Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Phco1g00582 ATGGCGGAATCAGATACGTCAATCCGAAACACGAAGATGAGCCCCATCGATCACCTTCCCCTCTGTCTCCTCAGATCCGACACGGTCCCACCCGCCCCTACCTTCTCCGAATCCACCGTCGATTTCCTCCCTCACTTCTCCGGCTACTCTTGGATCGCCTACGCCGCTTCTTCTCTCCTCGTTATCTCCCACTTCCCTTCTCCTCTTTCCCCTCATCAATCCCGCATCGGCCCCATTTTCCGCCAATCCTTTCAGCTCTCACCCGATCCCCTCGCCGCTGTCGCCTGGTCCCCTCGCTCACCCTCCTCCGGTGACCTTGCCGCCGCTGCCGATAACTGCATCTGCCTTTTCCACCACGACTCCACCGCCGCAAAAGGTTCTTTTTGTTGGAGCCAGAATGCAGTGCTTGTACAACATACGAAAGTTGCAAACATCAAATGGACTGGATCAGGAGATGGAATAATTTCTGTTGGAATGGAGGTGGTTTTCTGGAAAAAGAGCAACAAATGTTGGGAAGTTGCTTGGAAGTTTAAAGCAGATCAACCCCAAACACTTGTTTCTGCAACGTGGTCTATTGAGGGCCCTTCAGCAACTGCAGCACATCCTAGTAAAGAACAGATTGAAGGGGTCTTGACCAATGAGGAAAGCAAATGTGTAGTTGTGTGTCAAAGCAATGGACTTTCTGAATATTCAAAAGTCGAGCTACATCATCCCCTACCTGTTGTAATGATTCAATGGAGACCATCAAGAGGGAAGTTATCAAACAGATACGGTAAATATTCAGTAAGGCATGTTTTGTTGACATGCAGCTTAGATGGGACTGCAAGGTTATGGAGTGAAACTAATAATGGAAAGGCCAGGAGAGTTGGGAAGGACATCAATGATCAGAAAAATGCGGGATGCTCCTTTTGTGTTGTTGCTGTTATTGAGATTAATCAGACCTTAAATGGAACTCTTGGTTCAGATATATTTGTGAGATGGGGGGCAGAATTTGAGGGAATATTTAGAATTGGTGAAGAGTCCAAACAAGTTTTTTCCAAAGATGGATTTGAGCATGATGTCAGAAATTGCGATTGGATAGTTGGGTTTGGTCCTGGAATGTTGCTTAGCTTTTGGGCTGTCCACTGTCTTGATGATGTTTCACCACTGAGATTCCCTCGAGTTACATTATGGAAGAGACATGAACTCCAGAACCATGACATAGCAAATGTATACAAGTTTAACTCATCTGATTTTAAAAATGCGTTATTTCTTCAAAAGGTTATTTTAATGAGAAATTGCCTTTCTGGTCCACCTATTATATGCTCTCCACTTCAGCTATTGTCTTGTAATTCCTTAGTTTGGTCAAATTTCCGTATTCTAACAATACATGATGCCGTGGAGAACTCCATTGATAATGGTAACGCAGATAGCATGTCCCCCTATTTGACTGGTGGGGTTTTGAACTTAGATGGTCATAGTGGGAAAATCTTAAAGGTTTCAATTCATCCTTATTCATGCAAAGTTCAATTTGCTGCTTCTCTGGATTCTAATGGACTGCTTCTTTTCTGGTCACTTTCTAATATTTCAAACTGCATTTTGGGATGTCCAACTTTGGTTCCTACTATGGAACTCTGTGGAAAGCTTGCCACTCAAGACTCATGCTCATTGTACACAAGCTTGACTTGGGCACCTTCAATAGTTGGTGACAAACTGTTTTTTTTCATGGGACATACCCGGGGGATTGACTGCTTCATTGTCAATATTTGTCGAACTGAAGAGGAAAACATAGAATGTCATTACTTTTGCACTATTCCTTTCAATGGTCATGGTCCTTATGAAGATGGCCCTATTGATATCTTCACAATTCCTCTGAACTCCACCTGTGACAAAACTTTTTGTAACAGTAAACTTATGCTGTTGGCAGTATGGATGGGGAGATTTCAGGCCCTATCATGGGAAGTTAACTTGCATTCATTTGACATGTCAACAAACTGTTGTGAATGCAATTTTGATGCTAAAAGCATTGATAACTGTAGTGTTTGGGCATTTGAAAGTACATTTGCTGATAAAAAATTTTGCATTACTGTAAATCCATGTTCATGTGAGTTTCCAAGTTCCAATGATCTGGTGACTAGTTTCGCTGTGGCTAATCCAGGCACTCTAAGCCATATACGACAAGAGTTTGGCTTTGCAAATGATCTTTGTAGCAGTTATCCTACATACATCATGGTCACAGGCTCCTCTAATGGCATCTTGAAACTCTGGAAAAGTAAACCTGGGAACTCATTGACCCAACACTTGCCATGGGAGCTTGTGGGTGTTTTTGTTGCACATGATGGTCCCATCAAGGGTATATGTTTCTCTGATTGTGGTGAGAAGATTGCTACGATCGGCCATGAAAGCAATTCCAATGCTATCAATACCATACATATATGGGATGCTGTACCATTAATCAGTGCAGGCACTTTTATTTTGGAGGATAAAATAAAGACCAATAGTGATGTTATTGCTCTAAAGTGGTTAACTTTAGGAACAGGGGAGTTATTGCTTGGAGTTTGTTTGCAAAATGAATTACAAATATATGCTCCCAAGCGTTGTATAGGTACAACTTTGTCAAACTCTGTAAATTTTCCAAAAATGAATATATGGGTTCGCATTGCATATGCTCACACTTCCATTCCAATTTATGATTTCTTATGGGGACCTAGAGCTGCAGCAGTGGTGATTCATAGAAATTACTTTAGTATATTTAGTCATTGGTTGTTCTACATGGATAAAAAGCAAGGGAGTAATTGCCATCCTTGTGATTCAAAGCCTAATGCTTATAACCGTGAGGATGAAATATATGAAGACATACTTTCTACAGTTTTTACTGAATATGACATTGGTGCTCTCAGAGAACAGACAGATGGAGACAATCAAGTAGATTTTAATTATGTGCAGTCCATAAAAAAAATCAATATAAAGGACAATTCCAGTAGCTTGTTTCTGGCCAAAGAACAATTAAAATTTGAACTTCTAACCAAGGTTGGTTTATGGAGCATCTTAGAAGTATCTGAGATGATCAGTGGATCATTGCCTACTTATCACCCTGATGTACTACTTACTAATATCAGTTCAGGAAACTGGAAACGTGCTTATGTAGCTGTGAGGCATCTTGTTGAGTGCCTGACTTCTACTTATGATCCTAAAAAGAGACACATCTCCAAAAGAATTGGTCTTCCAAATATTGTATTGTCAAATTATCTAGAAGGTTGTATATCAAAAGTTTCCCAGGGTAAGGGATTTCAGTGGGGTGGGGATTCAGCATCAATTTCACAGGCTCAGAGTAGCTTGTTCCAGTTTCCATATCATTCAGGTTCCAGTGCTGAAAATGAAAGCATTTTCTCAACAAAATCTGAGCTTAATGGCTTTATTGAATCACTTGAGAAATTTCCTGAGTTACCACTTTTGATTGACATAGAGAAGACACAGATTCTTGCAATTATTGATCTGCTTAGTGAAGTTAGTAGTGCACACTCATCTTCTGCGTATCAGAGTCTTGATGAACCTGGGCGAAGGTTTTGGGTTGCACTACGGTTTCGGCAACTGCTTTTTCTCCGTAAGTTTGGTAGAGCTGCGTCTTTTGAAGAGTTGCCTGTTAACTCAAGATTGTTTGTATGGGCTTATCACTCTGACAGCCTAGATAATTTATTTGGTTCTGTCATACCCAATGAACCATCTTGGCAAGAAATGCGTGCTTTGGGTTTGGGCTTTTGGTATGCTAATATACCTCAATTACGTGCAAGGATGGAGAAATTGGCAAGAGCGCAGTATTTGAAGAACAAAAATCCAAAGGATTGTGCTTTGCTTTATATTGCATTGAATAGAATTCAAGTTTTGGCTGGCCTTTTCAAAATCAGTAAGGATGAGAAGGATAAGCCTCTGGTGGGCTTTCTTTCTCGCAATTTTCAGGACGAAAAAAATAAAGCTGCTGCTTTAAAAAATGCTTATGTATTACTGGGAAGGCATCAGATGGAATTAGCAGTTGCTTTCTTTTTGCTTGGGGGTGATCATTCTTCTGCTATAAACGTTTGTGCTAAGAATCTTGGGGATGAACAGCTTGCCTTAGTCATTTGTCGTCTTGTTGATGGCCACGGGGGACCTTTGGAGCATCACCTAATTACAAAGTACATACTTCCATCTGCAATTGATAAAGGAGACTACTGGCTTGCAAGCCTTCTGGAGTGGGAAATGGGTAATTACTACAGATCTTTTTATAGAATGCTAGAGTATTCAGTAAACCCTAGGCCTCCAGAGTCCACTGTCATGTCCAATTGTGGTCCTTTTCTGGACCCTACAGTTGGTTTTTATTGCCAAATGCTAGCAACTAAGAATAGCATGCGGAACGCCGTGGGGGAGCACAATTCTGCAATTCTTTTAAGATGGGCAACTTTGATGACAGTTGCTTCCTTAAAAAGATGTGGTAATCCTCTTGAAGCATTGGAGTATTTCTCATCTTCACTGAGCATGCCTGGGACTGCAGATCAAGACAGTGAATTAGGTGACAATCATGATGTGCTGTCCAATACTCTTAAGCCTTTGCCTAGAGAAGGCTCTAACTGGTTTTCTGCTAATGTTTCCATGCATATCGAGTACCATATTAAATTGAATTTGGCACTTTGCTACTTATCAAAATTGATAAGAGAGCATCCAAGCTGGCTTGACACTTTTTCAGAATACAATGAAGAAGCTTCTGATTCTGACAAGTACATGATGTACTATGAGAAATCAGTTGAAAGTTTTAAACAAAAGTTATACAGTGGGCTTGCTCTATTTGAACAGAGGTTTTTATTGGCTCCCCACTGTCTAATCGGCATGATTTTACTCTTACTTAGCCATCACGGATCATTGTACATCGGATATGATATGACAGATGGATCTACCCAAGGAGAACTGTCTCAAAAGAAGAGCGATATGTTTGATGATTTCAATTTATGTAACTCTAGGATTACACCCCTCTTCAAGACTGCAGAAGAAGTCTCCTTTCTCTATTCAAGATTATTTTGTGCCTGCAGTATGGAAAATTCTCAACGAGATTCATTTATTGATAGCAAACCTAAGTTTTTTTATGCTTCAGAGTGCCGCATTGAAGGTGTTTTTATTTCATTGTGGTTTTTAAGAGCAACTTTGAGGATTCAGTTGAGTTCTATTAGCAAAGATCTTATTAAAACACTTCTTGATATCCTAGATTTTTATGAATACTATTCACATTTTTCATTAGCTTGGCTTCAGAAAAACTCAGAAGTGCTTTTGTATATGGTGGAACCATTCTTTGTTGCACAATCTAATGGCCATAATCCTTATGACATTGATATGGTGAATCTAAAGAAGCTTATCCCAAAAATTGGACAGTTGTTGTCTCAAACTTCTTCCATACCTAGTGTGCAAAACCTTCAACTGTCGGAATGTGATATAAAGCATTCAATTCCTGATGATGAAAGATGGAAGATTTTAGGGACCTGCTTGTGGCAGCATATGTCTAGATTCATGATATCAAATTTGAATTCGGTTCTTGCCAAACTCGAAGATGGCAATTTGTCTGGTCCTTTCCATAGAAAGTATGCTTATGGGGAGTCTTGTATCGTAAGTATGGTTTCTGAAAGCATTAGCTTGCCAGAGAAGATTCGGATAGTCTCATATAGCCTATGTGATCTACTGATGACAACAGTTACTCACATCTCTTCTTATCTTGTTAAACAACATGCAGAATTTCTGTGGCAGAAAGTAAAGAATGATTTGAATGTACAGACTCTTGAATGGTTAAAACATAAATCTGAATTCAGTCAGAACCAAAACCTGAAAGTTTTGGAACTGGGGAACAGGAAAGATTATTCAGTTCATCAGTTATTATGGGATCACAGTGCAGATCCCAAATTGATATTGGATTGCTTTGCACAGGAAAAAATCAATTGGCCAAATGATTTGGATCATATGCACACTAAGGGGTGGAATGACTTGTCAATGATTATGTCAGGGCTGCATAAAACTGATGATACATGTGGTGACAACTTCAATCTTAGCACTAGATCTTCTAATCATGAAGTTGGAACTCCTGTTAAAGAAACATCTCTAAATGGCCATCCTTCTGCAAGATCAAACCAGAAAGATATAACTTCTACAAATTTTGCAGTTTTCCAGAGTCCAAGAGAAATGTACAAGAGAAATGGGGAACTTTTGGAGGCATTGTGTATAAACTCTACTTGTCAACAGGAAGCTGCGGTTGCTAGCAACAGGAAGGGTATAATGTTCTTTCATCTGGAAGATGAGATTCCACACAGTGGTAAATCAAATGATCTTTTGTGGGCCACAGCTGACTGGCCTCAGAATGGATGGGCAGGTTCAGAATCCACCCCTACTCCAACATGTGTTTCTCCTGGTGTTGGGCTTGGGAGCAATAAAGGGGCACACCTTGGGCTGGGTGGAGCAACTGTCGGTGTGGACTCTTCAACTTGGCCCAGCAATGACTTGACAGGTGGTGGAGTTTTAGGAATGCTAGGTTATGCTGATATTGGTGCCTCTAGATTAGGTTGGGAAATTCAACAAGATTTTGAAGATTTTGTTGATCCACCTGCCACTTTGGATAACATAAGTACCAGGGCTTTGTCTAGTCATCCAATGAGGCCTTTCTTCTTGGTTGGTTCTAGCAATACACACATTTACTTGTGGGAGTTCAACAAAGACAAAGCTACTGCTACATATGGAGTGCTGCCTGCTGCGAATGTCCCTCCACCTTATGCCCTTGCATCAATTTCAGCCTTACAGTTTGACCACTTTGGACACCGGTTTGCCAGTGCTGCATTAGATGGAACTGTCTGCACATGGCAGCTGGAGGTTGGAGGAAGGAGCAATGTCCGTCCAATAGAATCATCTCTTTGCTTTAATGGTCATGCTTCGGATGTCACATATTTTTCCTCAAGTGGATCAATAATAGCTGTGGCTGGATATAGCTCTAATGGTGTTAATGTGGTCATATGGGATACTTTAGCTCCACCCACAACTTCTCGCGCTTCCATTTTATGTCATGAAGGTGGTGCACAAACCGTGTCTGTTTCTGATAATCATGTGGGAAGTGGTTCTGTATCCCCCCTTATTGTGACCGGTGGTAAAGGTGGTGATGTTGGACTTCATGACTTCCGCTATATAGCTACTGGAAAGGCTAAAAGGCATAGGCATGCTGATAACATTGGACAAAGCTCTGCCAAATCTTTGGCTCGTGACAAGGACCAGAATGTAGATGGGATGCTTTGGTACATTCCAAAGGCTCACTCAGGGAGTGTCACAAAAGTAGTTACCATCCCCAATACCAGCTTGTTTTTAACTGGAAGCACAGATGGAGATGTCAAACTCTGGGATGCCCAGAGCACAAAGTTAGTACATCACTGGTCAAAGATACATGAAAAACACACTTTTCTACAGCCAAGTTCTCGTGGATTTGGTGGTGTAGTGCGGGCTGCTGTAACAGATATAAAAGTTGTTTCCAATGGTTTTCTTACATGCGGTGGGGATGGAACTGTAAAGCTGGTACGGCTTGACAATCACCTGCGTGGCCATTGA 7578 0.4084 MAESDTSIRNTKMSPIDHLPLCLLRSDTVPPAPTFSESTVDFLPHFSGYSWIAYAASSLLVISHFPSPLSPHQSRIGPIFRQSFQLSPDPLAAVAWSPRSPSSGDLAAAADNCICLFHHDSTAAKGSFCWSQNAVLVQHTKVANIKWTGSGDGIISVGMEVVFWKKSNKCWEVAWKFKADQPQTLVSATWSIEGPSATAAHPSKEQIEGVLTNEESKCVVVCQSNGLSEYSKVELHHPLPVVMIQWRPSRGKLSNRYGKYSVRHVLLTCSLDGTARLWSETNNGKARRVGKDINDQKNAGCSFCVVAVIEINQTLNGTLGSDIFVRWGAEFEGIFRIGEESKQVFSKDGFEHDVRNCDWIVGFGPGMLLSFWAVHCLDDVSPLRFPRVTLWKRHELQNHDIANVYKFNSSDFKNALFLQKVILMRNCLSGPPIICSPLQLLSCNSLVWSNFRILTIHDAVENSIDNGNADSMSPYLTGGVLNLDGHSGKILKVSIHPYSCKVQFAASLDSNGLLLFWSLSNISNCILGCPTLVPTMELCGKLATQDSCSLYTSLTWAPSIVGDKLFFFMGHTRGIDCFIVNICRTEEENIECHYFCTIPFNGHGPYEDGPIDIFTIPLNSTCDKTFCNSKLMLLAVWMGRFQALSWEVNLHSFDMSTNCCECNFDAKSIDNCSVWAFESTFADKKFCITVNPCSCEFPSSNDLVTSFAVANPGTLSHIRQEFGFANDLCSSYPTYIMVTGSSNGILKLWKSKPGNSLTQHLPWELVGVFVAHDGPIKGICFSDCGEKIATIGHESNSNAINTIHIWDAVPLISAGTFILEDKIKTNSDVIALKWLTLGTGELLLGVCLQNELQIYAPKRCIGTTLSNSVNFPKMNIWVRIAYAHTSIPIYDFLWGPRAAAVVIHRNYFSIFSHWLFYMDKKQGSNCHPCDSKPNAYNREDEIYEDILSTVFTEYDIGALREQTDGDNQVDFNYVQSIKKINIKDNSSSLFLAKEQLKFELLTKVGLWSILEVSEMISGSLPTYHPDVLLTNISSGNWKRAYVAVRHLVECLTSTYDPKKRHISKRIGLPNIVLSNYLEGCISKVSQGKGFQWGGDSASISQAQSSLFQFPYHSGSSAENESIFSTKSELNGFIESLEKFPELPLLIDIEKTQILAIIDLLSEVSSAHSSSAYQSLDEPGRRFWVALRFRQLLFLRKFGRAASFEELPVNSRLFVWAYHSDSLDNLFGSVIPNEPSWQEMRALGLGFWYANIPQLRARMEKLARAQYLKNKNPKDCALLYIALNRIQVLAGLFKISKDEKDKPLVGFLSRNFQDEKNKAAALKNAYVLLGRHQMELAVAFFLLGGDHSSAINVCAKNLGDEQLALVICRLVDGHGGPLEHHLITKYILPSAIDKGDYWLASLLEWEMGNYYRSFYRMLEYSVNPRPPESTVMSNCGPFLDPTVGFYCQMLATKNSMRNAVGEHNSAILLRWATLMTVASLKRCGNPLEALEYFSSSLSMPGTADQDSELGDNHDVLSNTLKPLPREGSNWFSANVSMHIEYHIKLNLALCYLSKLIREHPSWLDTFSEYNEEASDSDKYMMYYEKSVESFKQKLYSGLALFEQRFLLAPHCLIGMILLLLSHHGSLYIGYDMTDGSTQGELSQKKSDMFDDFNLCNSRITPLFKTAEEVSFLYSRLFCACSMENSQRDSFIDSKPKFFYASECRIEGVFISLWFLRATLRIQLSSISKDLIKTLLDILDFYEYYSHFSLAWLQKNSEVLLYMVEPFFVAQSNGHNPYDIDMVNLKKLIPKIGQLLSQTSSIPSVQNLQLSECDIKHSIPDDERWKILGTCLWQHMSRFMISNLNSVLAKLEDGNLSGPFHRKYAYGESCIVSMVSESISLPEKIRIVSYSLCDLLMTTVTHISSYLVKQHAEFLWQKVKNDLNVQTLEWLKHKSEFSQNQNLKVLELGNRKDYSVHQLLWDHSADPKLILDCFAQEKINWPNDLDHMHTKGWNDLSMIMSGLHKTDDTCGDNFNLSTRSSNHEVGTPVKETSLNGHPSARSNQKDITSTNFAVFQSPREMYKRNGELLEALCINSTCQQEAAVASNRKGIMFFHLEDEIPHSGKSNDLLWATADWPQNGWAGSESTPTPTCVSPGVGLGSNKGAHLGLGGATVGVDSSTWPSNDLTGGGVLGMLGYADIGASRLGWEIQQDFEDFVDPPATLDNISTRALSSHPMRPFFLVGSSNTHIYLWEFNKDKATATYGVLPAANVPPPYALASISALQFDHFGHRFASAALDGTVCTWQLEVGGRSNVRPIESSLCFNGHASDVTYFSSSGSIIAVAGYSSNGVNVVIWDTLAPPTTSRASILCHEGGAQTVSVSDNHVGSGSVSPLIVTGGKGGDVGLHDFRYIATGKAKRHRHADNIGQSSAKSLARDKDQNVDGMLWYIPKAHSGSVTKVVTIPNTSLFLTGSTDGDVKLWDAQSTKLVHHWSKIHEKHTFLQPSSRGFGGVVRAAVTDIKVVSNGFLTCGGDGTVKLVRLDNHLRGH 2525
