Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Prci14g0133 ATGGCGGATACTAAGTCTGTTGACGCTTCTCTGTGGTGGGATCCTTTCACTCTGCTGCTCACTGAGCTTGAGAACTCCTGTCTCTCCTCAGACCTCCCTCAAAATTTGGTGAAAAAGTTGAAGGACAACCATTCCTGGCTATTGGATGCAGTTTCGCGCTTCAAGCCGCCAAACGAGAAATCAAAGGAAGCTCTGAATTCGAAGAAACTGCAAATTGGATGTCACCAACTAACTGTACAAACACACTTGAAAGACAAAGCTCTAAAAATCAGCTCCTCCTTGCAATTGGATGAAGTTCAATCTTACATTCTTGCCGAAAGGTCACTCAAACATAACAATGTGGCAGTTGATTCCATGGCTCAAGAATTTCTTCACGTGATAGTAATTCAATATTATACGGAGAGACAGTGCTTGCTGAAATGCATCAGGTGGATTCTCATGCATGCTATATATATTGGACCAGGCTCTAAAGAACATGTTATAAGAGAGGAGGCAAAAAAGTTGTTTCATGATGGACTGGAAAACAAATTAATATCTTTGTTTCAGGATCTTTTGCTTTTTAGTTATCCAGAGCAAATGGATGTTGATCTTTACACTCTGTGGGCTGAGGAGACCCTAGTTGAGGACAACTTAGTTCTGGACATACTATTCCTTGCGTATTATGACTCATTTTGTAATTGTAGTGGTGAAAGGTGGAAGAAGTTATGTACTATCTACAAGGGAGTCATTTCTGGTCAATATAACTTCAGAAAGCTTGCAATAACGTCAGAAGCCTGGCAACTGTCTTATCATGTGAAAGTTCAACTGCTACTTATCCTGATAGAAACTCTGGACTTGGAAAATCTTCTTCAGATGGTTCATGATGAAACACCTTACAGGAAAGGTGCATCTACTTTTTCATTGACTGATGTCCAAGAGATGGATGCTTTAGTTTCTACTTTCAATGCTTTTGAAATGAAAGAAGCTGGTCCCTTATTTCTAGCATGGGCAGCATTTCTTTATCTGCTATTGACACTTCCAGGAAAAGATGAAAGCAATGGCCTAACGGAGATTGATCATGTTGGTTATGTTCGACAGGCATTTGAGGCTGCATCCTTTAGTTACTGTCTTGAAATTCTTGAGTGCGACATACTGAGGGAGTATGATGGTCCTATGTCTGGCTATCGCAGTGTATTGAGAACATTATTATCTGCTTTTATTGCATCTTATGAGGTCAACATTCGGGCAGAGGATAGCAACCCCATTTTGATACTGGATATTCTTTGCAAGATCTACAGAGGAGAGGAATCACTTTGTATTCAGTTTTGGGACAAGGAAAGTTTTATTGATGGTCCAATTCGTTGTCTTCTTTGCAACCTTGGTGGTGAGTTCCCTTTCCAGAGAGTGGAACTTGTTCAACTCTTGTCTTCCCTTTGTGAGGGGACATGGCCTGCAGAATGCGTGTATAATTTCATAGATAGGTCCATTGGTGTATCATCCTTGTTTGAGATTAGTAATGAGTCAGTGGCAGACATCTCTCATATAGTTGAGGCACAGCAACCAGTGCAAGTTCCTGGAATTGAAGGTTTTTTTATTCCCATGGGAACTCGTGGACATGTCTTGAAAGCTTTTGGACGGAACACTGCCCTTGTACGATGGGAGTATGCAACATCAGGAGTGTTTCTTTTACTCCTACGTTTAACACAAGAGGTACATCTGAATGGCAAGGAGGAGGTTCTTTTGACTCTTGACCTGCTCAGTAGATTGGTTTCCTTTAACACAGCTGTCTGTTTTGAGTTGATGAGTCTCAGCTGCTCTGCACATTTTCACACGGTTGGATTGATTGATGAGCAGAAAAAGAATGTCTGGGTCATTGAGATCATTTGCAATCTCGTCAAAAACCCATCTCTGAATTCCTATGGTGCTGCACTGATGTCAAAGGGCATCAAGATTTTGGGAAAGATGTTAATTTGTTCTCCTTCTAGTGTTGCAGCAATTGCTCTAAATGCAAATATATTTGATATGGCTTTGCAGACAACTGTTTTCAGTGGAGGAAATAATGCCTCGTCGAGTGGTTCATGGATGCTCTCTGGCAAACTGGCTAAGCTGCTTTTAATTGACTGTGAGCAGAACAGTAATGACTGCCCCTTGGCAATATCAGTTCTGGACTTTACCATACAGCTTGTAGAAACCGGGGTGGAGAATGATTGTCTCCTTGCATTGGTTATTTTCTCTTTGCAGTATGTTTTGGTCAATCATGAATCCTGGAAATACAAGATGAAGCATGTTCGATGGAAAGTGACATTGAAGGTGCTTGAACTGATGAAAAAATGCAACATATTGATGGCTTACCATGGAAAAGTGGGTGAGGTAATTCACGATGTGTTATTCTCTGATTCATCCATTCACAAGACGCTGTTCCAAATTGCTTGCACTACAGTGAATGCCTTGGAGAAATTGCATCTTAGCCGCCTCTTTGATCCAGTGGAGATTGAAGGGTTACAATTTGCAATAAGTTCTGTATTAGATGTTCTTCATGTTATGCTGACAAAACTTTCTGAGGAAGCAGCATCCAGCTATTCCGTTTTTCACCAAGCAGTGTTATCATGTACAATCAATTCTGTCCCCGTTGTTGCTGCTGTTATATCCTTGATTTCATACTTTCGAGATCCTGCCATCCAAATTGGTGCTGCTAGGTTTATTTCATTCTTATTTTCTATAGCAGATTCCATTCAGCCATTTTCATATGGAACCACATTCTTTGCCCCGGAATCTAATCAGATCATGGATTTGAGACACTCTGTGAGCTACATATTGTCGGAGCAATCATCATCTAATGAAGATCTCTTTATTGCAACAGTTAATCTGTTGACTTCTGCAGCATATCACCAGCCTGCATTTCTTATTGCTATATTTACTCCAGAGGAGAAGAACAATGATCAGTCAATTGTTGTTGGCGATGTGAAGCAGCAAAAAAGTGAAAATGTTCTGCCCAAAGGTTCAAAGAAATCATGCCAGATAGATGAACTTACGAATTATATTGCAAGGGCAGATGATCTGATTAAGAGCCGCCCACACATACTGCTGAGTGTACTTAACTTCATGATTGCCTTGTGGCAAGGGGCTCCTCAGTACTTAAATATCCTGGAGTCTCTGAGAAGCTCTGAGAAGTTCTGGAAGTACTTGTCTGATGCTATCTTAAAAGTTGCTGGCAGCACAGCTCTACTTGTTAATCTGACAGAGAAGGATGCTCGAAATGTAGCGAACAGTTACCTTTGTCAATCTGCAATACTTGGTATCATGTCATATGAGCTGTTCTTGCAGAAAAAGTTATTGCATGCAGAATCACTGGTGAAGGATGCAGCTGGATCTCAGGGCAAGGAACAAGGTGGTGCAGAAACCGAAAAATATAAGGCACCTGTTTTTTGTGATGTTAGGGAAATTTGGTCTTCCTGGTGCAAAGATTCTGTTTTGGAGAAACTAATGAAGTCATATACTTCTGGGTATAATTATGATATATATGATAGTGCAAAAGTTGCTATCGGTTTATTTTCTGTCCATGTGATGGAAAAGTTAGTAGCTGGTGATTCTGGAAGTTTATCAGTGTCATTGCAGCAGAAGTTTCATGCAACGTTAACAAAGTTGAGCATGCATCCTGCTTTTTCTGAATTACTCTGCCAGTATTCACAACGTGGTTACAGGTTAAGCGTTGAAGGGAAGAAATTGAAGAAGTTGATACTCAGTGATCTCTACTATCAGTTGCAAGGAGAACTTGAAGGCAGAAAAGTTGGTACGGGACCATTCAAAGAATTGTCTCAGTATCTGGTTGAATCAAATATTTTTGAAACCTATCAACATCATTTTAATGACGACCTTTGTGCAACTACCAAGAATTTATACTTGTTCGACCTTGTACGCTTGCGAGCTGATATAGGTTTAGATGTGTGGTATTGTTCTGAATGGAAGGCATCTAAGGAGATTGCAGAAACCATGTTGCACTGGCTGCAGGATGCAAACTCGTTTATGTTGGCTTCAAGCTCAAAGCTTTCTGCATTGAAAGCATTGATCTCTGTCTTGACTGTCTACCATGATGATGCACTAGGGAGAAAATCTACGAGAGAGGAGATCCCAGATCAAATCATTTTCACATGCATAGATCATATATGCCAATCTTTTCACGCTACAATTGAAAAATTAGCACCTGTTCTTGATGTGTCCGAAGATATACTCAATTTTCTTGCATCCCAAGCAGAACTGCTTCTCCAGTTTACCAGAACTGTCTGCAAAAGTCTCTCCTTTGATATTTCCCTACTCGTTCTGAAATGTTCTGGTTCAGGTCTTAAACTGTTGAGTGAACTTAAGCTGTTGTCTTCTAGGGCCAGCGTGATAATGAAGCTATTACTCACATTGCTGCTTTTAGTATTAGATTCCAACTGCCTCAGTTCTGATTTGGATGGGACAATAGACAAGAAGTCTGGTGAGGGCTTTTCTAAAATTTCAAATGCAATCCTTGGCCTACTTCCCATTCTATGCAAATGTGTTGCTGCTCCTGAACATTGTCTACTGTCTCTGTCAGTTATGGACTTGATATTAAGAAATTTCTTGATGCCTGCGACTTGGTTACCTGTCATACGGAATCATCTCCAGCTTAAACTTCTTTTGCTAAAACTTCAAGACAAAACGTCCTCTTCCATTCCAATAATATTGAAGTTTCTTTTGACACTTGCACGGGTAAAGGGAGGTGCTGAGATGCTTTATGGTTCTGGTTTCTTGTCGTCTCTGAGAGTGTTGTTTGCTGAATGTGATGAGGTGTTCTCAAGAATTCATAGTGAAAATGTGGGTAGCTTACATGGAAGGTTTGAAATGCCTGGAGACATTTGGGGACTCGGATTAGCTGTGGTCACAGCTATGGTTCAATCCTTGGAAGACAGTTCTTCTTGCACAGCTCTTGTGGAAAGTGTGATACCTTACTTTTTCCAGGAGAATGCTTATCTGATTTTTAGATCTCTAAATGCTCCAGACCTCCCAACAGATCATCATGACAAGAAAAGACCTCGGCCACAGAGGTCGTGGATTTCTCTTGCTAATCTTAAGGAGACAGAACATACTTTGATGCTCATGTGTGAACTAGCAAAACATTGGAATTCATGGGCGAAGGCAATCAATGAAGTGGATAGACAGCTTAGAGAGACATGTATCCATCTTTTAGCCTTTATTAGCAGGGGCACTCAACGGCTTGGTGATTTGTCTGACAGGAGTGCCTCACTTTTATGTCAGCCTTCTCTTAAAGAGGATTTTGACAGTTTCTTAAAGCCTTCTTTTATCAACAGTAAGAATGGATGGTTTGCCCTCTCACCGCTTTGCTGCGTGTCAAAACTGAAGACCAATTCTGTCTCGACTGCTTTGACCATCTATGGTGAAGCAACTAAAAGTACAGATTTGTTTCCAAAAACATGCTTTTCTGATACTTTTGCTGTGCAGATATATAGAATTGCATGTCTCCTTTTAAAGTTTCTCAGTTTACAAGCTGAGGGAGCTGTCAAAAGGGCTGAAGAGGTTGGCTTCGTTGATCTTGCGCATTTTCCCGAGCTTCCAATGCCAGAAATCTTGCATGGATTGCAGGATCAAGCCATTGAGATTGTTACAGAGTTATGTGAGGCCAACAAACCCAGGGTTTCTCCCCAAATTCAGAATCTCTGTTATTTATTGTTGCAAATAATTGAAATGGCCTTGCAGTTGGAGCTTTGTGTCCTGCAGATCTGTGGCATAAGGCCAGTATTAGGGCGCGTGGATGATTTTTCAAAGGAAATTAAAACTCTATTTGGTGCAATGGAGGGGCATGCGTTTCTGAAGGCTTCTAAGAAGTCCTTAAAACAAATGGTATTTTTGGTCTATCCTGGAATCCTGCAATCCGAGCGTTTATGA 5904 0.4077 MADTKSVDASLWWDPFTLLLTELENSCLSSDLPQNLVKKLKDNHSWLLDAVSRFKPPNEKSKEALNSKKLQIGCHQLTVQTHLKDKALKISSSLQLDEVQSYILAERSLKHNNVAVDSMAQEFLHVIVIQYYTERQCLLKCIRWILMHAIYIGPGSKEHVIREEAKKLFHDGLENKLISLFQDLLLFSYPEQMDVDLYTLWAEETLVEDNLVLDILFLAYYDSFCNCSGERWKKLCTIYKGVISGQYNFRKLAITSEAWQLSYHVKVQLLLILIETLDLENLLQMVHDETPYRKGASTFSLTDVQEMDALVSTFNAFEMKEAGPLFLAWAAFLYLLLTLPGKDESNGLTEIDHVGYVRQAFEAASFSYCLEILECDILREYDGPMSGYRSVLRTLLSAFIASYEVNIRAEDSNPILILDILCKIYRGEESLCIQFWDKESFIDGPIRCLLCNLGGEFPFQRVELVQLLSSLCEGTWPAECVYNFIDRSIGVSSLFEISNESVADISHIVEAQQPVQVPGIEGFFIPMGTRGHVLKAFGRNTALVRWEYATSGVFLLLLRLTQEVHLNGKEEVLLTLDLLSRLVSFNTAVCFELMSLSCSAHFHTVGLIDEQKKNVWVIEIICNLVKNPSLNSYGAALMSKGIKILGKMLICSPSSVAAIALNANIFDMALQTTVFSGGNNASSSGSWMLSGKLAKLLLIDCEQNSNDCPLAISVLDFTIQLVETGVENDCLLALVIFSLQYVLVNHESWKYKMKHVRWKVTLKVLELMKKCNILMAYHGKVGEVIHDVLFSDSSIHKTLFQIACTTVNALEKLHLSRLFDPVEIEGLQFAISSVLDVLHVMLTKLSEEAASSYSVFHQAVLSCTINSVPVVAAVISLISYFRDPAIQIGAARFISFLFSIADSIQPFSYGTTFFAPESNQIMDLRHSVSYILSEQSSSNEDLFIATVNLLTSAAYHQPAFLIAIFTPEEKNNDQSIVVGDVKQQKSENVLPKGSKKSCQIDELTNYIARADDLIKSRPHILLSVLNFMIALWQGAPQYLNILESLRSSEKFWKYLSDAILKVAGSTALLVNLTEKDARNVANSYLCQSAILGIMSYELFLQKKLLHAESLVKDAAGSQGKEQGGAETEKYKAPVFCDVREIWSSWCKDSVLEKLMKSYTSGYNYDIYDSAKVAIGLFSVHVMEKLVAGDSGSLSVSLQQKFHATLTKLSMHPAFSELLCQYSQRGYRLSVEGKKLKKLILSDLYYQLQGELEGRKVGTGPFKELSQYLVESNIFETYQHHFNDDLCATTKNLYLFDLVRLRADIGLDVWYCSEWKASKEIAETMLHWLQDANSFMLASSSKLSALKALISVLTVYHDDALGRKSTREEIPDQIIFTCIDHICQSFHATIEKLAPVLDVSEDILNFLASQAELLLQFTRTVCKSLSFDISLLVLKCSGSGLKLLSELKLLSSRASVIMKLLLTLLLLVLDSNCLSSDLDGTIDKKSGEGFSKISNAILGLLPILCKCVAAPEHCLLSLSVMDLILRNFLMPATWLPVIRNHLQLKLLLLKLQDKTSSSIPIILKFLLTLARVKGGAEMLYGSGFLSSLRVLFAECDEVFSRIHSENVGSLHGRFEMPGDIWGLGLAVVTAMVQSLEDSSSCTALVESVIPYFFQENAYLIFRSLNAPDLPTDHHDKKRPRPQRSWISLANLKETEHTLMLMCELAKHWNSWAKAINEVDRQLRETCIHLLAFISRGTQRLGDLSDRSASLLCQPSLKEDFDSFLKPSFINSKNGWFALSPLCCVSKLKTNSVSTALTIYGEATKSTDLFPKTCFSDTFAVQIYRIACLLLKFLSLQAEGAVKRAEEVGFVDLAHFPELPMPEILHGLQDQAIEIVTELCEANKPRVSPQIQNLCYLLLQIIEMALQLELCVLQICGIRPVLGRVDDFSKEIKTLFGAMEGHAFLKASKKSLKQMVFLVYPGILQSERL 1967
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Prci14g0133 1967 PANTHER NUCLEOPORIN NUP188 HOMOLOG 10 1964 IPR044840 GO:0017056
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Prci14g0133 Prci-Chr14 1123479 1144891 Tandem
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Prci14g0133 K14311 - gmx:100796560 2676.74
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Prci14g0133 14 1123479 1144891 Prci14g0133 14 1123479 1144891 ECH