNNVRVCYSVESQVLQCPLGKAGPNCTMDSYLLQTIVRRGSTPFESYYLPVVGGASYDSANFPLEPLLEKSSYVGEPENIWTYFLLDIPRGAAGGNIHVQLSSDMKINYEVYARFGALPSIDSWDYYYANKTRRSDPSMFFTLYDSSDDRVNFYIMYAREGTWGFGLRHINTSSDSMKGLTIMSISLERCPKRCSSHGECKFSFDASGLTSYSFCSCDRNHGGFDCSIEIVTHQGHVRQSIFLIVSNVAAILPAYWALRKKALAEWVLYTSSGISSGLYHACDVGTWCALNYNVLQFMDFWLSFMAVIITFLYLATIDEVFKRAIHAAVAILTALMAATKATRSSNVILVILIGALGLFIGWLIEISTKYRSLSFSIGMSLNFSHCFQTIKRWLYNLIKTIMRRYHWVFALAGFTALAMAAISWTLETSESYWFWHSIWHITIYTSSFFFICSKANIEDGENQLPTNGNYELTHQDSRSRSG 828
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste5g01349 828 ProSitePatterns EGF-like domain signature 1. 561 572 IPR000742 -
Pste5g01349 828 Pfam Protein of unknown function (DUF3522) 582 787 IPR021910 GO:0016020
Pste5g01349 828 PANTHER FIVE-SPAN TRANSMEMBRANE PROTEIN M83 22 826 IPR021910 GO:0016020
Pste5g01349 828 Gene3D - 415 576 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste5g01349 Pste-Chr5 8719145 8727779 Dispersed/Wgd
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste5g01349 5 8719145 8727779 Pste5g01349 5 8719145 8727779 ECH
Pste5g01349 5 8719145 8727779 Pste6g02048 6 9604811 9614827 PCT