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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste2g01745 GTTTGTTTTCCACTTGCAATAAAAGCCTCTCTTTCTCTAACCCACCCCTCCATTTCTCTTTCCCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTGCCCTATCTCATAGGGTTTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCATGCATTTTTGCTCTCACGAGTTCTTCTTTGCCGTTGCCCTCTTCTTCTTTGCAGTCTTTTCAGCCTTCTTTTCTGTGGAACTTATCAGCTTTCACCTCCCGGGTTTTTTTGAACTCTGAAAATGTCTAAAGTTTTCAGCTTTACCGGAAATGATGATTTTTGCCATGGGGGTCCTATATATCCTAACCCCAAGGAACCATGTCTCTTCTTGTCTCTTGGCCGTCAGGTTGATGTTTACTTTCCTATTCAGAAGAGATCTCGTTTCAGTGTTCCATTTGATATCAGTGGAGAATTGTTTGAGCAGAAGCAAAATACATCTATTGAATCTTTGCCAGATGAATGCCTCTTTGAGATCCTTAGAAGGTTGCCTGCAGGTCAAGATAGAAGTGTCTGCGCTTCTGTATCCAAGCGCTGGCTTATGCTTCTAAGCAGTATTTGTAAGAATGAGATCTGCAGTAATGGAAGTACCAGAAATGAAAGCAAGGATAATGATCAGGAATTTAGTGACGAAGGATACCTATCCAGAAGCTTGGAAGGAAAGAAGGCAACAGATGTTAGACTTGCTGCCATAGCCATTGGAACAGCATCTCGAGGAGGGTTGGGGAAGCTTACAATTCGCGGATGCAATTCAGATCGTGGGGTAACTAGTGTTGGTCTTAAGGCAATTGCTCATGGCTGTCATTCTCTAAAGGTTTTCTCTATATATGATGTTGATACTGTTAATGACGAGGGCCTGATTGAGATTGCTAGTGGGTGTCATCAGTTAGAGAAGCTTGATCTATGCAAATGTCCTAAGATTTCTGACAAGACTTTAATTGCAGTCGCAAAGAACTGTCCAAATCTGACTGAGTTATCAATTGAGTCATGTCCTAACATTGGTAATGAAGGTCTACAAGCTATTGGGAAGTGTCCCAATCTAAGGTCTATCTCAGTCAAGGATTGCTCTGGAGTTGGTGATCAGGGAATCATTGGCCTCTTGTCTTCAGCTTCTTTTGGTTTAACAAAGGTGAAGCTTGATTCGCTGTTTGTTTCTGATATGTCTCTAGCAGTGATTGGGCATTATGGCGTTGCAGTTACCAATCTTGTCCTACGTTGCCTCCCAAATGTCAGTGAGAAAGGGTTTTGGGTTATGGGTAATGGCCGTGGACTTCAGAAACTAACTTCAATCACAATCGATTGCTGCCAAGGAGTAACAGATGTTGGGCTTGAAGCTATTGGAAAAGGTTGTCCAAATGTGCAAAACTTCCAGCTTCATAAGTGTGCTTTTTTGTCAGACAAGGGGTTGGTATCACTTGCTAGGGATGCTCCATCAATTGAGAGCCTACAATTGCAAGAGTGCCACAGAATTACTCAAATTGGGTTTTTTGGTGTCTTTTTTAAGTGTGGTGCAAAATTGAAGGTTCTTACTCTAATTAGCTGCTATGGGATTCAAGATCTGAGTATGGAATTACCAGCAATATCTCCTTCTGAATCAATTTGGTCATTAACAATCCGTGACTGCCCTGGATTTGGCAATGCTAGCCTCGCTTTACTTGGAAAGCTATGTCCTCGGCTTAAGCATGTTGAATTGAGTGGACTTCAGGGAATAACAGATGCAGGTTTTCTTCCTCTACTGCAGAGCTCTGAGGCTGGTCTGGTTAAAGTTAATCTAAGTGGTAGCATAAATGTGACTGACAGAGTAGTTTTGTCCATGGTCAACTCACATAGGTGGACTCTTGAGGTGCTAAGCCTTGATGGTTGTAAAAGAGTCAGCGATGCTAGCTTGATGGCAATTGCAGGCAGTTGCCCTTTGCTCTCTGATCTTGATGTTTCCAAGTGTGCCATCTCTGATGTCGGTATTGCAGCCCTTGCTCGTGGAAAGCAGCTCAACCTGGAGATACTTTCTTTGGCAGGTTGCACATTGGTTTCAGACAAGAGCATGGCTGCATTTAAAAAAATGGGTGATTCCCTTGCAGGATTGAATATCAAGCGATGCAATGCAATAGGAAGCCGCTCTGTTGACAAGCTTATGCAACATCTCTGGATGTGTGACATCCTCTACTGAACAGGAAATGCCTCAGCTTTTATAGTTAGTGTTGCGATTTAGTGTTTTTGGGTTCATTCGCCATGGATCTTGGTCACATCTAGTACTCGGTTCTCTTTTTCCAGAGGATACAGTTATATTTAAACCTCTTATTTGCAGGATTCCTTTAATTGGAAATCTGTTCCAAATTTTTGGCACTCTATTGATGTGATGCCACTTTTAAAATGGCTGTTTATCTCTGTGAGCATAGTTACCGGGTGCTGAAGTTAGATATCTTACTTCTACTGTTGGCATCTGATGTTTTTAGCTCTGCTTTGTATCGGTTTTGCCACCGTACGTGTCCTTGTCTTTGTTTCTTTGCAGCAGTACGTACAAGAGTCTGTCCAGTGGTGTTTGCCTAATTTTCACGAATGAGCTTATGTTCTGTACGTGATGTTTGGGTCTAAGTTTTAGTCAAGGGGCAAGTTGAAGTTCCAGTTTATGTGCTGGTGTAGTCCTTGTTACTTTGGCAGTTCAGAGTTGTATGAAGCCTTTGTCTTCAGGGGCTTTGGCCATGGCAGCAAGTTATACAGGTCTGTCATGACAATCCTTTTCCCTTTGGGATGGATTGTTTTTTCTACCAAGCCCTAGTTTTTTAGGCTTCATTTTTTTTTAACTTGTCATTGTAACCTCTATCATGTAAATGCTACTGAGATATGTCCCTTGTACTGTATGTTTATTTTATGAAAAATAATGAATAAACATTTGTATTCTCTGTCCA 