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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pste1g00511 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5114 0.3852 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1449
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pste1g00511 1449 Gene3D RNA polymerase ii 389 441 - -
Pste1g00511 1449 Pfam RNA polymerase Rpb1, domain 2 356 513 IPR000722 GO:0003677|GO:0003899|GO:0006351
Pste1g00511 1449 Gene3D RNA polymerase Rpb1, domain 3 523 669 IPR042102 -
Pste1g00511 1449 PANTHER DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE 201 1284 IPR045867 GO:0003899|GO:0006351
Pste1g00511 1449 CDD RNAP_IV_RPD1_N 216 892 IPR040403 -
Pste1g00511 1449 FunFam DNA-directed RNA polymerase subunit 1338 1429 - -
Pste1g00511 1449 Pfam Protein of unknown function (DUF3223) 1353 1424 - -
Pste1g00511 1449 Gene3D - 1335 1426 - -
Pste1g00511 1449 Gene3D - 672 845 IPR038120 -
Pste1g00511 1449 Pfam RNA polymerase Rpb1, domain 3 519 667 IPR007066 GO:0003677|GO:0003899|GO:0006351
Pste1g00511 1449 SUPERFAMILY beta and beta-prime subunits of DNA dependent RNA-polymerase 242 1285 - -
Pste1g00511 1449 Gene3D - 351 522 - -
Pste1g00511 1449 Pfam RNA polymerase Rpb1, domain 4 731 793 IPR007083 GO:0003677|GO:0003899|GO:0006351
Pste1g00511 1449 SMART rpolaneu7 246 543 IPR006592 GO:0003677|GO:0003899|GO:0006351
Pste1g00511 1449 FunFam DNA-directed RNA polymerase subunit 523 661 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pste1g00511 Pste-Chr1 1638200 1654665 Dispersed
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Pste1g00511 1 1638200 1654665 Pste1g00511 1 1638200 1654665 ECH