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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste2g00961 AACAGTCCTCACTTTCCTTTCTTTGGTTTTCTTTTATTTTTCTCCCAAGCTCTCTGCTCACCAAAGGAGCATAATGCCCATGACTGTTCGATACTAATTCAGCAGAAGAAAATGGGTGCAGAGTCACAAATTCCGCGAAGCTTAATCCACAGAATCTACGCTCCCTTGGCTAACGAATTTCATTTTGCAGCGCCAATCTCTTCCTCCAGAACAAATGAACTCGAACTCGTGCGAGGTGCTCTACGGATGCTGCAAGGGTTTTCTGGTCCCCTGTTCTATTGGGATAAAAGTGCAAACAGTTTCCGGGCACAGAGCGGAGTGTACGTGAGCCATCTCTCTCAGAAAAGTCTCCACTCTCTTCTCAATCAGTTTATCCACGCAGCGACGAGTCTCCAATTGGTGGCGATTACACTCGATAAAGTCGAAACTGCAGTGCCAAAGTCTCCTCCTACTTTGAACGCGTTTGCTTGCTCTGCTTCAACGTGCCTTAAGCGGTTACGGAATGTTGCCTTGAAAGAGGAAGTGTCCACGAGCAATGCAGATGGCATAATCACTCCGACCTTGTTAGGATTGGCTAATTCTTTATCCAGTCTTTGCTCAGGTGCTGAGTTCTTATTTCGAGTTGTACACGATGCCATTCCTGCTGTATACTTTGAGTTTTGTGGGTCTCTATCAGCAGCTGAACTTGCTGTTCATGTGCTTGACTATCTTCATAAGAAGCTTGACGAAGTGTGTCTTGTACAAGGTGGTGAGGTCGAGGAAGCTTATCAGATGGTGCTTTATATGTATGTTGGAAGCTTGTTGCCATATATCGAAGGTCTTGATTCTTGGCTTTTTGAAGGAAGTCTTGACGATCCTTTCGGTGAGATGTTCTTTTTTACTAATAAAGAAGCCTCAGTTGATGAGGCTGAATTCTGGGAGAAGAGTTATTTGTTAAGAATGCTTCATCATAACAAGTTAGATTCAAAATTCTCTTCCACAAATTATGTCAATGATTCTGTGCCAGTGTCAAATGAGAAGGAAATGGATAGGAGGGATTCCATGACTTTGTCCAATACAATTAAAGGAAAAGAGCAGAGCTTTAAAGACCATCCTGCTTGCCCTTTTTTTATTAAGGATTTAGCTAAATCAGTAGTTTCTGCTGGAAAATCTTTGCAGCTGATGTGCCATGTACCTAATTCCTCTGTGAATTGTAGCAAAGGAAGCAATTATGAGATTGGAAGTACTAAATGTTTAAACTCTAGTTTCTATCTTTCTCAGAGAATAGCTGGGTTAACATTGCCAGAAATTTTTTCTGTATCTCTACTTGGACTTGTTGGTCATGGTGACCATGTTTTTAAGTACTTTTGGCAAGATAACTGGTACGAATCTGTATGTGCTACTTCCAATGTATCTCATGTAAATGTAAATGGGGAAAACTCAGATAATGACAATAATGAAAAATTAATTGCTCCACCTTACTCTGAAAAGACATGGTATAAGTTCTTGATTGATACATTATTTCACAAAAGATCAGCTGATTCAAAGCTAAAATATGAAGACATACATAATGACACAGGAGAGCTGAGAGGGGCTATGGTTATTGACGATGATGTTCTCTTGAGGTCATACATAGAAAATCCAGTTATTACTGTATGTCGAACAAACCTCAGAAAGAATGGGGATGCCTTGAAAGCATTGAATTTATCTAAAAAATTCAGCTTGCCTTCATTAAATGACGAGGATTTAAGAAAGGCTATATTTGGTGAAGAAAGTGCAGCATTTTCTGATAGCGAAGGAACAAACTATACTTTTGGCTTTCACTTTGGTGAATCTGAATACATTCACTCGCAGGATGACAGAAAGCTGTTAGAAATATTGTTTCCTTTTCCCACAATTTTGCCGTCGTTTCAGGATGATCTTCCTGTGTCGGAGCTCTTGCCTTTTCAGACAAACAGCAGTCTTAGTTCAAGAGTTCTTCGTTGGATGCAAAATGTTGACCTAAGAACTACTCCACTACCTGTGGTTATTATGCAGTACTGTCTAACAATCTACATTCAGAAACAGGTGGATTATATTGGAGTGAATATGTTGTTAAAGTTGATGAACGAATGGAGATTGATGGATGAGCTTGCATTAGATAAGGGTGAAGCATGGGATGATGATTTTGAATTAAACACAATATTACAGGAATCAATCAGAAATTCTGCAGATTGTATGCTGTTAAGTGCTCCAGATTCATTGGTAGTGTCGATAACCAAAAATCTTGTTGACAGTGATGAGGAAGCTATCACGGCTGGTGTTGTTTCAAGTACTCCTCGTCAGAGTAATGTCAATAGCTTTGGAATTAATGGCCTTGATATGCTTAAATTCACATATAAGGTCCCTTGGCCTCTTGAACTCATTGCAAATACAGAGGCTATTAAGAAGTACAACCAGGTGATGCGGTTCTTGTTGAAGGTCAAGCGTGCAAAATTTGTATTAGATAAAGTGCGGAGGTGGATGTGGAAGGGTAGGGGATCTGCCTCAAACAACAGAAAGCATCATTGGTTAGTGGAGCAGAAACTCCTTCATTTCGTGGATGCTTTTCACCAATATGTTATGGATCGGGTATATCACAGTGCATGGCGGGAACTATGTGAAGGTATGACTGCAGCAAAATCACTGGATGAAGTCATTGAAGTCCATGAAGCTTACATGCTATCAATTCAGCGGCAATGCTTTGTGGTTCCTGATAAGCTGGGGGCTCTTATTGCTAGCCGCATCAACAGCATTCTTGGCATAGCTTTAGACTTTTATAACATACAACAGACATTAAGTAGTGGTGGAGCTGTTTCTGCAATCAAAGCAAGGTGTGAGATGGAAGTGGACCGGATAGAGAAACAGTTTGATGATTGCATTGCTTTCTTACTCAGGGTTTTATCATTCAAACTAAATGTGGGTCACTTCCCTCATTTGGCTGATTTGGTGACCAGAATTAACTACAACTTTTTCTACATGTCTGCTAATGGAAATTTGATGACTGCCTCCAGTTCTGGAAGTGTTACTTCAAGGTTGGGGAAGACCTCTGGGTAGAATTGTTTGATCTATAAGGTGGAGTGCCATAACTATAATCTTAATACGAGATTAGTTCTGCACCTGTTTGTTGTATAGTATTTTGAGAGAGAATATCCTCCATTGCTTGATCTTTGAGCTCAGTAAAGGGAAAAGGGAGGGGGGATTGAATCTGTTGTTACCCGTGTTGCCTTACCTGTAACTGCAGGGCCACTTGTCTGGCACCATGCAGGAGTGCATAGCAAGATATAAATTGTATCGCTGTTGTTTATATGTCAGCTACGTAGGATCAACTCCTACTTTTTTGTCTGATTATGTAAGCCTGCACTGTGTTCTTTATTT 3375 0.4036 NSPHFPFFGFLLFFSQALCSPKEHNAHDCSILIQQKKMGAESQIPRSLIHRIYAPLANEFHFAAPISSSRTNELELVRGALRMLQGFSGPLFYWDKSANSFRAQSGVYVSHLSQKSLHSLLNQFIHAATSLQLVAITLDKVETAVPKSPPTLNAFACSASTCLKRLRNVALKEEVSTSNADGIITPTLLGLANSLSSLCSGAEFLFRVVHDAIPAVYFEFCGSLSAAELAVHVLDYLHKKLDEVCLVQGGEVEEAYQMVLYMYVGSLLPYIEGLDSWLFEGSLDDPFGEMFFFTNKEASVDEAEFWEKSYLLRMLHHNKLDSKFSSTNYVNDSVPVSNEKEMDRRDSMTLSNTIKGKEQSFKDHPACPFFIKDLAKSVVSAGKSLQLMCHVPNSSVNCSKGSNYEIGSTKCLNSSFYLSQRIAGLTLPEIFSVSLLGLVGHGDHVFKYFWQDNWYESVCATSNVSHVNVNGENSDNDNNEKLIAPPYSEKTWYKFLIDTLFHKRSADSKLKYEDIHNDTGELRGAMVIDDDVLLRSYIENPVITVCRTNLRKNGDALKALNLSKKFSLPSLNDEDLRKAIFGEESAAFSDSEGTNYTFGFHFGESEYIHSQDDRKLLEILFPFPTILPSFQDDLPVSELLPFQTNSSLSSRVLRWMQNVDLRTTPLPVVIMQYCLTIYIQKQVDYIGVNMLLKLMNEWRLMDELALDKGEAWDDDFELNTILQESIRNSADCMLLSAPDSLVVSITKNLVDSDEEAITAGVVSSTPRQSNVNSFGINGLDMLKFTYKVPWPLELIANTEAIKKYNQVMRFLLKVKRAKFVLDKVRRWMWKGRGSASNNRKHHWLVEQKLLHFVDAFHQYVMDRVYHSAWRELCEGMTAAKSLDEVIEVHEAYMLSIQRQCFVVPDKLGALIASRINSILGIALDFYNIQQTLSSGGAVSAIKARCEMEVDRIEKQFDDCIAFLLRVLSFKLNVGHFPHLADLVTRINYNFFYMSANGNLMTASSSGSVTSRLGKTSG 1017
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste2g00961 1017 PANTHER GAMMA TUBULIN COMPLEX PROTEIN 67 992 IPR007259 GO:0000226|GO:0000922|GO:0005815|GO:0007020|GO:0043015
Pste2g00961 1017 Pfam Gamma tubulin complex component N-terminal 78 404 IPR041470 -
Pste2g00961 1017 Pfam Gamma tubulin complex component C-terminal 699 992 IPR040457 GO:0043015
Pste2g00961 1017 Gene3D - 688 991 IPR042241 -
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pste2g00961 32 723 Glycosyltransferase AT1G20570 45.504 9.33e-179 535
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste2g00961 2 10220460 10230276 Pste2g00961 2 10220460 10230276 ECH