Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste3g03351 CTTCATTTTCCTCTCCAAATAGAAAGGGCCTCACCAATCTGCAATGGCAAATAGACAAGAAAGATGTAACCAATGTGGAAGAATATTAGTGGTTCCACCAGAGGTGCATGTGTTTGAGTGTGCAGTGTGCCATGGTATCACTCAGATTCGACCCACCACAGGTTCATGGACTCCTTCTTACAACCCTTTTCACCACATTAAAATTGCAGGTCGATTTAGAGGGTTTGTAAATACCATGATGACTAGTTCAGTTCACAGCAATTATGGGACCAATAATTTTGGGTATTATCCTCAGCCTCAGTCACTAAACCCATCATACCATGCACATGGCTCAAAGAGAGCACTGCTATGTGGAATTCGCTACCATGGCAAGAGTTACAGACTTAAAGGCTCCGTTAATGATGTAAAATGCATGAATTACTTTCTGATTAAAGAGTTTGGGTTTCCTACTGACTCCATTCTCATGCTCACAGATGATAGGGAGGAAAGCAATCCGCTAAGAATCCCAACGAAATATAACATACAAATGGGATTGAGGTGGCTGATTGAGAATAGCCAGTCAGGGGATTCAGTGGTGTTCCACTTCTCAGGACATGGCACACAAGAAATGAATATGTATGGGGATGAAATTGATGGGTTTGATGAAGCAATATGTCCTGTTGATTATGAAGAACAGGGAAAAATACTTGACGATGAGATCAATGCTACAATTGTTAGGCCACTGCCACGCGGTGCTAAACTCCATGCCATTATTGATGCGTGCCACAGTGGGACTGCTCTTGATTTAGCTTTTGTGTGCAATATGAACAGGGAAGGTAATTACACATGGGAAGATCACAGATGTCTCAGAACTAATAAAGGTACAAGTGGAGGGTTAGCAATTAGTATTTCAGCTTGTGAGGATGGTCAAACCTCAGTGGATACCTCTGCCTTAAGTGGCAATGAAGTTACTGGTGCCTTGACTTACAGTTTCATTCAAACAGTGCAACATGAACCTGGATTGAGTTATGGTCGATTGCTCAATGCAATGCGTTCAACAATCCGTGGGACAAAAACAGGCATAGTACAACTAAATGGCCCAATTGCTTCGTTGCTAAATAGACTTCTTGGTCCTAACCTCAGACAGGAGCCACAGCTATCTTCTTCTGAGATGTTTGACGTGTACACAAAGCGGTTTGCACTATGATATTGTAATTTATATATACTTCATATAATAAGAATAAAACGGTATTGTTATTTGAAATAACTTAAGCGTAAAGTATTGGAGATTCGTAATTAACTAAACATGTTATGGAACAGAAATATTTTAATGGTCATTATTGC 1323 0.4036 MANRQERCNQCGRILVVPPEVHVFECAVCHGITQIRPTTGSWTPSYNPFHHIKIAGRFRGFVNTMMTSSVHSNYGTNNFGYYPQPQSLNPSYHAHGSKRALLCGIRYHGKSYRLKGSVNDVKCMNYFLIKEFGFPTDSILMLTDDREESNPLRIPTKYNIQMGLRWLIENSQSGDSVVFHFSGHGTQEMNMYGDEIDGFDEAICPVDYEEQGKILDDEINATIVRPLPRGAKLHAIIDACHSGTALDLAFVCNMNREGNYTWEDHRCLRTNKGTSGGLAISISACEDGQTSVDTSALSGNEVTGALTYSFIQTVQHEPGLSYGRLLNAMRSTIRGTKTGIVQLNGPIASLLNRLLGPNLRQEPQLSSSEMFDVYTKRFAL 380
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste3g03351 380 Pfam Caspase domain 98 373 IPR011600 GO:0004197|GO:0006508
Pste3g03351 380 Gene3D - 57 380 - -
Pste3g03351 380 PANTHER METACASPASE-4 94 378 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste3g03351 Pste-Chr3 26303333 26309454 Dispersed
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste3g03351 3 26303333 26309454 Pste3g03351 3 26303333 26309454 ECH