Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste3g02136 AAAGATTGGAAAAAATGCAAGCTTCAACTGCGTGCTCTCCTCATGTGTACGTATATGGAATTGTCAGAGAGCAATCACACCCACACACTAACTTTGTTCCAACAATCGTTTCCCTCAAACCCGACCACTATAATTTGACTCGACCCGAATCAAATTCGAGGATAACATTCATATGCAATTCTCAATCTCAGCCACTGCTATACCTTTGCACATCAAAATCACCAAGACCTTGTGGTTCCAATGTTGGTCCACTTGGGTGCGGCATTTCGTCGAACGGGTACAGTGCAAAGGAAGGTAGGAATGTTGGGGAGTGGCTTGTGCTTGCTAGTGAGGTCCTTTCGACGGGATTTCCATTGTGGGTTACAATTGCGTCTTTTTTGAGGTTCATAAAACCCGATTACTTCAATCGGGCCAGTCCCAAATTGAGCATCACGGGTCTCACCATCATCATGCTTGGGATGGGTATGACTCTTACTCTTGATGATCTTCGCGGGGTTCTCACCATGCCTAAGCAAGTCCTCTCTGCTTTTCTCATCCAGTATTCGGTGATGCCACTATCTGGATTTTTTATAAGCAAATTCTTAAATCTTCCGTCACATTCTGCAGCAGGTTTAATAGTACTTGGTGCAAATGTGGCTCTTTCGGTGATAATGACAACTATAAGCACCCTATCTGCCATGATCATGACTCCTTTGCTGACAGCCAAACTTGCTGGTAAATATGTAGCAGTGGATGCACCTGGCTTATTGATTTCAATATTGCAAGTAGTGCTTGTTCCTGTGTTGGCTGGTGCATTATTGAATCAATTTTTCCAACCTATAGTTAAATTTGTCTCTCCATTAATGCCATCCATTGCAGTAATAACTCTGGCAATTTTGTGTGGAAATGCTATCGGGCAGAGTTCTTCAGCAATCCTTGCGTCAGGTGGTCAAGTGATTTTAGCCACCTTCCTTCTTCAAGCTTCTGGCTTCTTCTTTGGTTACTTATTTGCAAGATTTCTTGGGCTAGAGGTGTCATCATCAATAACCATATCCTCTCAGGTTGGCATGAAGAACTGTGTTCTCCAAATTGTTCTGTCTACGAAGCACTTTGGAGATCCCCTAACTGCAGTACCTGGTGCTGTTGCAATTGTGAATCAAAGCAATGCCAAACCAATTTCCATGATCACACTCAGATGCAATTCTCAACCTCAGCCACTGCTAAACCTTTGCACACCAAGAATCTTTAGTTCCAACGTTGGTTCAATTGGATGTGGCATTTCGTCAAACATGTACTGTGGAGGTGAAGAGTGTGAGGGAGTGGCTTGTGCTGGCTGGAGAGGTAGTTTCAACAGCATTTCCATTGTGGGATGCATTTGGGGGTTGATGAAACCCAATAGCTTCAATTGGGTCACTCCCAAATTGACAATTATGGGACTTGACATAATCATGCTTGGGATGGGTACGAGCCTAACGCTAGATGATCTTCGCGGGGCTCTTGCCATGCTTAAACAACTTAGTTTGAATAAAGTCTTGTTCTTTTATTCATTGCTGATGATGACTCCTTTTCTAACAGCAAAACTTGCTGGTAAATATGTAGCAGTGGATGCATCTGGCTTGTTGGTTTCAACATTGCAAGTTGTACTTTTTCCTGTGTTGGCGGGTGCATTTCTGAATCAGTTTTTTCAACCTTTTGTTAAATTAGTCTCTCCATTGATGCCACCCATTGCAGTAACAACAGTGACAATTTTATGTAGAAATGCTATTGCCCAAAGTTCCTCAGGCATCCTTGTGTGTGGTGGACAAGTGATTTTAGCCATCTTTCTTCTTCATGCTTCTGGCTTTTTCTTTGGCTACCTATTTGTAACAATGCTTGCACTAGATAAGGAGAAGATGCAAGCATCAGTATCATGCTCTCCATATGTATATGGATTAGTCAAAGTGAGAGTGCAATCATACACCGATCTTGTTCCAACAACAACCATTTCCCTCAAATCTGACTCTACTTTGACTTTAACCAAATCATCTTCTAAGTTCACACTAGGATGCAAGTTTCAGCCTCAACCACTGTTGAACCTTTGCACATTAAAATCACAAAGAATCAGCAGCTCAAAGGTTGGTCCACTTCAGTGCGGCATTTCATCGAACGGATACGGTGCAGATAAAGGTAGGGGTCTTCGGGAATGGGTTGAGCTCGTTGGTGAGGCCTTATCAACGGCATTTCCATTGTGGGTGACCATTGGGTGCGTTTTGGGGCTATTTAAACCCACTTCATTCAATTGGGTCACTCCAAAATTGAGCATTGTGGGTCTCACCATCATCATGCTTGGTATGGGTATGACCCTCACTCTTGATGATCTTCGTGGGGCTCTTGCCATGCCTAAGGAAGTCCTCTCGGGTTTTTTCCTTCAGTATTCGGTGATGCCAATATCTGGATTTCTTGTAAGTAAACTATTGAACCTTCCATCACATTATGCAGCAGGTTTAATATTAGTTGGGTGCTGTCCTGGTGGCACAGCTAGTAATATTGTTACATATCTTGCACGTGGAAATGTGGCGCTTTCTGTGATAATGACAGCAGCAAGCACTATATCTGCCGTGATCATGACTCCTTTTCTGACCGCCAAACTTGCTGGTAAATATGTAGCAGTGGATGCATCTGGCTTATTGTTTTCAACATTGCAAGTTGTGCTTTTTCCTGTGTTAACCGGTGCATTTCTGAATCAGTATTTCCAACCTCTTGTTAAACTCGTCTCTCCATTGATGCCACCCATGGCTGTAGCAACTGTGGCTATTTTATGTGGAAATGCTATTGCTCAGAGCTCTTCAGCAATCCTTATGTCTGGTGGACAAGTGATTTTAGCATCCTCTCTTCTTCATGCTTCAGGGTTTTTCTTTGGTTATGTACTAGCAAGAATGCTTGGACTAGACGTGTCATCTTCACGAACTATATCCATTGAGGTTGGCATGCAGAACTCAGTTCTTGGGGTTGTTCTTGCTACCAAACACTTTGGGGATCCCCTAACTACAGTACCTTGTGCTGTTTCAAGTGTGATTCATTCAATCTTTGGTAGCATTCTGGCAGGAATTTGGAGACACTCAGTGCCAGCTGAGCTGAAGGAGTGAAAGTATGTAACTGGGTAAGCTTTTGCATATAATTAGGATTGCTTTATTGTCACTCACCAAGTAAAAATGCATCCTTGTTGTCAAGGTCCTTCAGTCATACTTTTTTCAATTACCTGTTCAACTTTACTTTGTAAAATGACTTGGTTCAAATTAGTCTGTTCTGATGTATTGTGGACCTGTGGTTGAGAGTTAGGAAAGGTAAAAAATGAATTAAGTTTGATCTTTATTATTTTACCATGTTACATGGGGATATAAGTGCTATACTGGAACGTTAATTAATTTTGTAGATGACTGCACAGACATATTTGACATGTACGTTTTGAAGTGTG 3433 0.4212 MQASTACSPHVYVYGIVREQSHPHTNFVPTIVSLKPDHYNLTRPESNSRITFICNSQSQPLLYLCTSKSPRPCGSNVGPLGCGISSNGYSAKEGRNVGEWLVLASEVLSTGFPLWVTIASFLRFIKPDYFNRASPKLSITGLTIIMLGMGMTLTLDDLRGVLTMPKQVLSAFLIQYSVMPLSGFFISKFLNLPSHSAAGLIVLGANVALSVIMTTISTLSAMIMTPLLTAKLAGKYVAVDAPGLLISILQVVLVPVLAGALLNQFFQPIVKFVSPLMPSIAVITLAILCGNAIGQSSSAILASGGQVILATFLLQASGFFFGYLFARFLGLEVSSSITISSQVGMKNCVLQIVLSTKHFGDPLTAVPGAVAIVNQSNAKPISMITLRCNSQPQPLLNLCTPRIFSSNVGSIGCGISSNMYCGGEECEGVACAGWRGSFNSISIVGCIWGLMKPNSFNWVTPKLTIMGLDIIMLGMGTSLTLDDLRGALAMLKQLSLNKVLFFYSLLMMTPFLTAKLAGKYVAVDASGLLVSTLQVVLFPVLAGAFLNQFFQPFVKLVSPLMPPIAVTTVTILCRNAIAQSSSGILVCGGQVILAIFLLHASGFFFGYLFVTMLALDKEKMQASVSCSPYVYGLVKVRVQSYTDLVPTTTISLKSDSTLTLTKSSSKFTLGCKFQPQPLLNLCTLKSQRISSSKVGPLQCGISSNGYGADKGRGLREWVELVGEALSTAFPLWVTIGCVLGLFKPTSFNWVTPKLSIVGLTIIMLGMGMTLTLDDLRGALAMPKEVLSGFFLQYSVMPISGFLVSKLLNLPSHYAAGLILVGCCPGGTASNIVTYLARGNVALSVIMTAASTISAVIMTPFLTAKLAGKYVAVDASGLLFSTLQVVLFPVLTGAFLNQYFQPLVKLVSPLMPPMAVATVAILCGNAIAQSSSAILMSGGQVILASSLLHASGFFFGYVLARMLGLDVSSSRTISIEVGMQNSVLGVVLATKHFGDPLTTVPCAVSSVIHSIFGSILAGIWRHSVPAELKE 1029
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste3g02136 1029 Gene3D - 99 381 IPR038770 -
Pste3g02136 1029 Gene3D - 715 1022 IPR038770 -
Pste3g02136 1029 Gene3D - 499 629 IPR038770 -
Pste3g02136 1029 Pfam Sodium Bile acid symporter family 141 293 IPR002657 GO:0016020
Pste3g02136 1029 Pfam Sodium Bile acid symporter family 757 931 IPR002657 GO:0016020
Pste3g02136 1029 PANTHER SODIUM-BILE ACID COTRANSPORTER 714 1021 IPR004710 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste3g02136 Pste-Chr3 14857502 14874556 Dispersed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste3g02136 504 616 Organic Solute Cotransporters AT1G78560 66.372 4.76e-38 145
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste3g02136 3 14857502 14874556 Pste3g02136 3 14857502 14874556 ECH