Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste1g00603 TCTTACGCTGTTGCCTAACGTACCCGGGTTAGTGGTACGACACAGGTGAGGGTGGAGTGTTGGGGATGGAAGCAGAGTCCGAATCGCGGCACTTGAAGATTAGGTTTAGAGAAGGTGCGAAGCATTGGACGGATGCACTTCCCATTGGCAACGGACGCCTGGGAGCCATGATTTGCGGCCACTTCCAATCCGAAACTATACACCTCAATGAGGACACGCTATGGACTGGAACCCCCGCTGATTACACTAATTCTAAAGCTCCAGAGGCACTTTCTCATGTTAGAAACCTCGTGAACCGTGAGCTCTATCCGCAAGCCACTGCTGCTGCTTCGGGCTTAACAGGAAATCCATCCGAGGCTTACCAACTGCTCGGGGATATCAATTTGGACTTTGATTATTCACATCTCACCACCACGCACGCCCAACAAACTTATCAGAGGGACTTGGACTTACACACTGCTACTGTCAAAGTCACATATTCTGTTGGAGATGTTCAATTCACAAGGAAACACTTTGCCTCCTATCCAGATCAAGTCATTGTAACTAACATTTCTGCCTCTCAACAGGGTAAACTTTCGTTTACTCTTTGTTTACACAGCAAAATGATTAATAAAACCTACGTAAATGCCACGAATCAGAATCAGATTATTATGAAGGGAGCATGTCCTGCTAAAAGGACCCAAGATAATCTGCAGGGAATTCAATTTTCTGCAATTCTTGATTTGAAGATTGGTGGTGCAAATGCTGTCAGCCATGTTTTGGACAATAACAAGTTGAAGGTGGAGGCTTCAGATTGGGCTGTTTTACTTCTTGTTGCTTCATCGTCCTTTACTGGGCCATTTACTGCACCTTCAGATTCTAAAAAGGATCCTATTTCTCAGTGTTTATCCACATTGAGCTCAATAAGCAATATGTCATATTCTGATCTTTATGCGCGCCACTTAAATGACTATCAGGTTCTTTTTCACCGAGTATCCCTGCAGCTTATGAGAACCACCCGGCCAAATATATCAGAGGAGGCATCTTTGGATTTGAAGAGCCTTACCACATCTGTGTCTCATTTGTCTCTTTTGGATGGTGTAACACAAGTTTCAACTTCAGACAGGGTGAAATCATTTCAGACTGATGAAGATCCTTCCTTGGTGGAGCTTCTATTTCATTATGGCCGCTATTTGCTTATTTCTTCTTCGCGTCCTGGAACTCAGGTGGCAAACCTACAGGGAATTTGGAACAAAGATCTTGAGCCAGTTTGGGAGTATGTTTAAATTCTATTTTATTTCAAATGGATATGCATATGCTTTTAAACAAGGCTTGCTATCTGTTATTAGATGTCAAGATTAATCAGTGGAGCTCCTCACTTGAACATCAATCTTGAAATGAACTATTGGCCTGCTCTTCCTTGCAATCTTAGCGAGTGTCAAGAACCCTTGTTTGATTGTATTTCCTCTCTGTCCATGAATGGCAGTAAAACTGCACATGTGAATTACCAAGCAAGTGGTTGGGTGGCTCATAGTAAATCAGATATATGGGCAAGAACATCAGCAGGTCAAGGTGATGCTGTTTGGGCCTTGTGGCCAATGGGTGGTGCGTGGCTTTGCACCCATCTATGGGATCACTACGCTTACACAATGGATGAGGATTTTCTCAAATATAAAGCGTATCCCTTAATGGAAGGATGTGTGTCATTTTTGTTGAGCTGGCTGATCGAAGACAGTGAAGGATATCTTCAAACTAATCCATCAACTTCCCCTGAACATTATTTTATCACTCCCAACGGTGAGCGTGCTTGTGTAAGCCAGTCATCCACAATGGATGTGGCAATCATTAACGAAGTCTTCTCCATATTTCTTTCTGCTGCTGAGGTTATAGGGAGAGCAAAGGATAATATTGTTGGAGAAGTTTGTAAAGCTAAACCACGATTACGTCCAATCAAAATTGCCAAGGATGGTTCCATTATGGAATGGATGAAAGATTTCGAGGATCCAGAGGTGCACCACCGGCACCTTTCACATCTATTTGGTCTATTTCCAGGGCACACAATTACTTTTAAGGAAACTCCAGCCCTATTTGAAGCTGCTAAAAAAAGTCTTTATAAACGAGGAGAGGAAGGTCCTGGATGGTCAACCACATGGAAAGCTGCTTGCTGGGCACGTCTACAGAACAATTCTAATGCCTACAAGATGATCAAGCACTTGATCAACTTGGTGGATCCAGATCATGAGAAACCATTTCAAGGTGGACTTTACAGCAACCTTTTTGCTGCACACCCGCCTTTTCAGATCGATGCCAACTTTGGTTTTGCTGCGGCAGTTGCAGAAATGCTTGTTCAGAGTACATTAAGCGATCTTTTCATACTTCCTGCCCTTCCCTGGGAGAAGTGGCCAAATGGCTCCCTGAAAGGCTTGAAGGCTCGTGGAGGAACAACAGTTAGCATTTGCTGGAGAGAAGGGGATCTTCAGGAGGTTGGTATATGGCTCCAAGACCAAACAAGAACAACTCTAAGAAAAAATATACACTACAGAGGCACCATGGTCACTGCAGACATAGTGTCTGGAATTTTTTACAAGTTCAACGGACAGTTGAAGTGCTTGAACGCATGCTCTCTTTCAGAAATTAAGTGTCCTTGAATTTTAGGATTTGAAATATTACCTATATTTTCATTTGTATGTGCAATAGGTTTTCAGGTGGAAGTAATTTCTTAACACACCTTACTAATATTTCTTTTCCTATATAGCATTTAGCGCTTTCCTTTCCGAAATTTACTTTGTGTTTTGTTCAATAACCTAGTTGAAATAAAAGTTAAAATGTTATTTTAAAGTGTGTCACAGTAGTATGGGTATTTCTGTAAAGATGTGGA 2857 0.4225 MSRLISGAPHLNINLEMNYWPALPCNLSECQEPLFDCISSLSMNGSKTAHVNYQASGWVAHSKSDIWARTSAGQGDAVWALWPMGGAWLCTHLWDHYAYTMDEDFLKYKAYPLMEGCVSFLLSWLIEDSEGYLQTNPSTSPEHYFITPNGERACVSQSSTMDVAIINEVFSIFLSAAEVIGRAKDNIVGEVCKAKPRLRPIKIAKDGSIMEWMKDFEDPEVHHRHLSHLFGLFPGHTITFKETPALFEAAKKSLYKRGEEGPGWSTTWKAACWARLQNNSNAYKMIKHLINLVDPDHEKPFQGGLYSNLFAAHPPFQIDANFGFAAAVAEMLVQSTLSDLFILPALPWEKWPNGSLKGLKARGGTTVSICWREGDLQEVGIWLQDQTRTTLRKNIHYRGTMVTADIVSGIFYKFNGQLKCLNACSLSEIKCP 432
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste1g00603 432 PANTHER ALPHA-L-FUCOSIDASE 2 6 422 - -
Pste1g00603 432 SUPERFAMILY Six-hairpin glycosidases 13 378 IPR008928 GO:0005975
Pste1g00603 432 Gene3D - 1 332 IPR012341 GO:0005975
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste1g00603 Pste-Chr1 1956683 1971398 Dispersed
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste1g00603 1 1956683 1971398 Pste1g00603 1 1956683 1971398 ECH
Pste1g00603 1 1956683 1971398 Pste4g01120 4 8420644 8423496 PCT