Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lele16g1753 ATGGAGTCCGATTCATCTCCTTCTCCATTGCAGAGATCTCGTGCTGCCCGTCTTTGGCCATTATTTCTCTTAAACCCTTCAATACCCCTTAATTCTCCATTAAACATCTTATTCGTCCTCTTCTTCCTATGCAACTTTTGCTGTGTAACATCCACATTCTCAGATTCAAATTTTGAGAGTACATATACTCACCTCTGCGACCAAATCGTCCCCATTGCTGCATTGCAGCCTCATACTGGCAGTGTCCCTGGTGTCTCTAAGCTGCTTCGATTTCGATATGGGTACTTCTCTGGCGGCGATCGACTTTTCAATAAAACCTCACATTCCGCCGGTAAGCATACATGGTTTATGGTTCAGTCTGTTCACGAAACGGGGAAAGATGGCGTATATGAAGTGCAAGGGCAGTTGCGTCTCTGGAACCGAGATATGCAGCCAGTACAGAACCATTTCCGCAGGTTGCGAGGACAAGGTTACCGGCTCCCCAGAATAACGCATTGGAGAACAGGTATAGACTTTGTGCTGCATGGATTATGGTCTGAATCTTCTGGGAAGCTTTGTATGATTGGAACCGATTCGCGTGGTAATGGTAAAGGAAGAAATGTTGTTCTTAAGCTTAATTACCCGCTCGTATCGAGCATTTTCAATAGTTTCATTAATGGGACTCTTGAAAGCATTGATGACCAGAGTAACTTGCTTCACTTCGAGCCCATTTCAATAATTGCTTTATCTCAGGATTCAAATTATGAGTATAGTATTGTGGGGAAAGATGATATTGGTTGTTTAGCTGAAGCAGATGTTGAAAGCTTACGGCTCAACAACTTCAGTCAAGGTGCCTGTACTGTATTTAATAAACGCACAGATTTATTCGAACTGAAATATGGGAGTAACTGTCATGGTGATGATTGCAATTCTCTTGGTGCGAATGCCGGATATTTACCTGAGTTTATGTATTTTTATGGCATTCGATGTGCAGAAAAGCAAAAGGTTCAGATGTTATTGGGTTTTCCTGATCCCAGTTATCAAGATACTTTGTTTCCATTTAATCCTAATTCAACACTGATATCTGAGGGAACATGGGATGAGAAAAGGAACCAACTTTGTGCAGTTGCATGTCGAATCTTGAACTTTTCAGAATCATTAACTAATGCTTATGTTGGAAATTGCTCAATTAAGCTTACACTGAGATTCCCTTCAGTTTTGTCTTTAAGAAACAGAAGTGCTATTTTGGGTCAAATTTGGAGCAATAAAGCGGTTGATGAATCTGGACAACTCAGTAAAATCGAATTTCAGAGCTCCTCAAAGGTTCAAAGACTTCCCCTTAGTTTTCAGTATAAATATACTGAAATTGATACAGTAAGAAAATCATGTGCAGAAGACAAGACAGCTAGAGGGAAGGGAAAGGTGTATCCAGATGGAAATTCTTCTGATATGAAATTTAGCATGTCAGTGAGAAACAGCAAAGGACAAGTAGCACAGGGTTACTCATCTCCTCTATTTGTTAGTGATCAGATTTATGACAGTAGATTTTATGGGGGTTCACTTATGTTGACAAGGGACAGCCCAAAAGTACACATTGCTCAATTGGATAACCACAGAAATTTGTTGAATATCAGCTACACGATGAGCTTCAAACCATCAGCTAATTTTAAGTTTGACAGTGAGGGTACTTTGGCCAGAGAAGTTATTATTTTTGCTGAAGGAATATACAATAGCAATACAGGACTTCTGTGTATGGTAGGATGCCGGAATCTGAGATCAACTGACAAGCAAACGATGAAGAATGAATCACTGGATTGTGAACTTTTGATTAATGTCCAGTTTCCTTCCTTGAATTCAAAGGTTAATAAATATATTAAAGGAACTGTAAAAAGCAAAAGAGATAAATCTGATCCATATTATTTTGAGCCCCTTCAGTTGTCCTCATTTTCCATTTACACCAATCAAGTAGAAGCATCCATTTGGAGAATGGATCTCGAAATCATTTTGTTATTAATATCGAACACAATTGCTTGTGTGTTTGTAGGACTTCAACTCCTTCACGTGAAAAAGAATCCAGATGTGCTACCTTACATAAGCATTGTGATGCTTATCCTTCTTACTCTGGGACACATGATTCCACTGCTTTTGAGCTTTGAGGCCTTAATCATGGGAAACCATAGCCAACAGAATGTTTTCCTTGGAAGTGGAGGTTGGCTTGAAGTCAATGAAGTGGTTGTAAGGATGGTAACAATGGTAGCTTTCCTTCTGGAGCTGCGTCTTCTCCAGTTGACTTGGTCTTCAAGAAAGGGTGAGAGAAGCCAGCCAGGTTGCTGGGTTTCTGAGAAAAAGGTCCTTTTTGTGACTCTGCCTCTGTATCTTGCTGGTGGATTGACAGCATGGTTGGTGAACAGATGGAAGAATTCCCAGTTCAGGCCATTCCGACTATCACGTCACCGATCCCGTGGACAACTCTCTTTCAGGCCCCCTTCCCTCTGGGAGGATCTCAAATCTTTGGCCGGTTTGCTCCTGGACGGTTTTCTTCTTCCACAGATACTATTCAACGTATTCTTTAACTCAGAAGGAATGGCTCTTACACCATCTTTTTATGTTGGAACGACCATTGTTCGAATTCTGTCCCATGCTTATGATCTTTACAGAGCTCACAGTTCTGCATGGTACCTTGATTTATCGTATATATATGCAAACCATAGAATGGATTTGTATTCCACAGCTTGGGACATCATAATACCTTGCTGTGGACTTTTGTTTTCTCTCTTGATATACCTTCAACAGAAGTTTGGCGGCCGGTGTATTCTTCCGAGGAGATTCAGAGGAAGTTCTTCATACCAGAAAGTGCCTGTTATCGGTAACGATGATTTGTGA 2862 0.4074 MESDSSPSPLQRSRAARLWPLFLLNPSIPLNSPLNILFVLFFLCNFCCVTSTFSDSNFESTYTHLCDQIVPIAALQPHTGSVPGVSKLLRFRYGYFSGGDRLFNKTSHSAGKHTWFMVQSVHETGKDGVYEVQGQLRLWNRDMQPVQNHFRRLRGQGYRLPRITHWRTGIDFVLHGLWSESSGKLCMIGTDSRGNGKGRNVVLKLNYPLVSSIFNSFINGTLESIDDQSNLLHFEPISIIALSQDSNYEYSIVGKDDIGCLAEADVESLRLNNFSQGACTVFNKRTDLFELKYGSNCHGDDCNSLGANAGYLPEFMYFYGIRCAEKQKVQMLLGFPDPSYQDTLFPFNPNSTLISEGTWDEKRNQLCAVACRILNFSESLTNAYVGNCSIKLTLRFPSVLSLRNRSAILGQIWSNKAVDESGQLSKIEFQSSSKVQRLPLSFQYKYTEIDTVRKSCAEDKTARGKGKVYPDGNSSDMKFSMSVRNSKGQVAQGYSSPLFVSDQIYDSRFYGGSLMLTRDSPKVHIAQLDNHRNLLNISYTMSFKPSANFKFDSEGTLAREVIIFAEGIYNSNTGLLCMVGCRNLRSTDKQTMKNESLDCELLINVQFPSLNSKVNKYIKGTVKSKRDKSDPYYFEPLQLSSFSIYTNQVEASIWRMDLEIILLLISNTIACVFVGLQLLHVKKNPDVLPYISIVMLILLTLGHMIPLLLSFEALIMGNHSQQNVFLGSGGWLEVNEVVVRMVTMVAFLLELRLLQLTWSSRKGERSQPGCWVSEKKVLFVTLPLYLAGGLTAWLVNRWKNSQFRPFRLSRHRSRGQLSFRPPSLWEDLKSLAGLLLDGFLLPQILFNVFFNSEGMALTPSFYVGTTIVRILSHAYDLYRAHSSAWYLDLSYIYANHRMDLYSTAWDIIIPCCGLLFSLLIYLQQKFGGRCILPRRFRGSSSYQKVPVIGNDDL 953
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lele16g1753 953 PANTHER FAMILY PROTEIN, PUTATIVE (DUF2921)-RELATED 36 948 IPR021319 -
Lele16g1753 953 Pfam Protein of unknown function (DUF2921) 66 932 IPR021319 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lele16g1753 Lele-ChrLele16 10258701 10261562 Dispersed/Wgd
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Lele16g1753 16 10258701 10261562 Lele16g1753 16 10258701 10261562 ECH
Lele14g0657 14 17885574 17888444 Lele16g1753 16 10258701 10261562 hybridization