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Phco1g00582 2525 SUPERFAMILY YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase 551 854 IPR011044 -
Phco1g00582 2525 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 2207 2519 IPR036322 GO:0005515
Phco1g00582 2525 Pfam WD domain, G-beta repeat 2427 2459 IPR001680 GO:0005515
Phco1g00582 2525 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats circular profile. 2427 2462 - -
Phco1g00582 2525 PANTHER RABCONNECTIN-RELATED 25 2516 - -
Phco1g00582 2525 Pfam RAVE protein 1 C terminal 799 1408 IPR022033 -
Phco1g00582 2525 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 83 813 IPR036322 GO:0005515
Phco1g00582 2525 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats profile. 2427 2468 IPR001680 GO:0005515
Phco1g00582 2525 Gene3D - 68 314 IPR015943 GO:0005515
Phco1g00582 2525 Gene3D - 2200 2524 IPR015943 GO:0005515
Phco1g00582 2525 Gene3D - 446 860 IPR015943 GO:0005515
Phco1g00582 2525 SMART WD40_4 2420 2459 IPR001680 GO:0005515
Phco1g00582 2525 SMART WD40_4 2194 2231 IPR001680 GO:0005515
Phco1g00582 2525 SMART WD40_4 762 807 IPR001680 GO:0005515
Phco1g00582 2525 SMART WD40_4 2294 2334 IPR001680 GO:0005515
Phco1g00582 2525 SMART WD40_4 2339 2385 IPR001680 GO:0005515
Phco1g00582 2525 SMART WD40_4 228 279 IPR001680 GO:0005515
Phco1g00582 2525 SMART WD40_4 2248 2283 IPR001680 GO:0005515
Phco1g00582 2525 SMART WD40_4 2471 2517 IPR001680 GO:0005515
Phco1g00582 2525 SMART WD40_4 476 518 IPR001680 GO:0005515
Phco1g00582 2525 SMART WD40_4 690 750 IPR001680 GO:0005515
Phco1g00582 2525 SMART WD40_4 77 118 IPR001680 GO:0005515
Phco1g00582 2525 FunFam Transducin family protein / WD-40 repeat family protein 2200 2477 - -
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Phco1g00582 1 5004278 5026428 Phco1g00582 1 5004278 5026428 ECH