Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lja4g3035 ATGGGCATGGTGCCGATTGGTGACAAGGAAGAGTATCCTACTCCGATGGAGAATCCTCAACTCTCTGATTTGCAGTTGGTGTATCATGTCAGAGACGCACTTGTTGCTGTCACCTTGGGTGAAAGAGAGAATTACGATGACCTTGTTGGTTGCTTGTTTCGTCCTTTGAATTGGACACTCAAGAAAAAGCATCTCAACGAGGATGAGATTGCTCTGGTTGTGACAACTTTAAATGCGCTTGCAGGAGCGGTGTCCTACATTGATTTTTCCCATCACAACGCGCTTCTTTCTGCGGTTTCAAGTATGAGTTTGTGGGATTATGGAACCAATGTTATGGATGCACTCACTGAACTCATTGTGTCCTTGGCTTCTACCAATGTAAAATACATGGATTTGTGTCTGGAGATGCTGGTTGAAAATTTCATCCCACCAAACATGAAATATTTTCTGAGCCTGAGGAATGGACTTGACAGGAAAAATAAAGTTCTAGCTCGGGTCCATACTGCTTTGGAACAAATAGCTGAGTTGGTGCCCCTTGCACCGTTGCGTCTGTCTAAAATAGTTCTCCAGAAAATGCCCAATGTCTTCAGTGGGGAACATATGATTGTCATGTATGTGGAGAATATGTTAAGGCTGGAGAGTGGTTCAATTGGAGAAACCTTTGGTGGTGCAATGCTGCCCGCGCTTGTGGACAGGTTGATACAGTTGGATGTGGAAATTGGATGGGACGGCATTATGCAGGAAGATGCCAAAGGCATATTTGAAATGGAGTTGGAAAATGCTGCTGAATTTGCAGATGAGAATGAGAAATGTGATGATATGTCTTCTGCAGAGTTATTAAAGAGGAAAAATTTACAAGGCAATTTGGTTGTTGAGAAATTAGATAGCCTAATGGAACTGACTTTTTTGCATCTTGAAACCTGTCAAAACAATGGCCGTTTGGCTCAGGTATTCAATATTCTACTGACATCATTTAAGAGAACTGTACTGAATGCATACAAGTCAAAATTTACCCAGTTTGTGATGTTCTATGCATGTGCACTGGATCCTGAAGGATGTGGCGTGAAATTTGCCATGTTTCTTGCGGAGATGTTTGGTTCTGATGTTAATCCCCCTATTAATAGGATGAGTGCTGTTGCTTATCTTGCAAGTTATTTGTCTCGTGCGAAGTTTCTATCTGCTGCTCTGGTTGCTAGCATCTTACAAAGATTGGTAGATTGGTGTTTTAACTATTGCAAGTTGCATGATTTCGATATGAACCCACAAGCACATCAAGTTTTTTATTCTGGATGCCAGGCCATCATGTATGTTCTTTGCTTTCGCATGAGATCATTGGTGGATATTCCAAGGCTTAAGTTGCAACTTCACAATATGCCCATGGAGCCAATCTGGAAACATAAATTGAGTCCCTTGAAGGTGTGTTTGCCTACGGTAGTAGAGGAATTTCTCAGACAGGCGAAGGCTGCTCAACTTTTCATGTCCTCCTCAGAGACATTTGTTTTCAATGATTTGCTTGAGTCTGATGATCTTTCCAGGTCTTTTGGTGGGATGGATAGACTTGATATGTTCTTCCCATTTGATCCATGTCTATTGAAAAAGAGTGAAAGCTACATAAGGCCACATTTTGTCCGGTGGTCAAGAGTGAAAACTACATATGATAGTGATGACGATGAAGATGGCAGTGAAATGTCAGATGATGATTTTGTTGACAGGAATGCAGAGGAATTGGATATGATGGTGAGCGTTGAAGGTCTTGATTTTGATGCTGACTTGAACAAAATGTCTATTACACCCAACAACAACTCTTTGAAACAGCATATGCGAATGCCCGCAAGAATCAGACCCTCCACTAGTCCAGAGTCTTTGTAG 1869 0.4168 MGMVPIGDKEEYPTPMENPQLSDLQLVYHVRDALVAVTLGERENYDDLVGCLFRPLNWTLKKKHLNEDEIALVVTTLNALAGAVSYIDFSHHNALLSAVSSMSLWDYGTNVMDALTELIVSLASTNVKYMDLCLEMLVENFIPPNMKYFLSLRNGLDRKNKVLARVHTALEQIAELVPLAPLRLSKIVLQKMPNVFSGEHMIVMYVENMLRLESGSIGETFGGAMLPALVDRLIQLDVEIGWDGIMQEDAKGIFEMELENAAEFADENEKCDDMSSAELLKRKNLQGNLVVEKLDSLMELTFLHLETCQNNGRLAQVFNILLTSFKRTVLNAYKSKFTQFVMFYACALDPEGCGVKFAMFLAEMFGSDVNPPINRMSAVAYLASYLSRAKFLSAALVASILQRLVDWCFNYCKLHDFDMNPQAHQVFYSGCQAIMYVLCFRMRSLVDIPRLKLQLHNMPMEPIWKHKLSPLKVCLPTVVEEFLRQAKAAQLFMSSSETFVFNDLLESDDLSRSFGGMDRLDMFFPFDPCLLKKSESYIRPHFVRWSRVKTTYDSDDDEDGSEMSDDDFVDRNAEELDMMVSVEGLDFDADLNKMSITPNNNSLKQHMRMPARIRPSTSPESL* 623
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lja4g3035 622 Pfam RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3 22 549 IPR007991 GO:0001181|GO:0006361
Lja4g3035 622 PANTHER TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR IA RRN3 20 613 IPR007991 GO:0001181|GO:0006361
Lja4g3035 622 MobiDBLite consensus disorder prediction 598 622 - -
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Lja4g3035 K15216 - gmx:100812298 903.279
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Lja4g3035 4 57173533 57181676 Lja4g3035 4 57173533 57181676 ECH