Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Phco7g00425 ATGACAAACACCCTTCACAGCTCTTGCTATTCAGTGTCATGTCCGCCATTATCATTTGAAAGCCATGTTTGGTTTCGATCTCCACACTCTTCACTTTCCTTTCTGTCTTCCTTTCATTTTCTTCTTTTATTCTTCTTTTTCTCTCTGCTCACCAATCGGAGCATAGTGAGTGCCCATGAGTGTTGGCAACTAATTCAGCAGATAAAAATGGGTACAGAGTCACAAATTCCACGAAGCTTAATCCACAGAATCTACGCTCCCTTGGCTAACGAATTTCATTTTGCACCACCGCTCTCTTCCTCCAGAACAAATGAACTCGAACTTGTTCGAGGTGTTCTACGAATGCTGCAAGGGTTTTCTGGTCCCCTGTTCTCTTGGGATAAAAGTGCAAACAGTTTCCGTGCAAAGAGCGGAGTTTACGTCAGCCATCTCTCACAGAAAAGTCTCCACTCTCTTCTCAACCAGTTTATCCACGCAGCTACGTGTCTCAAATTCGTGGCGATTACACTCGATAAAGTTGAATCTGCAGTGCCAAAGTCTCCCCCTACTTTGAACGCGTTTGCGTCCTCTGCTTCAGCTTGCCTTAAGCGGTTACGGAATCTTGCCTTGAAGGAGGAAACGTCCTTGAGCAATGCAGATGGAATAACCACTCCAACCTTGTTAGGATTGACCAATTCCTTATCAAGTCTTTGCTCAGGGGCTGAATTTCTATTTCAAGTAGTGCATGAGGCCATTCCTGCTGTATACTTTGAGTTTGGTGTGTCTGTACCAGCAGCAGAACTCACTGTTCACGTGCTTGACTACCTTCATAAGAAGCTTGATGAAATGTGTCTGGTACAAGGTGGTGAGGAGGAAGCTAACCAGATGGTTCTTTATATGTATGTTGGAAGCTTGTTGCCGTACATTGAGGGTCTTGATTCCTGGCTTTTTGAAGGAATTCTTGATGATCCTTTTGGTGAGATGTTCTTTTTCTCTAATAAAGAAGTCTCAGTGGACGAGGCTGAGTTCTGGGAGAAGAGTTATTTATTAGGAATACTACAGCATAGCAAGTTAGGTTCAGATATTTCTTCCACAGATTATGGCAATGATTCTGTCCCAGCATCAAATGACAAGGAAATGGACAGGAGGGATTCCATTTCTTTGTCTGGCACAACTAAAGGAAAAGAACCAAACATTAGAGACCGTCCAGCTTGTCCCCTTTTTATTAACGATTTAGCTAAATCAATAGTTTCTGCTGGAAAATCTTTGCAGCTTATGCGCTATGTACCTAATTCCTCGGTGAATTGTAGCAAAGAAAGTAATTATGAGGTTGGAAGTACCAAATGTTTTAACTATGGTTTATATCCTACTCAGAGAATGGCTGGGCTAACCTTGCCGGAAGTTTTTTCTATATCACTAGTTGGACTTATTGGTCACGGTGACCATGTCTGTAAGTACTTTTGGCAAGAGAACTGGTATGATATTGTACCTGTTTCTTCCTATGCATCTTGTGTAAATGAGGAAAAAATAGATAATGACAATAATGAAAAATTAATTGCTCCACCTTATTCAGAGAAGACTTGGTATAAGTTCTTGATTGATACCTTGTTTCAGAAAAGATCAGCTGACTTAAAGCTAACATATGGACACATAAATAATGACACATTAGAGCTGAGAGGGGCTAAAGTTATTGAAGATGAGGTGCTTCTCTTGGGGTCATATGTGGAAAATCCAGTTATTACAGTATGTCGAGCGAACCTTGGAAAGAATGGGAATGCCTTGAAAGCATTGAATTTATCTCAAAAATTCAGCTTGCCTTCATTAAATGATGAGAGTTTAAGAAGAGCTATATTTGGTGCAGAAAGTCCTGGATTTTCTGATAGTGAAGGAACAAACTATACATTTGGCTTTCACTTTGGTGAATCTGAATACCTTCGCTCACAGGATGACAGAAAGCTTTTAGAAATGTTATTTCCTTTTCCCACTATTTTACCTTCATTTCAGGATGATGTTCCTGTGTCGGAGCTCTTACCTTTCCAGAGAAACAGCAGTCTTATTTCAAGAGTTCTTCGATGGATGCAGAATGTTGACCTAAGAACTACTCCACTTCCTCTAGTTATTATGCAGTACTGTCTAACCGTCTACATTCAGAAACAGGTGGATTATATCGGAGTGAATATGCTGTTAAAGTTGATGAATGAATGGAGATTGATGGATGAGCTTGCAGTGTTGAGAGCCATATACTTGCTAGGTTCAGGTGATTTGCTGCAACACTTTTTGACTGTAATTTTCAATAAGTTAGATAAGGGTGAAGCATGGGATGATGATTTTGAATTAAACACAATATTGCAGGAATCGATCAGAAATTCTTCTGATTGTATGCTGTTAAGTGCTCCAGATTCATTGGTAGTGACGATAACCAAAAATCGTGTTCACAGTGATGAGGAAGCTAGCACAGCTGGTGCTGTTTTGAGCACTCTTCGTCAAAGTCAGGTCAATAGCTTTGGAATTAATGGCCTTGATATGCTCAAGTTCACGTATAAGGTCCCTTGGCCTCTTGAACTTATTGCAAATACAGAGGCAATCAAGAAGTACAACCAGGTGATGAGGTTCTTGTTGAAGGTCAAGCGTGCAAAATTTGTATTAGATAAAGTGCGGAGATGTATGTGGAAGGGTAGGGGATCTGCTACAAACCTCAGAAAGCATCATTTGTTAGTGGAGCAGAAACTCCTTCATTTTGTGGATGCTTTTCACCAATATGTGATGGATCGGGTATATCACAGTGCATGGCGTGAACTATGTGAAGGTATGACTGCAGCAAAATCTCTGGATGAAGTCATTGAAGTCCATGAGGCTTACATGTTATCAATTCAACGGCAATGCTTTGTGGTTCCTGATAAGCTGGGGGCTCTTATTGCCAGCCGCATCAACATTATCCTTGGCATAGCTTTAGACTTTTATAACATACAGCAGACATTAAGTAGTGGTGGAGCTGTTTCTGCCATCAAAGCAAGGTGTGAGATGGAAGTGGACCGGATAGAGAAACAATTTGATGATTGCATTGCTTTCTTACTTCGGGTTTTGTCATTCAAATTAAATGTCGGGCACTTCCCTCATCTGGCTGATTTGGTGACCAGAATCAACTACAACTATTTCTACATGTCTGCTAATGGAAATTTGATGACTGCCTCCACTTCTGGAAGTGTTACTTCAAGGATGGCGAAGCCCCCTGGGTAG 3216 0.4092 MTNTLHSSCYSVSCPPLSFESHVWFRSPHSSLSFLSSFHFLLLFFFFSLLTNRSIVSAHECWQLIQQIKMGTESQIPRSLIHRIYAPLANEFHFAPPLSSSRTNELELVRGVLRMLQGFSGPLFSWDKSANSFRAKSGVYVSHLSQKSLHSLLNQFIHAATCLKFVAITLDKVESAVPKSPPTLNAFASSASACLKRLRNLALKEETSLSNADGITTPTLLGLTNSLSSLCSGAEFLFQVVHEAIPAVYFEFGVSVPAAELTVHVLDYLHKKLDEMCLVQGGEEEANQMVLYMYVGSLLPYIEGLDSWLFEGILDDPFGEMFFFSNKEVSVDEAEFWEKSYLLGILQHSKLGSDISSTDYGNDSVPASNDKEMDRRDSISLSGTTKGKEPNIRDRPACPLFINDLAKSIVSAGKSLQLMRYVPNSSVNCSKESNYEVGSTKCFNYGLYPTQRMAGLTLPEVFSISLVGLIGHGDHVCKYFWQENWYDIVPVSSYASCVNEEKIDNDNNEKLIAPPYSEKTWYKFLIDTLFQKRSADLKLTYGHINNDTLELRGAKVIEDEVLLLGSYVENPVITVCRANLGKNGNALKALNLSQKFSLPSLNDESLRRAIFGAESPGFSDSEGTNYTFGFHFGESEYLRSQDDRKLLEMLFPFPTILPSFQDDVPVSELLPFQRNSSLISRVLRWMQNVDLRTTPLPLVIMQYCLTVYIQKQVDYIGVNMLLKLMNEWRLMDELAVLRAIYLLGSGDLLQHFLTVIFNKLDKGEAWDDDFELNTILQESIRNSSDCMLLSAPDSLVVTITKNRVHSDEEASTAGAVLSTLRQSQVNSFGINGLDMLKFTYKVPWPLELIANTEAIKKYNQVMRFLLKVKRAKFVLDKVRRCMWKGRGSATNLRKHHLLVEQKLLHFVDAFHQYVMDRVYHSAWRELCEGMTAAKSLDEVIEVHEAYMLSIQRQCFVVPDKLGALIASRINIILGIALDFYNIQQTLSSGGAVSAIKARCEMEVDRIEKQFDDCIAFLLRVLSFKLNVGHFPHLADLVTRINYNYFYMSANGNLMTASTSGSVTSRMAKPPG 1071
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Phco7g00425 1071 Pfam Gamma tubulin complex component C-terminal 730 1046 IPR040457 GO:0043015
Phco7g00425 1071 Gene3D - 730 1045 IPR042241 -
Phco7g00425 1071 PANTHER GAMMA TUBULIN COMPLEX PROTEIN 91 1046 IPR007259 GO:0000226|GO:0000922|GO:0005815|GO:0007020|GO:0043015
Phco7g00425 1071 MobiDBLite consensus disorder prediction 361 389 - -
Phco7g00425 1071 FunFam Gamma-tubulin complex component 730 1045 - -
Phco7g00425 1071 Pfam Gamma tubulin complex component N-terminal 109 434 IPR041470 -
Phco7g00425 1071 MobiDBLite consensus disorder prediction 368 389 - -
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Phco7g00425 7 3011025 3019174 Phco7g00425 7 3011025 3019174 ECH