Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Mtr4g2594 ATGGAATCGATCCTCGCAAGAGCATTGGAATACACGCTCAAATACTGGCTCAAATCATTCACCAGAGACCAATTCAAGTTACAGGGTCGCACTGTTCAGCTTTCTAATTTAGATATAAACGGTGATGCATTACATTCCAGCATTGGATTTCCGCCTGCACTCAATGTCACCACCGCCAAAGTCGGAAAATTGGAAATCAAGCTACCGTCGGTGAGCAATGTACAGACAGAGCCAATCATTGTACAAATTGATAGGCTTGATATGGTTCTTGAGGAGAATTCTGATTTTAAACCACCCGAGACTCCAACCAGTTCCACACCTTCAAGTGCTTCTGCTAAGGGTAGCGGGTACGGTTTCGCTGATAAGATTGCAGATGGAATGACTATACAGATTCATACAGTTAATCTATTACTTGAAACTCATGGTAGTGCTCGTCTCCAAGGGGCAGCAACATGGGCACCACCCATGGCGTCTATAACCATACACAACCTTTTTCTGTATACCACAAATGAAAGCTGGCAGGTTGTAAATCTTAAGGAGGCGCGGGATTTCTCATCTAATAAGAAGTATATTTATGTCTTCAAAAAATTGGAATGGGAATCATTATCTATTGATCTTTTGCCTCATCCCGACATGTTCACGGATGCTACTTCAGGCAGCTCTCAAGTAGGTTCAAACATGAGAGATGATGATGGCGCAAAGAGAGTATTCTTTGGAGGCGAGCGTTTTATAGAAGGAATATCAGGAGAAGCACATATCACTGTTCAGAGAACTGAATTGAACAGTCCACTTGGGCTCGAGGTTCAGTTACATGTCACAGAAGCCGTTTGCCCTGCATTAAGTGAACCAGGGCTACGTGCACTTCTCCGCTTTATGACAGGAATATATGTTTGTCTAAACAGGGGAAATGTAGATTTCAAGGCCCAGCAGCAATCTACTGAAGCTGCTGGCCGTTCTCTTGTGTCAATTGTTGTGGACCATATATTTCTGTGCATTAAAGATTCTGGGTTCCAGCTTGAGCTTTTAATGCAGTCCCTCTTTTTTTCTCGGGCCAGTCTTTCTGAAGGAGATAACGACAGTAACTTGACAAGGATTACAATTGCAGGACTATTTTTGAGGGATACATTTTCACGCCCTCCATGTACATTAGTGCAGCCATCGATGGAATCTGTCACACAACAAGCTTTTCAAGTGCCGGATTTTGCTAGAAGCTTTTGCCCGCCAATATATCCTCTAGGAGAACAGCAGTGGCAATTGATTGTGGAAACTCCTCTAATATGCATCCACGCCCTTCAGATCATGCCTTCTCCACTTCCACCATCCCTTGCTTCTCAAACAGTTATTGACTGTCAGTCTCTTATGGTCCATCTCCATGAAGAATCCTGCTTGAGGATATCATCCTTCTTAGCTGATGGAATTGTTGTCAATCGTGGTGACATTTTACCAGATTTCTCTGTGAATTCTTTTATTTTCACTCTCAAGGGTTTGGATATTACAGTTCCTTTGGATAAGGCCCAATTGGATTTTTGTGTAAGCAACGCGGATGATACAATTAAATCCTTATTTGCTGGAGCAAGGCTACATATTGAAAACCTTTTTGTTTTAGATTCACCTTCAATGAAACCAAGAATACTAAACCTGGAGAATGATCCTGCTTGCTTCTGTCTCTGGGAAGATCAACCAATTGATGCCAGCCAGAAGAAGTGGGCTGCCAGAACATCCCACCTTACTCTATCTTTGGAAGCAAATACTGGCACATTTGGGCGTCAGAATTCTCTGGGATGGACTGCTGGATTGTGGAGATGTGTTGATTTGAAAGATGCTTGCTTTGAAGTAGCTATGGTGACTGCTGACGGCAGCCCATTGTTAAAGGTTCCTCCTCCTGCGGGTATTATGAGGGTTGGGGTTTCTTGTGAACAGTATCTATCCAACACTTCTATAGAACAATTATTTTTTGTCCTTGATCTCTATGCTTATTTTGGGCGAGTTAGTGAAAAAATAGCCATAGCTTGGAAAAGGAAAGAAATGAAGGACGCTAGGAATACATCTTTCAGTGGACAGCTGATTGACAAAGTTCCTAGTGACGCTGCTGTAAGTTTAGCCATAAAAAAGCTCCAATTTCGATTTCTTGAGTCTTCTTCTGTGAATATGGAGGGAATTCCTCTAGTACAGTTTGTCGGAGATGATCTGTTCTTTAATGCCACTCATAGAACCCTTGGTGGTGCTATTGTTGTATCATCCACTTTACGTTGGGAGAGTGTTGAGATAGATTGTGTGGATTCTGAGGAGCATTTGGCATGTGAAAATGGTTCGTCTTTTATTTTTGGGGAAAATGTTCCTTCAATGAGTGATACTGGATACCCTCAACTGACAGCTGTTTTTTGGGTGGATAACAGTAATCATTTATTGAATGGTAATGCTCGTTCAGTCCCGTTTTTGATCTTAAGTATGGATCAAGTCATACCATTTTGTGAAGTAGACAATGAGTCTCATTGTTTGAATATCTCCGCTTCAATATCTGGTGTTCGTCTTGGTGGTGGAATGAACTACGCTGAAGCCCTCCTGCATCGGGTTGGAATACTTGGGCCTGATGGCGGTCCAGGGAAGGGTCTTTCTAAAGGGTTGGCAAACTTACAAAAAGGACCATTGGGAAAACATTTTAAGACAACACGTATAATTGTTGATAATTCAGAAAATGAAAGTGTGATAGAAGGGAAAGAACCCAGTTTTCCACACTTAAAGAAGCCAGACACTGTGGATGTAATTATAGAGTTGAGGGACTGGTTGTTTGCTCTTGAAGGTGCACAAGATATGGCCAAAAGATGGTGGTTCTCCAGTCAAGGAGACATAGGTAGAGAACAGAGGTGTTGGCATACAACCTTCCACAGTTTAGAAGTAAAAGCTAGAAGTGGCCCAAAGAAGGTTTCAGGTGGCAAGGCGCAACATTCACATAGAAAACAACCTTTTGAACTGGTTACGGTTGTAGTTCAAGGGCTGAAGATCTTGAAACCCACACCCCAAAAAGATGTCATGTCATCCATGTTAACCACTAATGGAGTTAAAGAACTGACTGATGCAGTTTGGGGAATCGGCCTTGAAGTGGACTTGATATTACATGAGAATAATGCTGATGATGAAAGGGCCGATTGGGAAGTGGGAAACCTAAAATTCTCTATAAAACAACCGATCGAGGCTGTTGTAACCAAGGATGAGTTCCAGCACCTCAATTTTTTATGCAAATCTGAAATTGATTCCATGGGCCGTATAACAGCTGGAATTCTGCAATTGCTTAAGCTAGAAGGTTCTGTCAGCCAGTCTATAATGGATCAGCTAGGAAACATTGGGAGCGAAGGCATTGACAAGATTCTCTCTCCTGGGAAACTCAGCATAGATGGTAGTGTTAGCAGCAGGGGGCCTTCTCAATTACCAAAACTAATAAATGACAGCCCGCACAAATCTATGGAATCAACGATAACTTTTCTTGAGGAAGCAGTTGTGGATTCACAGGCTAAGATTAATGCTTTGATCACTGATATTGGTATTTCTGAGTCCTCCCTTCAGCACCTTGACGTTGTTAAACAACTTAGTCAACAGATTGAGTCAATGCAAGTTTTATTGACGCAATTACGGAATCAACTTTAA 3642 