Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Psa5g2795 ATGGCGCTAACCTTCTTCTTCCTCTTCTTCGCCTCTCACCTTCTCTATTGCATCTCTGGACAATCCAACTCCATGGAATCGGTTCCCGATCTTCAGAACACCATGTACACGGACGTCGATGGATATCCTTGTGTGCGGTTGCTGAGTCTTTCCGGAGCCATCGGTTGTTCAAATCCTGGGCGAGATAAGGTTGTTGCTCCAATTGTGAGGTTTGAAAATGTTGATCATGTGTCAGAGTTGTCTTCTATATTGGTGTCATTCGATGAGTTTCCTGCTCTCTTTACCAGATTATCAACTGACCCAAGCTTTGCAAGCAAAGTTGGTGGTGTACTAGTTGAACCAGTTATTGATTCACAAAAGAAGTTAAATGGATTTTCTCCCGATAAAAAGTTTCCGCAAGCTGAGTTTGCTCCTTACCATAATATCAGCTATGAATGGAATCCAATTGGTTCTGATATCATGTGGAAATCCTACAATTTTCCTGTGTTTTTACTCACAGAAAGTGGCACAAAGATTCTTCAAGAGTTTGTATTAAAGAGTAAGGACAAAAAGGAAGCTTATACTTCTAATGTGGCTGAGTTTGATCTGGTGATGCAGACAATGAAATCTGGAACACATGATTCAGAGTCTTGTTTAAAAGAAGGAACTTGCCTCCCTTTAGGTGGATACAGTGTTTGGTCGTCGCTACCCCCAATCAACGCTTCATCCTTAAAGCCGCCTAAGCCCATTATATTGACAGTAGCCTCTATGGATTCTGCTTCCTTTTTCCGGGACAAAAGCCTTGGTGCAGATTCCCCTATTTCTGGCTTAATTGCATTACTGGCAGCAGTTGATGCGCTTTCTCGTTTGGATGGTCTTGGTGGCCTTAGTAAACAGCTTGTTTTTGTAGTTTTCACTGGAGAGGCATGGGGTTATCTCGGAAGCAGAAGATTTTTAGTAGAACTTGATGAGCACTCAGATGCTGTTCATGGCCTTAATCACTCATTAATTGAAAAGGTCTTTGAAATCGGTTCTGTTGGAAAGGGTCTCAATCATGGTGCTAAAAACTACTTTGCTCATGCAGAAGGGGATTCTTCTGCCAAAAATCAGATAATGGCTGCCCTGAAACATGCCCAAGAGTCGCTACTCTCTGAGGATATAAATATCGCATCTGCAAGTGCCTCAAATCCTGGGATACCTCCATCATCTTTGATGACCTTTTTGAATAAGAACCCCAAAATCTCTGGTGTTGTGTTAGAAGATTTTGACTCTTCCTTTGTCAACAAGTTCTACCGTAGTCATCTTGATGATTTATCAAATGTGAACTCATCAGCTGTAGTTGCTGCTGCTTCTCTTGTTGCTCGAACCCTTTACATACTGGCTAGTGAAACTGATGATGTTCAAAATTCAACTTTGGCTGCTATAAATGTAAATGTCTCACTTGTTGAACAACTCATGGATTGCTTGTTGGATTGTGATCCTGGTCTTTCTTGTGAGTTGGTGAAGAAATATATTTCACCCGCTTCAACCTGCGCGAGCAATTATGTTGGTGTTATCTTAGATGAACCTTCATCCACACCTTATCCAGGATACATTAATGACGTTCCTAGGTTCATCTGGAATTTTCTAGCCGACATAACTTCTATCCCAAAGGAAAATAATAGCTCAGACTGTCAACAGGGTTGCAGTGGTAGTGATGAAGTTTGCATTAAAGCAGAGACTGATGGAAAGGGCATCTGCGCTCTCTCTACAACTAGGTATGTTCCAGCATATTCGACACGATTAAAAGTTGAATCAGGAGTATGGAGTATTTTGCCCCCCAATGCCTCAGATAGCATGGGCGTCGTAGACCCAGTCTGGACAGAAAGCAACTGGAACTCATTAGGCATTCGGGTATACACAGTCCAAACTGCTGCTTACGATTGGGTTGTTCTGTTTGGGGGAATTGCTCTTACAATCTTGGCATACCTTGCAATTGCAGTTACAAGAACTTTGGTTGCCAAAGCAACAAAGAGGGATTGA 2001 0.4218 MALTFFFLFFASHLLYCISGQSNSMESVPDLQNTMYTDVDGYPCVRLLSLSGAIGCSNPGRDKVVAPIVRFENVDHVSELSSILVSFDEFPALFTRLSTDPSFASKVGGVLVEPVIDSQKKLNGFSPDKKFPQAEFAPYHNISYEWNPIGSDIMWKSYNFPVFLLTESGTKILQEFVLKSKDKKEAYTSNVAEFDLVMQTMKSGTHDSESCLKEGTCLPLGGYSVWSSLPPINASSLKPPKPIILTVASMDSASFFRDKSLGADSPISGLIALLAAVDALSRLDGLGGLSKQLVFVVFTGEAWGYLGSRRFLVELDEHSDAVHGLNHSLIEKVFEIGSVGKGLNHGAKNYFAHAEGDSSAKNQIMAALKHAQESLLSEDINIASASASNPGIPPSSLMTFLNKNPKISGVVLEDFDSSFVNKFYRSHLDDLSNVNSSAVVAAASLVARTLYILASETDDVQNSTLAAINVNVSLVEQLMDCLLDCDPGLSCELVKKYISPASTCASNYVGVILDEPSSTPYPGYINDVPRFIWNFLADITSIPKENNSSDCQQGCSGSDEVCIKAETDGKGICALSTTRYVPAYSTRLKVESGVWSILPPNASDSMGVVDPVWTESNWNSLGIRVYTVQTAAYDWVVLFGGIALTILAYLAIAVTRTLVAKATKRD* 667
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Psa5g2795 666 Pfam Nicastrin 242 451 - -
Psa5g2795 666 Gene3D Zn peptidases 177 470 - -
Psa5g2795 666 Pfam Nicastrin small lobe 43 200 IPR041084 -
Psa5g2795 666 SUPERFAMILY Zn-dependent exopeptidases 212 452 - -
Psa5g2795 666 CDD M28_Nicastrin 39 619 - -
Psa5g2795 666 PANTHER NICASTRIN 14 665 IPR008710 GO:0016021|GO:0016485
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Psa5g2795 K06171 - gmx:100818367 1084.32