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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste3g02139 CATATTTTGATTTTAAGGAGACAGAAATTGGGGAACTTGGTCAGAAAAAGCACAGACTTCAAATTACCTGTCTCATATTTTAGCTCAAAGTCTGTAATATAAATTGACAAATCTTGGGTTTGGTTTCATTTAGTTAAGGTTGTTAGTATCTGTCTGGAATTTGTGTTTGAAGATCAATGTCTCTCTATGCTGCACTTTCCATTTGTAAAGTTGCCAAGGATGCAGCTGGAGTTGCAGGCAATGTCTTTGCTTTTGGGTTGTTTGTGTCTCCCATACCCACATTTAGGAGAATTATCAGAAATGGGTCAACAGAGATGTTCTCGGGGTTGCCATATATTTATTCCCTTCTGAACTGCTTGATCTGCATGTGGTATGGCACACCTCTGATATCTTCTGATAATTTATTGGTTACAACTGTTAATTCAATTGGAGCAGTCTTTCAGTTTGTGTACATAATCCTCTTCCTGATGTATGCTGAGAAAGCAAAGAAGGTGAGAATGCTTGGATTATTGGTGGCAGTTCTTGGCATATTTGCAATCATATTAGTTGGCAGCTTGCAAATACATGACATCCTAATACGTCGGTTCTTTGTGGGATTCTTGAGCTGTGCATCTCTCATTTCAATGTTTGCCTCTCCATTATTTATAATTAGATTGGTCATTCAGACAAAGAGTGTTGAATTCATGCCATTTTATCTCTCACTTTCCACCTTCCTAATGAGTACCTCTTTCCTTCTTTATGGAGTATTCAACGAGGATGCCTTTATTTATGTGCCAAATGGGATAGGAACCATTTTGGGAATGATACAGTTGATATTATACTTCTATTATGAGGGTAAATCTAGAGAGAACTCCAGGGAACCTTTAATAGTTTCATATGCGTGATCAGTTCTGCAGAAAAACTGAAGGTAAAAGCATATATGTAATTTTTCTGATTTAAGATTTCTGATCTTTGACTTAGGCAATTTTTTTATGAGAATTCATTTTCAATCTATGAAATAGTTTTCATACTGAATCAATATGTGGGTTTTATAAATAAAGTATTTCTACGCTCAATAGTGCAGCATATCCCTTTTGGGGTTTTAGTGGATCCCAGTTTATTATTGGTTCCCTCCTATTCATGATCCTTCTAGTTTACCACAAAAGCTTACTATTGTAATTGGAGAGCTCAGAGCATAAGATCTAACAAAGCTGACACTAGAATCACATACTTCGAATGTGAGACCCAAGTGCCAACTTTGCAGCTCCAGTGCCCATGTGGGCTGGTTGTGCACTAGCCCTTTGACTAGTGCCGTGCAAAAATACTTCAATGCTGGCATCACCACCTGCTCTGCTCATTTGCAGCTGAGAGACATGGTGGAAGGCTTTGATACCAATTCATAATAACCTTGAGAGAACGACACCACAAATGTTTACTTTTATAGTTGGAGAGTTCCAAGGTCTTGTAAAATCCACAGTAGAATCCTGTACTTCCAATGTGAGACTTAAGTTCCATATCTTGCAATTGGATCCTAATAGAGGATGCCTTTTGTATACCTGTTAATAGGTAAGAAAAGATGCTTTTCATGAAACTAGTGGATATAAACCTGCAACCAAAGACAGTCTGAAACCATGTTCCTAGTTTCATGATGCCATAAAAATTGTTCAACTTCATATTGTAGATATTCAATCTCTTCTGGTACCATTGCAGTCAAAATATTTATCCCTCAACACTGGTTTTCTGAAAAATAGACAAGTTAAGCATAATAGTAAGTTTAGTCTCAATTAAGAAATAAGCAGTATTTTCCTTTCCATTTTCAAATATTAATTGAAACCTACCTCAGCTATAAGGATATATTAATAACCACATGTAGTTCAAAGTTTTCCATTGTGTATATGTGGGATGGGTTTACAGCCTGATTGAGATTTGTTACACGAAGAGTATGCACGAGCTTTGATAAATTATGTGACTGAAGGGAGGTAAAATAACTTGAATAATAGTTTTAATTTGTATTGATGTTTTCTAACTAGACAACATGCTAGATGACTTGAATCAAAATCTATCTCAGATGTGCTTCCATATTTTCCAGGTGGCCTTTTAAACCTGAAAGTTTTTAGTTTTCTCTTTGTGGCTTAATTTTTCTGGTTTTGATGCTACCTGTAAGCTGTATTTACTATTTAGTAACAAAATGTCATATAATGTAATAGCAAAGAAGGAAAGGTTCATTCAGTACAGATAGAAGTATTACTATTGAACTGGAAATATGTTGTCAGAGCAAGGACAAACCAACCTGCAATTTTGTGAATCAACATTGCTTGTAAAATCTGAATGTCTATCTGTTAATGCTAATAAGAAAAGACTAACTTCATTAACATAAGTACTACAGTAAATCTTTAAGAATAGTTCTTACATTGACAGCTTCTTGTTCCTGCACAAAACAGAATCAATTATAGGAGCTAGAAATGACCCTTCGCAGCTAGATATGGTCTGAAACTGGAGTTAGCAATATCCCCCTTTGATTCAATTATAGGAGCAAAATTACTGTTGCATTGAGTGACCAGAAGTTATGATAATGAATAACTTGAAATTGTCTGTATCGTAGTTACCTGGTACGTGGTACAGGTACTGGTACGCGGTACTTGTAGGTACACTGTCACTTTTATGTACTTTTTACATTATTATTACAAGAGAGTCCAATATGCAATACGTGGTACGGTGAATTCAGTACGCAATATGCAGGGTTGGTAGAGAATTCTGTAACTATGATCCTATAATTATTTATGCAAGCCTTGGCACATTCCTTCGAAATGGGACTATTACAGGAATGGCACATTGCACCACTGCAGTCGTTTGTTGCGGTCCAAGATGGTTTCTCTTGCATTGAGGCTATTTCCAAGTTCATACGATGTTATACAAATATGTACACATTATTTGATAGACATGTATTATTTATTGTAGTTTGATTTTCCATCTTGATCCTCGTTTTACAGCTCAACAACATACTTTGTCTCTGTTGATCTCCTAATAATAGCAATTCAGTCACTGTCTCCATTTGTCATATGCTGTTTTACTAGTACAGTGGATAGGG 3067 0.3593 MSLYAALSICKVAKDAAGVAGNVFAFGLFVSPIPTFRRIIRNGSTEMFSGLPYIYSLLNCLICMWYGTPLISSDNLLVTTVNSIGAVFQFVYIILFLMYAEKAKKVRMLGLLVAVLGIFAIILVGSLQIHDILIRRFFVGFLSCASLISMFASPLFIIRLVIQTKSVEFMPFYLSLSTFLMSTSFLLYGVFNEDAFIYVPNGIGTILGMIQLILYFYYEGKSRENSREPLIVSYA 235
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste3g02139 235 Gene3D - 11 106 - -
Pste3g02139 235 FunFam Bidirectional sugar transporter SWEET 15 105 - -
Pste3g02139 235 PANTHER RAG1-ACTIVATING PROTEIN 1 23 224 IPR047664 -
Pste3g02139 235 Gene3D - 138 229 - -
Pste3g02139 235 FunFam Bidirectional sugar transporter SWEET 135 228 - -
Pste3g02139 235 Pfam Sugar efflux transporter for intercellular exchange 18 103 IPR004316 GO:0016020
Pste3g02139 235 Pfam Sugar efflux transporter for intercellular exchange 138 221 IPR004316 GO:0016020
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste3g02139 Pste-Chr3 14882807 14886381 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste3g02139 5 234 Miscellaneous Gene Families AT3G14770 69.697 2.30e-114 325
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste3g02139 3 14882807 14886381 Pste3g02139 3 14882807 14886381 ECH