Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Psa4g4944 ATGACAACAGAAACAACATCCTCGTCATCTTCTCAAACCACCAAAACCATCATCGATCACCACCTCCCCCTCCGTCTCCTCAGATCCGAAATTGTCACACCCGCTCCTACTTTCTCCCGTTCCACAATCGATTTCCTCCATCACTTTGCAGGCTATTCATGGATCGCTTATGGAGCTTCTTCAATTCTCACCATTACCCATTTCCCTTCTCCTCTTTCCACTCATCAAACGCGCATCGGTTCCGTTTTTCGTCAATTCTTTGAACTCTCATCCGATCAGTCCTCCCCTGTTTCTGCTGTCTCTTGGTCCCCTCAATTACCTTCCTCCGGTGAACTTGCCGCTGCCGCCGAAAATTGCATCTGGGTTTTTCATCACGACTCTGTTGCGTCCAAAGGTTCTTTTTGTTGGAGCCAGAATGCAGTGCTTGTACAAAGTACAAAAGTGGAGACCATCAGATGGACAGGATCCGGAGATGGAATTATTTCTGGTGGAATGGAGGTAGTTTTCTGGAAAAAGAGTAATAGATGTTGGGAAATCGCGTGGAAGTTTAAAGCAGATCAGCCCCAAACACTCCTAAGTGCAACCTGGTCTATTGACGGTCTTTCAGCAACTGCACCATATTCTAGTAAAGAACAGATTGAAGGATCCTTAATCAGTCAGGAAAGCAAATGTGTATTTGTATGTCAGAGCAATGGACTATCTGAATATTCAAAAGCCAAACTTCAGCATCCTCTACCTATTGTGACAATTCAATGGAGACCATCGAGGGGAAAACTATCAGACAAATACAGTAGGTATTCAAAAAGGAATGTGTTACTGACATGCTGCTTAGATGGAACTGCAAGGTTATGGAGTGAGGTTGATAATGGAAAGGCCAAGAGGGCTGGGAAGAACACGGGGTGCTCTTTTTGTGTTGTTGCTGTTATTGAGATTAATCAATGTTTAAATGGAACTCTTGATTCAGATATATTTGTGACGTGGGGGACGGAAATCGAGGGGCTATTTACAAGAGGTGAAGGAGACAAACAAAATTTCTCCAAAGAAGGAATTGAGCACGACATTAGAAAATGTGACTGGTTAGTTGGATTTGGTCCTGGAATGTTGCTTAGCTTTTGGGCCGTCCACTGTCTTGACGATGTTTCCCCATTGAGGTTCCCCCGAGTTACATTATGGAGGAAGCATGAACTCCAGAGTCGCGATATAGGAAACATTTGTAAATTTGACTCATCTGATTTTAAAAACGCATTACTTCTGCACAAAGTGATTATATCAAGAAACTCTTTGTCTGGTCCACCAAGCATATGCTCCCCACTACAGCTTTTACCTTGTAATTCCTTAGTTTGGTCATTTTTCCATATTCAAGAAATACGCGATGCTGTTGAGAACTCCCCTGACAATGGTAACATAGATGAAATCTCCTCTCATTTGACTGGTGGGTCTTTAAACTTAGATGGACACAGTGGGAAAATATTAAAGGTTTCAATTCATCCTTATATTTGCAAAGCTCAAGTTGCTGCTTCTCTTGATTCCAATGGACTGCTTCTTTTCTGGTCACTTTCTAATATATCAAATGGCATTTTGGGATGTCCAACGTTGGTTCCTACTTGGGAACTCTGTGGAAAACTTGCAACTCAACACTCATGCTCCATGTATACAAGCTTGACATGGGCACCTTCAATCCTTGATGAGAAACTTGTTTTTTTCATGGGACATACCAGAGGGGTTGATTGCTTCATAGTCAATATTAGTCGAACTGAGGAAGATAACTTAGAATGTCACTACTTATGCACTATTCCCTTCACTGGTCATGGTCCTTATGAGGATGGCCCGCACGATATATTTGCAATTCCTTTGAACTCTACTTCTAATAAAACAATTTTTAACAATAAACTTATGCTACTGGCAATTTGGACAGGGAGATTTCAGGCCCTATCATGGGAAGTTAATGTGCAATCTTTTGACATGTCAACAATCGGTTTTGAATGCAATTTTGATGCTGAAAGCCTTGATGACAACCATGTTTGGACATTTGAAAGTACATTTGCTAGTAAAAGATATTGCATTGTTGTCATTCCATGTTCATCCGAGTTTCCAAGTTCCGATGATCTGGTTACTAGTTTTGCAGTGGGATATCCAGGCACCGAGAGTCATAGACAGCAAGAGTTTGGCTTTGCAAATGATCATTGTAGTAGCTGTTCTACATATATCTTGGCCACAGGCTGCTCTGATGGTAGCTTGAAACTTTGGAAAAGTAACCATGGCAATCTGTCGACCCTGAACTTGCCATGGGAGCTTGTGGGTATGTTTATTGCACATAACAGTCCTGTCAAGGGTATCTGTTTCACTGATTGTGGTCAGAAAGTTGCAACGTTCTGTAGCAGAAATGATTCCAATGCTGTCAATACCATCCATATATGGGATGCTATAAACCTGATAATTGCAGGGACTTTTATTTTAGAAGATACACTAACGTTTGAAAGCGATGTTATTACTCTCAAGTGGTTAACTTTAGGGACTGGTGAGTTATTGCTTGGAGTTTGTTTGCAAAATGAGTTGCAAGTATATGCTCGGAAGCGTTATGACGGTCTGACTTGGTCTAACTCTGTAAATTTCCCAAAATTGAATATATGGTCTCACATCGCATTTGCTCGTACTTCCCTTCCAATAAATGATTTCTTATGGGGTCCCAGAGCTGCTGCAGTGGTAATTCACGGAAATTACTTCAGATATAAATCAGTAACCAACAAGGTACACCTATTTTTCGTTTTCTCATTATTTCGTTCTCGTGATTCAGATCCAAGAGCCTATAACAGCAAGGATGATGCATATGAAGACATAAGTTCTGCAGTTTTTACTGATTGTGACATTGAAGTAGCCGAGCTGATTAGTGGATCGTTGCCTACTTATCACCCTGATGTACTTCTTACCAATATAAGTTCAGGCAACTGGGAACGTGCTTACATAGCTGTCAAGCATTTTGTTGAACACCTGATTTCTAATCATGATCCTGAAAAGAGACAGATTACCAAAAGGGATGGTCTTCCGAGTATCATATTGTCAGGTTATCTAGAAGGCCGTATATCAAAAAATTCCCAAGATAAGGGATTTAATTGGAGTGGGGATGTTGCCTCAATCGCGTCATTTTCACAGACTCAAAGTAGCTCTATCCAGTTTCCATATCATTTGGATTCCAGTGCTGAAAATAAAAGCAGTTCCACCTCAACTAGATCCGAGCTTAATGGCTTTATTGAATCTTTAAAGAATTTTCCTGATTTACCTCATTTGATCAACATAGAAAGGACAGAGATTCTCTCAATCATTGATCTGCTCAGTGAAGTTTGTAACCCAGACTCGTCTTCTGCATATCAGAGTCTCGATGAACCTGGACGAAGGTTTTGGGTTGCACTAAGGTTTAAGCAATTACTTTTTCAACGAAAGTTTGCCAGAGCTGCATCTACCGAAGAGATGATCATTAACTCAAGGATGTTCGTATGGGCTTACCACTCTGATTGTGTTGAAAATTTATTTGGTTCTGTCATACCCAATGAACCATCGTGGCAACAAATGCGTGCTTTGGGTATGGGCTTTTGGTATTCCAGCATACCTCAATTGCGTGCTAGGATGGAGAAATTAGCAAGAGCACAATATTTGAAGAACAAAAATCCTAAGGATTGTGCACTGCTGTATATTGCATTGAACAGAATTCAAGTTTTAGCTGGCCTTTTTAAAATCAGTAGGGATGAGAAGGACAAGCCTTTAGTGGGTTTCCTCTTGCGCAATTTTCAGGATGAGAAAAATAAAGCTGCTGCTTTAAAAAATGCTTATGTCTTATTAGGAAAGCATCAGCTGGAATTGGCGGTTGCCTTCTTTTTGCTTGGAGGCGATCATTCTTCTGCTGTAAATGTTTGTGCTAAGACCCTTGGGGACGAACAACTTGCACTAGTCATTTGTCGCCTTGTTGAGGGCCATGGTGGACCATTAGAGCATCACCTAATTACTAAGTATATATTTCCATCTGCAACCGATAGAGGAGACTACTGGCTGGCTAGCCTTCTGGAGTGGGAAATGGGCAATTACTATCAATCTTTTCATAGAATGCTACAGTTTTCCATAGAGACCGGGGATCCAAAGTCCACCGTTATGTCCAATTCTGGTTCTTTTTTGGACCCTACTGTTGGTTTTTATTGTCAAATGCTTGCAACAAAGAATAGCACACGGAATGCTGTAGGAGAGCAAAATTCAACCATCCTTTTAAGGTGGGCAACTTTGATGACAATTACTGCCCTAAAAAGATGCGGTATACCTCTTGAGGCATTGGAGTATTTCTCATCTTCTCCGAGCATGCTTGGGACTGCTGATCAAGCAAATGAATTGGGCGATGTTCTGTCCAGTACATTAAAGCCTTTGCCAGGAAAATCCTCTAACTGGTTATCTGCTGATGTATCTGTGCATCTGGAGTTTCATGTTAAATTGAATTTGGCACTTTGCTACTTATCAAAACTGATAAGAGAGCATCCAAGTTGGCCTGATACTTTTATAGAATCTGATGGAGAAGGCTCTTACTCTGAAGAGTCAATGATTCAATACGAGAAATCAAATGATAGTTTCAAACAAAAGTTATATGCCGGGTTTGATCTTTTGGAACAAAAGTTCTTGCTAACTCCGTGTTATCTAATCAGCATGATCTTACTCTTACTTTGCCATCATGGGCTGTGGTACATTGGGTATGATGTGACAGACGGAAGTACTCAAGGAGAACTGTCTCAAAAGAAGAGTGATAGATTTGATGTTTCCATTTTATCTCATTCTCAACTCAAACCCCTCTTTAAAACTGCAGAAGAAATCTCCTTTTTCTATTCAAGATTTTTTTCTGCTTGCGGTATGGAATATTCTCAACCAAGTTCAACTCTTAAGAAAGCTTCACAGTGTCACTTTGAAGCTTGGCTTCGTAGAAAACCAGAAGCCCTTCTATTCATGGTGCAACCTTTCTTGATTGCACATGATGGCTGTAATCCTTATGAGGTTGATATGGTGAATCTGAAGAACCTTATCCCAAAAGTCGCGCAGTTGTTGGCTCAGAATTCTTTCATAACTAATACAGAAAACCTTCAAGTATCCAAATCTACAGAGAATAAACTAGAGGCAGATACGAAGAGTTTGGTTCCGGATGATGAAAGGTGGAAGATTTTAGGGACCTGCCTGTGGCAGCATATGTCTAGATTCATGATATCTAATTTGAATTTAGTTCTTTCTAAACTTGAAGATGAAAGTTTATCTAGTTCTTTTCACAGTTATAAATTCATGATATCTAATTTGAATTTAGTTCTTTCTAAACTTGAAGATGAAAGTTTATCTAGTTCTTTTCACAGTTATAGAGAATCTAATACTCCCAGAAATGTGGATTCTGATAGCATCAGTTTGCCAGAGCAGATTCTATTAGTCACGTTTAGCTTATGTGATTTACTGACGACAACAGTTACTCATATTTCTTCTTATCATGTTAAACAACTTGCGGAATTTTTGTGGCGAAAATCGCAGAATGGTTCAAATGTTATGACTCTTGAATGGTTAAGACAAACAAGTCAATCAGAACCGAATCATAATGAAAACCTGGATGTTTCGGAATTGGTTAACAGGAAAGATAACCATCTAGCTCATCAGTTATTATGGGATCACTGTGCCGATCCGAAATTGATACGCGACTGCTTTGCACAGGAGAAACTCAATTGGTCAAAGGATTCGGACCATAAGCCTATCAAAGAATGGAATGACTTGTATACAATTATGACAGGGTTGCATAAAACTGATGATTCACATAATGATGAAAGCAAAGTTGGCAAATTATCTGCTAATCACGAAGTAGAATCTCCTGTTAAAAGAATGTTTCCAAGCAGCCATGCTTCTGCTAGTTCCAACCAGAAAGAAACAACTTGTGCAAATATTGAAGACTTTCAGAGTCCCAGAGAAATTTACAAGAGAAATGGAGAACTTTTGGAGGCACTGTGTATAAACTCTACCAATCAACAGGAAGCTGCAGTTGCTAGCAATCGTAAGGGTATAGTATTCTTTCACTTGGAAGATGAGACACCTTTTAGTGGCGAAGCAGACCTTTTGTGGACCAAGGCCGATTGGCCACAAAACGGATGGGCAGGTTCAGAATCCACCCCTGCACCTACTTGTGTTTCTCCTGGTATTGGCCTTGGAAGCAAGAAAGGGGCACACCTCGGTCTTGGTGGTGCAACTGTGGGTATGGATTCTTCAGCTTGGCCCAGCAGAGACTTGACAGGCGGTGGATCTTTAGGAATGCTAGGTTATGCTGGTATTGGTGCCTCTGGATTGGGTTGGGAAACTCAACAAGACTTTGAAGATTTTGTTGATCCACCTGCCACTTTGGAGAATACAAGTACCCGGGCGTTTTCTAGTCATCCAATGAGGCCATTCTTCTTGGTTGGTTCAAGCAATACACACATTTACTTGTGGGAGTTCAATAAGGACAAAGCTACTGCTACATACGGGGTGCTGCCTGCTGCTAATGTCCCTCCACCTTATGCTCTTGCGTCAATTTCAGCTTTACAATTTGACCACTTTGGGCATCGTTTTGCCAGTGCTGCATTAGATGGAACCGTCTGCACATGGCAGCTAGAGGTAGGAGGAAGGAGCAACATTCGTCCAACAGAATCATCCCTCTGCTTCAATGGCCAAGCATCCGATGTCACGTACATTTCCTCTAGCGGATCAATAATAGCCGTGGCAGGATATAGCTCTACTGCTGTCAATGTGGTTATATGGGATACTTTAGCTCCACCTTCAACTTCTCGAGCTTCCATTTTATGTCATGAAGGTGGTGCACGCTCCCTTTCTGTATTTGACAATCAACTAGGAAGTGGTTCCGTTTCCCCTCTTATTGTGACCGGTGGTAAAGGCGGTGATGTTGGACTTCACGACTTCCGCTATATAGCTACTGGAAAGGCTAAAAGAACTAAGCGTTCTGATAGCATTGGGCGAAGCTCTCTCGCATCTTTGAATTACGACAAGGACCATAATGTAGATGGGATGCTTTGGTATATTCCAAAGGCACACTCAGGGAGTGTCACAAAAATAGCTACCATCCCAAATACGAGCTTGTTTTTGAGTGGAAGCTCAGATGGAGATGTCAAGCTCTGGGATGCCCAAAGCACAAGGTTAATACATCACTGGCCTAAGATACATGAAAAGCACACTTTTCTCCAGTCAGGCTCTCGTGGATTCGGCGGCGTTGTTCGGGCTGCTGTTACAGACATTCAAGTTGTTCCGCATGGTTTCCTAACATGCGGCGGGGACGGAAATGTAAAGCTTGTACAGTTGAAAAATCACCTGCGTGGCTTTGGAGATGAGTAA 7377 0.4129 MTTETTSSSSSQTTKTIIDHHLPLRLLRSEIVTPAPTFSRSTIDFLHHFAGYSWIAYGASSILTITHFPSPLSTHQTRIGSVFRQFFELSSDQSSPVSAVSWSPQLPSSGELAAAAENCIWVFHHDSVASKGSFCWSQNAVLVQSTKVETIRWTGSGDGIISGGMEVVFWKKSNRCWEIAWKFKADQPQTLLSATWSIDGLSATAPYSSKEQIEGSLISQESKCVFVCQSNGLSEYSKAKLQHPLPIVTIQWRPSRGKLSDKYSRYSKRNVLLTCCLDGTARLWSEVDNGKAKRAGKNTGCSFCVVAVIEINQCLNGTLDSDIFVTWGTEIEGLFTRGEGDKQNFSKEGIEHDIRKCDWLVGFGPGMLLSFWAVHCLDDVSPLRFPRVTLWRKHELQSRDIGNICKFDSSDFKNALLLHKVIISRNSLSGPPSICSPLQLLPCNSLVWSFFHIQEIRDAVENSPDNGNIDEISSHLTGGSLNLDGHSGKILKVSIHPYICKAQVAASLDSNGLLLFWSLSNISNGILGCPTLVPTWELCGKLATQHSCSMYTSLTWAPSILDEKLVFFMGHTRGVDCFIVNISRTEEDNLECHYLCTIPFTGHGPYEDGPHDIFAIPLNSTSNKTIFNNKLMLLAIWTGRFQALSWEVNVQSFDMSTIGFECNFDAESLDDNHVWTFESTFASKRYCIVVIPCSSEFPSSDDLVTSFAVGYPGTESHRQQEFGFANDHCSSCSTYILATGCSDGSLKLWKSNHGNLSTLNLPWELVGMFIAHNSPVKGICFTDCGQKVATFCSRNDSNAVNTIHIWDAINLIIAGTFILEDTLTFESDVITLKWLTLGTGELLLGVCLQNELQVYARKRYDGLTWSNSVNFPKLNIWSHIAFARTSLPINDFLWGPRAAAVVIHGNYFRYKSVTNKVHLFFVFSLFRSRDSDPRAYNSKDDAYEDISSAVFTDCDIEVAELISGSLPTYHPDVLLTNISSGNWERAYIAVKHFVEHLISNHDPEKRQITKRDGLPSIILSGYLEGRISKNSQDKGFNWSGDVASIASFSQTQSSSIQFPYHLDSSAENKSSSTSTRSELNGFIESLKNFPDLPHLINIERTEILSIIDLLSEVCNPDSSSAYQSLDEPGRRFWVALRFKQLLFQRKFARAASTEEMIINSRMFVWAYHSDCVENLFGSVIPNEPSWQQMRALGMGFWYSSIPQLRARMEKLARAQYLKNKNPKDCALLYIALNRIQVLAGLFKISRDEKDKPLVGFLLRNFQDEKNKAAALKNAYVLLGKHQLELAVAFFLLGGDHSSAVNVCAKTLGDEQLALVICRLVEGHGGPLEHHLITKYIFPSATDRGDYWLASLLEWEMGNYYQSFHRMLQFSIETGDPKSTVMSNSGSFLDPTVGFYCQMLATKNSTRNAVGEQNSTILLRWATLMTITALKRCGIPLEALEYFSSSPSMLGTADQANELGDVLSSTLKPLPGKSSNWLSADVSVHLEFHVKLNLALCYLSKLIREHPSWPDTFIESDGEGSYSEESMIQYEKSNDSFKQKLYAGFDLLEQKFLLTPCYLISMILLLLCHHGLWYIGYDVTDGSTQGELSQKKSDRFDVSILSHSQLKPLFKTAEEISFFYSRFFSACGMEYSQPSSTLKKASQCHFEAWLRRKPEALLFMVQPFLIAHDGCNPYEVDMVNLKNLIPKVAQLLAQNSFITNTENLQVSKSTENKLEADTKSLVPDDERWKILGTCLWQHMSRFMISNLNLVLSKLEDESLSSSFHSYKFMISNLNLVLSKLEDESLSSSFHSYRESNTPRNVDSDSISLPEQILLVTFSLCDLLTTTVTHISSYHVKQLAEFLWRKSQNGSNVMTLEWLRQTSQSEPNHNENLDVSELVNRKDNHLAHQLLWDHCADPKLIRDCFAQEKLNWSKDSDHKPIKEWNDLYTIMTGLHKTDDSHNDESKVGKLSANHEVESPVKRMFPSSHASASSNQKETTCANIEDFQSPREIYKRNGELLEALCINSTNQQEAAVASNRKGIVFFHLEDETPFSGEADLLWTKADWPQNGWAGSESTPAPTCVSPGIGLGSKKGAHLGLGGATVGMDSSAWPSRDLTGGGSLGMLGYAGIGASGLGWETQQDFEDFVDPPATLENTSTRAFSSHPMRPFFLVGSSNTHIYLWEFNKDKATATYGVLPAANVPPPYALASISALQFDHFGHRFASAALDGTVCTWQLEVGGRSNIRPTESSLCFNGQASDVTYISSSGSIIAVAGYSSTAVNVVIWDTLAPPSTSRASILCHEGGARSLSVFDNQLGSGSVSPLIVTGGKGGDVGLHDFRYIATGKAKRTKRSDSIGRSSLASLNYDKDHNVDGMLWYIPKAHSGSVTKIATIPNTSLFLSGSSDGDVKLWDAQSTRLIHHWPKIHEKHTFLQSGSRGFGGVVRAAVTDIQVVPHGFLTCGGDGNVKLVQLKNHLRGFGDE* 2459
