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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lapu6g01023 ATGGCGCTAATCGTTCTCTCTCTCTTCCTTCTCCTCTTCACCTTCCACCTTCCCTTCCGTTCCTCTGGACAATCGAGATCCATGGAATCAGTTCCCGATCTTCAGAACACTATGTATGCTTCCATCGACGGATATCCTTGCGTGCGCCTGCTGAATCTCTCTGGAAACATCGGTTGTTCTAATCCTGGACGAGATAAGGTTGTGGCTCCTATTGTACGGTTCGAAAATGTTGACAAAATAGCTGAGCCGTCTGCTATACTGGTATCACTGGAGGAGTTTCCAACTCTCTTTACTAGAATATCAGATGACTCTAGATTTGCTAGTAAAGTCAGCGGTGTACTTGTGGAACCAAGTACTGATTTGCAGAATAAGTTAAATGGATTTTCTCCCGATCAAAAGTTTCCGCAAGGTCAATTTGCGCCTTACCATAATACCGGCTATGAATGGAATCCAACTGGTTCTGGTATTATGTGGAAATCCTACAGTTTTCCTGTGTTTTTACTCACAGAAAGTGGGTCAAAGACTCTTCAAGAGTTTGTAACAAAGAATGAGGACAAAAAGAAAGCTTATACTTCTAATGTGGCTGAGTTTGATCTGGTGATGCAGACAGTGAAATCCGGGACACTTGATTCAGAGTCTTGTTTAAAAGAAGAAACTTGCCTTCCTTTAGGTGGATACAGTGTCTGGTCATCTCTTCCTCCGATCAACACTTCTTCCATACAGCAGTCTAAGCCCATTTTATTGACAGTGGCATCCATGGATTCTGCTTCATTTTTTCGTGACAAAAGCCTTGGGGCAGACTCCCCTATTTCTGGTTTAATTGCATTACTAGCTGCTGTTGATGCACTTTCTCATTTGGATGGTCTTGGTGACCTTAGTAAACAGCTTGTTTTTGCAGTTTTCACTGGAGAGGCATGGGGTTATCTTGGAAGTAGGAGATTCTTGGTAGAACTTGACTTGCACTCAGATGCTGTTCGTGGCCTTAATCATGGATTAATTGAAACGGTCATTGAAATTGGTTCTGTTGGAAAGGGTCTAAGTAAAGGTGTTAACAACTTTTATGCTCATGCAGAAGGGGATTCTTCTGCCACAAATCAGACTATGGTTGCCTTGAAACGCGCACAGGAGTCACTGTTATCTGAAAATGTAAAGATAACATCTGCAAGTTCTTCAAATCCTGGGATACCTCCATCATCTTTAATGTCCTTTTTGGAAAAGAATCCTGCAATCTCTGGTGTTGTCATTGAAGATTTTGACTCTGTCTTTGTCAACAAGTTCTACCATAGTCACCTTGATGATTTATCAAATGTAAATTCATCAGCTGTAGTTGCTGCTGCTTCTCTTGTTGCCCGAACCCTTTACATACTTGCTAGTGAAATTGACGATGTTCAAGATTCAACTTTGGCTGCTATAAATGTTAATGACTCACTTGTTGAACAACTTATGGGTTGCTTGTTGGACTGTGATCCTGGTCTTTCTTGTGAATTGGTGAAAAAATATATTTCACCCTTGTCAACCTGTCCAAGCCATTATGTTGGTGTTATCTTGGATGAACCCTCATCTACACCATATACAGGATACATCAATGATGTTCCAAGGTTCATTTGGAATTTTCTGGCTGACAGAACTTCTATCCCGAGGGAGACTAACAGCTCAAATTGCCAACACGGTTGCAATGGTAATGAAGTTTGCATCAAAGCAGAGACTGATGGAAAGGGAGTTTGTGTTCTCTCTGCAACAAGGTATGTTCCAGCATACTCAACACGGCTAAAATTTGAATCAGGAGGGTGGAATGTTTTGCCTCCTAATTCCTCTGAAAAAATGGGGGTTGTGGACCCTGTCTGGACTGAGAGCAACTGGAATTCAATAGGTATGCGGGTCTACACAGTCCAAAATGCTGCTTATGATCGGCTTGTTCTGTTTGGGGGCATCACTTTGACAATCTTCTCATACCTTGCAATGGCAACTGCAAGAACCCTTTTTTCCAAAGCAATGAAGAGGGATTGA 2007 0.419 MALIVLSLFLLLFTFHLPFRSSGQSRSMESVPDLQNTMYASIDGYPCVRLLNLSGNIGCSNPGRDKVVAPIVRFENVDKIAEPSAILVSLEEFPTLFTRISDDSRFASKVSGVLVEPSTDLQNKLNGFSPDQKFPQGQFAPYHNTGYEWNPTGSGIMWKSYSFPVFLLTESGSKTLQEFVTKNEDKKKAYTSNVAEFDLVMQTVKSGTLDSESCLKEETCLPLGGYSVWSSLPPINTSSIQQSKPILLTVASMDSASFFRDKSLGADSPISGLIALLAAVDALSHLDGLGDLSKQLVFAVFTGEAWGYLGSRRFLVELDLHSDAVRGLNHGLIETVIEIGSVGKGLSKGVNNFYAHAEGDSSATNQTMVALKRAQESLLSENVKITSASSSNPGIPPSSLMSFLEKNPAISGVVIEDFDSVFVNKFYHSHLDDLSNVNSSAVVAAASLVARTLYILASEIDDVQDSTLAAINVNDSLVEQLMGCLLDCDPGLSCELVKKYISPLSTCPSHYVGVILDEPSSTPYTGYINDVPRFIWNFLADRTSIPRETNSSNCQHGCNGNEVCIKAETDGKGVCVLSATRYVPAYSTRLKFESGGWNVLPPNSSEKMGVVDPVWTESNWNSIGMRVYTVQNAAYDRLVLFGGITLTIFSYLAMATARTLFSKAMKRD* 669
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lapu6g01023 668 SUPERFAMILY Zn-dependent exopeptidases 217 456 - -
Lapu6g01023 668 PANTHER NICASTRIN 9 667 IPR008710 GO:0016020|GO:0016485
Lapu6g01023 668 CDD M28_Nicastrin 40 621 - -
Lapu6g01023 668 FunFam Nicastrin 173 469 - -
Lapu6g01023 668 Pfam Nicastrin 245 454 - -
Lapu6g01023 668 Gene3D Zn peptidases 173 469 - -
Lapu6g01023 668 Pfam Nicastrin small lobe 46 203 IPR041084 -
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Lapu6g01023 K06171 - gmx:100801506 1178.31