LGRPv2

Gene search

Sequence information

Select	Gene	Cds	Cds_length	GC_content	Pep	Pep_length
	Mibi08g2002	ATGAACGTGAAAACTCACAGCTCCTTTCTGGGGAGTTCTCTTAGTGGCTCTTTCGAACTTATCGGTAGCAATAGGGAGCTTTTTAATTTTAACAAAATTTTGTTGCCGAAAAGGGATATTCGCAGATGCATTATATCTGCAAAGGAAAGTCAGCCGGTGAACCAAGTTTTTAGGTTCTCGCATTTTTGTGGGGGAAATGTGGAGTCATTGAGGAGAGATCTTGTCTCAAAAAATCAGTCGAGGTTGAAATGCTACAAGAAACCATTTCCTTTAGGCAAGGCTCTGGAGAGTTATCTAACGCCTTTGTGGAATGAAGGGCTACTTTTAATCAGGGCCTCTGTTTACATTGGAATTATCTCTGGGATATGCCTATTGGCGTGGTATGGGCAGAGTAAATCTAAGGGTTTCATTGAGGCAAAGCTATTGCCTTCTGTTTGCTCTGCAATCAGTGAACAGATTCAGCGTAAGCTAGAGTTTGGCAAGGTTAGAAGAATTTCGCCATTCAGCATTACGTTAGAGTCATGTTCATTAGGGCCACATAAGGAAGAATTTTCTTGTGGGGAGGCTCCCACAGTTAAACTTCGTCTCCATCCTTTTGCAAGTCTAAGGAGGGGAGAGTTGGTGATTGATGCAGTTTTGTCACGCCCAAGTGTCCTAGTAGTGCAACAGAAGGACTATAGTTGGATAGGAATCCCATCATCTGAAGGTGACACACGGAGGCACTTCTCAACTGAGGAAGGGATTGATCATCGTACAAAAATTAGGAGGCTTGCAAGAGAGAAAGCATCTGCTCAATGGGCAAAAGAAAGGGATGAAGCAGCTAGGAAAGCTGCAGAGATGGGTTACATAGTTTCTGAAAGGACTTCTACTCTATCTGAGGGTGATGCTTTGGAGGATATTGCTGCTCAATCGGCAGAATCAATTAAGTCTGAATCCTTTTATTGCCTGAATGAGGGGAAGCGTGATCGTCATTGCATGGACTCAGGTATTGATTATGACGTGAGACATGCAGATTTGGAAAAGTCATTTGGCGTAAAATTTCCAGGTTCAGGGCTTCAAATTTGGTCTAGAGAAACGGAAAGATGTAGGAAGCCCAAATTTAAGAGTAAGATTAATGGGAGTGGAAGTGCTGCCTCTGTTGTTGCTATTAAAGTAAAAATTCTTGAATGTAGTTCATTAGCAGCTCGTACTTATTTTCGAGGTCAATTACATGAGGAGTTTGGGGAGGCTTTATCACCACCTGGTAATTTTGATTTTGTGAACCAGGATACCTCTTCGGTGAAGAGTGATGTCAACAATAATACAAAATTTGTTATCAGTGGTGATGAAGCAAGAAATGATGGTAGAGAAAGGGTGACCGAGGTCAGAGATTGTGGTGTTAGGACTCATCTAAATGAAAGTGTTAATGGGCATTCAGATTCTTCAAAATTAGTTCAGGATCCAATGCTGCAGACAGGAGTTAGTAAGTGTGAAAATTTACAATCTCATGGGGATGTTGCAGAACCTGTAAATACTGATAGTTATATAGCCAAAGAGCAGAAGTTGGGACCTCATGTTGCTGATAGTCAGATTGATAATAAGTCCAAGGGCCAAAGAAATTTGTCAGCTGAAGATTCAGGCTTTATGAACCCTAGATTTTTTGAGTTCTTATTTTTCTTACTTTCTGGTTCTATTAAAAGATTCAAGTCTTACATGGGTCTCAAAGTTGAAGATAGTGTTTCTGAGCAAGTTGGTATGGCTGATTTTTTTTATTCTGAAGACACTAAGTTGTTTCCAGTTACACTTGATTCTGTTCATATCAGAGATGCTACAGTGATGCTACTTGCATACGGTGACAGGGAAGCTAGGGAGATAGAAAATGTCAATGGGCATGTGAAGTTCCAAAACTGTTATAGCCGCGTGCATGTTCAACTCGATGGTAATTGTAAGACATGGAGATCAGATATTATGTCTGAAGATGGTGGCTGGTTGTCTGCTGATGTCTTTGTGGATACTACTGAACAGAAATGGCATGCTAATGTAAAAATTGATAATCTGTTTGTCTCGATGTTTGAAAGGATTCTAGAAATTCCAATCACATGGTCTAAGGGGAGAGCCAGTGGTGAGGTTCACCTGTGCTTGTCGAATGGTGAAACATTTCCAAATCTTCATGGACAACTTGATTTGACGGGGGTGGATTTCCAATTATTGGATGCTCCATCATGGTTTTCTAACATTTCTGCAAGTTTACATTTTCGTGGTCAAAGAATATTTTTACACAATGCTAGTGGATGGTTTGGAAGCATTCCTCTTGAAGCATCAGGAGATTTTGGCATCCATCCTGAGGAAGGAGAAATTCATCTTATGTGTCAGGTTCCTGTTGTTGAACTAAATGCCTTGATGAGAACTTTTAACATGAGACCTCTCTTATTCCCGCTGGCGGGTTCAGTAACTGCTGTTTTCAATTGTCAAGGCCCACTGTGTGCTCCTGTATTTGTGGGTAGTGGAATGGTTTCCAGGACCTTCTCTCATATAAATACCGATACTCCTGCATCTGAAGCACTTGCTAACAGTAAAGAAGCTGGTGCATTAGCAGCTTTTGATCGTATTCCATTTTCAAATGTATCTGCCAATTTTACTTTTGCCACTGATAATTGTGTTGCTGATTTATATGGAATAAGGGCAATCCTTTCAGATGGTGGTGAAATTCGTGGGGCAGGAAATGTTTGGGTGTGCCCAGAGGGTGAGGGGGATGAAGCAGCAATAGATGTGAATTTCTCTGGAAGCTTGGCATTTGATAAAATTATACTTCGTTATATACCTAGCTATCATCGTTTGATGCCACTCAAATTGGGTACTATAAATGGAGAAACAAGATTGTCAGGATCTCTTTTAAGACCAAGGTTCGATATAAAATGGACTGCACCTAAAGCAGAAGGGTCGTTCAACAATGCCAGAGGAGATATCTTTATATCACATGATTCTGTAACTGTTGATTCCTCTTCAGCTGCATTTGATTTGTTTATGAGAGTCCAAACATTGGATGTTGATGATTTTTCTCCTGAGAGAAGTGAATTTTATGCAGCTAGAACCGTTCCATTTAACATTGATGGAGTTGACGTGGATTTGCGTATGCGTGATTTTGAAATATTCAGTTTGGGGTCTACTCTTTCATTTGATTCTCTAAGGCCATTGCATTTGAAAACAACTGGAAAGATTAAGTTTCAGGGAAGGGTTTCAAAACCTGGTACTAGTACCGCTGAACAAACTTCTGTGAAGAAAGGTCAGCAAGTGTCAGTAATGGAGGAAAGAAGTGAAGATAGCCTTGTTGGCGAGATTTTAATATCTGGTTTCAAACTTAATCAATTAATGCTGGCACCTCAGTTATCTGGATTTCTGAGAGTTTCTCCAAAGCATATCAAGTTGGAGGCTTCTGGTAGGCCTGATGAAAGTCTTGCAGTGGAGTTTGTTGGACCATTGCAGGTCAGTCGTGAAGATGGTCTACATATTGGAAAACTGTTGTCCATTTCCCTTCAGAAGGGGCAATTGAAGACTAACATTTGTTTTCGGCCACTTCATTCAGCTAACTTAGAGGTACGCCATTTTCCACTTGATGAGTTGGAGCTTGCTTCTCTTAGGGGAATTATAGAAAAGGCGGAAATTCAGCTGAGTTTTTGGAAAAGAAGAGGACATGGTGTCCTATCTGTACTTAAGCCAAAATTCAGTGGCGTGCTTGGTGAGGCCCTAGATATGGCAGCAAGATGGAGTGGAGATGTTATCACTTTTGAAAAAACTGTTTTGGAACAAAACTACAGCCGTTATGAAGTTCAAGGTGAATATGTGTTGCCTGGAGCTCATAGCCCTGTTGATGGAAAAGGGGGCGCCTTTCCTAAAAAGCCAATGTCGGTGCATCTTAGTAGTGTTATATCCTCAATGGGAAGGTGGAGAATGAAACTTGACATTCCTAGGGCTGAGGTTGCAGAGGTGCTTCCTCTTGCAAGGCTTTTTTCTCGAAGTATGGACCCTGCCCTCCGTTCAGTATCAAAGGATCTATTCATTCAGAGTTTGCAGTCAGTGGGATTATATGCTGAAAACCTTCAAGAACAGCTCGAGATGATTAGAGAGCACCAGGCTCCAATGAGTGATGTTCTTGAAGATTTGAACCTGCCTGGTTTATCTGAATTTAAAGGTCGCTGGCATGCCTCATTTGATGCTAGTGGTGGTGGAAATGGAGATACGCTGGTTGAATTCGACTTTCAAGGTGAGAACTGGGAGTGGGGAGACTACAAATCTCAGCGTCTCTGGGCTTCTGGTGCTTACAGTAATGATGACGGTCTGCACCTTGAGAAAATTTTTATCCAGAAGGATAATGCCACCATCCATGCGGATGGGACTTTGTTCGGGCCTAAAACGAACCTTCATTTTGCTGTCTTAAATTTTCCTTTTAGTCTGGTCCCAACTCTAATTCAGGTCTTTGAAACCGCAACAGTTGATGCAGTTCATTCTTTGCAGCCATTATTGGCACCAATTAAGGGTATATTGCATATGGAAGGAGATCTTCGAGGGACACTAGCAAAACCAGAATGTGATTTGCAAGTAAGGCTCCTGGATGGTGCCGTTGGTGGAATTGATCTTGGACGGGCAGAAGTTCTTGCTTCTTTAACCTCAGCCAGTCGTTTTCTTTTCAATGCAAAATTTGAACCTGTAATCCAGAATGGGCATGTACACATTCAAGGAAGTATCCCTGTTTCTTTTGTACAAAGTAATATATCAAGTGAAGATGTAGGATTTGATAGAACTCTGGTTAATGGGGGTGTACATTTGATGGAGAAGAATAAAGTGATGACCGAATATGCTAGAGACAAAATAGTTTCTAGAGATGGAAATGAAGGTTGGAACACCCAATTAGAAGAAAGCCTTAAAGGTATACACTGGAGAATTTTAGATGTTGAAGAAGTCAAGGTTGATGTCGATATAATTGATGGGGGAATGACGTTATTAACAGCTTTAACTCCCTATGCCAGTTGGCTTTATGGCAATGCTGATATCATGCTTGAGTGCAGAGGTACGGTTGATCAACCGATTCTAAATGGATATGCATCATTCCACAGGGCATTGATATCTTCTCCGGTGCTCAGAAAGCCACTGACCAACTTTGGTGGAACGGTTCACATAAAATCAAACAGTTTATGCATCCCTTCAATGGAGAGTAGGGTAGGCAGAAAAGGAAAACTGCTTGTAAAAGGAAACCTTCCCCTCAGAACTAGTGAAGCAGCCCTTGATGACAAGATTGAGTTAAAGTGTGAAGTTCTGGAAGTACAGGCAAAAAATTTTAGCGGTCAGGTTGACTCTCAGGTGCAAATAACCGGTTCAATATTGCAACCAAATGTATCTGGGAATATCCAAATCAGTCATGGAGTGGCAAATTTGCCTCATGATAGGAGTGCTTCTAGTGGATTCCCGTCAAATCAGTCTATGCTTCCTACCAGTGGAGTAAGCAGAGTTGTTCCTTCAAGATATGTTTCACAGTATTTCAACTCAGAACGTGCTCCCTCAAGGAACAAGTTTTCCCAATCCTCTGTCAAGTTAACTCAAGTTGAAAGGAACGTGGAGCAATTGCAAATTGAACCGAACATGGATATACGCCTTAGTGACTTGAAACTCACGCTTGGACCCGAGTTGAAGATAATATATCCTTTGATTCTTGATTTCGCTGTAAGTGGAGACCTTGAGTTGAATGGCCTGGCCCATCCAAAATGTATAAAACCTAAAGGCGTCCTGGCATTAGAAAATGGTGAAGTTGGTCTAGGTGCTCCCCAGGTGAGGTTAAAGAGAGAGCATATAAATATTGCTAAATTTGAGCCTGAATATGGACTGGATCCAATGCTAGATTTAGCATTGGTTGGGTCTGAATGGCAATTCAGAATTCATGGTCGAGCGAGCAATTGGCAGGAAAACCTTGTGGTGACCTCAGCTCGCTCTGGGGAACAGGATGCACTCTCGCCTATTGAGGCTGTGAGGAGGCTTGAGAGTCATTTGGCAGAGTCCATTTTGGAAGACAATGGTCGGCTTGCAATCAACAAGCTTGCAACTGAAACTCTCAAAAAATTAATGCCAAGAATAGAAGGGAAGGGAGAGTATGGGCAAGCAAGGTGGAGAATAGTGTATGCGCCTCAGATCCCTAGTTTGATGTCTGTTGATCCTACAGTAGATCCTCTCAAGTTACTTGCCAATACTATATCATTTGGTACAGAAGTTGAGGTCCAGCTAGGGAAACGTCTTCAGGCCACGATTGTTAGGCAAATGAAAGAGTCGGAGATGGCAGTGCAGGGGACTTTGAGCTATCAGCTTACAAATCGCTTGAGATTGCTGCTACAATCTGCTCCATCCAAGCGCCTTCTATTTGAGTATTCTGCTATATTACAGGATTAA	6411	0.4171	MNVKTHSSFLGSSLSGSFELIGSNRELFNFNKILLPKRDIRRCIISAKESQPVNQVFRFSHFCGGNVESLRRDLVSKNQSRLKCYKKPFPLGKALESYLTPLWNEGLLLIRASVYIGIISGICLLAWYGQSKSKGFIEAKLLPSVCSAISEQIQRKLEFGKVRRISPFSITLESCSLGPHKEEFSCGEAPTVKLRLHPFASLRRGELVIDAVLSRPSVLVVQQKDYSWIGIPSSEGDTRRHFSTEEGIDHRTKIRRLAREKASAQWAKERDEAARKAAEMGYIVSERTSTLSEGDALEDIAAQSAESIKSESFYCLNEGKRDRHCMDSGIDYDVRHADLEKSFGVKFPGSGLQIWSRETERCRKPKFKSKINGSGSAASVVAIKVKILECSSLAARTYFRGQLHEEFGEALSPPGNFDFVNQDTSSVKSDVNNNTKFVISGDEARNDGRERVTEVRDCGVRTHLNESVNGHSDSSKLVQDPMLQTGVSKCENLQSHGDVAEPVNTDSYIAKEQKLGPHVADSQIDNKSKGQRNLSAEDSGFMNPRFFEFLFFLLSGSIKRFKSYMGLKVEDSVSEQVGMADFFYSEDTKLFPVTLDSVHIRDATVMLLAYGDREAREIENVNGHVKFQNCYSRVHVQLDGNCKTWRSDIMSEDGGWLSADVFVDTTEQKWHANVKIDNLFVSMFERILEIPITWSKGRASGEVHLCLSNGETFPNLHGQLDLTGVDFQLLDAPSWFSNISASLHFRGQRIFLHNASGWFGSIPLEASGDFGIHPEEGEIHLMCQVPVVELNALMRTFNMRPLLFPLAGSVTAVFNCQGPLCAPVFVGSGMVSRTFSHINTDTPASEALANSKEAGALAAFDRIPFSNVSANFTFATDNCVADLYGIRAILSDGGEIRGAGNVWVCPEGEGDEAAIDVNFSGSLAFDKIILRYIPSYHRLMPLKLGTINGETRLSGSLLRPRFDIKWTAPKAEGSFNNARGDIFISHDSVTVDSSSAAFDLFMRVQTLDVDDFSPERSEFYAARTVPFNIDGVDVDLRMRDFEIFSLGSTLSFDSLRPLHLKTTGKIKFQGRVSKPGTSTAEQTSVKKGQQVSVMEERSEDSLVGEILISGFKLNQLMLAPQLSGFLRVSPKHIKLEASGRPDESLAVEFVGPLQVSREDGLHIGKLLSISLQKGQLKTNICFRPLHSANLEVRHFPLDELELASLRGIIEKAEIQLSFWKRRGHGVLSVLKPKFSGVLGEALDMAARWSGDVITFEKTVLEQNYSRYEVQGEYVLPGAHSPVDGKGGAFPKKPMSVHLSSVISSMGRWRMKLDIPRAEVAEVLPLARLFSRSMDPALRSVSKDLFIQSLQSVGLYAENLQEQLEMIREHQAPMSDVLEDLNLPGLSEFKGRWHASFDASGGGNGDTLVEFDFQGENWEWGDYKSQRLWASGAYSNDDGLHLEKIFIQKDNATIHADGTLFGPKTNLHFAVLNFPFSLVPTLIQVFETATVDAVHSLQPLLAPIKGILHMEGDLRGTLAKPECDLQVRLLDGAVGGIDLGRAEVLASLTSASRFLFNAKFEPVIQNGHVHIQGSIPVSFVQSNISSEDVGFDRTLVNGGVHLMEKNKVMTEYARDKIVSRDGNEGWNTQLEESLKGIHWRILDVEEVKVDVDIIDGGMTLLTALTPYASWLYGNADIMLECRGTVDQPILNGYASFHRALISSPVLRKPLTNFGGTVHIKSNSLCIPSMESRVGRKGKLLVKGNLPLRTSEAALDDKIELKCEVLEVQAKNFSGQVDSQVQITGSILQPNVSGNIQISHGVANLPHDRSASSGFPSNQSMLPTSGVSRVVPSRYVSQYFNSERAPSRNKFSQSSVKLTQVERNVEQLQIEPNMDIRLSDLKLTLGPELKIIYPLILDFAVSGDLELNGLAHPKCIKPKGVLALENGEVGLGAPQVRLKREHINIAKFEPEYGLDPMLDLALVGSEWQFRIHGRASNWQENLVVTSARSGEQDALSPIEAVRRLESHLAESILEDNGRLAINKLATETLKKLMPRIEGKGEYGQARWRIVYAPQIPSLMSVDPTVDPLKLLANTISFGTEVEVQLGKRLQATIVRQMKESEMAVQGTLSYQLTNRLRLLLQSAPSKRLLFEYSAILQD	2136

Annotation information

Select	Seq ID	Length	Analysis	Description	Start	End	IPR	GO
	Mibi08g2002	2136	MobiDBLite	consensus disorder prediction	1072	1091	-	-
	Mibi08g2002	2136	Pfam	TamB, inner membrane protein subunit of TAM complex	1730	2119	IPR007452	GO:0005886\|GO:0009306
	Mibi08g2002	2136	MobiDBLite	consensus disorder prediction	1071	1091	-	-
	Mibi08g2002	2136	PANTHER	EMBRYO DEFECTIVE 2410	86	2135	-	-

Duplication type information

Select	Gene	Chromosome	Start	End	Duplicated_type
	Mibi08g2002	Mibi-ChrMibi08	37264878	37282503	Wgd

Event-related genes

Select	Gene_1	Chr_1	Start_1	End_1	Gene_2	Chr_2	Start_2	End_2	Event_name
	Mibi08g2002	08	37264878	37282503	Mibi05g0673	05	6367579	6383860	CCT