2920 0.4182 MSKVFSFTGNDDFCHGGPIYPNPKEPCLFLSLGRQVDVYFPIQKRSRFSVPFDISGELFEQKQNTSIESLPDECLFEILRRLPAGQDRSVCASVSKRWLMLLSSICKNEICSNGSTRNESKDNDQEFSDEGYLSRSLEGKKATDVRLAAIAIGTASRGGLGKLTIRGCNSDRGVTSVGLKAIAHGCHSLKVFSIYDVDTVNDEGLIEIASGCHQLEKLDLCKCPKISDKTLIAVAKNCPNLTELSIESCPNIGNEGLQAIGKCPNLRSISVKDCSGVGDQGIIGLLSSASFGLTKVKLDSLFVSDMSLAVIGHYGVAVTNLVLRCLPNVSEKGFWVMGNGRGLQKLTSITIDCCQGVTDVGLEAIGKGCPNVQNFQLHKCAFLSDKGLVSLARDAPSIESLQLQECHRITQIGFFGVFFKCGAKLKVLTLISCYGIQDLSMELPAISPSESIWSLTIRDCPGFGNASLALLGKLCPRLKHVELSGLQGITDAGFLPLLQSSEAGLVKVNLSGSINVTDRVVLSMVNSHRWTLEVLSLDGCKRVSDASLMAIAGSCPLLSDLDVSKCAISDVGIAALARGKQLNLEILSLAGCTLVSDKSMAAFKKMGDSLAGLNIKRCNAIGSRSVDKLMQHLWMCDILY 640
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste2g01745 640 CDD F-box_AtTIR1-like 67 104 - -
Pste2g01745 640 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 132 224 IPR032675 -
Pste2g01745 640 SUPERFAMILY RNI-like 339 600 - -
Pste2g01745 640 SMART LRR_CC_2 395 420 IPR006553 -
Pste2g01745 640 SMART LRR_CC_2 343 368 IPR006553 -
Pste2g01745 640 SMART LRR_CC_2 502 527 IPR006553 -
Pste2g01745 640 SMART LRR_CC_2 449 474 IPR006553 -
Pste2g01745 640 SMART LRR_CC_2 186 211 IPR006553 -
Pste2g01745 640 SMART LRR_CC_2 607 632 IPR006553 -
Pste2g01745 640 SMART LRR_CC_2 422 447 IPR006553 -
Pste2g01745 640 SMART LRR_CC_2 475 500 IPR006553 -
Pste2g01745 640 SMART LRR_CC_2 212 237 IPR006553 -
Pste2g01745 640 SMART LRR_CC_2 238 263 IPR006553 -
Pste2g01745 640 SMART LRR_CC_2 264 288 IPR006553 -
Pste2g01745 640 SMART LRR_CC_2 532 554 IPR006553 -
Pste2g01745 640 SMART LRR_CC_2 555 579 IPR006553 -
Pste2g01745 640 SMART LRR_CC_2 581 606 IPR006553 -
Pste2g01745 640 SMART LRR_CC_2 369 394 IPR006553 -
Pste2g01745 640 Pfam F-box domain 68 106 IPR001810 GO:0005515
Pste2g01745 640 FunFam EIN3-binding F-box protein 1 isoform A 287 446 - -
Pste2g01745 640 FunFam EIN3-binding F-box protein 1 60 109 - -
Pste2g01745 640 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 448 639 IPR032675 -
Pste2g01745 640 Gene3D - 60 109 - -
Pste2g01745 640 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 235 447 IPR032675 -
Pste2g01745 640 PANTHER UNCHARACTERIZED 336 446 - -
Pste2g01745 640 FunFam EIN3-binding F-box protein 1 501 638 - -
Pste2g01745 640 Pfam Leucine Rich repeat 555 577 IPR001611 GO:0005515
Pste2g01745 640 Pfam Leucine Rich repeat 237 260 IPR001611 GO:0005515
Pste2g01745 640 Pfam Leucine Rich repeat 344 365 IPR001611 GO:0005515
Pste2g01745 640 SMART fbox_2 70 111 IPR001810 GO:0005515
Pste2g01745 640 SUPERFAMILY F-box domain 63 104 IPR036047 GO:0005515
Pste2g01745 640 SUPERFAMILY RNI-like 158 385 - -
Pste2g01745 640 FunFam EIN3-binding F-box protein 1 132 250 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste2g01745 Pste-Chr2 17961294 17964949 Dispersed
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste2g01745 2 17961294 17964949 Pste2g01745 2 17961294 17964949 ECH