Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Mal5g4077 ATGGCGCCAAGCTTAACCACCTTAAAAGAAACAAATCTCTTCCATACCAATTCCCTCCCTTCCATTAAACTCGAAAACTCAACATTCCTCGCCAATAACAACCCAATTCTCACTCAAGTCCCACCTAACATAACCGTCACTCCACCCCCTCATAACGATGCCGGTTGCTTCCTCGGCTTCAACGCCGACGAACCATGCAGCCGACACGTTGTTTCCATCGGCCACCTCGCCGGAATCAGATTCACAAGCATATTCAGATTCAAACTATGGTGGAGCACTCACTGGACAGGTACCAATGGCAACGACATAGAAAACGAAACGCAAATGATTATACTCGAAAACGACACCGTTAAGGAACGTCCTTACGTTCTTCTTTTACCACTCATCGAAGGTTCTTTCAGAGCTTCACTTCAATCAGGACAAAACAAAAACAATCACGTTGATATTTGCATGGAAAGTGGATCCTCACGTGTTATAGAATCAACCTTCAAAACATGTTTATACATTCATGCCAACTTGGATCCTTATATTTTAATGAACGAAGCTATTAAGGTAGTTAGAGACCACCTCGGAACATTCAAGCTTCTAGAAGAAAAAACAATACCTGATATTGTTGATAGATTTGGATGGTGTACATGGGATGCATATTACCTTAAAGTGCACCCTCAAGGAGTAAAAGAAGGTGTTAAGGGTTTAGTAGAAGGTGGGTGTCCTCCAGGTTTTGTAATCATCGATGATGGTTGGCAAAACTTTTGTCGTGATGATGAAGATTTTTTGAACGGTGGTGATTGTTTGAGCTTGAATTGTTCTATACCTGGTGAACAAATGTTGGGAAGATTGATAAGTTTTGAAGAAAATAAAAAATTTAAGGACTATGATGAATCTTTAGGTATGGGTGGGTTTGTGAGGGATTTAAAGGAGGAATTTAGGGGGTTATTAAAGGAGGTTTATGTGTGGCATGCTTTTTGTGGGTATTGGGGTGGGATTAGGCCTAATGTTGAAGGGATGCCGGAATCGGTGGTGGTTCCGGCGAAGTTGTCACCGGGTGCTGAGAGGTGTATGACGGATTTGGCGGTGGTGAAGATAATGGAGATTGGAGTTGGATTGGTGAAACCAGAAGAGGCGTATCAGTTGTATGAAGGACTTCATTCTCATTTGAAATCTGTTGGAATTGATGGTGTCAAAATTGATGTCACACACGTTCTAGAGATGTTATCAGAGGAATATGGTGGTCGAGTTGAACTTGCGAGAGCATATTACAAGGCACTAACTGATTCTGTGAAGAAACATTTCAAAGGCAATGGTGTTATTTCTAGTATGCAACAGTGCAACGATTTCATGTTCCTTGGTACTGAAACCATATCACTTGGACGAGTTGGTGATGATTTTTGGTGCACGGACCCAGCCGGAGATCCAAACGGTACATATTGGTTGCAAGGATGTCACATGGTGCATTGTGCCTATAACAGCTTATGGATGGGAAATTTTATACATCCAGATTGGGACATGTTCCAATCTCATCATGCTTGTTCTGAATTTCATGCTGCTTCTCGTGCCATCTCTGGTGGACCAATTTATGTAAGCGACTCAATTGGAAACCACAACTTCAAGTTACTCAAGAAGCTGGTTTTGCCCGATGGATCGATTTTGCGATGTCAACATTATGCACTTCCAACTCGAGACTCTTTATTTGTAGACCCTTTACATGATGGCAAAACAATGCTCAAAATTTGGAACCTCAACAAATATAGTGGAGTTTTGGGCCTATTCAATTGCCAAGGAGGAGGGTGGTGTCCTTTAACTAGGAGAAACAAAAGTGCCTCAGAGTTTTCTCACTCTGTAACTTGCTTTGCAAGTCCTAAAGACATTGAATGGAACAAAGGGAAACATCCAATTTGCATCAAAGGGGTTGATTTATTTGCTGTCTACATGTTTAAGGATGATAAATTGAAGCTACTAAAGTGCACAGAAAGTATAGAAGTTTCACTTGAGCCTTTTAGTTTTGAGCTAATGACAGTTTCTCCTGTGATGGTCATACCAAAAAATTCAATTCAATTTGCTCCAATTGGATTGGTTAACATGCTCAACTCCGGAGGTTCAATTATGTCATTGGAGTTTGATGAAGAGAAAAATTTGGTGAGAATTGGGGTGAGAGGTCATGGAGAAATGAGGGTCTTCGCGTCCGAGAAGCCGGTAAGTTGTATGATTGATGGAGAAGCTGTGAAATTTGATTATGATGATAGCATGGTAATGCTCCATGTCCCTTGGCCTTGTTCTTCAAGATTGTCAATGGTTGAGTATTTATTCTGA 2310 0.4117 MAPSLTTLKETNLFHTNSLPSIKLENSTFLANNNPILTQVPPNITVTPPPHNDAGCFLGFNADEPCSRHVVSIGHLAGIRFTSIFRFKLWWSTHWTGTNGNDIENETQMIILENDTVKERPYVLLLPLIEGSFRASLQSGQNKNNHVDICMESGSSRVIESTFKTCLYIHANLDPYILMNEAIKVVRDHLGTFKLLEEKTIPDIVDRFGWCTWDAYYLKVHPQGVKEGVKGLVEGGCPPGFVIIDDGWQNFCRDDEDFLNGGDCLSLNCSIPGEQMLGRLISFEENKKFKDYDESLGMGGFVRDLKEEFRGLLKEVYVWHAFCGYWGGIRPNVEGMPESVVVPAKLSPGAERCMTDLAVVKIMEIGVGLVKPEEAYQLYEGLHSHLKSVGIDGVKIDVTHVLEMLSEEYGGRVELARAYYKALTDSVKKHFKGNGVISSMQQCNDFMFLGTETISLGRVGDDFWCTDPAGDPNGTYWLQGCHMVHCAYNSLWMGNFIHPDWDMFQSHHACSEFHAASRAISGGPIYVSDSIGNHNFKLLKKLVLPDGSILRCQHYALPTRDSLFVDPLHDGKTMLKIWNLNKYSGVLGLFNCQGGGWCPLTRRNKSASEFSHSVTCFASPKDIEWNKGKHPICIKGVDLFAVYMFKDDKLKLLKCTESIEVSLEPFSFELMTVSPVMVIPKNSIQFAPIGLVNMLNSGGSIMSLEFDEEKNLVRIGVRGHGEMRVFASEKPVSCMIDGEAVKFDYDDSMVMLHVPWPCSSRLSMVEYLF* 770
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Mal5g4077 769 Gene3D Aldolase class I 207 542 IPR013785 -
Mal5g4077 769 Pfam Raffinose synthase or seed imbibition protein Sip1 23 753 IPR008811 -
Mal5g4077 769 PANTHER - 1 769 IPR008811 -
Mal5g4077 769 PANTHER GALACTINOL--SUCROSE GALACTOSYLTRANSFERASE-RELATED 1 769 - -
Mal5g4077 769 SUPERFAMILY (Trans)glycosidases 205 552 IPR017853 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Mal5g4077 Mal-Chr5 111096974 111100489 Wgd
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Mal5g4077 1 769 Glycoside Hydrolase AT5G40390 59.848 0.0 981
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Mal5g4077 K06617 - gmx:100798883 1278.08
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Mal5g4077 5 111096974 111100489 Mal2g2411 2 30253350 30257997 ECH
Mal5g4077 5 111096974 111100489 Mal5g4077 5 111096974 111100489 ECH