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Psa4g4944 2458 Pfam WD domain, G-beta repeat 2357 2389 IPR001680 GO:0005515
Psa4g4944 2458 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats profile. 2357 2398 IPR001680 GO:0005515
Psa4g4944 2458 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 92 818 IPR036322 GO:0005515
Psa4g4944 2458 Gene3D - 2127 2349 IPR015943 GO:0005515
Psa4g4944 2458 SMART WD40_4 2224 2264 IPR001680 GO:0005515
Psa4g4944 2458 SMART WD40_4 82 124 IPR001680 GO:0005515
Psa4g4944 2458 SMART WD40_4 690 750 IPR001680 GO:0005515
Psa4g4944 2458 SMART WD40_4 2401 2447 IPR001680 GO:0005515
Psa4g4944 2458 SMART WD40_4 762 807 IPR001680 GO:0005515
Psa4g4944 2458 SMART WD40_4 234 285 IPR001680 GO:0005515
Psa4g4944 2458 SMART WD40_4 2178 2213 IPR001680 GO:0005515
Psa4g4944 2458 SMART WD40_4 476 518 IPR001680 GO:0005515
Psa4g4944 2458 SMART WD40_4 2269 2315 IPR001680 GO:0005515
Psa4g4944 2458 SMART WD40_4 2124 2161 IPR001680 GO:0005515
Psa4g4944 2458 SMART WD40_4 2350 2389 IPR001680 GO:0005515
Psa4g4944 2458 PANTHER RABCONNECTIN-3A 28 2448 - -
Psa4g4944 2458 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 2137 2445 IPR036322 GO:0005515
Psa4g4944 2458 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats circular profile. 2357 2392 - -
Psa4g4944 2458 Gene3D - 2353 2453 IPR015943 GO:0005515
Psa4g4944 2458 Gene3D - 468 811 IPR015943 GO:0005515
Psa4g4944 2458 Pfam RAVE protein 1 C terminal 801 1393 IPR022033 -
Psa4g4944 2458 PANTHER RABCONNECTIN-RELATED 28 2448 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Psa4g4944 Psa-Chr4 428095224 428107161 Dispersed/Transposed
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Psa4g4944 K24155 - gmx:100789935 3645.9
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Psa4g4944 4 428095224 428107161 Psa4g4944 4 428095224 428107161 ECH