0.4206 MESILARALEYTLKYWLKSFTRDQFKLQGRTVQLSNLDINGDALHSSIGFPPALNVTTAKVGKLEIKLPSVSNVQTEPIIVQIDRLDMVLEENSDFKPPETPTSSTPSSASAKGSGYGFADKIADGMTIQIHTVNLLLETHGSARLQGAATWAPPMASITIHNLFLYTTNESWQVVNLKEARDFSSNKKYIYVFKKLEWESLSIDLLPHPDMFTDATSGSSQVGSNMRDDDGAKRVFFGGERFIEGISGEAHITVQRTELNSPLGLEVQLHVTEAVCPALSEPGLRALLRFMTGIYVCLNRGNVDFKAQQQSTEAAGRSLVSIVVDHIFLCIKDSGFQLELLMQSLFFSRASLSEGDNDSNLTRITIAGLFLRDTFSRPPCTLVQPSMESVTQQAFQVPDFARSFCPPIYPLGEQQWQLIVETPLICIHALQIMPSPLPPSLASQTVIDCQSLMVHLHEESCLRISSFLADGIVVNRGDILPDFSVNSFIFTLKGLDITVPLDKAQLDFCVSNADDTIKSLFAGARLHIENLFVLDSPSMKPRILNLENDPACFCLWEDQPIDASQKKWAARTSHLTLSLEANTGTFGRQNSLGWTAGLWRCVDLKDACFEVAMVTADGSPLLKVPPPAGIMRVGVSCEQYLSNTSIEQLFFVLDLYAYFGRVSEKIAIAWKRKEMKDARNTSFSGQLIDKVPSDAAVSLAIKKLQFRFLESSSVNMEGIPLVQFVGDDLFFNATHRTLGGAIVVSSTLRWESVEIDCVDSEEHLACENGSSFIFGENVPSMSDTGYPQLTAVFWVDNSNHLLNGNARSVPFLILSMDQVIPFCEVDNESHCLNISASISGVRLGGGMNYAEALLHRVGILGPDGGPGKGLSKGLANLQKGPLGKHFKTTRIIVDNSENESVIEGKEPSFPHLKKPDTVDVIIELRDWLFALEGAQDMAKRWWFSSQGDIGREQRCWHTTFHSLEVKARSGPKKVSGGKAQHSHRKQPFELVTVVVQGLKILKPTPQKDVMSSMLTTNGVKELTDAVWGIGLEVDLILHENNADDERADWEVGNLKFSIKQPIEAVVTKDEFQHLNFLCKSEIDSMGRITAGILQLLKLEGSVSQSIMDQLGNIGSEGIDKILSPGKLSIDGSVSSRGPSQLPKLINDSPHKSMESTITFLEEAVVDSQAKINALITDIGISESSLQHLDVVKQLSQQIESMQVLLTQLRNQL* 1214
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Mtr4g2594 1213 PANTHER UNCHARACTERIZED 1 1212 IPR026728 -
Mtr4g2594 1213 Coils Coil 1192 1212 - -
Mtr4g2594 1213 MobiDBLite consensus disorder prediction 94 114 - -
Mtr4g2594 1213 Pfam N-terminal region of Chorein or VPS13 1 98 IPR026854 -
Mtr4g2594 1213 MobiDBLite consensus disorder prediction 97 113 - -
Mtr4g2594 1213 PANTHER AMINO-TERMINAL REGION OF CHOREIN, A TM VESICLE-MEDIATED SORTER 1 1212 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Mtr4g2594 Mtr-Chr4 39463557 39474496 Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Mtr4g2594 - - gmx:100811661 1767.28