Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Mepo3g02168 ATGAGTTTTTTCAATTTGATTCTCACTCTTGTTGCGCTTCTTCTCTCTGCAAATGGTGAATCCAGTAGTAAAGGTGAAACCTTTATTGTTTCCAGCTTCAGCTACCCTCATACTAGACTCAGACCCTTTGATTTGCGCTATATAAGAGTTGACTTGCCGCCATGGTTTTCTGCAATGTCTATAACACTGAACTCAGACGTAGACCTTGATGTGTCTAAAATTGAAAAGGTTCCAATGAGCACACTGCCAATAATATGCTTTAGAGATGGAGGTCCTCCACTGCCAGATCCCTTAAACATAACTTTGAATGATTCAGCTGTCTCAGGGATAAATGGTTTAGATGTGGAGCAGTGCTTTCCTATGCAGAAAAACATCACTGTGAAACTAACAAACGATCAGATATCTCCAGGTGTTTGGTTCATTGGTCTTTTCAATGGCATTGGACCTACAAGGACACAGTCGAAGATGATTGTCCGAGGTCCAGCGTACTCCTTTGGTGCCAATATAACCGTGGAAGCATGCACAAATTCAATGATGACAGGAAATTTCTGTAACAGTCCAGTTTATCCGTTCTCATGCACAACATCTGATGTCAATAATGCTTTGAAGGCTACAGAAAACAACACAATGTTGGAAAATTTGATGACCTGCAAAAGTAATTTGAAAACTTTCTGTGCTCACGAAGGTGTACCAAACATCTTCTCCTTGGATATAATAAATGTGGCAGAAGAATTTACAGTTATGGCAAGTGATGTCAAATTCAGTGGTACAACTTCAAACAAAACAACTGGTGCAAATGATGTTGGTTTAATGTGTTTTGTTCGCCATGGTGCAATGCCTTCAGTGACTGTGTATGATTACTCCAGTGATTTAAATAAAGCACCGCTGGTTATTCATTCACCATTAATTGGTCGTTGGTACATTACTATCGTACCGATCAATCTTGTCAACACCCAGGATACTAATGTTACGGCTTGCTATTCGGTGGAATCCCACATGCTTCAATGCTCGCTTGGGAAGGCTGGACCAAATTGTACAATGGATACCTACACGCTTCAGACATTTGTACGGAGAGGACCAACTCCCTTTGAATCATATTATTTACCGGTTGGTTCTGGAGCATCGTACACTTCTGCCAATTTCCCCATTGAAACGCTTTTGAGTAACTCATCATACAATGGAGAACCTGGTAACATTTGGACTTACTTACTTTTGGACATTCCTCGTGGTGCAGCTGGAGGAAATATTCATGTGCAACTATCCTCAGATGTGAAGATCAATTATGAAGTTTATGCTAGATTTGGTGGATTGCCGTCTCTTATTAGCTGGGACTATTATTATGCTAACAAGACAAGGAGAAGCGATACATCTATGTTTTTCATGCTATATGATTCAAGTGATGGCAAGATCAATTTCTATATTATGTATGCTAGAGAAGGAACTTGGGGTTTTGGTCTTAGACATCTTAATACCAGCAGAAGTGATCCTTCTAAAGGGACAACTGTCATGGCTCTTTCACTTGAACGATGCCCAAAACATTGCTCCTCTCACGGGGACTGTAAATTTTCTTTTGATGCAAGTGGCTTAACATCATACAGCTTTTGCTCTTGTGATCGAAACCATGGAGGCATTGACTGTAGCGTTGAAATTGTAACACATCAAGGGCATGTACGACAATCATTTTTTCTCATTGTATCCAATGTTGCGGCCATACTTCCTGCCTATTGGGCCCTTCGGCAGAAGGCATTAGCAGAATGGGTTTTGTTCACATCCAGTGGAATTGCGAGTGGACTATATCATGCTTGTGACGTAGGTGCCTGGTGTGCATTGAACTATAATGTCTTACAGTTCATGGACTTCTGGCTCTCTTTCATGGCTATAATTAGCACTTTTCTTTATCTAGCTACTATTGATGAAGTATTGAAGAGGGCAATCCACACAGCTGTTGCTATCCTTACTGCCCTAATGGCTGTAACAAACGCAACCAGGTCTTCCAATGTTGTTCTTGTGATAGTGATTGGTGCGCTTGGTCTCCTTATTGGATGGGTTATAGAGATGTCAACAAAGTATAGGTCCCTTTCCTTTTCAGTTAGATTCTCACTTGATTTCTCTCACTGTTTACAAGTGATAAAGCGATGGCTCTGTAATCTTGTTGGGTCACTTCTAAGACGGTACCACTGGCCTTTTGCCTTAGCTGGTTTTTCTGCACTGTCAATGGCAATAGTAAGCTGGACACTTGAAACCAGTGAAACTTACTGGTTTTGGCATAGCTTTTGGCATATTTCAATATACACATCTTCTTTCTTCTTCCTTTGCTCGAAAGTAAATATTGTGGATGGTGAGAATCAGCTACCTGCAAATGGAAACTATGAACTGACCCATCAGGATTCAGCTCCAAGAAGTGGTTAG 2409 0.4085 MSFFNLILTLVALLLSANGESSSKGETFIVSSFSYPHTRLRPFDLRYIRVDLPPWFSAMSITLNSDVDLDVSKIEKVPMSTLPIICFRDGGPPLPDPLNITLNDSAVSGINGLDVEQCFPMQKNITVKLTNDQISPGVWFIGLFNGIGPTRTQSKMIVRGPAYSFGANITVEACTNSMMTGNFCNSPVYPFSCTTSDVNNALKATENNTMLENLMTCKSNLKTFCAHEGVPNIFSLDIINVAEEFTVMASDVKFSGTTSNKTTGANDVGLMCFVRHGAMPSVTVYDYSSDLNKAPLVIHSPLIGRWYITIVPINLVNTQDTNVTACYSVESHMLQCSLGKAGPNCTMDTYTLQTFVRRGPTPFESYYLPVGSGASYTSANFPIETLLSNSSYNGEPGNIWTYLLLDIPRGAAGGNIHVQLSSDVKINYEVYARFGGLPSLISWDYYYANKTRRSDTSMFFMLYDSSDGKINFYIMYAREGTWGFGLRHLNTSRSDPSKGTTVMALSLERCPKHCSSHGDCKFSFDASGLTSYSFCSCDRNHGGIDCSVEIVTHQGHVRQSFFLIVSNVAAILPAYWALRQKALAEWVLFTSSGIASGLYHACDVGAWCALNYNVLQFMDFWLSFMAIISTFLYLATIDEVLKRAIHTAVAILTALMAVTNATRSSNVVLVIVIGALGLLIGWVIEMSTKYRSLSFSVRFSLDFSHCLQVIKRWLCNLVGSLLRRYHWPFALAGFSALSMAIVSWTLETSETYWFWHSFWHISIYTSSFFFLCSKVNIVDGENQLPANGNYELTHQDSAPRSG 802
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Mepo3g02168 802 Pfam Protein of unknown function (DUF3522) 556 761 IPR021910 GO:0016020
Mepo3g02168 802 PANTHER FIVE-SPAN TRANSMEMBRANE PROTEIN M83 8 800 IPR021910 GO:0016020
Mepo3g02168 802 ProSitePatterns EGF-like domain signature 1. 535 546 IPR000742 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Mepo3g02168 Mepo-Chr3 31218483 31226366 Wgd
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Mepo3g02168 - - gmx:100778959 1306.2
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Mepo3g02168 3 31218483 31226366 Mepo3g02168 3 31218483 31226366 ECH
Mepo3g02168 3 31218483 31226366 Mepo1g03782 1 44021910 44029368 PCT