Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Mtr1g0048 ATGGGGAGGTCCCGATTAGATGCGCTCGTGTCCGTTTTCGTTACGGTGCACCCGCACGAATCCTCTGCTCTTCTCCATTCCTTCTTTTGCTTCTTCTTCATTTTGAGTGCTTATTTCGTAGTTTTACCTTTGCGTGACGAAGGTGCAATTTCGTTAGGACTATCAAATCTACCTGAATTGTTTATAGGTTCATTGTTGCTCACCGTCATTGCCACGCCGTTTACATCACTCGTCTTCTCTCTTCCTAATCTCTCTAAAAACAAGGCTTTGGTTTTCATACACAGGTTCTTCAGTGTATCACTCATAGTGTTCTTTATTCTATGGCACTATTCATCAGCTGGATCTTCGACGTCCAATTTGATCGGGTCCACTGCTTTGACCTCGAAAGATGCAAAACTTGGTGATCAAGGCAGTCTTGCATCATCAGTTAGCTGGGATAACCGTGGATGGTTTTATATCTCTGTCCGTATAGGATTGTTTCTTTGGGTTGCTTTGCTTAATCTAATTACACTTTCTTCAACTTGGGCAAGGGTAATTGACGTAATGGACAACGAGTCAGGTTCAAGATTATTTGGGTTTATTGGTGCTGGTGCCACCCTTGGACAACTTTGTGGATCACTGTTTGCCACTGGAATGGCTTTTGTTGGTCCATTCTTACTTTTGTTTGCTGCTTTGTTGATGGAACTTGCGGCTCAGACATCAAGAGGGATAAATTGCGATACATCTCATGTTGAAGAAGAACTGTCTCCCATTAGGACTGAACACACTCTAAAAGGTTCCCCAAAGTCATCCGCTTTAGTGAAGCATAATGTTTGGCCCATATTGGAAGGACTCTGGCTTATACTGTCATCAACCTACCTCTTGCATATATCATTGTTCATCTGGCTGAGTGCAGTTGTCTCTTCATTCTTCTATTTCCAGAAAGTGAGTGTGATTGCCAGCACAGTTACTAGCTCTCTTGGAAGGAGAAAATTGTTTGCCGAGATAAATAGCTTTATTGCTGTTTTTATTCTTATTGGACAACTAACATTAACAGGGCGCATTCTTACTGTTGCTGGGGTTACTGCAGCTATATGCTCAACTCCTTTTGTTGGCTTCTTAAATTTAGCAGCTCTAGCTCTTTGGCCAGATTGGATGGTGGTGGCTATTTGTGAGACACTGAGAAAGGTTGTTACATATGTTGTTACAAGGCCAGGAAGAGAACTTCTATTTGTTGTTGTTTCGGAGGATGAAAAGTATAAAGCTAAAATATGCATAGATGTGCTGGTTCAAAGACTTGGAGATGCTGCAGCAGCTGGAATGTATAAAATGCTATTTGGTACCCAAAACGGAAGCCCGTCAACTGCTGCCCTTTATGGACTTCCGGTTTGTTTGCTGTGGATAATCACAGCATTCTTTTTGGGCCGTAGGCAAGCTCAACTTTCGAAGGAAAATTTGAGATTGAATGTACAGTGA 1455 0.4213 MGRSRLDALVSVFVTVHPHESSALLHSFFCFFFILSAYFVVLPLRDEGAISLGLSNLPELFIGSLLLTVIATPFTSLVFSLPNLSKNKALVFIHRFFSVSLIVFFILWHYSSAGSSTSNLIGSTALTSKDAKLGDQGSLASSVSWDNRGWFYISVRIGLFLWVALLNLITLSSTWARVIDVMDNESGSRLFGFIGAGATLGQLCGSLFATGMAFVGPFLLLFAALLMELAAQTSRGINCDTSHVEEELSPIRTEHTLKGSPKSSALVKHNVWPILEGLWLILSSTYLLHISLFIWLSAVVSSFFYFQKVSVIASTVTSSLGRRKLFAEINSFIAVFILIGQLTLTGRILTVAGVTAAICSTPFVGFLNLAALALWPDWMVVAICETLRKVVTYVVTRPGRELLFVVVSEDEKYKAKICIDVLVQRLGDAAAAGMYKMLFGTQNGSPSTAALYGLPVCLLWIITAFFLGRRQAQLSKENLRLNVQ* 485
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Mtr1g0048 484 Pfam TLC ATP/ADP transporter 342 468 IPR004667 GO:0005471|GO:0006862|GO:0016021
Mtr1g0048 484 PANTHER ADP,ATP CARRIER PROTEIN 2 477 - -
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Mtr1g0048 K03301 - gmx:100802404 778.859