Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lele02g0589 ATGAAAAGTTACTGCACATTTCTTGGGATTGAGCTTCATGGTTCTTTGGAAGGTAGCAGCAGCTGTAGGAACCTCTTTCATCTGGAGACGAGGGAGTTGCCAAAAAGGGATCGTCGTAGATGTGCTATATCTGCTAAACAAAGTAGTCCAATCAACCAAGAATTTAGGTTTTCGTATTTTTCTGGAGGAAATGTGGAGTTTTTGAGGGGATCCCGTATTTTAAGAAATGGTTCGAGATTAAAATGCATCAAGGAACCTTTTTCTCGAAGCGAGGACCTGCTTAGTTATTTGAATCCTTTATGGAAAGAGGGGCTTCTTTTGATAAGGGCCTCTGTTTATACAGCCGTTATATCTGGAATATGTCTACTGGCATGGTACGGGCAGAATAAAGCCAAGGGTTTCATTGAAGCCAAGCTATTGCCTTCGGTTTGTTCAGCAATCAGTGAATACACTCAGCGTGACCTTGAGTTTGGTAAGGTTCGAAGAATATCACCGTTAAGCATTACATTGGAGTCATGTTCATTTGGGCCACATCAGGAAGAATTTTCATGTGGCGAGGTTCCCGCAGTCAAACTTCGAATTCGCCCCTTTGCAAGTCTGAGGAGGGGAAAATGGGTGATCGATGCTGTTTTGTCACAACCTAGTGTCTTGGTAGCACAAAAGAAGGACTTTACTTGGTTAGGAATACCAATATCAGAAGGTGGTATACAGAGACACTTATCAACTGAAGAAGGGATAGATCATAGGACCAAAATCAGGAGGCTTGCACGAGAGGAAGCAGGTGCTCGCTGGACAAGAGACAGGGATGCTGCAGCTAGGGAAGCTGCTGAGGCGGGCTACTTTGTTTCTGAGTTTTTTGGTCTATCTGAGGATGATGATTTAAAGGGGATTGCGACTCCTTCCGCAGTACCAGGGAATTCCAAATCCTTTTTCTGCATGGATGAGGAGAAGCATGATCATCATTGCATGGACACTGGCGTTGATTATGATATGAAACATGCAAATTTGGAAAAATCATTTGGGGTGAAATTTCCTGGTTCTGGGCTTAGATTTTGGTCCAGAGTAATAAAAAGGGGTAAGGCACATAAATTTAAAAGGAAGGCTAACGGGATTGACATTTCTGCGTCTGGTATTGCCATCAAAAGAAGAATTTTTGAACGTAGTGCATCAGCAGCTCAAGAATATTTTTCTGGTCCACATGGGAACTTTGGGAATGCTTCATCACCTTCTGAATGTTTTCATTTTATGAACCATAATGAGCTTAGGGGGATCAGCGAGGTTGACAAAAGTGCAGAATCTGTTGCCAACATTGATGAAAATAGAAGTGATAGTAGCAAATTAGGGACAGATGTCGGAGATTTGGGAATTTGGCCTCCTGCAGTTCGTGAAGATGTTAATGGCCATTCGGATCATGTCATTTGTGACCAAAATTCAACTTTAGAGACGAAAGAGAGTAAACGAGACAATTTGCAGTCTAGTGGTGGTGTTGGAGAACCTGATAATGTTAATAGTTATACAGCGGAAAATGAGGAGATGGGACTTGATGTTGTTGACAAACAAATTAATGATACCATACGAGGGGTTCAAAGAGGTTTAACATCTGACAGTCCAGGTTTTTTGCAGCCTAAGCCTAGATTGGCAACATATTTTCAAGTGTCCATTAAACCAATGATTCTGAAATCTAGCTCAGTCTCATTTTTTAGAAATGTTGGGAAGTTCTTATCTTGCTTCCTTTCCAGTCCCATTCAAAATTTGAAGCCTGACTTGGGTCTGAAAGTTGAGGATATTGTTACAGAACCTGTTGATGGTGTAGATGTTAAGCATTCTGAAGGCATAACTAATATGCTTCCTGTTACATTGGATTCTGTTCATTTCAGAGATGCAACGGTGATGCTGCTTGCATACGGTGACAGAGAAGTTAGGGAGATGGAGAATGTCAATGGGCTTGTGAAGTTCCAGAACCACTATAGCCGCATACATGTGCGATTGGGTGGAAATTGTAATACTTGGAGATCAGATATGATGTCTAAAGATGGTGGCTGGTTGTCTGCCAATGTTTTTGTTGACATTATTGAGCAAAAATGGCATGCTAATCTAAAAATTGAGAATCTGTTTGTACCGCTATTTGAAAGGATCCTAGAAATTCCAATAACGTGGTCTAAAGGAAGAGCCAGTGGTGAGGTTCACTTGTGCATGTCAAGGGGGGAAACTTTTCCCAATCTTCATGGACAGCTGGATGTGACGGGTTTGGAGTTCGATTTATTGGATGCTCCATCATCATTTTCTAAAATGTCAGTTAGTTTATGTTTTCGCGGCCAAAGAATATTCTTACACAATGCAAATGGCTGGTTTGGCAGCATTCCTCTGGAAGCATCAGGAGATTTTGGCATTCATCCTGAAGAAGGAGAATTCCATCTCATGTGTCAGGTTCCTAGCGTTGAAGTGAATTCCCTGATGAGAACTTTTAAGATGAGACCTCTCTTATTCCCTGTTGCTGGTTCAGTAACTGCTCTATTTAATTGTCAAGGTCCATTGGATGCTCCTGTATTTGTGGGTAGTGCTATGGTTTCTAGGACATTGTCTCAATTGCATGTAGGCACCCGTACGTCTGCAGCATTTGAAGTACTTGCTAAAAGTAAAGAGGCTGGTGCACTAGCAGCATTTGATCGCGTTCCTTTCTCATATGTGTCTGCCAATTTCACTTTCAATACTGATGACTGTGTTGCTGATTTATATGGAATTAGGGCAAGCCTTGTAGATGGTGGTGAAATTAGAGGGGCTGGAAATGCATGGATATGCCCAGAGGGTGAGGAGGATGAGGCAGCTTTAGATGTGAACTTCTCTGGAAGTATGGCTATTGATAAAATCATGCTTCGTTACATACCCAGTTATTGCCACTTGATGCCTTTCAAATTAGGGGACTTAAATGGAGAGACGAAAGTTTCAGGATCTCTTTTGAAACCGAGATTTGATATAAGATGGACTGCAGCTAAGGCAGAAGGGTCTTTTAGCGATGCTAGGGGAGACATCATTATCTCTCATGAATCTCTTACCGTCAATTCTTCCTCAGCAGGATTTGATTTGTATATGAGAGTTCAAACATCTTACATTGATGATTTTCCTCTTAAAAGAGAAGAGTTTTATGCAACAAGAACCATCCCAGTTACTATTGATGGAGTTGAGTTGGATTTGCGCATGCATGGCTTTGAATTCTTCAATTTGGTCTCTCCATATACATTTGATTCTTTAAGGCCTTTGCATCTCAAGGCAACTGGAAGGATTAAGTTTCAGGGGAAGGTCTTGAAACCTAGTACTGGTGATAAGGAACAAAAGTTTGAGGACAGGCATCAGGAACAAATGCTGGAGGAAGGAGGTGCAGATGGCCTTGTTGGTGAGGTTTCAATCTCTGGTCTCAAACTGAATCAACTGACGCTGGCACCTCAGCTGTTTGGGTTGCTGAAAGTTTCTCCTGATTGTATTAAGTTGGATGCCTCTGGCCGGCCTGATGAAAGTCTGGCATTGGAATTTGTTGGGCCACTACAGCCCAGTGGTGAAGATGGTCCACAAAGCGGAAAACTGTTGTCCATATTCCTTCAGAAGGGTCATTTAAGAGCTAACATTTGTTTTCAACCACTTCATTCAGCTAACTTGGAGGTAAGGCATTTTCCACTTGATGAGCTGGAGCTTGCATCTCTCAGGGGTACCATACAAAGGGCAGAAATCCAGCTGAATCTCCAGAAAAGAAGAGGGCATGGAGTTCTATCTGTTCTTCGGCCAAAGTTCAGTGGTCTGCTTGGTGAAGCCCTTGATGTTGCAGCTAGATGGAGTGGTGATGTTATCACTATTGAAAAAACTGTTCTGGAACAACACTACAGTTGTTATGAACTTCAAGGTGAATACGTGTTGCCTGGCACACGAGATCGAAGCCCTGTAGGCAGAAAGGGGGATGGCTTCTTGAAAAAGCTTATGTCTGGGCATCTTGGTAATGTTATATCCTCAATGGGCAGGTGGAGAATGAAGCTTGAAGTAAGTAGAGCTGAGGTTGCTGAGATGCTTCCTCTTGCTAGGCTTCTTTCTCGAAGTGCAGATCCTGCTGATCGTTCAAGATCAAAGGATATTTTTATCCAGAGTTTGCAGTCAGTTGGATTAAATGCTGAAGGCCTTCAACAACTGCTTGAGATAACAAGGGGGCATCATGCTCCATCAAATGACGTAGTTCTAGAAGATTTAGACCTCCCTGGTTTATCTGAACTTAAAGGTCGTTGGCATGGCTCTCTTGATGCTAGTGGTGGAGGAAATGGAGACACTGTGGCAGAATTTGACTTTCATGGCGAGGACTGGGAGTGGGGAGATTACAAAACCCAGAGGGTCTTGGCAGTTGGTGCTTACAGTAACGATGATGGACTCCACCTGGAGAAAATTTTTATCCAGAAGGATAATGCCACCATTCATGCAGATGGAACTTTGTTAGGGTCTAAAACAAACTTACATTTTGCTGTCCTAAATTTTCCTGTTAGTTTGGTCCCAACTCTAGTTCAAGTCTTTGAATCTACAGCAACAGATGCTGTTCACTCTCTGCGGCAATTGTTAGCACCCATAAGGGGTATATTGCATATGGAAGGAGATCTCAGAGGAAGTTTAGCAAAACCAGAATGTGATGTGCAAGTAAGGCTCCTGGATGGTGCCATTGGTGGTATTGATCTTGGGCGTGCAGAAGTTGTTGCTTCTCTTACCTCATCCAGCCGTTTTCTATTCAACGCAAAATGTGAACCTATAATCCAAAACGGTCATGTACTCATTAAAGGAAGTATTCCTGTCACTTTTATACAAAATAGCACGTTACAGGAAGATGTAGAATTGGATAAAAATGGGGCTACTTGGGTTCCTGACTGGGTAAAGGAGAAGAATAAGGGGAATATTGATGATGCCAGTGACAAAAAACTTTCTAGAGATAGAAATGAAGAAAGTTGGAATACTCAGTTAGCAGAAAGCCTTAAAGGATTAAATTGGCAGATTTTGGATGTTGGAGAAGTCAGGGTTGATGCTGACATAAAAGATGGGGGAATGATGCTGCTGACAGCTTTATCTCCTTATGCCAATTGGCTCCAGGGTAGTGCCGATGTCATGCTGGAGGTCAGAGGCACAGTTGATCAACCGATTCTTGATGGATATGCATCATTCCACAGGGCATCTATAACTTCACCAGTGCTACGAAAGCCACTTACCAACTTTGGTGGAACTGTTTATGTGAAATCAAACAGGTTATGCATCACCTCATTGGAGAGTAGGGTAAGCAGAAAAGGAAAACTGCTTCTAAGAGGGAACCTTCCTCTTAGAACTAGTGAAGCAGCACTTGATGACAAGATTGAGTTGAAATGTGAAGTTCTGGAAGTACGAGCAAAAAATATTTTGAGTGGTCAAGTTGACTCCCAGGTGCAAATAACTGGTTCGATATTGCAACCAAATATATCTGGGAACATTAAACTTAGCCATGGAGAAGCATATTTACCACATGATAGGGGTGGTGCTACTAACTCTAATAGATTCCCGTCAAATCAATCTATGCTTCCTGCTGGTGGTGTAAGTCAAGCAGTTGCTTCAAGATATGTTTCACGTTTTTTCAGCTCAAAATCTGCTGCTTCAAGGACCAAAGTTTCTCAATCTTCCGTTAAGTCAACTCAAGTTGAAAAGGACATGGAGCAAGTGCAGATTAAACCAAATGTAGAAGTTCGTCTTAGTGATTTGAAACTTGTGCTTGGACCTGAGTTGAAGATAGTTTATCCTTTGATTCTTAATTTTGGTGTTAGTGGAGAGCTTGAATTGAATGGTCTTGCTGACCCCAAATGGATAAAACCCAGAGGCATACTGACATTTGAGAATGGTGAAGTGGATTTAGTTGCAACGCAGGTGAGATTAAAACGAGAGCATCTAAATGTTGCCAAATTTGAGCCTGAATGTGGACTAGACCCCATGCTGGATATAGCCTTGGTTGGATCTGAGTGGCAGTTTAGGATTCAAGGTCGAGCAAGCAATTGGCAGGACAAACTTGTGGTGACCTCAACACGTTCTGTGGAACAGGATGCATTATCACCCACTGAGGCTGCTAGAAGGTTTGAGAGTCAGTTGGCTGAATCCATTTTGGAAGGGAATGGTCAGCTGGCATTTGAAAAACTTGCAACTGCAACTCTTGAAAAATTAATGCCAAGAATTGAAGGGAAGGGAGAGTTTGGGCAGGCAAGGTGGAGACTAGTATATGCACCACAGATACCTAATTTCGTTTCTGTTGATCCTACAGTGGATCCTCTCAAGTCACTTGCCAGTAATATATCGTTTGGTACAGAGGTTGAAGTCCAGCTAGGTAAACGTCTTCAGGCAACAATTGTGAGGCAGATGAAGGAATCAGAGATGGCAATGCAGTGGACGTTGAGCTACCAGCTCACAAGTCGCTTGCGAGTGCTCTTGCAATCAGCTCCATCCAAACGCCTTCTTTTTGAGTATTCTACTACATCCCAGGATTAA 6519 0.4241 MKSYCTFLGIELHGSLEGSSSCRNLFHLETRELPKRDRRRCAISAKQSSPINQEFRFSYFSGGNVEFLRGSRILRNGSRLKCIKEPFSRSEDLLSYLNPLWKEGLLLIRASVYTAVISGICLLAWYGQNKAKGFIEAKLLPSVCSAISEYTQRDLEFGKVRRISPLSITLESCSFGPHQEEFSCGEVPAVKLRIRPFASLRRGKWVIDAVLSQPSVLVAQKKDFTWLGIPISEGGIQRHLSTEEGIDHRTKIRRLAREEAGARWTRDRDAAAREAAEAGYFVSEFFGLSEDDDLKGIATPSAVPGNSKSFFCMDEEKHDHHCMDTGVDYDMKHANLEKSFGVKFPGSGLRFWSRVIKRGKAHKFKRKANGIDISASGIAIKRRIFERSASAAQEYFSGPHGNFGNASSPSECFHFMNHNELRGISEVDKSAESVANIDENRSDSSKLGTDVGDLGIWPPAVREDVNGHSDHVICDQNSTLETKESKRDNLQSSGGVGEPDNVNSYTAENEEMGLDVVDKQINDTIRGVQRGLTSDSPGFLQPKPRLATYFQVSIKPMILKSSSVSFFRNVGKFLSCFLSSPIQNLKPDLGLKVEDIVTEPVDGVDVKHSEGITNMLPVTLDSVHFRDATVMLLAYGDREVREMENVNGLVKFQNHYSRIHVRLGGNCNTWRSDMMSKDGGWLSANVFVDIIEQKWHANLKIENLFVPLFERILEIPITWSKGRASGEVHLCMSRGETFPNLHGQLDVTGLEFDLLDAPSSFSKMSVSLCFRGQRIFLHNANGWFGSIPLEASGDFGIHPEEGEFHLMCQVPSVEVNSLMRTFKMRPLLFPVAGSVTALFNCQGPLDAPVFVGSAMVSRTLSQLHVGTRTSAAFEVLAKSKEAGALAAFDRVPFSYVSANFTFNTDDCVADLYGIRASLVDGGEIRGAGNAWICPEGEEDEAALDVNFSGSMAIDKIMLRYIPSYCHLMPFKLGDLNGETKVSGSLLKPRFDIRWTAAKAEGSFSDARGDIIISHESLTVNSSSAGFDLYMRVQTSYIDDFPLKREEFYATRTIPVTIDGVELDLRMHGFEFFNLVSPYTFDSLRPLHLKATGRIKFQGKVLKPSTGDKEQKFEDRHQEQMLEEGGADGLVGEVSISGLKLNQLTLAPQLFGLLKVSPDCIKLDASGRPDESLALEFVGPLQPSGEDGPQSGKLLSIFLQKGHLRANICFQPLHSANLEVRHFPLDELELASLRGTIQRAEIQLNLQKRRGHGVLSVLRPKFSGLLGEALDVAARWSGDVITIEKTVLEQHYSCYELQGEYVLPGTRDRSPVGRKGDGFLKKLMSGHLGNVISSMGRWRMKLEVSRAEVAEMLPLARLLSRSADPADRSRSKDIFIQSLQSVGLNAEGLQQLLEITRGHHAPSNDVVLEDLDLPGLSELKGRWHGSLDASGGGNGDTVAEFDFHGEDWEWGDYKTQRVLAVGAYSNDDGLHLEKIFIQKDNATIHADGTLLGSKTNLHFAVLNFPVSLVPTLVQVFESTATDAVHSLRQLLAPIRGILHMEGDLRGSLAKPECDVQVRLLDGAIGGIDLGRAEVVASLTSSSRFLFNAKCEPIIQNGHVLIKGSIPVTFIQNSTLQEDVELDKNGATWVPDWVKEKNKGNIDDASDKKLSRDRNEESWNTQLAESLKGLNWQILDVGEVRVDADIKDGGMMLLTALSPYANWLQGSADVMLEVRGTVDQPILDGYASFHRASITSPVLRKPLTNFGGTVYVKSNRLCITSLESRVSRKGKLLLRGNLPLRTSEAALDDKIELKCEVLEVRAKNILSGQVDSQVQITGSILQPNISGNIKLSHGEAYLPHDRGGATNSNRFPSNQSMLPAGGVSQAVASRYVSRFFSSKSAASRTKVSQSSVKSTQVEKDMEQVQIKPNVEVRLSDLKLVLGPELKIVYPLILNFGVSGELELNGLADPKWIKPRGILTFENGEVDLVATQVRLKREHLNVAKFEPECGLDPMLDIALVGSEWQFRIQGRASNWQDKLVVTSTRSVEQDALSPTEAARRFESQLAESILEGNGQLAFEKLATATLEKLMPRIEGKGEFGQARWRLVYAPQIPNFVSVDPTVDPLKSLASNISFGTEVEVQLGKRLQATIVRQMKESEMAMQWTLSYQLTSRLRVLLQSAPSKRLLFEYSTTSQD 2172
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lele02g0589 2172 Coils Coil 1229 1249 - -
Lele02g0589 2172 PANTHER EMBRYO DEFECTIVE 2410 84 2172 - -
Lele02g0589 2172 MobiDBLite consensus disorder prediction 476 502 - -
Lele02g0589 2172 Pfam TamB, inner membrane protein subunit of TAM complex 1760 2156 IPR007452 GO:0005886|GO:0009306
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lele02g0589 Lele-ChrLele02 3532259 3545580 Dispersed/Wgd
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Lele25g0583 25 3709598 3725648 Lele02g0589 02 3532259 3545580 CCT
Lele26g0598 26 3806075 3822086 Lele02g0589 02 3532259 3545580 CCT
Lele02g0589 02 3532259 3545580 Lele02g0589 02 3532259 3545580 ECH
Lele02g0589 02 3532259 3545580 Lele03g0602 03 3549238 3552218 hybridization
Lele02g0589 02 3532259 3545580 Lele04g0608 04 3675883 3689245 hybridization