Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lja3g0286 ATGGCTGATACCACCACCGTCGACGCCTCTCTATGGTGGGACTCATTCACTCTCCTCCTCACTGACCTCGAGAATTCCTCTCTCTCATCAGATCTTCCACCAATTTTGGAGAAGAAGTTGAACGACAACCACGCTTGGTTCGTGGACACACTCTCACGCTTCAAGCCGCCCAGTCAGAAATCCAAGGAAGCGTTGAATTCCAAGAACCTCCAAATTGGATCTCACCACCTCACTATTCAACCTCACCTCAGAGATAAAGCTTTGCAGACTAGCTCCTGCTTGCTACTAGATGAGGTACAATCATACATACTTGTTGAAAGGAACGCCGCCAATCTTAACAATGCAGCTGCTGATTCCATGGCTCCAGAGTTTCCTAACATGATGTTGATCCAATACTACAAAGAGCGGCAGTGTTTGCTGAAATGCATCAGGTGGATTTTCATGCATGCCATCTACATCGACCCTGTGTCTGAAAAAAGTACTGTGAAGGAGGAGGCAAGAAAGCTTCTTCATGATGGACTAGAAAGTAAATTAGTATCTTTCTTTGAGGGCCTTTTGTCTTGCAGTTACCCAGAGCAAATGGATATTGATCTTTTTACTCTGTGGGCTGAGGAGACTCTAATTGAAGACAACTTGGTTCTAGACATCCTTTTCCTGACATATTATGACTCATTTTGTACATGTAGTGGTGAAATATGGAAGAAATTTGCTGCCCTGTACAAGGGGATCATAGGTGGTGATTATAACTTGGGAAAGCTGGCCATTACTACAGAAGCACAAGAGTTGTCTTATCACATCAAAGTTCAGCTGCTGCTTATTTTAATAGAAACCCTGAACTTGGAGAATCTTCTTCAAATGGTTCATGATGAAATACCTTACAGGAAAGGTGTGTTCACTTTTTCGTTGACTGACATCCAAGAGATGGATGCACTAGTTTCTACTTTTAGTGTTTTTGAAATGAATGAAGCTGGTCCTCTAGTTCTCGCATGGGCAGTATTTCTTTATCTACTCTTGACACTTCCAGAGAAAGATGATAACAATGAGCTCATGGAGATTGATCACATTGGTTATGTTCGTCAAGCTTTTGAGGCTGGATCCTTACGTTATTGTCTTGAAATTCTTCAGTGTGACATTTTGAAGGATCATGATGGACCAGTGTCTGGTTATCGCAGTGTTTTGAGGACATTCATATCTGCATTTATTGCATCCTATGAGATCAACCTTCAGCCAGAGGACATTAACTACACTTTGATACTGGATATCCTTTGCAAGATCTACCGTGGAGAGGAATCACTATGTATTCAGTTTTGGGACAAGGAAAGTTTTATTGATGGTCCTATTCGGTGTCTTCTTTGCAACCTAGAGAGTGAGTTCCCTTTCAGGACAGTAGAACTTGTTAGAATGCTATCAGCCCTCTGCGAAGGAACTTGGCCTGCAGAGTGTGTGTATAACTTTCTAGATAAGTCTGTAGGTATATCATCCTTGTTTGGGATTAGTAGTGATCCGCAGGCAGATGATGCCTGCCATATTGTTGAGGCACAACAGGCAGTGGGAGTTCCTGGTATTGAAGGTTTGGTTATTCCCTCTGGAACTCGTGGGCGTGTCTTGAGAGTTGTTGGACAGAATACTGCCCTTGTACGATGGGAGTATTCACCATCTGGAGTGTTTGTGTTGCTCCTACGTTTGGCCCAAGAGAGGTATTTGAATAACAAGGAGGAAGTTTTTGTCACTCTTGACCTTCTCAGTAGATTGGCGTCTTCTAACACTGGTGTTTGTTTTGGTATGATGAACATTCGTAACTCTCTGCAATTTCATGCTATTGACTTGGTGAATGAGCAGGATAAGAAGAATGTCTGGATTGTCGAGATAATTTGCAATCTAGTCAAAAATCTTCCCTTAAATTCCTATGGTGCTGCACTTATGTCAATGAGCGTTAAGATTTTGTGGATAATGATGACTTGTTGTCCATCTAGTGTATCAGCAGCCACTCTAAATGCAAATCTATTTGATATCACTTTGCAGACAAGTGTTTTCAGTGCAGGCACTAGTAACTTCTCAAGACTGGCTAGGATGCTTTTAATCGACTGTGAGCAGAACAGTAACGACTTCCCCTTGGCAATATCAGTGCTAGACTTCACCATACAGCTTGTAGAAACAGGAATAGAGAATGATGCTCTCTTGGCATTGATCATATTCTCTTTTCAGTATGTCCTGGTCAATCATGAGTATTGGAAGTACAAGGTGAAGCATATTAGATGGAAAATAACATTGAAGGTTCTTGAGTTGGTGAAAAAATGCATTATATCGCGGCCTTATAATGGTAAATTGGGTGAGATCGTGCACAATGTGTTGTTCTGTGACTCTTCCATCCACAACATGCTCTTCCAAACTGCTTGCACTACTGCACATGCTTTGGAGAAATTACACATAAGCCGCTTATTTGATCCACTGGAAATTGAAGGGTTACAGCTTGCTATAGGTTCTGTTTTAGATATTCTTTCAGTCATGCTGACCAACCTTTCGAAGGATACCTTGTCAAGCATTCCTGTTTTTCTCCAGGCAGTGTTCTCTTGCGCAACAAAACCAGTTCCTCTCATCACTTCTGTCATATCCTTGATCTCATATTTTCGAGATCCTGCCATTCAATTTGGTGCTGTCAGGTTTATTTCAACATTATTTGCCATAACGGATTGTGTTCAACCGCTTTCATATGGAACGTCGTTCTTTGCTCCAGATAATCAGGAGATCATATATTTGAGGCACTCTGTGAGCTGCATACTGCTGGAGCAACCAGAGTCGAATGAAGATCTCTTTGTTGCAACTGTTAATCTGTTAACTTCTGCAGCATATTACCAGCCTTCTTTTATTGTTGCTATCATGGCTCTAGAGGAAAACAGTGAAGACCACTCAAATACCAGTGATGCAAGGCTGCAAAAAAATGAAACTTTTGTTGTACCACTAGTTTCTAAGATTTCCAGTCTCGTAGATGCACTTATGCACTATATTGAAAGGGCAGATGATCTGATCAACAGTAAACCCTGCATCCTGCTTTGTATACTTAACTTCATGTTTGCCTTATGGCAAGGGGCTTCTCAGTATGCAAATTTCTTGGAGTTCCTAAGAACCCGTGAAAAGCTTTGGGAACACTTGGCCAATGCAATCTTGAACAGTGCTAGCTGTGAAACTCCTCTACTTGAGAGTCTAAAAGAAAAAGATGCTCTCAATCTGGCTTACACTTTCCGTTGTCAGTCTGCCATACTGGGAATCATGGCATATGAATTATTCTTTCAGAAAAAGTTGTTGCACGCAGAGTCACTTGTGAAGAATACAGCTGAATCTAAGGACAAGGAGCAAAATGCCACAAAAACTCAAAAATCTAAAGCCACAGATGTTCCTGATCTTAAGCGAATCTGGTCTTCATGGTTCAAAGAGGCCTTTTTAGAGAAACTAATAAAGTCATATATGTGTGAATTTAATAGTGATATATATCATGGTGCAAAGGTTGCCACCACTTTATTCTCTGTTCATGTGATGGTAAAATCCGCAGCCAGTGACTCTGGAAGTTTATCTGTGTCATTGCTTCAGAAGATTCATGGAATTCTGACAAAGCTGAGCATTCAACCTGCTTTCTCTGAATTGCTATCTCAGTATTCACAACGTGGTTACAGTGAGGGGAAAGAACTAAAGAAATTGATTCTCAATGATCTCTATTATCATTTACAAGGAGAGCTCGAAGGAAGGAAAATTGGTATTGGACCGTTCAAAGAATTATCTCAGTATCTTCTTGAATCAAATTTTTTGGGAACCTATCAACGCCAGTTCAATGAAGATTTTTTTGCAAAGAACGTGTACTTGTTTGACCTTGTACAGTTGCGAGCAGATTTGAGATTAAATATGTGGGATTGTTCTGATTGGAGAACATCTAAGGAGATAGCAGAAACTATGCTGCGTTTCCTGCAGGATGCAAACTCAGTTATGTTGTTTTCAAGTTCAAAGCTTTCTGCACTAAAAGGACTTACAGCAGTGTTGGCCGTCTATCATGATGATTCACTAGGGATGGCTGCTACAAGAGAGCGGATGCCGGATGAACTCATGGTCACTTGCATAGATATTACATGCCAATCTTTCCTTGCAACCATTGAGACATTATCATCTGTTCTAGATGCCTCTCAGGATATGCTAAATTTTCTTGCATGTCAAGTAGAATTACTCCTCTTGTTGGCAAGAGTCTGGAAAGGCCTATCCTTATCTGTATCCCAACTTGTTTTGAAATGTGCAACTTCAGGTCTTAAAATATTGAGTGAACTTAAATTGGTACCTTCTGAGGCTAATTTGATCATGAAGCAATTACTCACATTGCTGCTTTTGGTACTTCAGTCCAACTCTTTCAGTTCACATTCAGGTGGGGCAACAAATGAGAGTTCTAGTGAGGATTTCTCAACAGTTTCAAATGCAACCCTTGGCCTACTACCCATTCTCTGTAGATGTATTGCGACTTCTGAGCATTGCATGCTGTCCCTATCAGTCATGGACGTTATACTGAGAGTCTTCTTGGTGCCCAGGACTTGGTTACCTGTCCTGCAGAATCATCTTCAGTTGCAGTTTGTTATGCTAAAGCTCCAAGATAAAAAATCTGCAGCTCCGACAATAATGAAATTCTTCTTAACCCTTGCACGGGTTAGAGAAGGTGCTGATATGCTATATTGTTCTGGCTTCTTGTCATCTTTGAGAGTGCTGTTTGCTGAATCTGATGAAGCTTTCCTTAGAATTGGTAGTGAGAATCCTGGCAGCTCATCAGAAAAGTTCGAGACACTTCAAGACATCTGGGGACTTGGATTAGCCGTGGTTACTGCTATGGTTCAATCCTTGGGAGACAGTTCTTCTGGCACTGCTATTGTGGACAGCATGATGCCTTACTTTTTCTCAGAGAAAGCTCATCTTATTTTTGATTCCTTAAATGCCCCAGACTTCCCTTCTGATGATCATGACAAGAAAAGACCTCGGGCACAGAGGTCGTGTATATCTTTTGGTAATCTTAAAGAAACAGAACATACTCTGATGCTCATGTGTGAGCTAGCAAAACATTGGAATTCATGGAATAAGGCAATAAAAAATGTGGATAGACAACTTCGAGAGAAGTGTATCCATCTTTTAGCCTTCTTTAGTAGGGGAACTCAACGCCTTAGTGAATCATCAAGTAGGAATGCCCCTCTTCTGTGTCCACCTACTGTTAAAGGGGATTTTGAAATTGCCTTAAAACCTTCATATATCAATAGCAGAAATGGATGGTTTGCTCTTTCACCACTTGGATGTGTGCCAAAACAGAAGACCCCTCCTTTTTCAACTGCTTTATCTATATACGATGGTCAAGCCGCTGGGTCTACTGATGCTGTTCCAAAAACATGCTTCTCTGACACTGTTGCTGTGCAGGTGTATAGAATTACATATCTTCTTTTACAATTTCTGTGTTTACAAGCTGAGGGTGCTTCTAAAAGGGCTGAGGAGGTAGGGTTTGTTGATCTTGCACATTTTCCTGAACTTCCAATGCCAGAAATCTTGCATGGACTGCAGGATCAAGCTTCTGTCATTGTTGCGGAGCTCTGTCAAGCCAATAAACTGAGGGAATCCCCAGAAACACAGAATGTTTGCAAGTTACTGTTGCAAATACTTGAAATGGCCTTGTACTTGGAACTTTGTGTTCTACAAATTTGTGGCATAAGACCTGTATTAGGACGTGTGGAGGACTTCTCAAAGGGAGCCAGATCTTTATTTAGTGCATTGGAGGGTCATGCTTTTCTAAAAGCATATAGGAAATCTTTAAAGCAGATGATATCATGTATCTATCCTGGACTTTTGCAAGCAGAGGGTTTGATTTAA 5877 0.4104 MADTTTVDASLWWDSFTLLLTDLENSSLSSDLPPILEKKLNDNHAWFVDTLSRFKPPSQKSKEALNSKNLQIGSHHLTIQPHLRDKALQTSSCLLLDEVQSYILVERNAANLNNAAADSMAPEFPNMMLIQYYKERQCLLKCIRWIFMHAIYIDPVSEKSTVKEEARKLLHDGLESKLVSFFEGLLSCSYPEQMDIDLFTLWAEETLIEDNLVLDILFLTYYDSFCTCSGEIWKKFAALYKGIIGGDYNLGKLAITTEAQELSYHIKVQLLLILIETLNLENLLQMVHDEIPYRKGVFTFSLTDIQEMDALVSTFSVFEMNEAGPLVLAWAVFLYLLLTLPEKDDNNELMEIDHIGYVRQAFEAGSLRYCLEILQCDILKDHDGPVSGYRSVLRTFISAFIASYEINLQPEDINYTLILDILCKIYRGEESLCIQFWDKESFIDGPIRCLLCNLESEFPFRTVELVRMLSALCEGTWPAECVYNFLDKSVGISSLFGISSDPQADDACHIVEAQQAVGVPGIEGLVIPSGTRGRVLRVVGQNTALVRWEYSPSGVFVLLLRLAQERYLNNKEEVFVTLDLLSRLASSNTGVCFGMMNIRNSLQFHAIDLVNEQDKKNVWIVEIICNLVKNLPLNSYGAALMSMSVKILWIMMTCCPSSVSAATLNANLFDITLQTSVFSAGTSNFSRLARMLLIDCEQNSNDFPLAISVLDFTIQLVETGIENDALLALIIFSFQYVLVNHEYWKYKVKHIRWKITLKVLELVKKCIISRPYNGKLGEIVHNVLFCDSSIHNMLFQTACTTAHALEKLHISRLFDPLEIEGLQLAIGSVLDILSVMLTNLSKDTLSSIPVFLQAVFSCATKPVPLITSVISLISYFRDPAIQFGAVRFISTLFAITDCVQPLSYGTSFFAPDNQEIIYLRHSVSCILLEQPESNEDLFVATVNLLTSAAYYQPSFIVAIMALEENSEDHSNTSDARLQKNETFVVPLVSKISSLVDALMHYIERADDLINSKPCILLCILNFMFALWQGASQYANFLEFLRTREKLWEHLANAILNSASCETPLLESLKEKDALNLAYTFRCQSAILGIMAYELFFQKKLLHAESLVKNTAESKDKEQNATKTQKSKATDVPDLKRIWSSWFKEAFLEKLIKSYMCEFNSDIYHGAKVATTLFSVHVMVKSAASDSGSLSVSLLQKIHGILTKLSIQPAFSELLSQYSQRGYSEGKELKKLILNDLYYHLQGELEGRKIGIGPFKELSQYLLESNFLGTYQRQFNEDFFAKNVYLFDLVQLRADLRLNMWDCSDWRTSKEIAETMLRFLQDANSVMLFSSSKLSALKGLTAVLAVYHDDSLGMAATRERMPDELMVTCIDITCQSFLATIETLSSVLDASQDMLNFLACQVELLLLLARVWKGLSLSVSQLVLKCATSGLKILSELKLVPSEANLIMKQLLTLLLLVLQSNSFSSHSGGATNESSSEDFSTVSNATLGLLPILCRCIATSEHCMLSLSVMDVILRVFLVPRTWLPVLQNHLQLQFVMLKLQDKKSAAPTIMKFFLTLARVREGADMLYCSGFLSSLRVLFAESDEAFLRIGSENPGSSSEKFETLQDIWGLGLAVVTAMVQSLGDSSSGTAIVDSMMPYFFSEKAHLIFDSLNAPDFPSDDHDKKRPRAQRSCISFGNLKETEHTLMLMCELAKHWNSWNKAIKNVDRQLREKCIHLLAFFSRGTQRLSESSSRNAPLLCPPTVKGDFEIALKPSYINSRNGWFALSPLGCVPKQKTPPFSTALSIYDGQAAGSTDAVPKTCFSDTVAVQVYRITYLLLQFLCLQAEGASKRAEEVGFVDLAHFPELPMPEILHGLQDQASVIVAELCQANKLRESPETQNVCKLLLQILEMALYLELCVLQICGIRPVLGRVEDFSKGARSLFSALEGHAFLKAYRKSLKQMISCIYPGLLQAEGLI* 1959
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lja3g0286 1958 PANTHER NUCLEOPORIN NUP188 HOMOLOG 2 1951 IPR044840 GO:0017056
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lja3g0286 Lja-Chr3 2877942 2919161 Tandem
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Lja3g0286 K14311 - gmx:100796560 3000.69